异源物代谢核受体PXR与肿瘤多药耐药相关性的研究进展

肿瘤的多药耐药性是临床化疗中迫切需要解决的问题.孕烷X受体(pregnane X receptor,PXR)为配体活化的转录因子,其下游靶基因均为主司异源性药物/毒物生物转化功能的I相、II相代谢酶及III相转运蛋白,可对药物代谢动力学过程产生重要的影响,故有可能成为逆转肿瘤多药耐药的新的药物作用靶点.本文总结了PXR在肿瘤多药耐药中的作用及机制、新型PXR配体类药物研发等方面的研究进展.     

次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶研究进展

次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase, HPRT)是一种细胞质酶, 在体内广泛存在, 它不仅参与嘌呤碱基的补救合成途径, 而且关系到嘌呤类药物的代谢, 是调控该类药物药理效应和毒性反应的关键酶。其基因突变可影响酶的活性, 不仅可能导致不同临床表现的代谢疾病的发生, 而且影响体内嘌呤类药物的代谢。同时, HPRT作为管家基因, 是诊断许多疾病的靶点基因。文章概括了HPRT研究的新进展, 通过总结国内外研究现状, 发现HPRT的研究既推动了嘌呤类药物个体化用药的发展及新药物的研发, 又促进了HPRT突变相关遗传代谢疾病的诊断和治疗。     

用基因芯片检测DPYD等位基因在受试人群中的发生频率

二氢嘧啶脱氢酶基因(DPYD基因)所编码的二氢嘧啶脱氢酶(DPD酶)是氟化嘧啶类抗肿瘤药物代谢的主要限速酶,其活性存在显著的个体差异,并因此影响药物的疗效和毒副作用.大部分编码低/无活性酶的突变型等位基因是由于基因中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)造成的,检测这些SNPs是预测患者对药物的反应和实现个体化给药方案的基础.制备并优化了用于检测DPYD基因中6个已知SNPs所编码的等位基因(DPYD*2,*3,*4,*5,*9,*12)的基因芯片,建立了该芯片的基因分型标准.并利用该芯片检测了肿瘤患者(112例)、肾病患者(83例)和健康者(45例)中DPYD突变型等位基因的发生频率.在受试人群中,突变型等位基因DPYD*5和DPYD*9平均发生率分别为32.08%和11.25%,未发现DPYD*2,*3,*4,*12突变型等位基因.而且以上单碱基突变的发生率在肿瘤患者、肾病患者和健康者间以及男性、女性肿瘤患者间无显著性差异,表明其与疾病的发生或性别无显著性关联.对20例标本的基因分型结果采用直接测序法进行验证,19例基因芯片分型结果与直接测序法结果相一致.DPYD*5、DPYD*9突变型等位基因在受试人群中具有较高的发生率.利用基因芯片能够对其实现快速准确的检测.     

产业动向

《当前优先发展的高技术产业化重点领域指南(2007年度)》发布《当前优先发展的高技术产业化重点领域指南(2007年度)》已经国家发展改革委、科学技术部、商务部、国家知识产权局联合修订,日前发布,其中涉及“生物技术”的部分主要包括:生物反应及分离技术、发酵工程关键技术及重大产品、新型疫苗、重大疾病防治创新药物、基因工程药物、单克隆抗体系列产品与检测试剂、新型给药技术及药物新剂型、计划生育药具、中药材及饮片、中药制品、中药制药工艺及设备、生物医学材料、新型医用精密诊断及治疗设备、医学信息技术及远程医疗、生物芯片、…     

偏头痛相关酶和KEGG通路分析

搜集与偏头痛相关的编码酶的基因,利用KEGG通路分析目标基因的分布和功能,促进偏头痛遗传学研究和新药靶点研究。以＂gene name＂AND migraine检索PUBMED数据库,从原始文献中搜集并整理偏头痛相关酶基因数据,用DAVID在线分析工具对数据进行处理。搜索得到31个偏头痛酶基因,对7条KEGG代谢通路进行了分析：色氨酸代谢通路、酪氨酸代谢通路、精氨酸和脯氨酸代谢通路、叶酸一碳单位循环代谢通路、药物代谢通路、外源物质细胞色素P450代谢通路、肾素血管紧张素代谢通路。其中药物代谢通路包括9个药物,又以高选择性5-羟色胺重摄取抑制剂西酞普兰的应用前景最大。DDC、DBH、MTHFD1等6个偏头痛相关基因需要完善多态性研究。CYP450和单胺氧化酶在偏头痛的病理和治疗中都占有重要的地位。通过分析疾病相关酶基因的代谢通路,有助于了解疾病的分子病理基础,并为新药设计提供可靠靶点。     

肠球菌肽脱甲酰基酶在大肠杆菌BL21(DE3)中高效表达及其活性检测

肽脱甲酰基酶 (peptidedeformylase ,PDF)存在于所有原核生物中是其生长、代谢、繁殖必不可少的关键酶 ,但不存在于人类与其他哺乳动物细胞内 ,因而被视为新一代广谱抗生素药物筛选的理想靶点。将肠球菌 (Enterococcusfaecium)肽脱甲酰基酶基因连接到高效蛋白表达载体pET 30 A( )中 ,并转入宿主大肠杆菌BL2 1 (DE3)中进行诱导表达。在该基因的诱导表达中 ,采用不同表达条件进行诱导表达 ,最终获得表达效率极高且可溶的肽脱甲酰基酶。从宿主细胞中提取分离该酶 ,并进行酶活性检测 ,诱导表达的肽脱甲酰基酶有很高的酶活性     

肿瘤化疗与药物代谢酶

药物代谢酶(DME)在药物代谢解毒和药物代谢活化中起着重要的作用,对组织器官的药物效应和毒性的易感性产生重要影响。DME在肿瘤组织和非肿瘤组织表达和活性存在差异。与常用化疗药物有关的药物代谢酶主要有细胞色素P450(CYP)、谷胱甘肽S-转移酶(GST)、尿苷二磷酸-葡萄糖醛酸转移酶(UGT)、巯嘌呤甲基转移酶(TPMT)和二氢嘧啶脱氢酶(DPD),这些酶均具有遗传多态性,在一定条件下可以被诱导,具有个体差异。     

代谢组学在肿瘤药物靶点筛选中的应用进展

肿瘤是一种多因素参与造成机体各系统功能平衡紊乱的代谢性疾病,代谢重编程是恶性肿瘤的重要特征之一.研究"代谢指纹图谱"的代谢组学,通过揭示肿瘤或药物引起的宿主内源性代谢物的变化,为肿瘤药物靶点的筛选提供了可能.但目前对代谢组在肿瘤药物靶点筛选中的整体性综述并不多见,因此,本文在介绍了代谢组学筛选肿瘤药物靶点的流程的基础上...     

脂质代谢相关基因变异在早发冠心病中作用的研究进展

最新研究表明, 早发冠心病(pCAD)往往具有较强的遗传背景和脂质代谢紊乱等易感基础, 脂代谢相关基因异常导致各类脂质合成、代谢障碍, 最终血管壁发生动脉粥样硬化, 相关研究多集中在(1) 影响低密度脂蛋白代谢的基因, 如：低密度脂蛋白受体、载脂蛋白B、载脂蛋白E等基因; (2) 影响高密度脂蛋白代谢的基因, 如：ATP 结合盒式转运子、载脂蛋白AI及脂蛋白脂酶基因; (3) 脂联素基因、低密度脂蛋白受体相关蛋白基因等。目前已发现这些脂质代谢基因与pCAD密切相关, 有些基因的突变可造成以pCAD为特征的遗传性疾病。文章对上述基因与pCAD的发生发展进行综述, 以期为冠心病的预防和个体化治疗提供理论依据。     

磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1(PCK1)的研究进展

磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶基因(phosphoenolpyruvate carboxykinase, PEPCK)编码的胞质磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1(phosphoenolpyruvate carboxykinase 1, PCK1)是调节糖异生过程中的限速酶,参与维持血糖水平。它广泛参与糖代谢、脂代谢、衰老、糖尿病以及肿瘤细胞增殖和凋亡等代谢和生物学进程。本文对PCK1在以上物质代谢和生物学进程中的研究进展作一综述,为进一步探究PCK1参与糖尿病、肿瘤及衰老等疾病的分子机制提供理论基础,也为PCK1作为新的判断肿瘤和糖尿病的分子标志物和治疗靶点提供理论依据。     

硫化氢在肿瘤中的作用及以其为靶点的治疗

硫化氢(hydrogen sulfide, H₂S)是一种具有广泛生理功能的气体信号分子,在肿瘤的发生发展中起着关键作用,因此其代谢酶已成为多种肿瘤的药物治疗靶点。本文对H₂S的合成和分解代谢途径及其在肿瘤中的双重作用进行了综述,进一步探讨了外源添加H₂S供体化合物以及抑制内源性H₂S合成作为抗肿瘤治疗的有效策略,可为临床上以H₂S为靶点的肿瘤预防和治疗提供理论基础。     

药物基因组学在新药临床试验及个体化用药中的应用

药物安全性和有效性评价是药物临床试验和个体化用药的核心,也是药物基因组学研究的主要内容。药物基因组学研究贯穿于药物 研发、上市评价和临床应用整个过程, 根据药物代谢酶、转运体、受体相关基因多态性对用药者进行分层分析,评价与药物体内的处置过程、 安全性、有效性个体差异的相关性。综述药物基因组学在新药临床试验、个体化用药中的应用研究新进展。     

基因多态性及核受体对磺基转移酶代谢功能的调节

目的本研究主要探讨磺基转移酶的基因多态性与癌症药物治疗之间的关系以及核受体调节对磺基转移酶代谢功能的影响,期望为临床个体化治疗提供借鉴和指导。方法通过查找pubmed数据库和国内相关文献,分析近年来有关磺基转移酶的代谢功能与基因多态性和核受体调节关系的研究进展。结果磺基转移酶对维持体内激素平衡有重要作用,与肿瘤的易感性和药物治疗效果有密切关系,其代谢功能的强弱很大程度上取决于基因多态性以及核受体的调节。结论磺基转移酶的遗传药理学研究内容将对临床药师今后的个体化治疗工作产生重要影响。     

二氢乳清酸脱氢酶作为抗肿瘤靶点的研究进展

二氢乳清酸脱氢酶(dihydroorotate dehydrogenase,DHODH)是存在于线粒体内膜的一种含铁的黄素依赖酶,这种酶催化嘧啶核苷酸从头合成途径的第4步反应。而嘧啶核苷酸可用于DNA、RNA、糖蛋白和磷脂生物合成,对于细胞代谢和细胞增殖至关重要。近年来的研究表明,DHODH与多种肿瘤的发生、发展密切相关,抑制或下调DHODH可以降低肿瘤细胞增殖,诱导其凋亡或者增加其他靶点药物的抗肿瘤效果。该文结合所在实验室目前的研究成果及进展,就DHODH作为治疗恶性肿瘤靶点的相关机制及当前DHODH抑制剂的研究进展作一综述。     

单管PCR-Pyrosequencing快速检测华法林代谢酶基因多态性方法的建立

文章旨在建立一种单管、快速及高通量的华法林药物代谢酶相关基因多态性的检测方法。通过抽取人外周血DNA,应用带有生物素标记的扩增引物,经PCR扩增并制备焦磷酸测序单链模板,于PyroMark ID焦磷酸测序仪上进行焦磷酸测序,以Sanger测序法测序结果为对照,观察分析的准确性。结果显示,华法林药物代谢酶的3个相关基因多态性(CYP2C9*2、CYP2C9*3、VKORC1(-1693))于单管中可被同时检测,一次可获得96份DNA的华法林药物代谢相关多态性位点检测结果。经与Sanger测序方法比较,符合率为100%。结果表明本方法可准确、高通量、快速检测华法林药物代谢酶相关基因多态性,与单管检测一个位点的焦磷酸测序方法相比,能有效降低检测成本,节省检测时间。该方法在个性化医疗上有较大的推广应用价值,也可以将该平台运用于其他疾病相关基因多态性检测。     

新型冠状病毒肺炎治疗推荐用药相关基因多态性进展

新型冠状病毒病已呈全球大流行态势。迄今仍未发现针对该病的特异性抗病毒药物,所有治疗均基于实验和同情用药,由于缺乏大规模临床研究支持,在临床给药中须格外注意药物不良反应。既往研究显示药物不良反应除受年龄、性别、地域等外在因素影响外,还与患者的基因背景密切相关。国家卫生健康委员会发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案》(试行第七版)给出了若干指导性药物,本文就该方案中提示的药物相关基因多态性做一综述。     

细胞色素P450基因多态性与药物代谢研究进展

细胞色素P450（cytochrome P450,CYP450）在人体药物代谢过程中起着非常重要的作用并参与代谢80%以上的临床药物。由于CYP450在不同种族和不同人群中存在基因多态性,从而造成药物反应的个体差异,一度成为药物基因组学研究的热点。通过查阅国外相关文献,综述了近年来关于CYP1A2、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6和CYP3A4五种主要的药物代谢酶的基因多态性和药物代谢的研究进展,为临床指导个体化用药、避免药物不良反应和新药研发提供科学参考依据。     

《酵母遗传学和分子生物学指南》

《酵母遗传学和分子生物学指南》(Guide to yeast genetics and molocular biology)由Christine Guthrie和Gerald R.Fink编著,1991年学术出版社出版,933页。该书是《酶学方法》(Methods in enzymology)多卷书中的第194卷,它汇集了研究酵母基因的各种最新方法和程序。该指南有下列特点:①其程序能使新手建立酵母实验室并掌握     

基于网络药理学、分子对接及实验验证探讨黄柏治疗痛风的作用机制CSCD

采用网络药理学、分子对接和体外细胞实验探讨黄柏抗痛风(gout)的物质基础与潜在作用机制。首先通过TCMSP数据库获得黄柏主要活性成分及其对应作用靶点信息;通过GeneCards、OMIM、TTD数据库获得痛风相关疾病靶点;将黄柏有效成分对应靶点与痛风靶点取交集,借助STRING平台及Cytoscape3.9.0软件,绘制交集基因蛋白互作(PPI)网络图;利用基因注释与分析平台(Metascape)数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过微生信云平台对富集结果可视化;借助AutoDock Tools软件对核心成分及关键靶点基因进行分子对接,并对核心化学成分抗痛风炎症作用进行实验验证。共筛选出25个黄柏抗痛风活性成分和70个关键交集靶点,PPI网络分析获得5个关键靶点包括蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARγ)、白介素6(IL-6)、前列腺素内过氧化物合酶(PTGS 2);GO功能和KEGG通路富集显示,黄柏作用于细胞迁移的正向调控、细胞分化的负调控、炎症反应等生物学过程,调控PI3K-Akt、MAPK等信号通路,进而发挥抗痛风作用。分子对接结果显示,黄柏的5个主要活性成分与关键靶点间存在分子结合位点且结合能较强,均小于-5 kcal/mol;体外实验显示核心化学成分对尿酸钠诱导的炎症反应有较好的抑制作用,本研究初步揭示了黄柏具有多种潜在的抗痛风活性成分,其作用机理可能是通过作用于多靶点和多通路来实现的。     

应用可视化基因芯片技术检测幽门螺杆菌感染个体化药物治疗相关基因

目的:建立一种能同时检测幽门螺杆菌克拉霉素(23S)、喹诺酮(gyrA)耐药位点和人PPI代谢相关CYP2C19的基因多态性情况的基因芯片检测方法.方法:通过分析筛选人基因组CYP4502C19 *2,CYP4502C19*3及幽门螺杆菌克拉霉素和喹诺酮类耐药位点的DNA序列,设计制备了HP感染个体化药物治疗检测基因芯片,并对其特异性、灵敏度、重复性进行了评价.结果:该芯片可以检测出不低于103 CFU/ml的幽门螺杆菌和不低于2ng/μl的人基因组DNA.196例临床标本的芯片检测结果与测序结果基本一致.结论:应用可视化基因芯片进行幽门螺杆菌感染个体化药物治疗相关基因检测具有较高的特异性和敏感性,结果准确且易判读,具有较好的应用前景,可以为临床医生提供用药指导.