杂交试验中的最佳样本含量

杂交试验是一项费时费钱的工作,因此在进行试验之前如能进行严密的设计,给出试验所需的样本大小是十分必要的,统计学中常见的估计样本容理的公式不宜应用于杂交试验,本文分两种情况给出了杂交试验中样本容量的估计公式,据此估计出的样本容量安排杂交试验,可在满足试验者要求的条件下,使试验的总成本最低或使试畜的总头数最少。     

均衡独立样本设计的研究

均衡独立样本设计是一种把独立样本设计与差异显著性检验相结合的试验设计．它基本上可以保证参试的优劣个体在所分样本（或组）间的分布相对均匀一致,使所分样本既具有独立性又具有均衡性,以增强对处理效果反应的灵敏度,提高试验的准确度．     

样本区间长度的渐近分布

设(X1,X2,…,Xn)为服从I=[0,1]上的均匀分布的简单随机样本,它们将 [0,1]分成(n 1)个样本区间,以Y0,Y1,…,Yn分别表示这些样本区间的长度．本文利用顺序统计量的性质讨论了Yi(0≤i≤n)的渐近分布以及Yi,Yj(i≠j)的渐近独立性．     

血清样本双向电泳操作条件的优化

为建立分辨率高、重复性好的血清样品双向电泳技术,本文从血清样品的水化、等电聚焦、胶条的平衡、胶条的染色等几个方面对双向电泳操作条件进行了分析。结果表明采用以下的操作过程可以获得分辨率高、重复性好的双向电泳结果：样品水化2小时（25℃);胶条泡涨12-16小时(25℃);17cm胶条的等点聚焦程序采用 250V线性1小时/1000V线性1小时/4000V线性2小时/8000V线性3小时/8000V线性10小时/500V快速0.5小时/,11cm的胶条的等点聚焦程序采用250V慢速4小时/1000V快速2小时/4000V快速1小时/8000V快速2.5小时/8000V快速7小时/500V快速30分钟;两次平衡各15-20分钟;银染条件为固定两小时或过夜,敏化50-60分钟,定影30-40分钟,显影10分钟左右,终止10分钟）。这一研究对利用双向电泳分析血清蛋白具有很好的参考价值。     

消化道微生态标准化样本库共识

生物样本库主要是指标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的器官、组织、细胞、血液、体液、分泌物、排泄物及生物大分子衍生物等各种生物样本,以及与这些样本相关的临床、检验、病理、影像、治疗、随访、患者知情同意等信息,包括质量控制、信息管理与应用系统。人类消化道生存着众多微生物,包括细菌、古生菌、真菌、病毒和原虫等[1]。肠道微生物与宿主长期共同进化,构成肠道微生态,影响着宿主的健康。随着测序等高通量技术和生物信息学发展,以消化道微生态（主要是细菌和真菌）样本为基础的研究使得我们对消化道微生态的认知和应用向前推进了一大步[2],成为国内外重要的研究热点。然而,消化道微生态样本的采集、制备、储存等是后续研究的第一步,对检测和分析结果有着重要的影响[3]。统一标准、高质量的生物样本是研究数据真实性、可重复性、一致性及整合数据和应用等的根本基础,也是进行基础和临床大数据研究的重要保障。消化道微生态样本可用于基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、培养组、营养组、微生态移植、转化医学等多方面研究。目前尚缺乏消化道微生态样本库构建的标准及规范,制定共识意见非常迫切和必要。     

用少量样本进行抑制性消减杂交

利用根据cap-finder方法建立的全长cDNA合成技术,扩增获得了恒河猴着床点子宫内膜组织表达mRNA的双链cDNA,通过抑制性消减杂交,成功地构建了恒河猴着床点消减文库.随机挑选文库中的阳性克隆,经点杂交证明27％为着床点差异表达的克隆.由此表明抑制性消减杂交结合cap-finder扩增全长cDNA的方法,可以有效地从少量而珍贵的样本中获得高质量的消减文库.     

生物样本库的建立与管理

目的:探讨医学研究中样本库的建库条件,样本的采集、保存和质量控制,以及样本库的信息化管理等问题。方法:流行病学现场采集人群的全血、血浆等标本,按分子生物学实验要求分装处理,于液氮或-80℃低温冷冻保存;建立了一套信息管理软件应用于样本库的管理。结果:2004年7月至2009年12月收集维吾尔族、哈萨克族、汉族人群的各类样本达2万余份,并且已应用于新疆民族高发性疾病的研究,效果良好。结论:生物标本库的建立,有利于合理有效地利用资源。     

转化医学与生物样本库现状

转化医学(translational medicine)是近10年来国际生物医学领域出现的新概念和重点研究方向,其为一种倡导实验室与临床研究双向转化的模式,而这种模式的核心意义之一便体现在协作与资源共享方面。这便促使生物样本库成为了转化医学的战略资源。本文在分析发达国家促进转化医学发展政策的同时分析了生物样本库建设的现状、趋势和问题,旨在为我国制定转化医学发展战略,建设生物样本库,促进转化医学发展提供参考。     

血液样本质量的评估技术进展

生物样本为转化医学研究提供了宝贵的临床资源.高效的生物样本质量检测技术对于临床样本分析结果的准确性和可靠性具有重要意义.将有效的质控检测方法和特定的生物学标志物作为血液质量指标,能够评估血液离体后的质量变化情况,进而在样本分析前剔除低质量样本,提升被分析样本和数据的总体质量和可靠性.血液样本由血细胞和血浆组成,包含核酸水平、蛋白质水平、代谢物水平等多个分子层面信息.因此在分析样本前,应根据样本类型和目标分子做出相应的质量评估.目前血细胞中的核酸质量可利用多种检测技术对其浓度、纯度和片段完整性进行检测.对于血浆和血清中的游离DNA以及结构不稳定的RNA小分子,可利用对应的靶标分子作为整体质量检测指标.但血细胞中mRNA离体表达水平的变化暂无明确的评估方法.此外,对于结构更为复杂的代谢小分子、蛋白质以及多肽片段,目前的研究多利用核磁共振技术或各种分离纯化手段(包括色谱、免疫亲和分离、磁分离等)与质谱联用技术来寻找目标质控靶标分子.这些分子作为标志物的可靠性、稳定性和准确性仍需验证.目前对于代谢小分子、蛋白质及多肽的质谱鉴定技术的成本高,无法满足大部分实验室对于样本质量检测的需求,因此需要寻...     

生物样本库及其伦理问题简介

随着分子和基因组信息对流行病学影响的增加,无数遗传流行病学研究和后人类基因组计划的研究都越来越依赖人类生物样本库的使用。生物样本库的范围也已横跨学术或者医院环境下的小数量收集到大规模的全国性储藏。尽管生物样本库的概念并不新,但是在基因组研究和后人类基因组计划的背景下,伴随它们十几年极大发展的是无数待解决的伦理挑战。从生物样本库的概念着手,介绍了其与一般遗传数据库的区别以及建立生物样本库的意义;然后介绍并比较国际上已有的生物样本库,以及其伦理问题和伦理法律框架的发展趋势。     

蠕形螨扫描电镜样本的制备方法

本文对蠕形螨扫描电镜样本制备方法做了一定改进,结果制得的山羊蠕形螨扫描电镜样本观察效果显著优于原有方法,该改进方法特别适用于于结节脓疱型蠕形螨扫描电镜样本的制备。     

尖锐湿疣样本中HPV病毒的分子检测

调查男性和女性尖锐湿疣样本中人乳头瘤病毒（HPV）的检出率及病毒类型,为研发相关防治疫苗提供依据,以HPV 外壳蛋白DNA序列为模板设计特异引物,SSP－PCR扩增检测样本中HPV的感染率和病毒类型。收集了北京及邯郸市医院门诊尖锐湿疣样本22例,其中男性13例,女性9例。检测发现所有样本中存在着高浓度的HPV病毒DNA。男性样本中有5例感染HPV6型,6例感染HPV11型,2例为HPV6＋HPV11混合感染。女性样本中有3例感染HPV6型,2例感染HPV11型,4例为 HPV6＋HPV11混合感染。被诊断为宫颈湿疣的4位女性还在其含宫颈粘膜脱落细胞的样本中检出了HPV16、HPV18、HPV33、HPV35、HPV45、HPV54、HPV56或HPV58等高危险型病毒类型。所有检测到的HPV病毒DNA片段均TA克隆并将测定的DNA序列存入了国际基因数据库GenBank（DQ003066－DQ003079）。调查没有在单纯的男女尖锐湿疣组织块中检测到除HPV6和HPV11以外的其他HPV类型。该研究建立了灵敏可靠的HPV分子检测及分型方法,尖锐湿疣中HPV的检出率达100％。 本研究初步结果显示导致男女尖锐湿疣的HPV病毒类型没有显著差异,主要为HPV6及HPV11型。     

广州地区三级甲等医院急诊科样本周转时间现况研究

??????? 目的 调查广州地区三级甲等医院急诊科样本周转时间（TAT),为持续改进检验流程提供科学依据。方法 2012-04-02至2013-03-29期间,从广州地区4家三级甲等医院急诊科,随机抽取8 196例样本,利用医院信息系统（HIS）全程记录检验申请、付费、采集样本、输送、检验前处理、检验、审核、取报告、医生处理等过程。结果 8 196例样本TAT的中位数为72.9 min,付费、采集样本、输送、检验前处理、检验、审核、取报告、医生处理分别用时9.1 min、5.1 min、9.7 min、12.5 min、13.8 min、5.3min、12.9 min、3.9 min,实验室内TAT为32.1 min。结论 广州地区三级甲等医院急诊科常见样本的TAT 基本符合临床需要,但部分项目的TAT有待进一步缩短。     

血液样本蛋白质组分析方法的比较研究

比较和优化血液样本蛋白质组学样品制备和质谱分析技术,为深度研究和挖掘血液样本蛋白质组学信息创造条件.采用Q-Exactive Plus质谱仪,对比分析血浆、血清和去除高丰度蛋白血清预处理方法制备的大鼠血样蛋白质组构成;比较血清样本的常规酶切、45℃孵育、热辅助酶切、二次热辅助酶切、尿素辅助酶切和变温酶切的效率;比较数据...     

微量植物样本的DNA提取方法研究

为建立一种适于法庭科学实践的植物物证DNA提取优化方法,以期获得高质量的适于PCR分析的模板DNA.用8种方法从不同植物的干叶片中提取DNA,利用线粒体DNA非编码区的PCR扩增结果分析评价提取DNA的质量.结果表明8种DNA提取方法所提取的DNA都可以获得线粒体DNA非编码区的PCR扩增产物,对照紫外波长扫描结果显示,以改进的CTAB方法制备的模板DNA纯度最高,可达到进口试剂盒同等制备精度,OD260/280稳定在1.7～1.9之间.因此改进的CTAB方法适用于微量植物样本的DNA提取,可应用于法庭科学实践.     

基因标签区分癌症样本的初步分析

从基因表达水平的角度对癌症样本进行分子分型,其较高的临床结果预测能力已经获得越来越广泛的关注。研究发现,某些基因集合(称为基因标签)的表达水平可以显著区分不同癌症样本之间的亚型差异并与癌症病人的临床结果显著关联。使用主成分分析法能够帮助我们找出这类表达谱与临床结果密切相关的基因标签。本研究通过主成分分析法从MSig BD和GeneSigDB数据库包含的基因集中找出可以解释不同癌症样本区别的基因标签并进一步评价了这些基因标签对癌症病人生存结果的预测能力。通过对10种癌症分别进行检验,我们找到了数量可观的可以区分癌症样本且相应的临床结果具有显著差异的基因标签。基于基因表达谱、临床数据和主成分分析法,基因标签能够对具有不同临床结果的癌症样本进行亚类的区分。     

桑蚕种样本孵化率偏差控制方法研究

桑蚕种孵化率是蚕种质量检验的重要指标,控制样本间孵化率偏差是保证孵化率准确性的关键．通过理论分析,给出了样本孵化率偏差的控制方法．在置信水平1-α下,两样本孵化率最大随机偏差约为u_(α/2)(p(1-p)(1/n_1 1/n_2))．并通过实际调查,与理论方法进行了具体分析与比较．并为蚕业生产提供了一套控制孵化率偏差的可行性方案．     

不同样本中甲螨的分离方法

采用电热分离法、清水漂浮法和振动分离法对不同样本中甲螨的分离时间、数量,样本的放置时间及电热分离所用热光源作了比较,结果证明,分离土壤甲螨时,土壤放置7d与立即分离所获甲螨数无差别,少量土样宜用清水漂浮法,大量土样宜用电热分离法,而植被样本宜用振动分离法。     

群落有序样本的一种聚类分析方法

目前,适用于群落聚类分析有序样本的聚类方法主要是“最优分割法”。本文提出了一种新的适用于群落有序样本的聚类方法,该法较最优分割法计算简便。