球囊菌门丛枝菌根真菌最新分类系统菌种名录

球囊菌门Glomeromycota是菌物界(Kingdom of Fungi)晚近新增加的一个门,下设1纲4目11科27属约300种丛枝菌根(AM)真菌,均是植物根系重要的共生真菌。同其他真菌分类研究过程相似,随着新种的不断发现、分类技术的进步与研究的深入,AM真菌分类系统及其菌种学名经历着持续不断的变更。然而,这些变动给AM真菌研究者造成了一定的困扰和混乱。本文在AM真菌系统发育分类重建的基础上,结合当前国际上AM真菌分类的最新进展,规范、正确并一致描述全球已知的AM真菌菌种拉丁文和中文学名,以纠正错误和统一AM真菌中文学名;同时标注了中国新记录种、新种和种质资源保藏种名录,以期促进中国AM真菌分类、资源多样性、群落结构及其相关研究。     

我国丛赤壳类真菌分类研究

丛赤壳类真菌是具有经济重要性的生物类群。该文回顾了我国该类分类研究的简史,概述近年来取得的相关研究进展,揭示我国该类真菌的物种丰富程度,展示建立在分类学基础上的真菌DNA条形码探索以及分子系统学研究成果,表明资源和分类研究与真菌天然产物研究联手的新发现。     

世界大型真菌分类系统及信息平台http://www.nmdc.cn/macrofungi/上线

真菌是真核生物中除植物和动物的第三类生物,其中拥有肉眼可辨识的大型子实体的真菌被泛称为大型真菌,即人们所熟知的蕈菌、蘑菇。分类学上大多数物种来自担子菌门,少数来自子囊菌门。随着分子系统发育研究的开展,真菌分类学获得了巨大的进步,同时随着类群间进化关系认识的不断深入,近年来真菌分类系统经历了大量的调整,不断推陈出新,这让使用者难以把握。近期结合分子系统学研究的最新进展,担子菌门及子囊菌门的分类系统得以修订,为了方便广大研究者对大型真菌分类系统的需求,在中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室、中国科学院微生物研究所菌物标本馆、中国菌物学会、中国菌物标本馆联盟的支持下,结合相关研究成果,世界大型真菌分类系统及信息平台上线。该平台提供了完整的大型真菌分类系统及相关分类信息,并在广泛的国内外合作基础上,实现定期更新。这将满足不同领域的研究者对相关信息的需求,并为研究者提供学术交流平台,有力促进大型真菌分类系统的稳定性和前沿性。     

蕈菌分类与多样性研究团队

<正>蕈菌,即大型真菌。吉林农业大学蕈菌分类研究始于20世纪30年代周宗璜教授在留法期间所做的关于鬼伞类真菌的个体发育研究。回国后,周先生在吉林农业大学成立真菌研究室,其弟子李玉、刘振钦、杨信东等以黏菌、食用菌、病原菌的分类研究为主,基本保障包括蕈菌在内的真菌分类课程的开设。     

基因组学时代的真菌分类学:机遇与挑战

真菌物种的形态特征有限,加之形态滞后和形态可塑性,仅靠外部形态、内部结构及生理生化指标,很难把握真菌的系统亲缘。应用DNA测序、基因组测序、比较基因组学及生物信息学等技术,研究人员可以快速识别真菌演化中出现的数量众多的单系支系,为建立各分类等级的新分类单元提供有力证据,为真菌分类学研究带来了新的希望和活力。自2000年以来,在真菌界至少发表了1新亚界、4新门、7新亚门、19新纲、9新亚纲、40余新目等高级分类单元。近3年来,我国发表了20余个真菌新属,其中绝大多数属的建立都有分子证据支持。可以预见,大量的新种、新属、新科乃至更高级分类单元将会在今后10年内持续发现和建立。这必将大大促进真菌分类学的发展,完善现有的真菌分类系统。我们应该顺势而上,利用我国丰富的真菌资源,为真菌分类学的发展做出应有贡献。与此同时,真菌分类学也面临着十分严峻的挑战。挑战主要来自3个方面,一是研究变得越来越综合,不但需要有相应的研究经费支持,而且要求从事该领域的研究人员技术更全面、知识更广博及知识更新速度更快捷;二是新物种描述进度偏慢,远远不能满足人们对物种认识和利用的日益增长的需要;三是研究人员亟需创新研究模式,以新技术、新思路、新机制来构建新的真菌分类学,加速新物种的发现和描述进度,最终为社会进步和科学发展服务。     

核糖体DNA的内转录间隔区序列标记在真菌分类鉴定中的应用

传统的真菌分类主要根据真菌菌株的形态特征、生长特性与生理生化指标进行,而分子生物学技术的发展提升了真菌分类鉴定研究的手段。真菌核糖体DNA内转录间隔区(ITS)在进化上比编码区快,种内的不同菌株之间高度保守,但在种间变化极大,故可为真菌学的研究提供丰富的遗传信息。简要综述了ITS序列分析技术在真菌分类鉴定中的应用现状、相关问题及前景。     

土壤真菌研究进展

综述了土壤真菌的研究简史、研究方法的发展、多样性和现代真菌分类技术在土壤真菌研究中的应用和发展等。     

白蚁共生真菌——蚁巢伞属研究概况

蚁巢伞属真菌是一类极具市场开发价值的野生食用真菌。本文对蚁巢伞属真菌的分类、与白蚁的共生关系、活性成分和作用、人工培养研究以及产生的相关木质纤维素降解酶类等方面进行综述,总结了近年来该属真菌的研究现状,指出了研究过程中出现的分类混乱、重名异名现象严重等问题,展望了未来有望开发菌丝体相关产品及深化出菇机制以逐步实现蚁巢伞人工栽培的研究方向,以期为未来的研究提供依据。     

虫霉真菌分类系统名录

虫霉真菌是低等真菌的重要成员,目前包含280余种,多为节肢动物的专性寄生真菌,少数腐生于土壤和枯枝落叶。本文在Humber发表的虫霉真菌分类框架上,结合近期发表的虫霉真菌分类单元,对该类真菌分类系统名录进行更新,介绍了1门、3纲、3目、10科和25属的分类学特征,并对当前虫霉真菌分类存在的问题进行了总结和展望。     

国家自然科学基金委员会生命科学部2002年度资助自由申请科学基金项目一览表

项 目 名称1 微生物学学科(80项)木本豆科植物根瘤菌分类和系统发育研究放线菌种分类单元及种内菌株的分子分类指征的评价我国酸性土壤中链霉菌的选择分离与快速鉴定稀有放线菌的系统分类中国西部荒漠地衣及其固沙生物学研究中国灵芝属分子系统学研究隔指孢属(D0c吲eff0 Grove)系统分类研究中国团毛菌目粘菌系统分类研究虫草属的遗传多样性与进化生物学研究滇黔桂喀斯特地区大型真菌区系调查与分类学研究拟青霉属真菌资源调查及其分类研究中国东部地区土壤中暗色丝孢菌属、种调查中国嗜热真菌分类研究北方保护地土壤真菌生物多样性的研究植…     

真菌系统学大趋势：越来越多的分类单元

分子生物学技术与真菌系统学的有机融合,为真菌分类和系统发育研究带来了革命性的变化。最近20年来,真菌学家们建立了大量的新目、新科、新属和新种,掀开了真菌多样性及其起源进化研究的新纪元,但很多重要的系统发育问题仍没有解决,特别是大量目间、科间的亲缘关系并不清楚。细分是真菌系统学的主流趋势,野生食用菌和毒蘑菇的分类也是如此,近年涌现了越来越多的新分类单元,如在2010-2019年的10年间,中国发表大型真菌（含地衣）新种1 240余个。本专刊收载的15篇论文是对我国野生食用菌和毒蘑菇研究工作的部分总结,对真菌资源利用、毒蘑菇中毒预防与治疗具有较重要的科学意义和应用价值。     

医学真菌分类与鉴定中的新热点：rRNA基因

真菌是自然界中一个大的生物类群,就医学真菌而言,如何确定其分类地位以及属,种等问题很多,传统分类法从形态表型出发,存在着一定的片面性,随着分子生物学技术的应用和发展,医学真菌方面已逐渐形成了以其因分析为基础的分类与鉴定系统,真核生物的rRNA基因结构的独特性使其在医学真菌的分类与鉴定中应用广泛,结合聚合酶链反应,随机扩增片段多态性,限制性酶切片多态性及核苷酸序列分析等技术,rRNA基因适合于各分类水平（各系发生、种内分型及种间鉴别）的研究。     

国际真菌分类委员会为系统真菌学工作者制定的实践守则

国际真菌分类委员会建议真菌学家在真菌(包括酵母菌)的系统学研究中坚持他们提出的15点建议(原文摘要中为14点建议,文内为15点建议,故译文将摘要改为15点建议——译者注),并把它们作为工作的实践守则。采用这个守则可以促进命名上的稳定性和达到真菌描述上的一致性(本文所说的“真菌描述”都是指真菌新分类群的发表——译者注)。     

药用杜仲树皮真菌群落的核心真菌组研究

微生物在生态系统中起着重要作用。最近的研究表明,微生物群落具有核心组(分类单元),这些类群对宿主的健康、生长和生产有着重要的影响。基于MetaCoMET与共存网络两种方法对采自湖南、四川和贵州的药用杜仲树皮真菌群落进行了核心真菌组分析。MetaCoMET结果显示,在OTU水平上,核心真菌组共有16个分类单元,优势菌是丛赤壳科一未定真菌,其次为Fusarium pseudensiforme、一种黄丝菌Cephalothecaceae sp.和一种镰刀菌Fusarium sp.等。共存网络分析揭示了11个中枢真菌分类单元。虽然两种方法的分析结果不完全吻合,但在11个中枢真菌上具有较好的一致性。整体而言,特定核心真菌组具有一定的稳定性。研究结果为进一步揭示植物微生物组的功能提供支撑。     

中国灵芝属真菌的多样性与资源

灵芝属是大型真菌的一个重要类群,具有重要的经济价值、生态价值和文化价值。尽管国内外对灵芝属真菌的研究较多,但灵芝属真菌的分类一直存在诸多问题,我国过去报道的灵芝属真菌有114个分类单元,但其中很多的分类地位存在争议。本文基于凭证标本,确认我国目前发现的灵芝种类有40种,其中具有ITS分子序列的种类有39种,其他74个分类单元或为同物异名或为待定种。本文提供的中国39种灵芝的ITS序列可为今后准确鉴定灵芝的野生和栽培种类提供依据。     

中国科学院真菌、地衣系统学重点实验室

中国科学院真菌、地衣系统学重点实验室是1985年成立的中国科学院第一批开放实验室之一,是我国唯一对真菌地衣进行全面的分类学和系统学研究的科研机构。实验室在我国生物多样性研究的基础上,开展真菌地衣重要类群的分类、系统和进化生物学研究,揭示真菌地衣的物种起源与演化的基本规律,真菌与其它生物间的相互作用和协同进化机制;同时开展真菌地衣资源储备和建立资源评价体系,为人口与健康、农业可持续发展和生态环境等国民经济建设作出贡献。     

食线虫真菌资源研究概况

食线虫真菌是指寄生、捕捉、定殖和毒害线虫的一类真菌,这类真菌是自然界中线虫种群控制的重要因子,也是动植物病害生物防治的重要研究材料,具有特殊的研究意义和经济价值。目前全世界共报道700余种食线虫真菌,包括捕食线虫真菌380余种,线虫内寄生真菌120余种,产毒真菌270余种和大量机会真菌。针对丰富的食线虫真菌资源,近年来世界各国尤其是中国科学家对其进行了广泛研究,在捕食线虫真菌资源的分类、系统进化、生态分布、有性无性联系等方面的研究取得了重要进展,在线虫内寄生真菌侵染宿主的方式及产毒真菌的次生代谢产物挖掘等方面也进行了广泛研究,文章综述了以上研究进展并简述了食线虫真菌资源的生物防治应用概况。     

巨孢囊霉目丛枝菌根真菌的分类研究进展

巨孢囊霉目(Gigasporales)真菌因其形态特征显著而被认为是较易归类和鉴定的一类丛枝菌根真菌(AMF)。近十余年来随着研究技术的进步,基于无性孢子形态特征而建立的AMF分类、鉴定方法得以不断补充和完善,也使得巨孢囊霉目真菌的系统分类一直处于不断变化和更新的状态。文中主要介绍了该目真菌基于形态特征的鉴定方法上的最新变化以及最新的分类系统,着重归纳已报道科、属、种分类特征,旨在为开展我国AMF资源调查、丰富其多样性提供便利。     

葡萄座腔菌科真菌的系统学和多样性探讨

葡萄座腔菌科的真菌是子囊菌中重要的代表性类群,是农林生态系统中重要的组成部分。该类真菌物种资源丰富、全型特征多样,包括许多具有重要经济价值和生态功能的类群,隶属子囊菌门(Ascomycota)果囊菌亚门(Pezizomycotina)座囊菌纲(Dothideomycetes)葡萄座腔菌目(Botryosphaeriales)。本文在概述葡萄座腔科真菌生态功能的基础上,回顾了一百年来该类真菌目、科、属和种各级分类单元的建立及其系统分类研究历史,重点评述以von ArxMüller和Barr提出的两大分类系统,总结了基于全型形态特征和多基因序列分析的现代分子系统学研究现状。虽然该类群的分类系统日趋完善,但中国的相关研究存在资源挖掘不够深入、研究的系统性不足等问题。主要针对资源挖掘必要性、分类依据科学性、物种特征全息化等几个方面存在的问题进行了分析和讨论,并对未来研究方向进行展望,以期为该类真菌的深入研究与开发利用提供科学依据。     

分子系统学在真菌分类命名中的应用与进展

真菌分子系统学以分子生物学、遗传学和生物信息学为手段,以分子水平对真菌进行种属识别,与传统的表型分类系统相比,更为可靠、高效,极大地推动了真菌分类学的发展。因此,真菌分类学正处于一个划时代的转变时期,即由表型分类向基因型分类的转变,以形态学为基础的种属概念向以分子系统学为基础的种属概念转变。综合论述了分子系统学在真菌分类和命名中的应用,并介绍近年来真菌分类和命名方面的变化和进展,供国内科研和临床工作者参考。