微生物蛋白质组学的定量分析

越来越多的微生物基因组序列数据为系统地研究基因的调节和功能创造了有利条件.由于蛋白质是具有生物功能的分子,蛋白质组学在微生物基因组的功能研究中异军突起、蓬勃发展.微生物蛋白质组学的基本原则是,用比较研究来阐明和理解不同微生物之间或不同生长条件下基因的表达水平.显而易见,定量分析技术是比较蛋白质组学中急需发展的核心技术.对蛋白质组学定量分析技术在微生物蛋白质组研究中的进展进行了综述.     

合成生物学改造微生物及生物被膜用于重金属污染检测与修复

随着工业化进程不断加快,重金属污染日益加剧,尤其是水体的重金属污染,已严重威胁人类健康,迫切需要进行有效的污染修复.相比传统物理和化学修复,生物修复具有绿色环保和可持续性的特点.因为微生物生长繁殖迅速、生物被膜具有动态可调节和环境适应性好等特点,使其能更好耐受胁迫环境,在环境修复中有重要作用.合成生物学改造微生物及生物...     

毒力基因调控蛋白PrfA促进单核细胞增生李斯特菌生物被膜的形成

单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)是重要的革兰氏阳性食源性致病菌,易在食品以及各种食品加工、运输和保藏设备的接触面形成生物被膜,从而具有更强的抗逆性而难以彻底清除,因此成为食品卫生安全的重要隐患.PrfA是LM毒力基因转录表达的重要调控因子,通过比较研究LM野生株(EGD和EGDe)、PrfA缺失株(EGDAprfA和EGDeAprfA)、无害李斯特菌(Listeria innocua,LI),携带组成性表达PrfA蛋白的重组无害李斯特菌(LI-pERL3-prfA*)以及重组单核细胞增生李斯特菌(EGDeΔprfA-pERL3-prfA*)生物被膜形成能力的差异,探讨LM重要的毒力调控蛋白PrfA对生物被膜形成的影响.实验结果显示:LM野生株具有较强的生物被膜形成能力,而LI形成生物被膜的能力最弱;PrfA的缺失能降低LM生物被膜的形成能力;组成性高量表达PrfA蛋白可以回复EGDeΔprfA的生物被膜形成能力,但对LI没有增强作用.以上实验结果表明:PrfA在LM生物被膜形成中具有重要的促进作用.     

细菌生物被膜检测方法的研究进展

细菌生物被膜(bacterial biofilm,BF)是细菌黏附于接触物表面,由细菌自身分泌的胞外基质包裹形成的多细胞微生物群体,是微生物界细菌普遍的生存状态。基于生物被膜的物理屏障作用和膜内特殊微环境,其具有多重耐药性以及较强的黏附性、抗吞噬性等特性,导致所致疾病迁延不愈,已成为医疗卫生领域的重大挑战。早期、快速、准确检测生物被膜形成对及时有效防治其感染性疾病至关重要。现从表型和基因型检测两个方面对细菌生物被膜检测方法作一综述。     

药物外排泵与生物被膜在微生物耐药机制中的相关性研究进展

生物被膜是介导微生物耐药与多重耐药的一大热点机制,涉及微生物的生长代谢、耐药基因等基因表型改变、群体感应系统的调控及药物外排泵等多重因素。耐药基因、药物外排泵与生物被膜在微生物耐药机制中,具有复杂而密切的相互影响。分别从生物被膜对药物外排泵、耐药基因的影响,药物外排泵对生物被膜的影响,以及药物外排泵和微生物生物被膜共同的调节因素,对近年来的相关研究进展作一综述。     

菜豆叶片衰老期间叶绿体被膜膜脂与脂肪酸组分的变化

菜豆叶片叶绿体总脂和被膜膜脂中均含有单半乳糖甘油二脂和双半乳糖甘油二脂,在整个衰老期间两种糖脂的比值变化不大。叶绿体总脂中含有5种磷脂,脂肪酸以不饱和的亚麻酸为主,而被膜膜脂中仅含磷脂酰胆碱和磷脂酰甘油,脂肪酸以饱和的棕榈酸为主,不饱和亚油酸为次。叶片衰老过程中被膜所含两种磷脂比值明显降低,脂肪酸的不饱和指数也因亚麻酸相对含量显著减少、棕榈酸相对含量增加而降低。     

细菌生物被膜对抗生素耐药机制的研究进展

细菌生物被膜引发的感染已成为医院感染的主要原因之一,具有耐药性和难治性的特点,引起了基础和临床研究的极大关注。但是细菌生物被膜对抗生素的耐药机制目前还不十分明确,对近年来生物被膜怎样和为什么会对抗生素如此耐药形成了几种可能机制进行综述。     

细菌生物被膜的耐药机制及控制策略

在特定的条件下,细菌可以形成生物被膜,包被有生物被膜的细菌称为被膜菌.被膜菌无论其形态结构、生理生化特性、致病性还是对环境因子的敏感性等都与浮游细菌有显著的不同,尤其对抗生素和宿主免疫系统具有很强的抵抗力,从而导致严重的临床问题,引起许多慢性和难治性感染疾病的反复发作.细菌生物被膜粘附在各种医疗器械及导管上极难清除,以至引发大量的医源性感染.近年来,随着人们对细菌致病机制认识的逐步深入,控制细菌生物被膜的方法已有较大发展.本文拟探讨被膜菌的耐药机制并着重综述细菌生物被膜控制方法的最新研究进展.     

基于微流控的生物被膜研究进展及口腔微生态系统应用展望

口腔是人体最重要的微生物储藏库之一,这些微生物通常以生物被膜的形式稳定地黏附于口腔内粘膜及牙齿表面,在病理条件下则可以深入髓腔及牙槽骨内,成为龋病、根尖周炎、牙周病等常见口腔疾病的主要病因,甚至与许多全身性疾病密切相关.在人类口腔微生态系统中,微生物种类繁多,生物被膜的构成及相互作用关系复杂,目前对其认识还十分有限;此...     

抗微生物肽CRAMP联合抗生素分散铜绿假单胞菌生物被膜的增效作用研究

【目的】研究修饰后的鼠源抗微生物肽CRAMP联用抗生素对铜绿假单胞菌PAO1成熟生物被膜的分散作用,为临床联合应用抗生物被膜药物提供理论依据。【方法】采用微量肉汤稀释法测定CRAMP修饰肽和抗生素对PAO1的最低抑菌浓度(MIC)、最低杀菌浓度(MBC)和生物被膜最小根除浓度(MBEC);采用时间杀菌曲线(time-kill curve,TKC)法测定CRAMP修饰肽及抗生素单用和联用对PAO1成熟生物被膜的杀菌活性;采用菌落计数法和激光共聚焦扫描显微镜(CLSM)评估CRAMP修饰肽联用抗生素对PAO1成熟生物被膜的分散作用。【结果】与单用抗生素组相比,除2种碳青霉烯类药物和4种β-内酰胺类药物,其他抗生素联合CRAMP修饰肽后的MBEC值均有不同程度的下降,万古霉素、罗红霉素和阿奇霉素下降倍数最明显(4倍)。TKC试验结果表明,CRAMP修饰肽分别联用万古霉素、罗红霉素和阿奇霉素均具有比单用药更快且更强的杀菌作用,尤其是与万古霉素联用仅在3h时杀灭了全部(100%)的生物被膜细菌。随后,通过CLSM观察发现生物被膜数量、体积、面积和单位面积荧光强度均有明显的变化。【结论】CRAMP...     

Microbial corrosion monitoring by an amperometric microbial biosensor developed using whole cell of Pseudomonas sp.

A microbial biosensor was developed for monitoring microbiologically influenced corrosion (MIC) of metallic materials in industrial systems. The Pseudomonas sp. isolated from corroded metal surface was immobilized on acetylcellulose membrane and its respiratory activity was estimated by measuring oxygen consumption. The microbial biosensor was used for the measurement of sulfuric acid in a batch culture medium contaminated by microorganisms. A linear relationship between the microbial sensor response and the concentration of sulfuric acid was observed. The response time of biosensor was 5 min and was dependent on the immobilized cell loading of Pseudomonas sp., pH, temperature and corrosive environments. The microbial biosensor response was stable, reproducible and specific for sensing of sulfur oxidizing bacterial activity.     

Time-resolved fluorimetry in the study of attachment of staphylococci and streptococci on substrate-bound fibronectin

Abstract The application of time-resolved fluorimetry was evaluated in the study of staphylococcal and streptococcal attachment to fibronectin-coated coverslips. The test system allowed the use of low bacterial concentrations (2 × 10⁵−10⁷ bacteria per ml), in contrast to the much higher concentrations of bacteria used in earlier assays. The bacteria attached much better to fibronectin-coated plastic surfaces than to albumin-coated ones, but there were differences between the individual strains. Soluble fibronectin inhibited the adsorption of staphylococci but enhanced streptococcal attachment to fibronectin-coated surfaces. Purified antibodies to fibronectin inhibited both staphylococcal and streptococcal adhesion in a dose-dependent way. Our results show that time-resolved fluorimetry is a very sensitive method for quantitating bacterial attachment.     

花粉形态计算机量化分析研究

以白莲花粉为实验材料 ,介绍了进行花粉形态计算机量化分析的步骤。花粉经醋酸法处理后 ,用电子显微镜对花粉进行观察照相 ,尔后用计算机技术对花粉电镜照片进行处理 ,最后用C语言编制了计算花粉形态面积的计算机程序。结果表明 :花粉计算机量化分析有助于快速定量测定有关花粉形态指标 ,是花粉数量分类的一种有效方法。     

微生物燃料电池发展态势分析

随着世界经济的高速发展和人口的不断增长,能源短缺和环境污染问题日益成为制约发展的瓶颈。微生物燃料电池(microbial fuel cell,MFC)能将污染物中蕴含的化学能直接转化为电能,实现同步污水处理和电能回收,是一种极具前景的可持续污水处理技术。同时,MFC在污泥处理、生物修复、环境监测、海水淡化等方面也展示了诱人的前景。基于科睿唯安Web of Science数据库和德温特专利检索分析平台(Derwent Innovation, DI),对MFC领域1990~2018年的论文和专利数据进行统计分析,得出全球MFC领域的发展趋势、国际分布、研发热点和技术格局。在此基础上,对未来MFC领域的发展做出了展望,对中国MFC产业化发展提出了思考和建议。     

微生态制剂在水产养殖中的作用

微生态制剂的主要作用有 :净化水质、改善养殖水体环境 ;抑制病原微生物 ,提高机体免疫力 ;作为饲料添加剂 ,促进养殖生物生长 ;常用的微生物菌群主要有光合细菌、硝化细菌、芽孢杆菌等。综述了微生态制剂在水产养殖中的作用及常用微生物菌群。     

油藏调剖菌TP-1的培养条件及岩芯模拟驱油研究

从油井产出水中分离得到一株兼性厌氧芽孢杆菌TP-1,该菌株可在55℃的油藏温度生长,并代谢产生粘性多糖和气体.经培养条件优化,发酵液多糖产量可达5.5 g/L,产气量为22 mL/L.低浓度的CaCl2、MgSO4和AlCl3对多糖的生成有促进作用.岩芯模拟试验表明,该菌的注入可使岩芯压力增加,提高石油采收率7.37%.TP-1是一株性能良好的油藏调剖菌.     

荧光标记糖电泳在新琼寡糖定性和定量分析中的应用

目的:建立荧光辅助糖电泳(FACE)对系列新琼寡糖进行定性、定量分析的方法。方法:将系列新琼寡糖用7-氨基-1,3-萘胺二磺酸钾(AGA)氨化还原衍生后,在浓度梯度为18%-25%的聚丙烯酰胺凝胶中电泳分离,于波长264nm直接检测寡糖衍生物,得到聚合度为4-14的新琼寡糖衍生物电泳分析图谱。结果:寡糖衍生物的相对电迁移率与其分子量的负三分之二次方成线性关系;运用图像分析软件对电泳图谱进行数字化转换,发现寡糖衍生物的灰度积分面积与样品浓度呈线形关系。结论:建立了快速、精确的新琼寡糖微量定性、定量分析的方法,为新琼寡糖的质量分析提供了技术支撑。     

油藏调剖菌TP-1的培养条件及岩芯模拟驱油研究

从油井产出水中分离得到一株兼性厌氧芽孢杆菌TP-1, 该菌株可在55℃的油藏温度生长, 并代谢产生粘性多糖和气体。经培养条件优化, 发酵液多糖产量可达5.5 g/L, 产气量为22 mL/L。低浓度的CaCl2、MgSO4和AlCl3对多糖的生成有促进作用。岩芯模拟试验表明, 该菌的注入可使岩芯压力增加, 提高石油采收率7.37%。TP-1是一株性能良好的油藏调剖菌。     

微生物絮凝剂产生菌的筛选和发酵条件研究

设计了微生物絮凝剂产生菌菌种筛选模型,并从土壤和活性污泥中筛选到５１株絮凝剂产生菌,经复筛获得两株絮凝活性较高的菌株,分别定名为Ｎｏｃａｒｄｉａ,ＪＩＭ－８９和ＪＩＭ－１２７。对两株菌的发酵条件,特别是培养基组成,进行了初步研究。两株菌所产生的絮凝剂,对大肠杆菌悬液２０ｍｉｎ的絮凝活性在１０００ｕ／ｍｌ,最高可达１２４８ｕ／ｍｌ。