基于滚环扩增的鸭乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA检测方法的建立

滚环扩增(RCA)是新近发展起来的一种能特异性扩增环形DNA的实验技术,自2008年以来被广泛用于HBV基因全长扩增及共价闭合环状DNA(cccDNA)耐药突变分析等研究。为了便于鸭乙型肝炎病毒(DHBV)cccDNA的分析,本研究建立了基于RCA的DHBV cccDNA的检测方法。通过针对DHBV高度保守序列设计的4对RCA硫化修饰引物,以血清DHBV DNA为阴性对照,从肝组织DHBV DNA标本中扩增得到DHBV cccDNA。然后用跨缺口引物扩增RCA产物测序替代限制性内切酶切分析进行DHBV cccDNA鉴定。应用该方法检测39份携带DHBV麻鸭肝组织与血清标本结果显示:全部肝组织标本均检出DHBV cccDNA,而全部血清标本则均无DHBV cccDNA检出,表明本研究建立的基于RCA的DHBV cccDNA检测法具有良好的特异性和灵敏性。该方法的建立为应用鸭乙型肝炎病毒动物模型研究cccDNA在病毒致病机制中的作用以及评价抗病毒疗效奠定了实验基础。     

染色体外环状DNA的研究进展

染色体外环状DNA (extrachromosomal circular DNA, eccDNA)是一类位于染色体外的DNA分子,普遍存在于真核细胞中,并发挥其调控作用。研究表明,eccDNA是从染色体分离或脱落而形成的,独立存在,并可以转录出编码和非编码RNA,广泛参与细胞的生理和病理调控。大量证据显示,在肿瘤的发生发展中,高水平表达的促癌基因来自eccDNA转录。本论文对eccDNA类型、形成机制、eccDNA生理及病理调控机制几个方面进行综述,以促进eccDNA在细胞生理及病理功能和应用方面的研究。     

染色体外环状DNA的研究进展

染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)是存在于真核生物染色体外的环状DNA分子,由基因组中的DNA或细胞内的外源DNA形成.eccDNA是一类特殊的遗传物质,可以携带完整的基因,编码有功能的蛋白质或RNA.研究表明,eccDNA可以通过特殊的方式参与多种生理和病理...     

单链环状DNA基因组的发现

单链环状ＤＮＡ基因组的发现关键词单链环状ＤＮＡ常有学生问我：您是如何着手寻找单链ＤＮＡ病毒的？您怎么一下子就找到了头绪？寻找单链ＤＮＡ并不是我最初的目标,发现它们完全是偶然机遇,或者说是因为敢于相信自己的试验数据。实际上,一开始我是想弄清楚某一病毒结...     

环状病毒M14 dSRNA基因组的进一步研究

M14病毒是1981年从北京郊区捕获的三带喙库蚊中分离获得。其生物学、形态学和理化特性均符合呼肠孤病毒科环状病毒的特点。聚丙烯酰胺凝胶电泳将其dsRNA基因组分离成11条区带。但最近的进一步研究发现,它是由12个片段的RNA组成。又用猴轮状病毒SA11株作为标准,测定了每个片段的分子量。 白纹伊蚊细胞C6/36纯系,由日本长畸大学热带医学研究A.Igarashi教授惠赠,并照他的方法培养传代。     

杆状病毒基因组DNA复制相关基因的研究进展

综述了与杆状病毒DNA复制相关基因的研究进展.杆状病毒表达系统是最重要的四大基因工程表达系统之一,杆状病毒还具有作为生物杀虫剂的潜能.DNA复制是杆状病毒复制循环的中心环节.     

一株新型云南牛环状病毒的分离鉴定

【目的】为加深云南省动物虫媒病毒多样性的认知。【方法】在云南省景洪市设立哨兵牛,定期采血接种细胞进行虫媒病毒的分离;通过RT-PCR、电镜观察与基因组琼脂糖凝胶电泳对分离病毒进行初步鉴定;扩增分离病毒的基因节段2 (Seg-2)与基因节段3 (Seg-3)全长序列进行分析与系统发生树的构建,明确病毒的分类地位;通过qRT-PCR与血清中和试验对病毒在动物上的感染进行回溯分析。【结果】2019年7月,从哨兵牛上采集的血液中分离到1株可在BHK-21细胞上引起细胞病变的病毒;电镜下观察,病毒粒子呈球形,直径约70nm;琼脂糖凝胶电泳显示病毒基因组由双链RNA组成,呈现"3-3-3"的带型特征。分离毒株的Seg-2编码环状病毒属病毒保守的T2蛋白,与Mobuck virus具有最近的亲缘关系,核酸与氨基酸序列相似度分别为72.8%与84.0%;分离毒株的Seg-3编码决定环状病毒属病毒血清型的OC1蛋白,与Mobuckvirus的核酸与氨基酸序列相似度仅为60.2%与56.5%;在T2与OC1蛋白构建的系统发生树上,分离毒株形成独立于Mobuckvirus的进化分支。对哨兵牛血液中的病毒核酸与血清中和抗体回溯分析结果显示,从病毒感染哨兵动物至监测期结束的17周内,动物血液中均可检测到病毒核酸;动物感染病毒1周后,开始产生特异性中和抗体,随后上升至最高水平(抗体效价1:226),至监测期结束,中和抗体仍维持在较高水平(抗体效价1:113)。【结论】本研究首次报道了1种新型Mobuckvirus在云南省哨兵牛上的分离与感染特性。研究结果丰富了对我国环状病毒属病毒的认知,为开展病毒的诊断、流行病学与致病性研究奠定了基础。     

蛋白质起始的DNA病毒复制机制

DNA聚合酶在DNA合成过程中需要的引物包括RNA引物、DNA自我引物和蛋白质引物3种类型。新DNA链(如冈崎片段)的复制多是在DNA模板上合成一段RNA引物,细小病毒利用其基因组末端的反向末端重复序列(ITRs)自我折叠成DNA引物,而一些DNA、RNA病毒及真菌质粒起始复制反应的引物则是蛋白质。以感染原核生物的噬菌体Phi29和真核DNA病毒腺病毒为例,从复制过程所涉及的蛋白质、对复制原点的识别、复制起始反应、新链的延伸、复制终止过程等方面详细阐述DNA病毒由蛋白质引发的复制机制,并对已商品化的Phi29 DNA聚合酶产品多重置换扩增及单细胞测序等的应用以及基于噬菌体Phi29蛋白质起始的最小复制系统体外扩增异源DNA等最新的应用研究作相关总结介绍。     

多分DNA病毒分子生物学研究进展

本文从基因组特点、生理功能、起源进化及应用前景等方面综述了近年来有关多分DNA病毒分子生物学的研究进展。     

快速检测HBV DNA的环状介导等温DNA扩增法

环状介导等温DNA扩增（LAMP）技术是一种新的核酸扩增方法,它能够高特异性、高效、快速地进行核酸的扩增。利用LAMP法检测乙型肝炎病毒（HBV）,能够在等温条件下于1h内将少量的基因拷贝数扩增至10^9,在对65份临床标本的检测中显示了较高的特异性。与现有的PCR技术相比,LAMP法更加简便快速,且在等温条件下进行,不需要复杂的仪器设备,为临床检测乙肝病毒提供了一个快速筒便的新方法。     

嗜肝DNA病毒包装信号的研究进展

本文综述了嗜肝ＤＮＡ病毒前基因组ＲＮＡ近５＇端一段顺式序列即包装信号的结构与功能，重点阐述了其在病毒包装和逆转录两个过程中所起的重要作用，并从包装信号二级结构稳定性入手，分析探了乙型肝炎病毒Ｅ阴性变异株形成的原因。     

云南省两株环状病毒的分离和鉴定

从云南省采集的中华(?)蚊和棕头库蚊中,分离到两株对3周鼠致死的病毒。血清学鉴定表明,该病毒与披膜病毒科(甲病毒属)、黄病毒科、布尼亚病毒科病毒的免疫腹水,以及呼肠孤病毒科环状病毒(M14)的免疫腹水均不发生反应。电镜观察病毒为球形,具双层壳体的颗粒,直径为70.35±3.07nm,毒粒常常和颗粒状包涵体及管状结构相连;核衣壳具有环状病毒特有的20面体对称结构,直径为56.06±2.42nm。在负染标本中能观察到直径为38.36±2.42nm的核心颗粒。该病毒对乙醚相对抵抗,对酸,热敏感。聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,病毒基因组由10条RNA片段组成,分子量在0.3～2.5×10~6道尔顿之间,病毒基因组RNA带形分布(3-3-3-1)类似环状病毒,但与已知环状病毒RNA带形分布都有不同。     

嗜肝DNA病毒的细胞受体研究进展

本文对近年有关嗜肝DNA病毒进入细胞的分子机制的研究作一综述,主要介绍了近年来鸭乙型肝炎病毒细胞表面受体的研究进展,新发现的与乙型肝炎病毒进入细胞有关的细胞膜分子以及乙型肝炎病毒包膜蛋白的水解机制。     

DNA病毒编码的病毒因子和病毒受体

ＤＮＡ病毒编码的病毒因子和病毒受体杨天兵金奇（病毒基因工程国家重点实验室,北京１０００５２）关键词ＤＮＡ病毒病毒因子病毒受体病毒在长期的进化过程中已演绎出一套用于逃避宿主免疫系统攻击,有利于病毒存活与繁殖的微妙策略。近年来国际上提出了病毒因子（ｖｉｒ...     

植物双生病毒研究进展

双生病毒（Ｇｅｍｉｎｉｖｉｒｕｓ）是一组具有双生颗粒形态的单链环状ＤＮＡ植物病毒［１～３］。典型的双生病毒为１８×３０ｎｍ颗粒,基因组大小为２．５～３．０ｋｎｔ。双生病毒研究已成为植物病毒学最活跃的领域之一。１双生病毒的性质１．１双生病毒组的成员划分...     

核多角体病毒(NPV)感染的家蚕中肠DNA多聚酶的研究

家蚕核多角体病毒(NPV)感染的中肠组织中的DNA多聚酶,经过磷酸纤维素柱层析纯化,正常家蚕中肠与NPV感染的家蚕中肠NPV多聚酶都表现了前和后两个活力峰,感染NPV的家蚕中肠DNA多聚酶前、后峰的比活力比正常家蚕中肠DNA多聚酶前,后峰的比活力分别提高10～15倍,总活力回收为56～60％。研究了DNA多聚酶的性质,讨论了与NPV复制的关系。