用地高辛标记原位杂交技术定位黄鳝rRNA基因于二价染色体3q12─q24和7q14─q26

以地高辛标记重组质粒ＰＴＡ７１中所含的小麦ｒＲＮＡ基因作为探针,与ＥｃｏＲＩ酶切的黄鳝核基因组总ＤＮＡ经Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交,呈现２条带,片段长度分别为１２．８ｋｂ和４．６ｋｂ。再运用染色体原位杂交技术及杂交后多重带显带技术,定位ｒＲＮＡ基因于黄鳝二价染色体３ｑ１２－ｑ２４和７ｑ１４－ｑ２６两个区间,其分布位点与硝酸银染色法结果相符。此外,还讨论了在黄鳝二价体上开展基因定位研究的突出优点。     

用地高辛标记原位杂交技术定位黄鳝rRNA基因于二价染色体3q12—q24和7…

以地高辛标记重组质粒ＰＴＡ７１中所含的小麦ｒＲＮＡ基因作为探针,与ＥｃｏＲＩ酶切的黄鳝核基因组点ＤＮＡ经Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交,呈现２条带,片段长度分别为１２．８ｋｂ和４．６ｋｂ。再运用染色体原位杂交技术及杂交一多重带显带技术,定位ｒＲＮＡ基因于黄鳝二价染色体３ｑ１２－ｑ２４和７ｑ１４－ｑ２６两个区间,其分布位点与硝酸银染法结果相符。此外,还讨论了在黄鳝二价体上开展基因定位研究的突出优点。     

用原位杂交技术定位甲状旁腺素基因于猪染色体14q25—q28

本文报告了以氚标记的人甲状旁腺素ＤＮＡ片段为探针,用原位杂交法将此基因定于猪染色体１４ｑ２５－ｑ２８的实验结果。此外本文还对相关问题进行了讨论     

人肝癌中的抑癌基因

杂合性丢失分析资料显示,在肝癌的发生和演进过程中涉及多种抑癌基因失活。国内外研究表明,肝癌中存在抑癌基因ＴＰ５３突变失活,ＴＰ５３基因突变表现特异性和病因相关性。作者通过检查１５个高度多态的微卫星标记,进行染色体缺失精细定位,将肝癌中染色体１３ｑ缺失的最小重叠区域限定于１３ｑ１４,强烈提示ＲＢ１基因为染色体缺失的靶基因;进一步应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ分析和ＤＮＡ测序发现２例发生染色体１３ｑ臂内缺失的肝癌中有ＲＢ１基因微小缺失,其结果是无法编码有功能的蛋白产物,从而找到肝癌中ＲＢ１基因失活的可靠证据;免疫组织化学染色表明,５２％的肝癌组织中ｐ１１０ＲＢ１蛋白丢失且与染色体１３ｑ杂合性丢失高度相关。因此,确定ＲＢ１基因为肝癌的又一重要抑癌基因。     

基因网络相继故障机理分析

癌相关基因在疾病发生与发展过程中的作用机理是非常重要的研究课题。现代数据分析方法,为从基因组数据中推断癌相关基因之间的关联,以及分析基因组的作用机理提供了有效的手段。本文根据基因表达谱数据分别建立了正常组织与神经胶质瘤和肾癌的患病组织的基因互信息网络。用以介数为基础的相继故障模型研究了基因网络结构与鲁棒性之间的关系。定义了网络相继故障节点百分比、平均相继故障规模和相继故障规模比例累积概率等衡量网络鲁棒性的结构参数。通过对照组与实验组之间的比对,我们发现实验组网络比对照组网络更加稳定,并将引起网络大规模相继故障的基因称为结构性关键基因。这些结构性关键基因中的一部分已经被证明与神经胶质瘤或肾癌的发生、发展有密切关系。大多数基因被预测在神经胶质瘤和肾癌的发生中起着激励或抑制作用,需要进一步的试验验证。预测信息为研究癌相关基因提供了新的方向。     

血小板C1q受体

血小板Ｃ１ｑ受体（ＰＱＲ）纯品的分子量为６７０００,沉降系数２．４Ｓ,有链内二硫键。每个血小板约含有４×１０＾３个ＰＱＲ分子,其对Ｃ１ｑ的亲和常数为３．５×１０＾７Ｍ＾＿。ＰＱＲ与Ｃ１ｑ的结合具有特异性、可饱和性和可逆性。ＰＱＲ是不同于血小板胶原受体的膜受体分子,但可与胶原发生交叉反应。单体Ｃ１ｑ抑制胶原或免疫复合物（ＩＣ）诱导的血小板聚集和释放反应,而多聚Ｃ１ｑ则能激活血小板的这些功能。ＰＱＲ…     

金鱼草基因转化和转基因植株再生

本实验采用根癌农杆菌ＬＢＡ４４０４（ｐ３５ＳＧＵＳＩＮＴ与金鱼草下胚轴切段共培养,将ＧＵＳ基因导入金鱼草细胞,通过不定芽发生途径获得抗Ｇ４１８再生植株．经ＤＮＡ／ＤＮＡ斑点杂交及ＧＵＳ活性原位组织检测初步证实外源基因ＧＵＳ已整合进金鱼草基因组并得到表达．     

中国人群食管鳞状细胞癌多个易感基因位点获确认

由中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肿瘤研究所林东听教授领衔的食管鳞状细胞癌易感基因研究获重大突破。林东听研究组通过全基因组关联分析，鉴别出多个中国人群食管鳞状细胞癌易感基因位点，并分析了相关基因与环境的互作关系。     

人肝癌中的抑癌基因

杂合性丢失分析资料显示,在肝癌的发生发生和演讲过程中涉及多种抑癌基因失活。国内外研究表明,肝癌中存在抑癌基因ＴＰ５３突变失活,ＴＰ５３基因突变表现特异性的和病因相关性。作者通过检查１５个高度多态的微卫星标记,进行染色体缺失精神定位,将 染色体１３ｑ缺失的最小叠区域限定于１３ｑ１４,强烈提示ＲＢ１基因为染色体缺失的靶基因;进一步应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ分析和ＤＮＡ测序发现２例发生染色体１３ｑ臂内缺失的肝     

癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析

MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的内源性非编码RNA,通过与靶基因转录本互补结合调控基因的表达。近年来,研究发现miRNA与癌症发生密切相关,miRNA可以直接充当癌基因或者抑癌基因而影响肿瘤的发生和生长。为更进一步揭示癌症相关miRNA的特征及靶基因的功能,文章通过数据库搜索及文献检索,在人类基因组中发现了475个癌症相关miRNA,系统地比较了癌症相关miRNA与非癌症miRNA以及基因内和基因间区癌症相关miRNA在保守性、SNP位点分布、癌谱及转录调控等特性。研究发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA保守性要强,发生SNP概率比较低,同时发现miRNA所涉及癌症数目与保守性成正相关。基因组定位分析发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA更倾向于成簇存在。进一步对宿主基因、癌症相关miRNA及作用的靶基因与癌症发生进行关联分析,发现一些非癌症miRNA的宿主基因倾向于被癌症miRNA作用。本研究结果为深入理解miRNA与癌症之间的关系,以及进一步为miRNA作为癌症诊断指示物提供理论依据。     

毛细胞白血病5q13.3断裂位点线性DNA荧光原位杂交定位

毛细胞白血病经常与５ｑ１３．３断裂位点相关联,该断裂位点区域及位于这一区域的重要基因有待研究。我们探索了ＤＮＡ纤维荧光原位杂交方法（即ＤＮＡ纤维ＦＩＳＨ）检测该断裂位点的可行性。实验选用含有断裂位点区域的两个基因组克隆及位于断裂位上是的两个ｃｏｓ质粒探针与带有结构性到位（５）（ｐ１３．１ｑ１３．３）的线性ＤＮＡ共杂交（ＤＮＡ来自ＨＣＬ患者的细胞系）。实验证明该断裂位点将探针信号一分为二。根据这些结果描绘出断裂位点区域图。研究表明,ＤＮＡ纤维ＦＩＳＨ方法是绘制高精度物理图谱和检出遗传重排的一种有效的研究手段。     

基因倍增和脊椎动物起源

有机体基因复制导致基因复杂性增加及其和脊椎动物起源的关系已经成为进化生物学研究的热点。20世纪70年代由Ohno提出后经Holland等修正的原始脊索动物经两轮基因组复制产生脊椎动物的假设目前已被广泛接受。脊椎动物起源和进化过程中发生过两轮基因组复制的主要证据有三点：（1）据估计脊椎动物基因组内编码基因数目大约相当于果蝇、海鞘等无脊椎动物的4倍;原口动物如果蝇和后口动物如头索动物文昌鱼的基因组大都只有单拷贝的基因,而脊椎动物的基因组则通常有4个同属于一个家族的基因。（2）无脊椎动物如节肢动物、海胆和头索动物文昌鱼都只有一个Hox基因簇,而脊椎动物除鱼类外,有7个具有Hox基因簇,其余都具有4个Hox基因簇。（3）基因作图证明,不但在鱼类和哺乳动物染色体广大片段上基因顺序相似,而且有证据显示哺乳动物基因组不同染色体之间存在相似性。据认为第一次基因倍增发生在脊椎动物与头索动物分开之后,第二次基因倍增发生在有颌类脊椎动物和无颌类脊椎动物分开以后。但是,基因是逐个发生倍增,还是通过基因组内某些DNA片段抑或整个基因组的加倍而实现的,目前还颇有争议。     

一个定位在7q32染色体区域的鼻咽癌负相关EST

为了分离和克隆定位于７ｑ３２染色体区域的与鼻咽癌发病有关的抑瘤基因,检测了鼻咽癌活检组织及配对外周血标本中７ｑ３２微卫星ＤＮＡ多态性位点的基因型,发现在７ｑ３２区域存在３０％左右的杂合性丢失,从Ｉｎｔｅｒｎｅｔ中查询到定位于７ｑ３２区域的所有不同ＥＳＴ,对其中２０个ＥＳＴ进行分析,ＲＴ－ＰＣＲ和Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交发现,ＡＡ０７０４３７,ＥＳＴ在鼻咽癌细胞株ＨＮＥ１中表达微弱,而在正常鼻咽上皮原代     

杨树基因组中染色体基因丰度分化及EST序列对基因覆盖度的检测(英文)

高等植物基因组中,大部分序列为非表达序列,基因序列所占的比例很小,了解基因在基因组中的分布是研究基因组结构的一个重要方面。在美国能源部资助下,一个毛果杨无性系的基因组测序已经完成并对公众发布。杨树全基因组序列的完成,为我们了解林木基因组中基因的分布提供了一个特例。在本文中,我们利用泊松分析对杨树基因组中基因在各个染色体上的密度进行了检测,结果表明杨树基因组中各条染色体的基因含量存在显著差异。杨树全基因组测序项目揭示现代杨树基因组起源于一次古全基因组复制事件(称为杨柳科基因组复制),所以杨树基因组不同染色体间存在很大的同源复制片段。但是我们的研究显示,杨树基因组中大多数高度同源的染色体上基因的密度与染色体间的同源性没有明显关系,这说明杨柳科全基因组复制事件后,各个高度同源染色体上的基因发生了流失,且基因流失的速率是不一样的。同时本文还对近九万条毛果杨EST序列进行了比对分析,结果显示这些EST序列覆盖的基因仅占杨树基因组中基因总数的16.8%左右。EST测序虽然是发现基因的一个重要手段,但小规模EST测序对基因的覆盖度很低,所以小规模EST测序的应用价值是有限的。     

节肢动物线粒体基因组与系统发生重建

对mt基因组的比较研究是探讨节肢动物系统发生的有效手段之一。基因的排列和DNA序列可以为重建节肢动物的系统发生提供有用的信息。目前,已测定mt基因组全序列的节肢动物已增加到44种。归纳、总结了节肢动物mt基因组的基本特征、基因顺序、基因重排的发生和机制等。简要评述基于mt基因组的节肢动物系统发生研究。     

用原位分子杂交技术定位生长激素基因于5号染色体

本工作利用放射性标记的ｂＧＨ基因为探针，通过原位杂交定位牛生长激素基因于染色体５ｑ２２－２６内，该结果与以前的ｂＧＨ基因定位的结果不同，讨论了基因探针、基因定位方法等方面与定位准确性的关系。     

黄鳝二价体上Px基因E3外显子特异引物原位DNA合成

在鱼类中首次应用地高辛标记的特异引物原位ＤＮＡ合成技术,将Ｐｘ基因Ｅ３外显子定位于黄鳝粗线期８号二价体的８ｑ１５～ｑ２６区间和ｌ号二价体的ｌｑ３２～ｑ３７区间,证实了异种生物基因探针和引物原位ＤＮＡ合成技术用于基因定位研究的可行性。     

人类基因组中巢式基因对的系统分析

基因组上一个基因的所有或大部分外显子位于另一基因内含子和UTR中被称为巢式基因(Nested gene)。巢式基因对(Nested gene pair)是由主基因(Host gene)和巢式基因组成的基因对。文章针对人类基因组上的顺式巢式基因对(简称为巢式基因对)进行全基因组鉴定,并通过比较巢式基因对在人和小鼠基因组上的保守性分布,研究巢式基因对的进化方式。保守性分析表明基因转座、序列原位突变和主基因转录起始/终止位点突变是巢式基因对进化的主要原因,其中主基因转录起始/终止位点突变是巢式基因对独特的一种进化方式。Gene On-tology分析揭示大部分巢式基因与主基因的产物在功能上没有相关性。     

后生动物线粒体基因组:起源、大小和基因排列进化

由于受到强烈的进化约束,后生动物线粒体基因组在大小和基因含量上一直保持稳定,相比之下核基因组则发生了巨大的改变。后生动物线粒体基因组结构的可塑性在一定程度上归功于可能由tRNA基因介导的基因重排事件,虽然亲缘关系密切的物种间也可能出现基因重排,但同门内的线粒体基因组仍趋向于具有类似的结构特征。我们对后生动物线粒体基因组的起源、大小和基因排列进化方面的特点进行了介绍。     

肝细胞癌中FHIT基因启动子甲基化状态分析及其与临床病理特征之间的关系研究

目的:分析肝细胞癌组织中FHIT基因启动子甲基化状态及其与FHIT基因表达和肝细胞癌临床病理特征的关系。方法:运用甲基化特异性PCR(MSP)方法分析肝细胞癌组织和癌旁正常肝脏组织中FHIT基因启动子甲基化状况;应用RT-PCT和Western免疫印迹方法检测FHIT基因mRNA和蛋白的表达情况;统计学分析FHIT基因启动子甲基化与肝细胞癌临床病理特征的关系。结果:MSP分析结果表明肝细胞癌组织中FHIT基因甲基化率(60.8%)显著高于癌旁正常组织中FHIT基因甲基化(16.2%;x2=31.071,P=0.000)。同时我们还发现:发生完全或者部分甲基化的肝细胞癌组织或者癌旁正常肝组织中FHIT基因mRNA和蛋白表达水平显著降低。FHIT基因启动子甲基化和肝细胞癌患者的临床分期和肝外转移情况密切相关(P=0.006和0.049),而与其他临床病理特征无相关性(P>0.05)。结论:FHIT基因甲基化是导致FHIT基因在肝细胞癌中失活的一个重要因素,与肝细胞癌的发生密切相关,有望成为肝细胞癌早期诊断的分子检测标志物和分子治疗新靶点。