Quox—1基因同源序列在人胚早期发育中的表达

以Ｑｕｏｘ－１基因的特异性片段ｂ２为探针与人基因ＤＮＡ作Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交,结果显示,人基因组中存在Ｑｕｏｘ－１基因的同源序列。结果表明其表达有明显的时间和空间特异性。胚龄３０天以前,Ｑｕｏｘ－１基因的同源序列在人胚包神经管等许多部位表达,３０天以后表达部位局限于脊索、心肌细胞、生机节、消化道上皮及周皮等处。     

鸡传染性支气管炎病毒中国流行株免疫原S1基因的分子克隆,序？…

对来源于我国华东地区的鸡传染性支气管炎病毒流行株ＱＤ免疫原Ｓ１基因ｃＤＮＡ进行了克隆,序列分析了和ＤＮＡ免疫的初步研究,ＲＴ－ＰＣＲ扩增ＱＤ毒株的Ｓ１基因,将其５′和３′端分别进行了分子修饰后插入克隆载体ＰＵＣ１８的ＢａｍＨＩ／ＨｉｎｄⅢ位点,大肠杆菌中实现了目的基因的克隆,利用英国ＩＢＶ毒株Ｓ１全基因核酸探针与ＱＤ毒株Ｓ１基因的重组克隆质粒子分杂交后,采用ＨａｅⅢ,ＰｖｕⅡ和ＸｂａＩ等限制酶对此     

鸡传染性支气管炎病毒中国流行株免疫原S1基因的分子克隆、序列分析及其DNA免疫的初步研究

对来源于我国华东地区的鸡传染性支气管炎病毒流行株ＱＤ免疫原Ｓ１基因ｃＤＮＡ进行了克隆、序列分析和ＤＮＡ免疫的初步研究。ＲＴＰＣＲ扩增ＱＤ毒株的Ｓ１基因,将其５′和３′端分别进行分子修饰后插入克隆载体ｐＵＣ１８的ＢａｍＨⅠ／ＨｉｎｄⅢ位点,在大肠杆菌中实现了目的基因的克隆;利用英国ＩＢＶ毒株Ｓ１全基因核酸探针与ＱＤ毒株Ｓ１基因的重组克隆质粒分子杂交后,采用ＨａｅⅢ,ＰｖｕⅡ和ＸｂａⅠ等限制酶对此流行毒株Ｓ１基因ｃＤＮＡ进行了酶切分析;在测定ＱＤ毒株Ｓ１基因５′端高变区核苷酸序列并以此与ＩＢＶＭ４１,Ｈ１２０,６／８２及Ｂｅａｕｄ等参考毒株序列对比分析的基础上,构建了ＱＤ株Ｓ１基因ＤＮＡ免疫表达质粒,肌肉注射免疫小鼠后,鸡胚病毒中和试验的结果表明,ＩＢＶＳ１基因ＤＮＡ免疫表达质粒能诱导小鼠产生病毒特异的中和抗体,具有良好的免疫原性,初步显示基因疫苗在鸡传染性支气管炎防治上应用前景。     

酵母PH081基因的克隆和表达

从酵母染色体ＤＮＡ中获得１个约３．０ｋｂ的ＢａｍＨＩ的克隆片段和１个约５．０ｋｂ的ＰｓｔＩ片段,前者包含１７４５ｂｐ的ＰＨＯ８１基因编码序列及１２４４ｂｐ的上游列,后者包含２２３６ｂｐ的编码序列及约２．８ｋｂ的下游序列,经拼接得完整的ＰＨＯ８１基因。以ＵＲＡ３基因取代部分ＰＨＯ８１的编码序列,通过体内同源重组,获得ＰＨＯ８１基因缺陷的酵母细胞株。构建ＰＨＯ８１－ＬａｃＺ融合基因,以β－半乳糖苷敏的     

利用同源重组提高外源GUS基因在植物组织中表达

将１８Ｓ ｒＲＮＡ基因的部分片段,或烟草的核骨架结合序列（ＳＡＲｓ）作为同源序列与外源ＧＵＳ基因作为报告基因构建成用于基因打靶载体,以枪或农杆菌介导转化到拟南芥的根组织中,检测ＧＵＳ基因瞬间表达的结果显示,两种同源基因序列均可提外源ＧＵＳ基因的表达。     

用ＰＣＲ—ＳＳＯ方法研究云南西部彝族ＨＬＡ—ＤＱＢ１基因的多态性

应用ＰＣＲ－ＳＳＯ基因分型技术,对我国云南西部地区３代内无血缘关系的７６个彝族健康个体进行了ＬＡ－ＤＱＢ１位点的基因分型。结果显示,在ＤＱＢ１的３８个等位基因中,观察到１３个等位基因,云南西彝族表现为ＤＱＢ１＊０３０１（３６．１８％－３６．８４％）最常见。其他频率大于５％的等位基因还有ＤＱＢ１＊０５０２（１０．５３％－１１．１８％）、ＤＱＢ１＊０４０１（９．２１％）、ＤＱＢ１＊０３０２（８．５５％－９．２１％）、ＤＱＢ１*0601(7．８９％）ＤＱＢ１＊０５０３１（６．５８％）、ＤＱＢ１＊０３０３２（５．９２％－６．５８％）。和其他１３个华人群体ＤＱＢ１等位基因的频率比较分析表明,总体上,云南西彝族和其他各华人群体间都存在很大的差异。显示其ＨＬＡ等位基因频率分布的民族独特性。     

B.thuringiensis穿梭载体的构建及cry1C基因的表达

以ＵＣ１９为母体,克隆了Ｂｔ ｋｅｎ－Ａｇ（Ｂ。．ｔｈｒｕｉｎｇｉｅｎｓｉｓ ｓｕｂｓｐ．ｋｅｎｙａｅ Ａｇ）的复制起始区（～１．６ｋｂ）、ｐＵＣ４Ｋ的ａｐｈ１基因,构建成穿梭载体ｐＨＶ－１,ｐＨＶ－１在Ｅ．ｃｏｌｉ中经１００个世代,质粒保持率在８０％以Ｂｔｉ ４Ｑ８（Ｂ．ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ ｓｕｂｓｐ．ｉｓｒａｅｌｅｎｓｉｓ ４Ｑ８）中经４０个世代,质粒保持率在８０％以上,将Ｂ．ｌｉｃｈ     

酵母PHO80基因的克隆,表达及功能分析

利用原位杂交方法从野生型酵母菌染色体ＤＮＡ中克隆了ＰＨＯ８０基因,全长约４．２ｋｂ,包括１．１ｋｂ的上游序列和８７９ｂｐ的编码序列。以ＵＲＡ３基因为筛选标记,通过体内同源重组和营养互补筛选获得了ＰＨＯ８０基因缺失突变株。进一步研究了ＰＨＯ８０在细胞内的功能,它是酵母阻遏型酸性磷酸酯酶结构基因以及调控基因ＰＨＯ８１表达的负调控因子,但不影响ＰＨＯ４和ＰＨＯ８５的表达。还构建了ＰＨＯ８０－ＬａｃＺ融合基因,探索它在细胞内的表达规律。β－半乳糖苷酶活力测定结果表明,ＰＨＯ８０基因在细胞内呈低水平表达,并受自身产物和ＰＨＯ８５的抑制,推测它与ＰＨＯ５和ＰＨＯ８１基因的调控模式可能相似。     

Egr-1基因调控序列连接OSM cDNA表达质粒的构建及其在黑色素瘤细胞中的表达

ＯＳＭ是一种对黑色素瘤细胞显示抑制作用的细胞因子．为进行ＯＳＭ针对黑色素瘤的基因－放射治疗研究,构建了小鼠Ｅｇｒ－１基因调控序列引导入ＯＳＭｃＤＮＡ真核表达质粒（ｐＥＯ）,ｐＥＯ质粒转染小鼠Ｂ－１６黑色素瘤细胞,经Ｇ４１８和抗人ＯＳＭ抗体的筛选,获得了稳定表达ＯＳＭ的克隆细胞（ｐＥＯ－１细胞）,ＯＳＭ表达量可达５．９７ｎｇ每１０５细胞天,分子量为３２ｋＤ．ｐＥＯ－１细胞用一定浓度Ｈ２Ｏ２处理后ＯＳＭ表达量可提高６２％,表明ｐＥＯ重组质粒可在氧自由基的刺激作用下增强ＯＳＭ表达     

有基因转录活性的血管紧张素Ⅱ1B受体的组织分布

我们首次利用基因同源重组技术,用包含编码β半乳糖苷酶（ＬａｃＺ基因）基因的ＡＴ１Ｂ同源ＤＮＡ片段,置换ＡＴ１Ｂ受体基因的外显子序列,通过显色示踪基因ＬａｃＺ产生的β半乳糖苷酶,观察了有基因转录活性的ＡＴ１Ｂ受体的组织分布。结果显示ＡＴ１Ｂ受体主要分布在睾丸、肾上腺皮质的球状带和蛛网膜下腔血管及侧脑室脉络膜血管上,在垂体前叶组织中也有少量的存在。为进一步研究ＡＴ１Ｂ受体的生理和生化功能确定了组织学分布范围     

Quox-1基因同源序列在人胚早期发育中的表达

以Quox-1基因的特异性片段b_2为探针,与人基因组DNA作Southern杂交,结果显示,人基因组中存在Quox-1基因的同源序列。以抗Quox-1蛋白的抗体与早期人胚胎组织的切片作免疫组化反应研究了Quox-1基因同源序列在人胚早期发育过程中的表达,结果表明其表达有明显的时间和空间特异性。胚龄30天以前,Quox-1基因的同源序列在人胚包括神经管等许多部位表达,30天以后表达部位局限于脊索、心肌细胞、生肌节、消化道上皮及周皮等处。文中讨论了Quox-1基因同源顺序对人类胚胎早期发育过程可能的调控作用。     

人同源框基因Lhx4 cDNA序列的获得,染色体定位和基因组分析

Lhx4基因是LIM同源框基因家族的一员 ,它在运动神经元的发育过程中发挥着重要的作用 .从人脊髓cDNA文库中筛选到了 1个人源性Lhx4基因的cDNA全长序列 ,它与鼠源性的Lhx4基因的cDNA序列有 92 %同源性 .它的基因被定位在 1号染色体 1q 2 4 .1- 1q 2 4 .3的位置 ,并包含有 6个外显子 .其中同源框结构域由外显子 4和 5表达 ,LIM结构域 1由外显子 2表达 ,LIM结构域2由外显子 3表达 .     

大鼠FMR1同源基因cDNA的克隆、测序与选择剪接的初步分析

应用ＲＴ－ＰＣＲ方法,从新生大鼠脑组织总ＲＮＡ扩增大鼠ＦＭＲ１同源基因的ｃＤＮＡ片段,克降至ｐＵＣ１８质粒中进行序列分析．获得从终止密码子起共１６８１ｂｐ的编码序列,尚缺少约２００ｂｐ的５′序列．所克隆的这部分大鼠ＦＭＲ１ｃＤＮＡ,不含有对应于人ＦＭＲ１基因的外显子１２及外显子１７第一和第三剪接受点之间的序列,提示大鼠ＦＭＲ１基因也有选择剪接表达．同源性分析显示,大鼠ＦＭＲ１与小鼠ＦＭＲ１基因的同源性为９７．７％,与人ＦＭＲ１基因的同源性为９４．９％;与小鼠ＦＭＲＰ（ＦＭＲ１蛋白）的氨基酸序列同源性为９８．４％,与人ＦＭＲＰ的氨基酸序列同源性为９７．９％．以大鼠ＦＭＲ１ｃＤＮＡ片段为探针检测到大鼠不同组织中ＦＭＲ１基因的选择剪接表达．上述结果为以大鼠为动物模型深入研究ＦＭＲ１基因功能奠定了基础．     

rHox: A homeobox gene expressed in osteoblastic cells

Homeodomain proteins are characterized by a conserved domain with a helix-turn-helix motif. These proteins act as regulatory factors in tissue differentiation and proliferation. However, their role in the regulation of osteoblast differentiation is unknown. In this study we have identified and characterized a homeobox gene in osteoblast-like cells. This gene, termed rHox, was isolated from a cDNA library derived from rat osteoblast-like cells. The nucleotide sequence of the 1,375 base pair (bp) cDNA contains a noncoding leader sequence of 329 bp, a 735 bp open reading frame, and 312 bp of 3′ noncoding sequence. Sequence comparison demonstrates that rHox is identical to the mouse Pmx gene (also called MHox) at the amino acid level and 90% homologous at the nucleotide level. Both Southwestern blotting and gel shift analyses indicate that rHox has potential to bind both the collagen l α 1 and the osteocalcin promoters. Transfection experiments using an rHox expression vector showed a strong repression of target promoter activity, regardless of whether the target promoters contained homeodomain binding reponse elements. These data suggest that rHox is a potent negative regulator of gene expression, although the specific role of rHox in bone gene regulation remains to be determined. © 1995 Wiley-Liss, Inc.     

牛Irak-1基因的电子克隆及生物信息学分析

电子克隆提供了一种利用基因组数据库克隆新基因全长cDNA序列的策略。利用小鼠Irak-1基因编码序列(NM_008363)为种子序列进行电子克隆获得了牛Irak-1基因完整编码序列。然后,用生物信息学方法分析了该基因的结构,微卫星位点,密码子偏性和氨基酸的同源性等。结果表明:该基因cDNA全长2 645bp,无内含子,最大开放阅读框2 157bp,编码718个氨基酸,与小鼠的同源性为77%。     

Rapid Identification of Quox-1 Homeodomain DNA-Binding Sequence Using SAAB

Quox-1 is the only gene in the hox family whose expression occurs throughout the development of the central nervous system. Using the Quox-1 homeodomain produced in a bacterial expression system, we were able to identify DNA-binding targets of the Quox-1 protein from a library of randomly generated oligonucleotides by the selection and amplification binding (SAAB) technique. The results indicated that the Quox-1 protein recognizes a new consensus sequence, 5'-CAATC-3', which has not been reported for any other Hox family homeoprotein. In addition, electromobility shift assay further confirmed that the Quox-1 homeoprotein preferentially binds to the 5'-CAATC-3' sequence, but not to the binding sites for other Hox class homeoprotein (TAAT) or NKX class homeoprotein (CAAG). Based on mutation analyses of the DNA sequences, we found that the 5'-CAATC-3' core sequences are required for high affinity binding by the Quox-1 protein. Furthermore, mutation analyses of the Quox-1 homeodomain showed that one of the major determinants participating in recognition of a minor groove is the Gln6 and Thr7 in the N-terminal arm of the homeodomain.     

Differential expression of the Quox-1 gene in normal human cells,early human embryo,and tumor cells

Quox-1 is the only gene in the hox family whose expression occurs throughout the developing central nervous system. The differential expression of the Quox-1 gene was studied in normal human tissues and tumor tissues. Marked expression of Quox-1 was detected in early human embryos, LCE cells, and HeLa cells, with weak to zero expression being detected in various normal human tissues. Immunocytochemistry analysis further confirmed that the Quox-1 protein was absent in normal human leukocytes. However, high levels of Quox-1 product were found in leukocytes of acute lymphocyte leukemia patients and in patients with a subtype of acute nonlymphocyte leukemia. In addition, Southern blot analysis showed that the genomic DNA of LCE, HeLa, and normal human leukocyte cells had a DNA rearrangement of the Quox-1 gene, suggesting that the rearrangement of genomic DNA might be the cause of differential expression in normal human tissues and tumor tissues. The data implied that the overexpression of Quox-1 was associated with tumors, and that there may be links between the processes of embryogenesis and carcinogenesis.     

小鼠新基因Ayu17-449的克隆及表达分析

在利用PU8捕获载体从小鼠ES细胞中寻找有关对发育起重要作用基因时,一阳性ES克隆编号为Ayu17-449被捕获,经过Southern blotting法证实捕获载体单一整合在Ayu17-449号ES细胞的基因组中。通过用5＇RACE法得到所捕获基因的一小段cDNA,在EST数据库中比对,得到一5523bp cDNA序列,在Celera数据库中它包含于两个相邻基因,根据这两个基因的mRNA设立了一系列的引物进行RT-PCR和测序,用这两个基因的不同片段分别作探针进行Northern blotting分析,确定这是一个RNA约9kb并编码1920个氨基酸的新基因（定名为Ayu17-449基因,其cDNA序列和编码蛋白序列发表在NCBI数据库,编号为DQ079067）。Northern blotting揭示Ayu17-449基因高度表达在小鼠的脑、肾脏、心脏、肺、肌肉和胃等组织。PU8捕获载体具有X-gal报告基因,能从蛋白表达水平揭示它所捕获的基因的表达模式。X-gal染色结果显示,Ayu17-449蛋白高度表达在小鼠的脑、肾脏、心脏等组织,与Northern blotting法的结果高度一致。X-gal染色切片结果进一步证明Ayu17-449蛋白主要表达在脑的神经细胞和肾脏近曲小管细胞中。Ayu17-449基因的编码蛋白在数据库（Scansite,http：//scansite．mit．edu/）做功能基团分析后,揭示其编码蛋白的N末端含有Granin基团,大量文献证实Granin基团具有参与激素的分泌的功能,显示Ayu17-449基因可能与激素的分泌有关。