基于COⅡ基因序列的斑腿蝗科部分亚科的分子系统学研究

采用PCR产物直接测序法测定了斑腿蝗科10个亚科16属22种的COⅡ基因585 bp的片段, 对序列的碱基组成进行了分析,并评估了数据集的系统发育信号;最后,以癞蝗科的肃南 短鼻蝗作为外群,采用NJ法、MP法、ML法以及贝叶斯推论法构建了系统树,以解决这些物种所代表的亚科之间的系统发育关系。结果表明：22种斑腿蝗科昆虫的COⅡ基因序列碱基组成表现强烈的A+T含量偏向性。对COⅡ基因585 bp序列片段构成的全数据组和根据密码子不同位点划分的密码子第一、第二和第三位点数据组的系统发育信号分析显示,所有数据组都具有一定的系统发育信息。在4种方法得到的合一树中发现： （1）星翅蝗亚科、刺胸蝗亚科、黑背蝗亚科、斑腿蝗亚科的亲缘关系较近;（2）卵翅蝗亚科与稻蝗亚科亲缘关系较近,建议卵翅蝗亚科似乎应归入稻蝗亚科中,板胸蝗亚科与这两个亚科的关系较近;（3）黑蝗亚科和秃蝗亚科似乎应合并为一个亚科;（4）切翅蝗亚科的4个属未聚在一起,表明这些属的区别较大,不是一个单系群;（5）黑蝗亚科和秃蝗亚科关系较近,且与本研究中其他几个亚科的亲缘关系相对较远。研究结果表明COⅡ基因在解决斑腿蝗科的亚科以下属种间的系统发育关系时是一个有效的分子标记。     

基于线粒体ND2基因的中国斑翅蝗科部分种类分子系统学研究（直翅目：蝗总科）

本文的目的是通过对斑翅蝗科部分种类的线粒体ND2基因进行分析,重建斑翅蝗科昆虫的系统发育关系,并探讨分子系统发育关系和传统分类结果的异同。扩增并测定了我国斑翅蝗科10属16种蝗虫的线粒体ND2全基因1 023 bp的序列,对序列的碱基组成、转换颠换、系统发育信号等进行了分析。并基于ND2全基因序列数据,分别采用邻接法（NJ）、最简约法（MP）、最大似然法（ML）和贝叶斯法重建了10属16种蝗虫的系统发育关系。结果表明：斑翅蝗科蝗虫ND2全基因A+T含量平均为74.6%;痂蝗亚科和异痂蝗亚科没能得到区分,建议合并为一个亚科;而斑翅蝗亚科和飞蝗亚科的分类地位还存在争议。     

粉蛉记(一)曲粉蛉属Coniocompsa Enderlein 1905(脉翅目:粉蛉科)

曲粉蛉属(Coniocompsa)是脉翅目(Neuroptera)粉蛉科(Coniopterygidae)中的一个属,因下颚的外颚叶分三节,前翅中脉(M)干有两根脉鬃,后翅M有一半以上与第一肘脉(Cu_1)密接,以及腹部具成对的腹囊而属于囊粉蛉亚科(Aleuropteryginae);并由于径分脉(Rs)正常,前后翅M均单一等而独立为曲粉蛉族(Coniocompsini)。本族内目前只此一属。     

中国黄粉蝶亚科六属间基于COⅡ和EF-1α基因部分序列的系统发育关系（鳞翅目：粉蝶科）

为了探讨中国黄粉蝶亚科属间的系统发育关系,我们对其中6属9种的细胞色素氧化酶Ⅱ（COⅡ）的部分序列和延伸因子基因（EF-1α）部分序列进行了分析。分别采用最大简约法（maximum parsimony, MP）、最大似然法（maximum likelihood, ML）和贝叶斯推论法（bayesian inference, BI）构建黄粉蝶亚科分子系统树。结果表明：在测得的COⅡ基因的648 bp序列和EF-1α基因的504 bp序列中,有261个变异位点,151个简约信息位点,黄粉蝶亚科内各属COⅡ基因A+T含量（77.3%）均明显偏高。系统发育分析显示黄粉蝶属为亚科中较为原始的类群,分化较早,豆粉蝶属和迁粉蝶属亲缘关系较近,但钩粉蝶属与豆粉蝶属、迁粉蝶属之间的亲缘关系还不能确定。本研究结果和传统的基于形态学的黄粉蝶亚科的分类体系有所不同,最显著的分歧是本研究支持内群中分化最早的属应为黄粉蝶属,而不是豆粉蝶属和迁粉蝶属。     

基于生物信息学对部分鸡形目鸟类系统发生关系的研究

本研究从GenBank下载了31种鸡形目鸟类、2种雁形目鸟类、1种戴胜目鸟类、1种佛法僧目鸟类和1种犀鸟目鸟类的线粒体16SrRNA基因的部分序列。经比对后序列长度为1384bp,其中有400个变异位点。A+T平均含量为54.2%,C+G平均含量为45.8%。贝叶斯系统发生分析揭示出鸡形目和雁形目分别形成单系。研究表明:(1)珠鸡科是鸡形目中较为原始的一个类群;(2)传统分类中的雉亚科和鹑亚科并非分别形成单系;(3)吐绶鸡科和松鸡科与雉科的亲缘关系较近;(4)孔雀属、Francolinus和Bambusicola之间的亲缘关系较近;山鹑属与多个雉亚科的亲缘关系较近;(5)雉科内各个属的属内分化主要发生于后中新世-更新世期间。     

基于12S rRNA和16S rRNA基因序列探讨中国蚤蝇科部分属间的系统发育关系

基于线粒体12S rRNA和16S rRNA基因序列联合分析,采用最大简约法、最大似然法和贝叶斯法分别构建了中国蚤蝇科14属的系统发育树.结果表明:联合分析序列总长度为819 bp,其中可变位点277个,简约信息位点200个;A+T平均含量为77.7%,具A、T偏倚性.系统发育分析显:中国蚤蝇科为单系发生,分为蚤蝇亚科和裂蚤蝇亚科两个单系群.蚤蝇亚科内脉蚤蝇属、锥蚤蝇属和刺蚤蝇属亲缘关系较近,栅蚤蝇属与栓蚤蝇属亲缘关系较近;裂蚤蝇亚科中虼蚤蝇属与裂蚤蝇属互为姐妹群,寡蚤蝇属与伐蚤蝇属互为姐妹群.     

从18S rDNA序列初探散胞盘菌亚科属间亲缘关系

散胞盘菌亚科Encoelioideae建于1932年,为盘菌纲Discomycetes锤舌菌目Leotiales锤舌菌科（广义）Leotiaceae的成员,它包括腐生、植物寄生、真菌上生的盘状子囊菌,现含18属,其中若干为单种属。传统分类从形态学角度将外囊盘表层细胞松散结合或者表面覆盖短的菌丝延伸物视为此亚科的主要特征,宏观上,其成员的共性表现为外囊盘被表面糠皮状、鳞屑状或霜状。迄今,学者们从未对散孢盘菌亚科这一性状是否反映属间亲缘关系进行过任何探讨,国际基因库中亦无此亚科的可利用序列。为了探明此性状在系统演化过程中的作用以及散胞盘菌亚科的属间亲缘关系,我们对此亚科中绿散胞盘菌Chlorencoelia、复柄盘菌属Cordierites、散胞盘菌属Encoelia、霍氏盘菌属Holwaya、拟爪毛盘菌属 Unguiculariopsis、以及丝绒盘菌属Velutarina代表种的18SrDNA片段进行了序列测定,受实验材料所限,每属只获得了一个种的18SrDNA序列。为了分析和比较,还对同一科内锤舌菌亚科Leotioideae中绿杯菌属Chlorociboria一个种的相关序列进行了测定。在构建系统树的过程中,核盘菌科的核盘菌Sclerotiniasclerotiorum被选为外群;从基因库中调入属于同一个目的地舌菌科和锤舌菌亚科几个属的代表即胶鼓菌属Bulgaria、锤舌菌属Leotia、小舌菌属Microglossum、新胶鼓菌属Neobulgaria和地勺菌属Spathularia的序列;利用ClustalW和TreeView软件,构建出Neighbour-joining系统进化树。初步的研究结果表明,散孢盘菌亚科不是单源的,该亚科的成员与其他亚科或者其他科的物种一起形成四个系统演化分支。散胞盘菌亚科的Holwaya与另一亚科的Bulgaria（Leotiaceae,Leotioideae）聚在一起,具有95%的序列相似性和97.4%支持率（bootstrapvalue）;此二属与Leotia（Leotiaceae,Leotioideae）和Microglossum（Geoglossaceae）组成姐妹群。散胞盘菌亚科Cordierites和Encoelia接近,支持率为93.6%;它们是Leotioideae中Chlorociboria和Neobulgaria两属的姐妹群。散胞盘菌亚科的Unguiculariopsis与Velutarina在一起,独立成为一个分支,支持率高达99.3%。Chlorencoelia与本研究所涉及的散胞盘菌亚科其他成员的关系都比较远。以上研究结果表明,散胞盘菌亚科很可能是多源的;但是,由于该亚科大多数属缺乏分子生物学证据,本研究结果只能作为推断。     

粉蛉亚科中国二新记录属与二新种（脉翅目：粉蛉科）

本文报导粉蛉亚科Ｃｏｎｉｏｐｔｅｒｙｇｉｎａｅ中国２新记录属；匣粉蛉属ＴｈｅｃｏｓｅｍｉｄａｌｉｓＭｅｉｎａｎｄｅｒ和半粉蛉属ＨｅｍｉｓｅｍｉｄａｌｉｓＭｅｉｎａｎｄｅｒ及２新种：杨氏匣粉蛉Ｔ．ｙａｎｇｉＬｉｕ和中华半粉蛉Ｈ．ｓｉｎｅａｓｉｓＬｉｕ。模式标本保存于北京农业大学昆虫标本馆。     

粉蛉记(二)粉蛉属Conwentzia Enderlein(脉翅目:粉蛉科)

粉蛉属Conwentzia后翅极退化,仅为前翅长的一半或更小,为粉蛉亚科Coniopteryginae中较特化的一类,Enderlein将此属单独列为(虫齿)粉蛉族Conwentzini。我国此属粉蛉以前无记载,本文就北京农业大学收藏的标本记述了中华蜡粉蛉Conwentziasinica(陕西)、直胫(虫齿)粉蛉C.orthotibia(甘肃)和中越(虫齿)粉蛉C.fraternalis(广西)三个新种。第一种表示为我国本属的初次记录,第二种是指足上突出的特征,第三种则因标本采自中越边界的大青山顶,为了纪念中越人民的友谊而命名的。     

基于细胞色素b序列的鲹科分子系统发育

测定了中国鲹科8属9种鱼的细胞色素b基因的全序列(1141bp),结合来自GenBank中分布于美国、安哥拉、希腊以及巴拿马的鲹科4属14种鱼的相应同源序列生成供系统发育分析的序列矩阵,用最大简约法和邻接法构建分子系统树。结果显示:(1)支持科下设四个亚科(鲹亚科,亚科,鲳鲹亚科,鰆鲹科)阶元的分类系统;(2)亚科属下不宜设亚属分类阶元;(3)及达副叶鲹与丽叶鲹亲缘关系较近,应同属于副叶鲹属;(4)我国传统的鱼类检索系统将狮鼻鲳鲹误鉴定为卵形鲳鲹,建议予以修正。     

Recent advances in the study of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus replication and pathogenesis

It has now been over twenty years since a novel herpesviral genome was identified in Kaposi's sarcoma biopsies. Since then, the cumulative research effort by molecular biologists, virologists, clinicians, and epidemiologists alike has led to the extensive characterization of this tumor virus, Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus(KSHV; also known as human herpesvirus 8(HHV-8)), and its associated diseases. Here we review the current knowledge of KSHV biology and pathogenesis, with a particular emphasis on new and exciting advances in the field of epigenetics. We also discuss the development and practicality of various cell culture and animal model systems to study KSHV replication and pathogenesis.     

The structure, reproduction and taxonomy of Vidalia and Osmundaria (Rhodophyta, Rhodomelaceae)

Comprises species occurring mostly in subtidal habitats in tropical, subtropical and warm-temperate areas of the world. An analysis of the type species, V. spiralis (Sonder) Lamouroux ex J. Agardh, a species from Australia, establishes basic characters for distinguishing species in the genus. These characters are (1) branching patterns of thalli, (2) flat blades that may be spiralled on their axis, (3) width of the blade, (4) primary or secondary derivation of sterile and fertile branchlets and (5) position of sterile and fertile branchlets on the thalli. Application of the latter two characters provides an important basic method for separation of species into three major groups. Osmundaria , a genus known only in southern Australia, was studied in relation to Vidalia , and its separation from the Vidalia assemblage is not accepted. Species of Vidalia therefore are transferred to the older genus name, Osmundaria. Two new species, Osmundaria papenfussii and Osmundaria oliveae are described from Natal. Confusion in the usage of the epithet, Vidalia fimbriala Brown ex Turner has been clarified, and Vidalia gregaria Falkenberg, described as an epiphyte on Osmundaria pro/ifera Lamouroux, is revealed to be young branches of the host, Osmundaria prolifera.     

New or rare chromosome counts in Artemisia L. (Asteraceae, Anthemideae) and related genera from Kazakhstan

Fifteen chromosome counts of six Artemisia taxa and one species of each of the genera Brachanthemum, Hippolytia, Kaschgaria, Lepidolopsis and Turaniphytum are reported from Kazakhstan. Three of them are new reports, two are not consistent with previous counts and the remainder are confirmations of very scarce (one to four) earlier records. All the populations studied have the same basic chromosome number, x = 9, with ploidy levels ranging from 2x to 6x. Some correlations between ploidy level, morphological characters and distribution are noted.     

肝癌中HBV和HCV基因和抗原的分布及意义

采用原位分子杂交方法检测HCV RNA及HBV X基因;采用免疫组织化学方法研究HCV核心抗原,非结构区C33c抗原及HBxAg在肝细胞肝癌中的定位及分布.结果表明(1)HCV RNA、HBV X基因在肝细胞肝癌组织检出率分别为40%(55/136)和82%(112/136).HCV RNA定位于癌细胞的胞浆内,阳性细胞呈散在、灶状及弥漫分布三种形式;HBV X基因在肝癌细胞中的分布呈胞浆型、核型及核浆型,阳性细胞也呈上述三种分布形式;(2)HCV C33c抗原、核心抗原在肝细胞肝癌中的阳性率为81%(133/164)及86%(141/164).C33c抗原定位于癌细胞及肝细胞的胞浆内;核心抗原既定位于癌细胞核中,又可定位于胞浆中.C33c抗原阳性细胞以灶状分布为主;而核心抗原阳性细     

Selection with two alleles and complete dominance

For a plant selection model with frequency-independent viabilities, fertilities and selfing rates, it is shown that apart from global fixation, for certain parameter combinations a protected polymorphism and facultative fixation (either allele may become fixed according to initial frequencies) may both occur. Facultative fixation requires different selling rates for the dominant and recessive type. Protection of the polymorphism requires resource allocation for male and female function. In this connection the problem of purely genetically caused population extinction is discussed.
For general frequency dependence and regular segregation, the chances for establishment of a completely recessive gene are compared to those of a completely dominant gene. It is proven that the process of establishment of the recessive gene, despite a fitness advantage, may be considerably endangered by drift effects if random mating prevails. The recessive gene may reach the same effectivity in establishment as a dominant gene, only if the recessive homozygote mates exclusively with its own type during the period of establishment.