两种PCR方法对检测A组轮状病毒膜芯片杂交结果的影响

A组轮状病毒(rotavirus,RV)是导致拿世界婴幼儿腹泻的最主要病原,危害巨大。拟用RT-巢式PCR技术对A组RV的保守序列进行高度扩增,通过固本室内制的膜芯片杂交,实现对该病毒的检测。分别采用对称PCR和不对称PCR扩增,均可得到扩增的目的片段．对称式扩增产物杂交结果不理想。而不对称式扩增得到了大量待检单链产物,同膜芯片杂交获得了理想的杂交结果。显著地提高了对A组RV杂交检测的灵敏度。表明不对称式PCR扩增是一种制备用于芯片杂交大量单链产物的理想方法,尤其是针对富含AT的核酸检测区域。     

检测A组轮状病毒的微阵列技术初探

采用荧光染料TAMRA标记上游引物,经RT semi nestedPCR扩增A组轮状病毒的保守区域,并将扩增产物与自行研制的玻片微阵列进行杂交。经杂交信号扫描分析,可简便快速地检出A组轮状病毒,并能达到高灵敏性,为下步进入临床打下了基础。     

A组轮状病毒实时定量PCR检测方法的研究进展

A组轮状病毒是引起婴幼儿急性肠胃炎的最主要病原之一。目前已建立的轮状病毒检测方法有电镜检测、酶免疫法、反转录PCR法、实时定量PCR法。实时定量PCR法与其他方法相比具有特异性强、敏感度高、可以分型、定量准确等优势。本文就实时定量(Real-time)PCR技术应用于A组RV检测的研究进展进行简单概述。     

A组轮状病毒相关受体的研究进展

轮状病毒(Rotavirus,RV)是导致人类和动物病毒性腹泻的重要病原体,其中A组RV是导致全球5岁以下婴幼儿腹泻的主要病原体。RV感染宿主细胞的第一步是病毒与细胞表面的受体结合,介导病毒颗粒进入细胞内。因此,研究RV病毒受体对于揭示RV的致病和免疫机理具有重要价值。对近年来发现的A组RV受体及其作用的研究进展进行了综述。     

腹泻患儿粪便A群轮状病毒抗原检测的结果分析

目的:了解本地区腹泻婴幼儿的A群轮状病毒感染情况及其流行特点。方法:采用胶体金法对我院2009年10月-2010年9月2104例有腹泻和肠炎特征的婴幼儿粪便进行A群轮状病毒抗原检测。结果:在2104例受检者中,A群轮状病毒感染的总阳性率是24.71%,其中男性感染率24.17%,女性为25.40%。不同年龄组间以1-2岁婴幼儿感染率最高,为32.13%,0-1岁为20.72%,2-5岁为12.03%。感染的季节特征是秋末冬初季(10-12月)阳性率最高,为42.82%,春末夏初季(4-6月)最低,为8.81%。结论:由A群轮状病毒感染引发的急性腹泻主要发生在1-2岁的婴幼儿,各个季节均有发生,以秋末冬初季为高发。     

腹泻患儿粪便A群轮状病毒抗原检测的结果分析

目的：了解本地区腹泻婴幼儿的A群轮状病毒感染情况及其流行特点。方法：采用胶体金法对我院2009年10月-2010年9月2104例有腹泻和肠炎特征的婴幼儿粪便进行A群轮状病毒抗原检测。结果：在2104例受检者中,A群轮状病毒感染的总阳性率是24．71％,其中男性感染率24．17％,女性为25．40％。不同年龄组间以1—2岁婴幼儿感染率最高,为32．13％,0-1岁为20．72％,2-5岁为12．03％。感染的季节特征是秋末冬初季（10—12月）阳性率最高,为42．82％,春末夏初季（4．6月）最低,为8．81％。结论：由A群轮状病毒感染引发的急性腹泻主要发生在1-2岁的婴幼儿,各个季节均有发生,以秋末冬初季为高发。     

三种检测婴幼儿腹泻A组轮状病毒的方法学评价

目的对婴幼儿腹泻A组轮状病毒的三种不同检测方法进行评价。方法同时采用胶体金、琼脂糖凝胶电泳、逆转录PCR（RT-PCR）对浙江萧山医院1周320份腹泻患儿的标本进行轮状病毒检测,然后进行方法学比较。结果三种方法的阳性检出率分别为36．3％、48．1％和42．8％,经卡方检验三种方法的检出率之间差异均存在统计学意义（P〈0．05）;以琼脂糖凝胶电泳为检测的最终标准,RT-PCR的敏感性为88．9％,特异性达100％;胶体金法的敏感性71．4％,特异性达96．4％。结论胶体金法检测轮状病毒的敏感性和特异性能够满足临床上对轮状病毒快速筛检的要求;PT-PCR法的敏感性和特异性均最高,既可用于临床检测,又是轮状病毒血清G、基因P分型的重要手段,在对无菌体液和环境样本中轮状病毒的检测具有不可比拟的优势。     

2019—2022年珠海市腹泻患者A组轮状病毒感染的流行病学分析

为分析珠海市腹泻人群中A组轮状病毒（RVA）检出情况与患者性别、年龄及感染时间的相关性,收集珠海市妇幼保健院2019年1月至2022年12月腹泻患者粪便样本,采用抗原试剂盒检测RVA抗原,对其结果应用SPSS 20.0软件进行统计学分析。在收集的11 385例样本中,RVA总检出率为9.170%(1 044/11 385),性别分布无统计学差异（P>0.05）。各年龄段均检出RVA,29 d～<1岁婴儿的RVA阳性率最高,为9.962%(369/3 704),显著高于6～<12岁学龄期儿童、≥18岁成年人（P<0.01）,6岁以下儿童各年龄间RVA阳性率无统计学差异（P>0.05）。RVA感染全年均有发生,从月份看,2月阳性率最高,为15.456%(117/757),显著高于除1月、3月、5月的其他月份（P<0.01）;从季节看,春季阳性率最高,为11.666%(341/2 923),显著高于夏季和秋季（P<0.01）。研究表明,2019―2022年珠海地区RVA感染呈明显的季节性和人群分布特征,应在晚冬、初春季节加强对6岁以下儿童的重点防控。...     

A组轮状病毒可视化RT-LAMP方法的建立

【目的】建立一种利用颜色判定的快速、简单、灵敏度高的检测方法,即可视化的逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)方法,并应用于人A组轮状病毒的基因检测。【方法】针对A组轮状病毒VP6基因的6个保守区域设计4条特异性引物,在64 °C恒温条件下进行核酸扩增反应1 h,在扩增前加入染料钙黄绿素(Calcein)作为反应指示剂,以钙黄绿素的颜色变化作为结果判定标准。评价该方法的特异性和灵敏度,并同时利用RT-LAMP和RT-PCR两种方法对90份临床腹泻样本中的病毒核酸进行检测。【结果】RT-LAMP方法特异性较高,灵敏度可以达到103 copies/μL RNA分子水平,比RT-PCR高出100倍。对临床标本的检出率与RT-PCR方法相当。【结论】建立的RT-LAMP法灵敏度较高,特异性强,节省时间,结果可视化,具有野外检测和现场快速检测的潜力。     

A组人轮状病毒全基因组克隆和基因型分析

运用基因克隆和重组技术,从一急性胃肠炎患儿样品中克隆到一株轮状病毒（RV）全基因组cDNA。核苷酸序列测定结果表明,该株RV基因组11条RNA共含有18613个核苷酸（3302bp—751bp）,编码5791个氨基酸。全基因组研究结果表明,该株RV（TB-Chen）为A组,II亚组,基因型为G2P[4]/NSP4[A]。这是首个A组人RV全基因组研究结果的报道,对研究和开发RV疫苗具有积极的意义。     

An Occurrence of Diarrheal Cases Associated with Group C Rotavirus in Adults

Six of the 23 college students who joined a group trip in February of 1991 developed acute nonbacterial gastroenteritis with severe diarrhea. The causal agent was identified as group C rotaviruses by electron microscopy (EM), immune-EM (IEM) and the molecular examinations including polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and polymerase chain reaction (PCR) on virus particles detected in the extract of watery fecal specimens of the patients. The patients positive for virus isolation showed significant increase in IEM antibody to the isolated virus in their paired sera. These findings suggest that the group C rotavirus is an important etiological agent of diarrhea and may also cause serious food-borne diarrheal disease in adults.     

在中国卢龙县发现G5型人A组轮状病毒

轮状病毒是引起我国儿童重症腹泻的主要病原。按照WHO轮状病毒监测方案,对2003年间河北省卢龙县开展了以医院和社区为基础的小于5岁儿童轮状病毒腹泻的监测,发现一株新型轮状病毒。该病毒用传统分型引物(G1、G2、G3、G4)扩增不出条带,对其VP7基因全序列测定和分析后确定该毒株为G5型。这是我们在亚洲首次发现的人类G5型轮状病毒。该毒株与猪的G5型C134毒株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为88·6%和95·4%,与非洲发现的人的G5型毒株MRC3105核苷酸和氨基酸的同源性为89·9%和94%,与巴西发现的IAL-28毒株核苷酸和氨基酸的同源性为87·2%和93·3%。系统发生树分析表明:卢龙毒株LL36755与其他已经报告的两种猪和一种人类的G5型毒株可能具有相同的起源。这是人轮状病毒G5型首次在亚洲国家发现,而且该毒株可能是由人类轮状病毒与动物轮状病毒毒株自然重组产生。     

Expression and Immunoreactivity of a Human Group A Rotavirus Vp4

Rotavirus capsid protein Vp4 plays an important role in the virus adhering and entering the cells. In this study, a Vp4 gene cloned from a rotavirus strain TB-Chen was highly expressed in E.coli BL21 (DE3). The results of the Western blot showed that the protein possesses specific immuno-reactivities and can be specifically recognized by guinea pig antibodies against rotavirus strain SA11 or Wa. Some Vp4 dimers were formed during renaturation. These data obtained from this study provide a strong basis for further study on the structure and function of the Vp4.     

口蹄疫等5种动物病毒基因芯片检测技术的研究

用分子克隆方法获得口蹄疫病毒、水泡性口炎病毒、蓝舌病病毒、鹿流行性出血热病毒和赤羽病病毒各一段高度保守的基因片段,用芯片点样仪点样到包被过的玻璃片上,制备成检测芯片。提取样品中的RNA,进行反转录和荧光标记后滴加到芯片上进行特异性杂交,对杂交结果进行扫描检测,可同时诊断上述5种动物传染病,此方法不但快速、准确、敏感,而且可同时进行多种病毒的检测,达到大批动物高通量检疫的目的。     

A群脑膜炎球菌多糖菌苗固体总量试验

本试验采用５０℃干烤法在不同实验条件下对Ａ群脑膜炎球菌多糖菌苗的固体总量进行了测定,并对其结果进行了比较。实验结果表明：（１）１ｍ１,２ｍｌ和４ｍ１取样量的固体总量之间无显著性差异。（２）采用２ｍｌ取样量用不同规格称量瓶和不同规格吸管对测定结果无明显影响。（３）采用１ｍ１、２ｍｌ和４ｍｌ取样量试验结果重复性均好。但从标准差及变异系数看,取样２ｍｌ或４ｍｌ者,试验误差更小,结果更为准确。