少孢节丛孢DNA随机扩增多态性及变种分析

本文对少孢节丛孢的１０个菌株进行了随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析。４个随机引物获得的ＲＡＰＤ谱带清晰并呈多态性,单个引物获得的ＲＡＰＤ片段数在２～１３个之间。供试的１０个菌株来自不同的地方,形态差异较大,但四个随机引物的扩增结果基本上都体现了少孢节丛孢种的特征“指纹”。基于遗传距离分析和应用ＵＰＧＭＡ方法构建的分子系统树显示,少孢节丛孢不同地理群体间不存在遗传分化,提示ＲＡＰＤ在少孢节丛孢群体中没有显著的地区特异性。结果表明,根据分生孢子的大小将少孢节丛孢划分为三个变种的观点不能成立,而附属丝在少孢节从抱形态分类上没有意义。     

弯孢节丛孢和厚皮单顶孢菌株的RAPD分析

对来自不同地方的７个弯孢节丛孢（Ａｒｔｈｒｏｂｏｔｒｙｓ ｍｕｓｉｆｏｒｍｉｓ Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒ）的９个厚皮单顶孢（Ｍｏｎａｃｒｏｓｐｏｒｉｕｍ ｅｕｄｅｒｍａｔｕｍ（Ｄｒｅｃｈｓｌｅｒ）Ｓｕｂｒａｍ）标准菌株用４个随机引物（ＯＶＷ－１８,ＯＰＷ－１６,ＯＰＭ－１,ＯＰＫ－１９）进行了随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析。扩增谱带聚类分析结果不能将弯孢节丛孢和厚皮单顶孢的菌株分开,具有附属丝的菌     

弯孢节丛孢和厚皮单顶孢菌株的RAPD分析

对来自不同地方的7个弯孢节丛孢（ArthrobotrysmusiformisDrechsler）和9个厚皮单顶孢（Monacrosporiumeudermatum（Drechsler）Subram）标准菌株用4个随机引物（OPW-18、OPW－16、OPM-1、OPK-19）进行了随机扩增多态性DNA（RAPD）分析。扩增谱带聚类分析结果不能将弯孢节丛孢和厚皮单顶孢的菌株分开,具有附属丝的菌株没有被聚在一起,菌株间地理起源上的亲缘关系也没有体现,证明RAPD分析不能作为节丛孢属和单顶孢属的属间鉴别分析,附属丝地捕食线虫真菌不具分类学意义,不能以之作为成立小掘氏霉属的证据,系统聚类关系与地理来源基质也没有相关性。     

节丛孢属rDNA ITS区RFLPs分析

利用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法对捕食线虫真菌节丛孢属进行了系统发育研究。以ＩＴＳ１和ＩＴＳ４为引物对该属１０种１２个菌株的核糖体ＤＮＡ转录间区（ＩＴＳ）进行了ＰＣＲ扩增,４种内切酶（ＡｌｕⅠ、ＨａｅⅢ、ＨｐａⅡ、ＴａｑⅠ）酶切。结果表明该属的ＩＴＳ区长度没有明显差异,其长度范围在６５８－７０５之间,酶切图谱能体现不同种间的多态性,根据４种内切酶酶切结果,利用ＵＰＧＭＡ法构建的节丛孢属分子系统树,基于体现     

滇西北地区冬虫夏草和阔孢虫草的遗传分化研究

应用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术对来自云南西北部高黎贡山和丽江玉龙雪山的６个冬虫夏草Ｃｏｒｄｙｃｅｐｓ ｓｉｎｅｎｓｉｓ（Ｂｅｒｋ．）Ｓａｃｃ．,来自德钦地区三个地方的８个阔孢虫草Ｃ．ｃｒａｓｓｉｓｐｏｒａ Ｚａｎｇ,Ｙａｎｇ ｅｔ Ｌｉ以及来自云南昆明的一个蛹虫草Ｃ．ｍｉｌｉｔａｒｉｓ （Ｖｕｉｌｌ）Ｆｒ．进行分析。１８个随机引物获得的ＲＡＰＤ谱带清晰并呈现多态。遗传距离分析表明,冬虫夏     

澳大利亚棉花黄萎病菌DNA多态性及其地理分布相关性研究

应用ＲＡＰＤ技术对澳大利亚东南部八个主要棉花种植区的９９个棉花黄萎病菌菌株进行了ＤＮＡ多态性分析。结果表明用１０个筛选的随机引物对供试菌株的全基因组ＤＮＡ扩增,共获得９２条ＲＡＰＤ谱带,其中５５．４％的谱带为多态带。经类聚分析,供试菌株类聚为１５个ＲＡＰＤ遗传指纹相似组,其中１０个指纹相似组的菌株与其采集区域有明显相关性,其余５个指纹相似组的菌株为普通分布的指纹类型。     

澳大利亚棉花黄萎病菌DNA多态性及其地理分布相关性研究(英文)

应用ＲＡＰＤ技术对澳大利亚东南部八个主要棉花种植区的９９个棉花黄萎病菌菌株进行了ＤＮＡ多态性分析。结果表明用１０个筛选的随机引物对供试菌株的全基因组ＤＮＡ扩增,共获得９２条ＲＡＰＤ谱带,其中５５．４％的谱带为多态带。经类聚分析,供试菌株类聚为１５个ＲＡＰＤ遗传指纹相似组,其中１０个指纹相似组的菌株与其采集区域有明显相关性,其余５个指纹相似组的菌株为普通分布的指纹类型。     

冬虫夏草的随机扩增多态DNA及其遗传分化

本文对来自青藏高原３个区域５个具有代表性地方的１３个冬虫夏草样本进行随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析。１９个随机引物获得的ＲＡＰＤ谱带清晰并呈现多态,单个引物获得的ＲＡＰＤ片段数在３￣１０个之间。该１９个引物在每个样本中扩增的ＲＡＰＤ片段总数平均约为６５个。基于遗传距离分析,受试的１３个冬虫夏草样本中,来自同一地方的样本间遗传差异甚微,同一区域不同地方的样本间遗传差异较大,不同区域的样本间遗传差     

大豆灰斑病菌生理小种的RAPD标记

运用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲａｎｄｏｍａｍｐｌｉｆｉｅｄｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃＤＮＡ,ＲＡＰＤ）技术对发生于中国东北的大豆灰斑病菌（Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍｓｏｊｉｍｕｍ）的１０个生理小种进行基因组ＤＮＡ多态性分析,用１３个１０－核苷酸随机引物获得了１１１个ＲＡＰＤ标记,其中８６．５％具有多态性,通过聚类分析确定了供试小种间的亲缘关系,试验证明,ＲＡＰＤ技术分析大豆灰斑病菌遗传传变异可提供大量     

中国棉花枯萎菌生理小种的RAPD分析

利用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分子标记方法对我国棉花枯萎菌３个生理小种（３、７、８号）进行遗传多样性分析,以筛选出的１０个随机引物对采自我国１１个省（自治区）的２６个代表菌株及国外３个不同生理小种对照菌株进行ＲＡＰＤ－ＰＣＲ扩增,共产生了１４０个ＲＡＰＤ分子标记,其中８７．８％具有多态性。通过聚类分析确定了供试小种间的亲缘关系,并寻找到了我国３、７、８号小种的特异条带,为确立我国棉花枯萎菌生     

鹅膏菌属真菌RAPD分析及亲缘关系的研究

本文对采自湖南莽山的２６种鹅膏菌属（Ａｍａｎｉｔａ）真菌进行了随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析,４０个随机引物中筛选出扩增效果较好的６个引物,每个引物能产生１～１０条ＤＮＡ条带,获得的ＲＡＰＤ谱带清晰并呈现多态性ＯＰＧ１５、ＯＰＨ０４两个引物扩增的ＲＡＰＤ谱带能将２６种鹅膏菌完全区分开来,通过６个引物的ＲＡＰＤ分析获得的平均相似性系数表明种与种之间的相关系数在２０－６０％之间,平均链锁聚类分析     

澳大利亚棉花黄萎病菌DNA多态性及其地理分布相关性研究

应用ＲＡＰＤ技术对澳大利亚东南部八个主要棉花种植区的９９个棉花花萎病菌菌株进行了ＤＮＡ多态性分析。结果表明用１０个筛选的随机引物对供试菌株的全基因组ＤＮＡ扩增,共获得９２条谱带,其中５５．４％的谱带为多态速,经类聚分析,供试菌株类聚为１５个ＲＡＰＤ遗传指纹相似组,其中１０个指纹相似组的菌株与其采集区域有明显相关性,其余５个指纹相似组的菌株为普通分布的指纹类型。     

烟草黑胫病菌株亲缘关系的RAPD分析

从２２０个ＲＡＰＤ（Ｒａｎｄｏｍ Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ＤＮＡｓ）随机引物中所选出的多态扩增性强的２１个引物对来源不同的３３个烟草黑胫病菌株进行全基因组ＤＮＡ遗传多样性分析和指纹构建。选用引物对受试菌株进行ＲＡＰＤ－ＰＣＲ扩增,共产生２４３条ＤＮＡ标记图带,其中１９１条为多态性图带,多态检测率为７８．６％。利用ＵＰＧＭＡ（Ｕｎｗｅｉｇｔｈｔｅｄ Ｐａｉｒ－ｇｒｏｕｐ Ｍｅｔｈ     

中国棉花枯萎菌生理小种的RAPD分析*

利用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分子标记方法对我国棉花枯萎菌３个生理小种（３、７、８号）进行遗传多样性分析,以筛选出的１０个随机引物对采自我国１１个省（自治区）的２６个代表菌株及国外３个不同生理小种对照菌株进行ＲＡＰＤ－ＰＣＲ增,共产生了１４０个ＲＡＰＤ分子标记,其中８７．８％具有多态性。通过聚类分析确定了供试小种间的亲缘关系,并寻找到了我国３、７、８号小种的特异条带,为确立我国棉花枯萎菌生理小种在国际上的分类地位提供了可靠的分子证据。     

利用RAPD技术对木耳属菌株进行分类鉴定的研究*

利用ＲＡＰＤ技术对木耳属不同种和种内不同菌株进行了分子鉴定。结果表明,在供试的２６个随机引物中,有１０个引物可扩增出清晰、稳定的ＤＮＡ带型,其中引物Ｓ４和Ｓ６与供试木耳属菌株的基因组ＤＮＡ结合位点少而保守,扩增图谱具有种的特异性,可用于种的快速准确鉴定;其综随机引物的扩增ＤＮＡ多态性较强,可用于种内不同菌株的鉴定;聚类分析表明,在７５％相似水平下,可将供试的木耳属菌株分成四大类,其中有三大类各代表一个形态鉴定的种。研究结果表明了ＲＡＰＤ技术可有效地用于木耳属种或菌株的快速准确鉴定。     

中国棉花枯萎菌生理小种的RAPD分析

利用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分子标记方法对我国棉花枯萎菌３个生理小种（３、７、８号）进行遗传多样性分析,以筛选出的１０个随机引物对采自我国１１个省（自治区）的２６个代表菌株及国外３个不同生理小种对照菌株进行ＲＡＰＤ－ＰＣＲ增,共产生了１４０个ＲＡＰＤ分子标记,其中８７．８％具有多态性。通过聚类分析确定了供试小种间的亲缘关系,并寻找到了我国３、７、８号小种的特异条带,为确立我国棉花枯萎菌生理小种在国际上的分类地位提供了可靠的分子证据。     

利用RAPD技术对木耳属菌株进行分类鉴定的研究

利用ＲＡＰＤ技术对木耳属不同种和种内不同菌株进行了分子鉴定。结果表明,在供试的２６个随机引物中,有１０个引物可扩增出清晰、稳定的ＤＮＡ带型,其中引物Ｓ４和Ｓ６与供试木耳属菌株的基因组ＤＮＡ结合位点少而保守,扩增图谱具有种的特异性,可用于种的快速准确鉴定;其综随机引物的扩增ＤＮＡ多态性较强,可用于种内不同菌株的鉴定;聚类分析表明,在７５％相似水平下,可将供试的木耳属菌株分成四大类,其中有三大类各代表一个形态鉴定的种。研究结果表明了ＲＡＰＤ技术可有效地用于木耳属种或菌株的快速准确鉴定。     

应用RAPD技术分析奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼的基因多态性(英文)

以随机扩增多态ＤＮＡ技术（ＲＡＰＤ）分析了奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼两个养殖群体的群体内及群体间遗传关系,并探讨了该技术在种群鉴定中的应用。ＲＡＰＤ引物筛选结果表明,所测试的２０个随机引物中（Ｔａｂｌｅ　１）,除一个引物未扩增出任何片段外,其余１９个引物均扩增出１～１１个大小不等的片段,长度大部分在５００～３０００ｂｐ之间,共扩增出２２０个片段,平均每个引物产生５．５个片段。两群体间共有片段７０条,大部分引物的扩增产物具有种间多态性,种群间相似系数为０．７２７。以筛选的引物对两种群不同个体（Ｆｉｇ．１,Ｔａｂｌｅ２）及种群混合样品（Ｆｉｇ．２,Ｔａｂｌｅ３）进行ＲＡＰＤ分析。结果表明,不同引物在扩增图谱上表现很大差异。奥利亚罗非鱼不同个体间表现为一致的扩增图谱,种内相似系数达１０００,显示了其种群内遗传变异的缺乏;尼罗罗非鱼种内相似系数为０．８２７,个体间存在不同程度的多态性;两个种群间的相似系数分别为０．７６７和０．７４２,表明种间有较高的同源性,遗传距离为０．２３５,略低于国外的报道、此外,两个养殖群体间的扩增图谱比较也暗示了遗传渐渗现象的存在。实验表明,ＲＡＰＤ标记可以作为一种可靠的遗传标记,用于不同鱼     

鹅膏菌属真菌RAPD分析及亲缘关系的研究

本文对采自湖南莽山的２６种鹅膏菌属（Ａｍａｎｉｔａ）真菌进行了随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析,４０个随机引物中筛选出扩增效果较好的６个引物,每个引物能产生１～１０条ＤＮＡ条带,获得的ＲＡＰＤ谱带清晰并呈现多态性ＯＰＧ１５、ＯＰＨ０４两个引物扩增的ＲＡＰＤ谱带能将２６种鹅膏菌完全区分开来,通过６个引物的ＲＡＰＤ分析获得的平均相似性系数表明种与种之间的相关系数在２０－６０％之间,平均链锁聚类分析可将２６种鹅膏菌分为二大类,且一些具菌环和苞状菌托的种类聚在一起,与形态分类基本相吻合。     

烟草黑胫病菌株亲缘关系的RAPD分析

从２２０个ＲＡＰＤ（ＲａｎｄｏｍＡｍｐｌｉｆｉｅｄＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ　ＤＮＡｓ）随机引物中所选出的多态扩增性强的２１个引物对来源不同的刀个烟草黑胫病菌株进行全基因组ＤＮＡ遗传多样性分析和指纹构建。选用引物对受试菌株进行ＲＡＰＤ－ＰＣＲ扩增,共产生２４３条ＤＮＡ标记图带,其中１９１条为多态性图带,多态检测率为７８．６％。利用ＵＰＧＭＡ（ＵｎｗｅｉｇｔｈｔｅＰａｉｒ－ｇｒｏｕｐ　ＭｅｔｈｏｄＷｉｔｈＡｒｉｔｈｍｅｔｉｃ　Ａｖｅｒａｇｅ）软件对受试菌株间的遗传距离进行聚类分析构建系统树状图,受试对个菌株被划分为５个遗传聚类组即（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ）。结果证明供试菌株具有丰富的遗传多样性,虽各自的遗传背景差异显著,但其亲缘关系相近,遗传聚类组的划分与菌株的地理来源未有明显的相关性。