小核仁RNAs及其衍生RNAs的研究进展

小核仁RNAs(small nucleolarRNAs,snoRNAs)是一类发现较早且位于核仁内的小非编码RNAs,在核糖体RNAs(ribosomalRNAs,rRNAs)、信使RNAs(messengerRNAs,mRNAs)、小核RNAs(small nuclearRNAs,snRNAs)的成熟及修饰中均发挥重要作用。snoRNAs的功能及其作用途径一直以来均是学术界的研究热点。目前,snoRNAs对rRNAs的化学修饰作用已得到广泛认可。另外,有研究表明snoRNAs与一些遗传疾病以及肿瘤性疾病的发生发展存在密切关联。近年来研究发现,部分snoRNAs经切割可生成更小的、有功能的RNAs,即小核仁RNAs衍生RNAs(snoRNAs derivedRNAs,sdRNAs),这些sdRNAs中部分具有微小RNAs(microRNAs,miRNAs)的特征,可发挥类似miRNA的作用,这一发现极大地拓展了snoRNAs的作用机制方式。结合国内外研究现状,在总结snoRNAs的结构和基本功能的基础上对sdRNAs与miRNAs之间的相关性进行了综述,以期为后续的相关研究提供参考。     

植物小RNAs的研究进展

小RNAs(长度小于40 nt)是nc-RNAs重要的一部分,现在植物中已发现了多种小RNAs,如小干扰RNAs(siRNAs)、微小RNAs(miRNAs)、反式作用的小干扰RNAs、天然反义转录小干扰RNAs、异染色质小干扰RNAs、长小片段小干扰RNAs、天然反义转录的微小RNAs及其一些未命名的小RNAs.成熟的小RNAs聚集相关的蛋白质因子,可以抑制转录,导致转录水平的基因沉默(TGS);或介导目标mRNA的剪切,抑制翻译,导致转录后水平基因沉默(PTGS).就这些植物小RNAs产生及其作用的研究进展作一概述     

抗流感病毒小RNAs研究进展

流行性感冒是一类由流感病毒引起的呼吸道传染病, 通过季节性流行或全球性爆发严重威胁着人类健康。目前防治流感的主要方法是疫苗和药物, 但存在神经毒性、肠胃副作用、易耐药等诸多限制因素。新的技术特别是小RNAs介导的RNA干扰(RNAi)技术, 因其具有高效、特异、快速等特点, 已成为抗病毒治疗的候选方法之一。随着近年来流感病毒的流行, 应用小RNAs抗流感病毒的报导越来越多, 其中靶向PA、NP和M2的PA-2087, NP-1496和M-950是目前报道的抑制流感病毒效果最好的siRNA。靶向不同流感病毒基因保守区域的siRNA具有更广泛的病毒毒株抑制效果, 靶向不同基因的siRNAs联合使用可取得更好的病毒抑制效果。文章就目前siRNAs和miRNAs在抗流感病毒方面的研究进展及RNAi治疗的前景和问题进行了综述。     

抗流感病毒小RNAs研究进展

流行性感冒是一类由流感病毒引起的呼吸道传染病,通过季节性流行或全球性爆发严重威胁着人类健康。目前防治流感的主要方法是疫苗和药物,但存在神经毒性、肠胃副作用、易耐药等诸多限制因素。新的技术特别是小RNAs介导的RNA干扰(RNAi)技术,因其具有高效、特异、快速等特点,已成为抗病毒治疗的候选方法之一。随着近年来流感病毒的流行,应用小RNAs抗流感病毒的报导越来越多,其中靶向PA、NP和M2的PA-2087,NP-1496和M-950是目前报道的抑制流感病毒效果最好的siRNA。靶向不同流感病毒基因保守区域的siRNA具有更广泛的病毒毒株抑制效果,靶向不同基因的siRNAs联合使用可取得更好的病毒抑制效果。文章就目前siRNAs和miRNAs在抗流感病毒方面的研究进展及RNAi治疗的前景和问题进行了综述。     

小RNAs作用机制的研究进展

RNAi的发现引发了生物学的一次革命, 也揭示了一种原来未被发现的, 通过小RNAs(大小~20–30 nt)家族在转录水平或转录后水平调解基因表达的方式。在真核生物中, 这些小RNAs包括siRNAs、miRNAs、piRNAs、scnRNAs、21U-RNAs和其他一些小RNAs等。它们通过调节基因表达来控制细胞的代谢、生长和分化, 维持基因组的完整性, 协调生殖细胞的成熟和抑制病毒对细胞的侵袭以及转座成分的转座。文章综述了这些小RNAs在鉴定和生物合成方面的研究进展, 并讨论了它们对基因表达的调节作用。     

微小RNAs在心力衰竭炎症机制中作用的研究进展

微小RNA是一组高度保守的长度约22个核苷酸非编码RNA,通过靶定相应的互补序列导致信使RNA的沉默,下调或者抑制翻译以调节基因和蛋白的表达。心力衰竭进程中存在慢性炎症激活和microRNA的异常表达,其中TLR4通路和NF-κB通路被广泛研究和认同,炎症因子如IL-1、IL-6、TNF-α参与心力衰竭的炎症激活过程,并且可以通过多种通路导致心肌细胞肥大,纤维化及凋亡,炎症因子激活、炎症通路中间因子及疾病进展形成复杂的病理网络,最终导致心肌功能紊乱和减退;microRNA可通过部分结合mRNA靶定部分在转录水平上抑制蛋白合成,参与心力衰竭炎症通路的整个过程,这一调节机制在心肌肥大、心力衰竭等多种心脏疾病中的作用逐渐被阐明。本文旨在总结微小RNAs在心力衰竭炎症机制中作用的研究进展,寻找微小RNA与心力衰竭中炎症激活过程的联系。     

小RNAs与其靶标的相互调控

小RNAs 是生命活动非常重要且广泛存在的调节因子,可以调控基因表达和基因组稳定性. 然而最近的研究发现,小RNAs与它们的靶标间的调控是相互的调控(reciprocal regulation),因为它们的靶标反过来也可以调控小RNAs. 也就是说,它们的靶标可以通过自身与小RNA的互补程度或自身丰度水平,引发小RNAs无需模板地在其3′ 端添加核苷酸,导致小RNAs降解. 另外,病毒也可以通过这种方式调控宿主基因的表达. 这种现象的发现挑战了以前对小RNAs作用过程的理解,这不仅可以解释以前一些关于小RNAs所不能解释的问题,而且对于转基因技术、反义核酸技术和RNA干扰技术都有重要的启示作用. 本文综述了这种靶标引发小RNA修饰并降解现象的研究进展和应用前景.     

家蚕微孢子虫中小RNAs的全基因组鉴定与分析

【目的】家蚕Bombyx mori微粒子病是蚕业生产上的毁灭性病害,家蚕微孢子虫Nosema bombycis是该病的病原,可经卵垂直传播和经口水平传播。为了探索家蚕微孢子虫中对重复元件的抵御以及对基因转录调控的潜在方式,本研究拟在基因组水平上对该物种的小RNAs进行全面系统的分析,鉴定与转座子相关的小RNAs和潜在的miRNAs。【方法】从感染家蚕微孢子虫的家蚕中肠中提取总RNA,分离小片段RNA并反转录后,进行Solexa高通量测序。通过生物信息学方法对小RNAs进行分类及功能注释,鉴定起源于家蚕微孢子虫不同类型转座子的小RNAs,并对潜在的miRNA进行预测分析。【结果】家蚕微孢子虫小RNAs的长度主要是24和25 nt,其中大部分序列表现出5′末端的尿嘧啶偏好性。家蚕微孢子虫中存在丰富的与转座子相关联的小RNAs,并且与转座子标准序列匹配的反义小RNAs明显多于正义小RNAs。同时,鉴定获得了31个候选miRNAs,部分为Nosema属的其他孢子虫中所共有,暗示其在微孢子虫基因组进化上具有保守性。【结论】首次鉴定到家蚕微孢子虫的转座子相关性小RNAs,暗示小RNAs在家蚕微孢子虫基因组对转座子防御过程中起到作用,31个潜在的miRNAs为家蚕微孢子虫miRNAs的功能验证提供了后续靶标。     

ROCK的巨大作用

K. Watanabe et al., ＂A ROCK inhibitor permits survival of dissociated human embryonic stem Cells[一种ROCK抑制剂可使离体的的人类胚胎干细胞存活]，”Nat Biotech，25：681—86，2007．（被59篇文章引用）     

小RNAs在生殖细胞发育过程中的作用

很多动物可以产生具调节作用的小RNAs,根据产生方式和作用机制可以将它们分为三类:微小RNAs(miRNAs)、与Piwi相互作用的RNAs(piRNAs)和内源小干扰RNAs(endo-siRNAs),这些小RNAs可以在生物生殖细胞发育过程中发挥重要作用。其中miRNAs的主要作用是调节蛋白质基因的表达;piRNAs主要的作用是沉默转座因子,但piRNAs主要存在于生殖细胞中;endo-siRNAs则可能具有上述两种主要作用。该文论述了这三种小RNAs在生物生殖细胞发育过程中的作用,同时也讨论了它们在治疗生物不育及其在生物节育方面的应用前景。     

植物小RNAs及其抗胁迫机制研究进展

植物非编码小RNA(sRNAs)主要分为三类:微小RNA(m iRNAs)、小干扰RNA(siRNAs)和长小片段干扰RNA(lsiRNAs)。三者的生物合成和作用机制有所不同,但他们主要都通过介导靶mRNAs的剪切或抑制其翻译来调控基因的表达。这篇文章主要介绍小RNA研究的最新进展,并重点阐述其在非生物和生物胁迫中发挥的作用,如应对矿质元素缺乏、氧化胁迫、ABA胁迫以及病原菌入侵等生理过程。     

小RNAs在沉默转座因子中的作用

在很多生物基因组中都存在DNA成分的转座序列,它们能够转座到基因组的很多位点,对基因组造成很大的危害,如破坏编码基因、改变基因表达的调节网络、使染色体断裂或造成大范围基因重排等。真核生物已经进化出了多种机制来控制这些寄生核酸序列造成的损伤,以维持基因组完整性。虽然这些机制在不同生物中有些差异,但其中一种主要的机制是通过小RNAs介导的,这些小RNAs包括小干扰RNAs、piwi相互作用的小RNAs、微小RNAs、扫描RNAs和21U-RNAs等。这些小RNAs可以通过DNA水平剪切转座序列,或在转录和(或)转录后水平沉默转座成分。该文就这些小RNAs沉默转座成分的机制和功能做一论述。     

Genetics: still a discipline?

In the institutional sense of the term "discipline" (laboratories, societies, congresses, curricula, etc.), genetics remains a discipline. In the intellectual sense of the term (consensus on a definite array of concepts, methods and theoretical purposes), it is doubtful that genetics is still a discipline. At first, molecular biology seemed to have introduced an unequivocal structural (or molecular) definition of the gene: a definite sequence of nucleotides that code for a protein. In fact, as it appears in retrospect, this was not the case. Even in 1961, when Jacob and Monod proposed their first model of genetic regulation in bacteria, there was no possibility of constructing a non equivocal concept of the gene. More recent developments in molecular genetics have made this situation worse. There is no possible definition of the gene as a general category. The reasons why biologists keep the word are pragmatic rather than theoretical: communication among scientists, economic interests and ideology.     

新型隐球酵母非编码小RNAs的研究进展

新型隐球酵母是一种担子菌病原真菌,主要感染免疫功能缺陷的人群,例如HIV-1感染病人,最终会引起致命隐球菌性脑膜炎。非编码小RNAs一般指长度为20-30nt的小RNAs,具有调节功能。新型隐球酵母能够产生大量的小RNAs,但是其生成（biogenesis）过程以及生物学功能尚未完全阐述。本文就新型隐球酵母中小RNAs的特征和产生、以及在新型隐球酵母中的生物学作用和机制进行综述。     

哺乳动物嵌合RNAs产生机制:cis-SAGe

嵌合RNAs是指由两个或两个以上独立基因(即亲本基因)融合产生的新RNAs。传统观点认为,嵌合RNAs都是染色体重排的结果。近年来研究发现,相邻基因间的顺式剪接(cis-splicing of adjacent genes,cis-SAGe)也是产生嵌合RNAs的重要机制之一。cis-SAGe是同一条染色体上位置相邻、转录方向相同的基因间发生转录通读,由此产生的初始转录本经过加工,形成了含有两个或多个亲本基因序列的嵌合RNAs。cis-SAGe最初是在肿瘤细胞中被鉴定出来,其在肿瘤发生中的潜在功能引起了研究者的广泛兴趣。随着研究的深入,人们发现cis-SAGe也广泛存在于正常组织中,可能是哺乳动物进化过程中产生新基因的一种重要机制。本文就cis-SAGe的剪接和表达特性、产生机制及其产物的功能等方面进行了综述,以期为人们全面了解cis-SAGe的研究概况及发展趋势提供参考。     

内源小RNAs在植物胁迫反应中的作用

世界范围内, 农作物的产量都容易受到各种生物和非生物因素的影响, 对植物逆境适应性反应机制的深入研究有助于我们采取新的措施, 以提高作物的逆境适应性。以前通常认为植物适应逆境胁迫的机制主要涉及相关基因在转录水平的调节, 然而, 近来发现部分内源小RNAs(siRNAs), 如miRNAs、 nat-siRNAs和 lsiRNAs不仅可以调节植物的生长发育,而且在植物逆境反应中具有重要作用。文章就这些内源小RNAs在氧、矿质元素、干旱、低温、脱落酸、机械、重金属、生物及其他环境因素胁迫中的作用机制做一概述。     

Science:海马体之外还有形成记忆的新系统

正直到现在,海马体仍然被认为是与形成和唤醒记忆有关的最重要脑部区域,其他区域只起到次要作用。但是发表在国际学术期刊Science上的一项新研究发现脑部的内嗅皮质区域在其中发挥着新的独立作用。奥地利科学技术研究所的科学家们发现大鼠的内嗅皮质能够进行运动记忆的重放不需要经过海马体。当空间记忆形成,内嗅皮质区域的细胞特别是网格细胞会发挥导航系统一样的作用。它们为海马体提供位置信息并提供一些动物移动距离