同时抽提DNA和RNA的简便方法

同时抽提ＤＮＡ和ＲＮＡ的简便方法刘定干（中国科学院上海生物化学研究所,２０００３１）关键词ＤＮＡＲＮＡ抽提在研究工作中,常同时需要培养细胞的ＤＮＡ和ＲＮＡ,从同一样品中同时提取ＤＮＡ和ＲＮＡ。目前,已有好几种同时抽提ＤＮＡ和ＲＮＡ的方法［１～４］。作...     

安捷伦科技与Caliper科技联合推出最新型的RNA6000Pico芯片实验室试剂盒辅助癌症研究

该芯片实验室试剂盒可用于微量采样的ＲＮＡ分析以及极少量ＲＮＡ样品的完整性分析全球领先的跨国高科技公司安捷伦科技 (ＮＹＳＥ :Ａ)和Ｃａｌｉｐｅｒ科技公司 2 0 0 2年 12月宣布推出名为ＲＮＡ 6 0 0 0Ｐｉｃｏ的芯片实验室试剂盒 ,用于总ＲＮＡ和信使ＲＮＡ样品的自动质量控制分析。同ＲＮＡ 6 0 0 0Ｎａｎｏ芯片试剂盒相比 ,ＲＮＡ 6 0 0 0Ｐｉｃｏ灵敏度提高了 2 5倍 ,因而在临床微量采样技术的样品分析中非常有用 ,比如在癌症研究中 ,可用于比较肿瘤组织与相邻组织的基因表达差异。虽然现在的研究手段能够成功地分离单个细胞 ,并从…     

小量快速RNA,DNA提取研究耐药株中GSTЛ及癌基因的表达

本文采用一种小量快速ＲＮＡ制备法（硫氰酸胍－酚,氯仿／异尤戊醇－液氮）和ＤＮＡ－ＲＮＡ联合提取法（硫氰酸胍－酚,氯仿／异戊醇－液氮法）,提取ＲＮＡ和同一样本中ＤＮＡ与ＲＮＡ,同时采用一种快速液相杂交法,通过标记探针与样品ＤＮＡ或ＲＮＡ经变性－复性杂交,凝胶电泳,凝胶抽干,放射自显影。经用本法研究Ｐ３８８／ＡＤＲ耐药株中的ＧＳＴπ及三种癌基因表达表明：耐药株中的ＧＳＴπ较敏感株增加１．５６倍（ｐ＜０     

HCV RNA的检测方法简介

本文讨论了检测丙型肝炎病毒核糖核酸（ＨＣＶＲＮＡ）的样本来源和处理,引物的设计,合成和选择等问题;重点介绍了蛋白酶Ｋ消化法,聚乙二醇沉淀法,异硫氰酸胍一步法,硅凝胶提取法和直接捕获法提取ＨＣＶ　ＲＮＡ的５种方法,以及一步ＰＣＲ法,常规ＲＴ－巢式ＰＣＲ,直接ＲＴ－巢式ＰＣＲ,化学修饰的ＲＴ－巢式ＰＣＲ,联合ＰＣＲ,双温ＰＣＲ和定量竞争性ＰＣＲ等７种ＰＣＲ方法检测ＨＣＶ　ＲＮＡ,用ＰＣＲ检测ＨＣＶ　ＲＮＡ方法的标准化以及检测ＨＣＶＲＮＡ具有非常重要的意义。本文还介绍了一种新型的定量方法－ｂＤＮＡ信号放大技术检测ＨｃＶＲＮＡ。     

新证据支持“RNA世界”假说

纽约国立大学的ＨｉｒｏａｋｉＳｕｇａ及其同事改变了一种ＲＮＡ ,这种修饰ＲＮＡ能独立执行正常时需要在蛋白质帮助下才能执行的功能。他们将此研究工作发表在 2 0 0 1年 4月 2日的ＥＭＢＯＪ上 ,该工作支持了生物界“ＲＮＡ世界”这一假说。在ＲＮＡ世界中 ,ＲＮＡ分子自行装配并自身复制 ,而象独立的生活物质那样活动。“ＲＮＡ世界”的概念是 1986年哈佛大学分子进化学家ＷａｌｔｅｒＧｅｌｂｅｒｔ提出来的。现在Ｓｕｇａ及共同事还证明有一种有类似酶的活性的ＲＮＡ甚至能催化氨基酸与ｔＲＮＡ相结合 ,他们运用一种试管进化的方法进…     

一种简易RNA甲醛—琼脂糖凝胶变性电泳

构建ｃＤＮＡ文库 ,进行Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交分析以及ＲＴ ＰＣＲ等分子生物学研究 ,都需要纯度高、完整性好的ＲＮＡ。鉴定ＲＮＡ的完整性通常需要进行甲醛 琼脂糖凝胶电泳。然而 ,传统的甲醛 琼脂糖凝胶电泳操作步骤繁杂[1 ] ,本文提出一种改进的甲醛 琼脂糖凝胶电泳 ,不仅简化了操作 ,而且效果很好。我们以向日葵总ＲＮＡ和ｍＲＮＡ甲醛 琼脂糖凝胶电泳为例 ,对这一方法进行介绍。1　材料与方法1.1　总ＲＮＡ的提取及ｍＲＮＡ的分离取向日葵花蕾 1ｇ ,按照改进的异硫氰酸胍法提取向日葵总ＲＮＡ[2 ] 。利用磁珠法分离ｍＲＮＡ[3] 。…     

HCVRNA反转录PCR技术的建立及对血液样品的检测

实验建立了ＨＣＶ　ＲＮＡ的反转录和套式ＰＣＲ技术,扩增出２３２ｂｐ的核酸片段,经酶切电泳图谱和Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交鉴定,来自ＨＣＶ基因５,端非编码区。实验从抗ＨＣＶ阳性的１８例血浆样品和１９例血清样品中分别检出７例和１３例ＨＣＶＲＮＡ阳性。     

雀麦花叶病毒缺陷型RNA_（3b）的研究

采用ＰＥＧ沉淀和差速离心的方法提纯雀麦花叶病毒的Ｇ和Ｔ分离物。利用蛋白酶Ｋ和两相酚法制备雀麦花叶病毒的总ＲＮＡｓ。将Ｇ和Ｔ分离物ＲＮＡｓ进行琼脂糖凝胶电泳,结果发现Ｂｒ－ＭＶ－Ｇ除含有正常的ＲＮＡ组分外,还出现了另一新的ＲＮＡ＿（３ｂ）组分,其分子量为０．５０×１０￣６。ＲＮＡ＿（３ｂ）只出现在大麦寄主中,而在昆诺基上缺失。ＲＮＡ＿（３ｂ）仅依靠于其来源的Ｇ分离物的ＲＮＡｓ进行复制。以ＲＮＡ＿（３ｂ）为模板合成￣（３２）Ｐ－ｃＤＮＡ探针,和ＢｒＭＶ－Ｇ分离物的ＲＮＡｓ进行分子杂交试验表明：ＲＮＡ＿（３ｂ）属ＲＮＡ＿３的缺陷型组分,它依赖于ＢｒＭＶ－Ｇ－ＲＮＡ＿３的帮助才能在大麦寄主中复制。ＲＮＡ＿（３ｂ）的出现和缺失对ＢｒＭＶ的症状表现没有影响。     

一种改进的甲醛—琼脂糖凝胶电泳

构建ｃＤＮＡ文库,进行Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交分析以及ＲＴ－ＰＣＲ等分子生物学研究,都需要纯度高、完整性好的ＲＮＡ。鉴定ＲＮＡ的完整性通常需要进行甲醛－琼脂糖凝胶电泳。然而,传统的甲醛－琼脂糖凝胶电泳操作步骤繁杂［１］,本文提出一种改进的甲醛－琼脂糖凝胶电泳,不仅简化了操作,而且效果很好。我们以向日葵总ＲＮＡ和ｃＤＮＡ甲醛－琼脂糖凝胶电泳为例,对这一方法进行介绍。１ 材料与方法１．１ 总ＲＮＡ的提取及ｍＲＮＡ的分离：取向日葵花蕾１ｇ,按照改进的异硫氰酸胍法提取向日葵总ＲＮＡ［２］。利用磁珠法分离ｍＲ－…     

RNA聚合酶Ⅲ启动子的结构与功能

ＲＮＡ聚合酶Ⅲ (ｐｏｌⅢ )是真核生物催化合成ｔＲＮＡ和 5ＳｒＲＮＡ及一些核小ＲＮＡ和胞质ＲＮＡ必需的酶。ＲＮＡ聚合酶Ⅲ能够识别ｔＲＮＡ基因中一些高度保守的特征性ＤＮＡ序列而启动下游ＤＮＡ的转录 ,这些序列称为ＲＮＡ聚合酶Ⅲ启动子。ＲＮＡ聚合酶Ⅲ启动子不仅广泛存在于真核细胞中ｔＲＮＡ、Ｕ6核小ＲＮＡ(ＳＮＲ6 )等的基因中 ,也是病毒催化合成一些小片段ＲＮＡ如腺病毒ＶＡＲＮＡ所必需的。ＲＮＡ聚合酶Ⅲ启动子因其能在体内外高效快速地转录某些小片段基因 ,已被人们广泛地应用于核酶和反义ＲＮＡ技术中 ,在众多的ＲＮＡ…     

RNA编辑

ＲＮＡ 一种基因转录产物所包含的信息在转录中或转录后被改变的过程,从某种意义上是对中心法则的一种扩展。本文以Ｋｉｎｅｔｏｐｌａｓｉｄ线粒体ＲＮＡ为例,对ＲＮＡ编辑反应的基本过程是反应模型进行了综述,并对可能参与编辑反应的反式因子及ＲＮＡ编辑反应类型与进化意义作了简要介绍。     

丙型肝炎病毒RNA打点杂交检测方法同RT－PCR方法的比较

采用ＨＣＶ基因组结构区Ｃ区ｃＤＮＡ探针和非结构区ＮＳ３－４区ｃＤＮＡ探针,建立了用打点杂交（ｄｏｔｂｌｏｔｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）检测血清中ＨＣＶＲＮＡ的方法,同采用ＨＣＶ基因组５’端非编码区的一对寡核苷酸引物通过逆转录－聚合酶链式反应（ＲＴ－ＰＣＲ）检测血清中ＨＣＶＲＮＡ的方法相比较,发现两种方法都能快速早期和特异地检出血清中ＨＣＶＲＮＡ,但ＲＴ－ＰＣＲ法敏感性优于ＲＮＡ打点杂交法。对于无血清学指标的慢性ＮＡＮＢ肝炎病人的诊断,可采用这两种方法。这两种方法的敏感性在很大程度上依赖于引物和探针的敏感性,以及ＲＮＡ提取方法。ＲＴ－ＰＣＲ法适用于诊断病毒血症和复制,打点杂交法适用于研究ＨＣＶＲＮＡ量的变化,对治疗的评价,以及为实验筛选较高滴度的ＨＣＶＲＮＡ阳性样本。     

基因治疗中的受体介民反义RNA转移技术

在调节特定基因的表达上,反义ＲＮＡ是一种重要的手段。但由于存在降解、非特异性转移及安全性等问题,反义ＲＮＡ在个体基因治疗中无法得到充分利用。受体介导的内吞作用为定向转移反义ＲＮＡ提供一种运载工具,它可以将反义ＲＮＡ定向、高效、低毒、高安全性地转移到靶细胞中发挥作用,因而将大大加快反义ＲＮＡ基因治疗的临床应用。     

从石蜡包埋的微量肾活检组织中提取及分析RNA

本文用氧钒核糖核苷复合物ＶＲＣ（ＶａｎａｄｙｌＲｉｂｏｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅＣｏｍｐｌｅｘ）孵育的方法,从石蜡包埋半年以上的肾组织中提取出ＲＮＡ,分析了ＲＮＡ的质量,探讨了影响ＲＮＡ提取的因素。在此基础上,我们又采用ｔＲＮＡ助沉的方法,进一步从石蜡包埋的微量肾活检组织中提取出ＲＮＡ,并用逆转录热启动ＰＣＲ（ＲＴ－ｈｏｔｓｔａｒｔ－ＰＣＲ）方法,观察了石蜡包埋的肾活检组织中细胞因子的基因表达。     

双链RNA技术在植物病毒研究中的应用

含ＲＮＡ基因组的植物病毒在复制时会产生双链ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）。本文介绍了用ＣＦ－－１１纤维素粉提取ｄｓＲＮＡ的步骤,并列举了ｄｓＲＮＡ在植物病毒研究中的应用,其主要应用有（１）用于检测植物病毒;（２）用于病毒株系分化;（３）用于病毒卫星ＲＮＡ及亚基因组ＲＮＡ研究;（４）用于侵染性测定及病毒基因组功能研究等。     

中国大麦黄花叶病毒分离物的分子变异

１３个供试的中国和英国大麦黄花叶病毒（ＢａＹＭＶ）分离物,经ＲＮＡ１和ＲＮＡ２全基因组不同区域ＤＮＡ片段背地里单构象多态分析（ＳＳＣＰ）,外壳蛋白基因和ＲＮＡ２ ７０ｋＤ基因５端７０５碱基序列分析,以及此７－５碱基ＤＮＡ片段限制性内切酶图谱分析结果,它们的ＲＮＡ１和ＲＮＡ２彼此无一相同,其中ＲＮＡ２变异比ＲＮＡ１更大。由于变异十分复杂,且没有规律性,因而当前通用的分子生物学技术尚不能简单地ＢａＹＭ     

大鼠胆碱酯酶mRNA在卵母细胞中的表达

ＡＧＰＣ法是一种快速、简便、有效的ＲＮＡ提取方法。参照该法自新生大鼠脑组织中提取出总ＲＮＡ,进一步通过ｏｌｉｇｏ（ｄＴ）－纤维素亲和层析分离获得ｐｏｌｙ（Ａ）￣＋ＲＮＡ。当ｐｏｌｙ（Ａ）￣＋ＲＮＡ或总ＲＮＡ经显微注射法进入非洲爪蟾卵母细胞后,其翻译系统能够利用外源ｍＲＮＡ合成具有催化活性的胆碱酯酶。表达的胆碱酯酶大部分分泌到卵母细胞培养液中。在一定范围内,ｍＲＮＡ的注射量与胆碱酯酶的表达量成正比。所合成的胆碱酯酶活性可被毒扁豆碱和Ｓ－（２－二异丙基氨乙基）甲基硫赶膦酸乙酯（ＶＸ）抑制。     

dsRNA介导的RNA干扰

在多种生物中 ,外源或内源性的双链ＲＮＡ(ｄｏｕｂｌｅ ｓｔｒａｎｄｅｄＲＮＡ ,ｄｓＲＮＡ)导入细胞中 ,与ｄｓＲＮＡ同源的ｍＲＮＡ则受到降解 ,因而其相应的基因受到抑制。这种转录后基因沉默 (ｐｏｓｔ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌｇｅｎｅｓｉｌｅｎｃｉｎｇ ,ＰＴＧＳ)机制首先在线虫 (Ｃ .ｅｌｅｇａｎｓ)中得以证实。由于这是一种在ＲＮＡ水平的基因表达抑制 ,故也称为ＲＮＡ干扰 (ＲＮＡｉｎｔｅｒｆｅｒ ｅｎｃｅ) ,简称ＲＮＡｉ[1] 。随后发现 ,在各种生物 ,如果蝇[2 ] 、拟南芥菜[3 ] 、及小鼠[4] 等均存在ｄｓＲＮＡ介导…     

RNA病毒RNA聚合酶的研究进展

自然界仅有ＲＮＡ病毒以ＲＮＡ作为基因载体。依赖于ＲＮＡ的ＲＮＡ聚合酶在这种病毒的增殖复制期起到了非常重要的作用。它一方面以病毒ＲＮＡ为模板复制子代病毒的基因,另一方面也将病毒增殖期间需要的蛋白质和酶类的基因转录成为ｍＲＮＡ,也就是说它担负了复制酶和转...     

中国丙型肝炎病毒基因型研究新进展

为了进一步了解中国丙型肝炎病毒基因型感染状态 ,我们建立了 5′ ＮＣＲＡＢＣ程序酶切分型法 :首先采用ＲＴＰＣＲ技术 5′ ＮＣＲ扩增ＨＣＶＲＮＡ阳性样品中的ｃＤＮＡ ,然后按照ＡＢＣ程序进行分型 ,Ａ应用ＢＨＨ(ＢｓｒＢⅠ ,ＨａｅⅡ ,ＨｉｎｆⅠ )复合内切酶消化 5′ ＮＣＲｃＤＮＡ ,Ｂ应用ＢｓｔＵⅠ消化 ,Ｃ应用ＨａｅⅢ消化 ,电泳检测片段大小。应用该方法对临床采集的ＨＣＶＲＮＡ阳性血清进行分型 ,在国内首次发...