基于数据挖掘分析MTERF2基因在子宫内膜癌的表达及意义

目的:基于数据挖掘分析线粒体转录终止因子2(MTERF2)基因在子宫内膜癌及正常子宫内膜组织中的表达情况,并进一步探讨MTERF2对子宫内膜癌患者预后的影响。方法:利用Oncomine数据库分析MTERF2基因DNA拷贝数在子宫内膜癌组织中的变化;利用cBioportal分析MTERF2基因在子宫内膜癌组织中的突变情况;通过基因表达谱动态分析(GEPIA)探讨人体正常组织及其相应的肿瘤组织中MTERF2基因的表达差异;经MethHC分析子宫内膜癌和正常子宫内膜组织中MTERF2基因DNA启动子区甲基化水平的差异;利用OncoLnc对MTERF2基因的表达水平与子宫内膜癌患者生存率做Kaplan-Meier生存分析和Log-Rank检验;在String-DB数据库中探索MTERF2基因在线粒体DNA表达调控过程中关系密切的相关基因。结果:与正常子宫内膜组织相比,子宫内膜癌组织中MTERF2基因DNA拷贝数无明显变化(P0.05),在mRNA水平呈显著低表达(P0.05),DNA启动子区甲基化水平显著降低(P0.005);MTERF2基因的表达水平与子宫内膜癌患者的总体生存时间无显著相关性(Log-Rank P0.05);TFB1M、TFB2M、POLMT、MTERFD1、MTERFD2、PTCD1、SSBP1、COA3、HDGFRP3等基因与MTERF2基因关系密切,可能存在相互作用。结论:大样本数据挖掘能迅速获取子宫内膜癌组织中MTERF2基因表达的相关信息,为深入探究MTERF2基因在子宫内膜癌发生发展中的作用机制及其预后价值奠定基础。     

CDH13甲基化参与的老年卵巢癌发病机制及EZH2的调控作用分析

分析研究CDH13甲基化和EZH2的表达在老年卵巢癌发病机制中的调控作用。选取2009年8月至2015年8月期间收治的160例老年卵巢癌患者进行研究,采用甲基化特异性聚合酶链式反应分析患者肿瘤组织与癌旁组织CDH13甲基化程度,采用ELISA法检测EZH2基因的表达水平。最终显示,卵巢癌组织中的CDH13基因甲基化率明显高于对照组和癌旁组织,IGF-1、IGF-2、EZH2、PTEN和COX-2蛋白的表达也明显高于对照组和癌旁组织,且差异显著,具有统计学意义(p0.05);CDH13基因的甲基化及EZH2蛋白表达与卵巢癌的临床分期和预后密切相关,且随着患者临床分期的升高、年龄及肿瘤组织的增大、肿瘤分化程度的升高,CDH13基因的DNA甲基化率明显升高(p0.05)。CDH13基因甲基化和EZH2基因表达与老年卵巢癌的临床分期和预后密切相关,可作为临床诊断及治疗的标志物。     

天冬酰胺合成酶(ASNS)在喉癌中的表达意义及苦参碱干预机制

[目的]探索天冬酰胺合成酶(ASNS)在喉癌诊断和预后中的意义及苦参碱干预机制。[方法]从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载喉癌的基因表达谱和临床数据，分析ASNS在喉癌组织和邻近非肿瘤组织中的表达差异，通过Logistic回归分析评估ASNS与临床病理参数的关系，进一步通过Kaplan-Meier生存分析和单因素、多因素Cox回归分析判断ASNS与喉癌患者临床特征的相关性，并对苦参碱与ASNS进行分子对接，预测其结合模式和亲合力。[结果]喉癌组织中ASNS的表达高于邻近非肿瘤组织(P<0.05),ASNS高表达患者生存时间明显短于低表达患者(P<0.05),ASNS表达与性别、N分期和T分期显著相关，性别、ASNS可作为喉癌患者的独立预后因素，并通过调控能量代谢、细胞功能等通路发挥作用。分子对接显示苦参碱与ASNS存在多个结合位点，最低结合能为-8.6 kcal/mol。[结论]ASNS在喉癌中高表达，是喉癌重要的诊断和预后标志物，可作为喉癌患者预后的独立预测因子，苦参碱可能通过调控ASNS发挥治疗喉癌的作用。     

基于公共数据库分析TCF3在胃癌中的表达及临床意义

[目的]探讨TCF3在胃癌组织中的表达水平及其与临床预后的相关性。[方法]通过GEPIA、ULCAN数据库分析TCF3在胃癌组织中的差异性表达、临床病理资料以及与错配修复基因之间的关系,并利用Kaplan-Meier Plotter数据库绘制TCF3与胃癌患者生存预后曲线。根据Spearman相关系数寻找胃癌中和TCF3作用相关的基因,另外对TCF3及其相关基因进行G0/KEGG富集分析,找出其中最具差异性的生物学注释,最后使用String数据库搭建TCF3蛋白质和上下游蛋白的调控互作网络。[结果]胃癌组织中TCF3表达水平明显高于正常胃组织(P<0.05),而且TCF3与错配修复基因MLH1、MSH2、MSH6、PMS2之间存在显著相关性(P<0.001),另外TCF3表达与肿瘤组织分化程度高低、是否感染幽门螺旋杆菌有关(P<0.05)。生存分析数据表明TCF3表达量越高,胃癌患者的总生存率和进展后生存率越低(P<0.001)。生信富集分析结果显示TCF3及其相关基因在生物遗传信息保存、细胞周期、肿瘤发生发展方面有重要作用(P<0.05),蛋白质网络提示...     

恶性胸膜间皮瘤中EFEMP1基因mRNA的表达及其临床病理学意义

目的:探讨人表皮生长因子含纤蛋白样胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因mRNA表达量与恶性胸膜间皮瘤(MPM)临床病理之间的相关性及其预后意义。方法:利用Oncomine数据库对非肿瘤组织与MPM组织中EFEMP1基因的mRNA表达量进行比较分析;采用R3.6.3软件下载美国公共癌症基因数据库(TCGA)中MPM数据集并分析EFEMP1基因mRNA表达的病理相关性;采用基因表达谱动态分析(GEPIA)构建Kaplan-Meier生存模型,探究EFEMP1基因mRNA表达量对MPM患者预后的影响;使用cBioportal进行EFEMP1基因相关性的可视化分析。结果:EFEMP1基因mRNA在正常组织中低表达,在MPM组织中高表达;EFEMP1基因mRNA表达水平与MPM的T分期(P=0.046)、病理类型(P=0.031)及组织学诊断类型(P=0.031)具有显著相关性;在MPM患者中,EFEMP1基因mRNA表达量与患者的总生存率和无疾病进展生存率均无显著相关性(logrank P0.05)。基因表达相关性分析结果表明,UGP2、RRAS2、ANXA3、UPK1B、ADH6、XPC与EFEMP1基因表达量呈显著性正相关(P0.05),TCF4、NFATC4、SMTN与EFEMP1基因表达量呈显著性负相关(P0.05)。结论:EFEMP1基因有望作为MPM诊断和治疗的潜在靶点,但EFEMP1基因mRNA表达量不是判断MPM患者预后的有效指标。     

基于生物信息学分析的宫颈鳞状细胞癌预后相关基因的筛选

为了分析宫颈鳞状细胞癌(cervical squamous cell carcinoma, CESC)与正常组织中的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),鉴定与CESC预后相关的关键基因,从GEO和TCGA数据库下载CESC的基因表达谱数据,利用R软件筛选CESC组织与正常组织中的DEGs,并对这些DEGs开展功能和通路富集分析;然后构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,筛选出关键(hub)基因;最后对hub基因进行LASSO COX回归及总体生存率(overall survival, OS)分析。研究共筛选出167个DEGs,这些基因主要涉及染色体分离、DNA复制等生物过程,介导染色质结合、G蛋白偶联受体结合等分子功能,富集于染色体区域、纺锤体和MCM复合体。GSEA分析结果显示,富集的通路主要涉及DNA复制和细胞周期信号通路。此外,从PPI网络中筛选出20个hub基因, LASSO COX回归结果显示MAD2L1、ZWINT、RRM2、TTK、CDC6、PBK、TOP2A、KIF11、KIF20A、NCAPG、NUSAP1、CCNB1及CDK1与CESC患者的预后相关; Kaplan-Meier曲线显示, ZWINT、DTL、CCNB1、CDC6、TOP2A、CDK1、PBK、RFC4及NUSAP1的m RNA表达水平与CESC患者生存预后相关。本研究结果表明, ZWINT、CDC6、PBK、TOP2A、NUSAP1、CCNB1和CDK1为CESC的预后关键基因,为阐明CESC的分子机制提供了理论依据。     

食道癌组织miR-21、miR-182表达与临床病理特征及预后的关系

目的:探讨食道癌组织微小RNA-21(miR-21)、微小RNA-182(miR-182)表达与临床病理特征及预后的关系。方法:选取2011年4月到2013年7月期间在我院接受手术治疗的食道癌患者84例,取患者的癌组织和癌旁正常组织作为检验标本,比较癌组织和癌旁正常组织中miR-21、mi R-182的表达水平,并分析食道癌组织中mi R-182、mi R-21的表达与临床病理特征及预后的关系。结果:癌组织中mi R-21、mi R-182的相对表达量明显高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。食道癌组织中mi R-21的表达与淋巴结转移、临床分期有关(P<0.05),与性别、年龄、分化程度、肿瘤大小无关(P>0.05);食道癌患者癌组织中miR-182的表达与年龄、性别、肿瘤大小无关(P>0.05),与分化程度、临床分期、淋巴结转移有关(P<0.05)。食道癌癌组织中miR-21、miR-182高表达患者的中位生存时间均低于低表达患者,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:食道癌组织mi R-21、mi R-182表达与患者的部分临床病理特征及预后有关,两者有望成为食道癌新的治疗靶点。     

基于ONCOMINE数据库荟萃分析BRCA1基因在肺癌中的表达及意义

为探讨BRCA1基因在肺癌中的表达及对肺癌患者预后生存意义,本研究利用(BioGPS, Oncomine,Kaplan-Meier Plotter)基因数据库和癌症细胞系百科全书(CCLE),分析BRCA1基因在正常人体组织中的表达以及差异表达情况,并对符合条件的研究进行Meta分析,同时分析BRCA1基因在肺癌组织细胞系中的表达和对肺癌患者预后生存意义。研究发现,BioGPS数据库显示BRCA1在正常肺癌组织中低表达(3.65±0.035);同时Oncomine数据库检索BRCA1基因有453项不同种类结果,35项结果表达有统计学差异意义,其中28项显示表达增高,7项显示表达降低,共有研究样本量229例;并对符合条件的5项研究进行Meta分析,发现BRCA1基因差异表达中位数值排名为34.0,p=2.51×10~(-5);与CCLE检索BRCA1基因在肺癌组织细胞系中高表达的结果一致;Kaplan-Meier Plotter数据库检索结果表明BRCA1表达水平与患者的总生存预后周期相关(p=9.5×10~(-6));并且BRCA1高表达组相对于低表达组的肺癌患者总体生存周期明显降低(p0.05)。因此,通过深入挖掘Oncomine等数据库中BRCA1基因芯片信息,证实BRCA1基因在肺癌组织中呈现高表达状态,且与肺癌患者预后生存周期相关,为临床肺癌的治疗及基因靶向药物的研制提供重要依据。     

胃癌组织中微小RNA-375基因甲基化及其表达与临床病理特征的关系研究

目的:研究胃癌组织中微小RNA-375(miRNA-375)基因甲基化及其表达与临床病理特征的关系。方法:选择从2015年9月到2017年6月在我院接受手术治疗的胃癌患者60例纳入研究对象,将术中切除的癌组织标本60例作为观察组;另选同期在我院治疗的浅表性胃炎患者60例,将经内镜采集到的正常胃黏膜标本60例作为对照组。检测并对比两组患者miRNA-375基因甲基化及表达水平,分析胃癌患者的miRNA-375基因表达水平及甲基化与其病理特征的关系,并采用Spearman法分析miRNA-375基因表达水平、基因甲基化与其分化程度的相关性。结果:观察组miRNA-375基因的表达水平为(0.034±0.021),明显低于对照组的(0.187±0.104),差异有统计学意义(P0.05)。miRNA-375基因甲基化的阳性率为61.67%(37/60),明显高于对照组的20.00%(12/60),差异有统计学意义(P0.05)。低分化胃癌患者的miRNA-375基因表达水平明显低于中、高分化者,差异有统计学意义(P0.05)。低分化胃癌患者的miRNA-375甲基化阳性率明显高于中高分化者,差异有统计学意义(P0.05)。根据Spearman相关性分析发现,胃癌患者的miRNA-375基因表达水平与其分化程度呈正相关(P0.05),基因甲基化与其分化程度呈负相关(P0.05)。结论:胃癌组织中的miRNA-375基因的表达水平明显下降,而基因甲基化的比例明显上升,且二者均与肿瘤的分化程度有关,可考虑在临床上将其作为监测靶点,从而更好地评价患者的病情及预后。     

lncRNA DGCR5在非小细胞肺癌组织中的表达及其与临床病理特征的相关性分析

摘要 目的：探究lncRNA DGCR5在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达及其与临床病理特征的相关性。方法：选取2020年1月至2021年12月在我院肿瘤科收治的进行手术治疗的NSCLC患者86例,在手术期间从患者获得肿瘤和非肿瘤的肺癌旁组织样本。采用qRT-PCR测定肿瘤组织及癌旁组织中lncRNA DGCR5表达水平。分析lncRNA DGCR5表达水平与NSCLC患者性别、年龄、临床分期、T分期、N分期等临床病理参数的关系,lncRNA DGCR5表达水平与患者预后总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）的关系。结果：与癌旁组织相比,lncRNA DGCR5在NSCLC肿瘤组织中的表达水平相对较低,差异具有统计学意义（P<0.01）。lncRNA DGCR5表达与肿瘤分化程度、TNM分期、肿瘤体积、淋巴转移和远处转移之间存在明显相关性,差异具有统计学意义（P<0.05）。采用Kaplan-Meier法进行生存分析,研究发现lncRNA DGCR5高表达组中位OS及中位DFS分别显著高于lncRNA DGCR5低表达组（P<0.05）。低分化程度、II+ IIIa临床分期、N1-N3淋巴转移、远处转移、及lncRNA DGCR5 低表达均与NSCLC患者总生存率和无进展生存率相关。结论：LncRNA DGCR5在NSCLC患者肿瘤组织中的表达量降低,NSCLC患者血LncRNA DGCR5表达水平与分化程度、TNM分期、淋巴转移、远处转移及预后具有相关性。LncRNA DGCR5可作为早期诊断和治疗NSCLC的新型生物标志物。     

结直肠癌组织LASS2、HOXB7蛋白表达与凋亡指数及预后的关系分析

摘要 目的：探讨结直肠癌（CRC）组织人源长寿保障基因2（LASS2）、同源异型盒基因B7（HOXB7）表达与凋亡指数（AI）及预后的关系。方法：选择2013年10月至2015年4月期间在我院接受治疗的105例CRC患者作为研究对象。检测其CRC组织以及癌旁组织中LASS2、HOXB7表达以及AI,分析LASS2、HOXB7表达与临床病理特征的关系,采用Kaplan-Meier生存曲线分析不同LASS2、HOXB7表达患者总生存率的差异,Cox比例风险回归分析CRC患者预后的影响因素。结果：CRC组织中LASS2阳性率低于癌旁正常组织,而HOXB7阳性率高于癌旁正常组织（P<0.05）,CRC组织中AI低于癌旁正常组织（P<0.05）。经Spreaman相关性分析显示CRC组织LASS2阳性率和AI呈正相关关系,而HOXB7阳性率和AI呈负相关关系（P＜0.05）。LASS2表达与临床分期、浸润深度和淋巴结转移有关（P<0.05）,而HOXB7表达与临床分期和淋巴结转移有关（P<0.05）。HOXB7表达阳性患者的生存率低于HOXB7表达阴性患者,而LASS2表达阳性患者的生存率高于LASS2表达阴性患者（P<0.05）。Cox比例风险回归分析结果显示,临床分期为Ⅲ期、有淋巴结转移、LASS2阴性表达、HOXB7阳性表达以及AI＜2.0%均是影响CRC患者预后的危险因素（P<0.05）。结论：在CRC组织中HOXB7阳性率升高,而LASS2阳性率以及AI下降,且与临床分期以及淋巴结转移密切相关。LASS2、HOXB7表达及AI与CRC患者的生存和预后联系密切。     

骨肉瘤中RASSF1A基因的甲基化状态研究

目的:分析骨肉瘤组织中RASSF1A基因甲基化状况。方法:运用甲基化特异性PCR(MSP)分别检测44例骨肉瘤组织及相应的癌旁组织中RASSF1A基因启动子甲基化状态并分析其临床病理意义。结果:骨肉瘤组织中RASSF1A基因异常甲基化率(61.4%)显著高于癌旁正常骨组织中RASSF1A基因的异常甲基化率(20.5%),二者之间差异具有统计学意义(P<0.05)。RASSF1A基因异常甲基化导致组织中RASSF1A基因mRNA和蛋白表达水平均显著降低。另外,RASSF1A基因异常甲基化和肿瘤组织分化程度及全身有无转移情况有相关性(P值分别为0.022和0.016),而与患者年龄、性别、肿瘤位置及大小等临床特征无关(P值分别为0.6944,0.977,0.786和0.831)。结论:RASSF1A基因启动子高甲基化可能是导致其在骨肉瘤中表达水平降低的分子机制之一,有望成为骨肉瘤早期辅助诊断的一个重要分子标志物。     

CDH1 基因启动子甲基化与宫颈癌临床病理类型的关系

目的:探讨分析CDH1基因启动子甲基化与宫颈癌临床病理类型的关系。方法:选取2012年5月~2015年7月我院105例宫颈癌患者为宫颈癌组,同时选取60例正常宫颈组织为正常组,以甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测CDH1基因启动子Cp G岛甲基化状态及高危型HPV DNA状态,分析CDH1基因甲基化状态与高危型HPV DNA状态及临床病理参数的关系。结果:宫颈癌组CDH1基因启动子甲基化阳性率为56.19%,明显高于正常组的6.67%,具有统计学差异(P0.05);宫颈癌组的高危型HPV DNA阳性率为84.76%,明显高于正常组的20.00%,具有统计学差异(P0.05);高危型HPV DNA与CDH1基因启动子甲基化的一致性分析结果具有统计学意义(P0.05);CDH1基因启动子甲基化率与患者的WHO组织分化程度分级、FIGO分期、组织病理学分型、肿瘤大小有关,差异有统计学意义(P0.05)。结论:宫颈癌CDH1基因启动子甲基化与WHO组织分化程度分级、FIGO分期、组织病理学分型、肿瘤大小具有关联,并与高危型HPV DNA阳性具有一致性,可以作为宫颈癌诊断和预后评估的参考指标。     

非小细胞性肺癌患者Runx3基因启动子区甲基化状态研究

目的:分析非小细胞性肺癌(NSCLC)中Runx3基因启动子区甲基化状态.方法:运用甲基化特异性PCR技术检测62例NSCLC组织和癌旁正常肺组织中Runx3基因启动子甲基化,并分析该基因启动子甲基化Runx3基因mRNA和蛋白表达的影响及其与临床特征之间的关系.结果:NSCLC组织中Runx3基因异常甲基化率(48.4%)显著高于癌旁正常肺组织中Runx3基因的异常甲基化率(17.7%,P＝0.000);发生完全或者不完全甲基化的NSCLC组织或者正常肺组织中Runx3基因mRNA和蛋白表达显著降低.Runx3基因启动子区高甲基化和肿瘤分化程度及临床分期有相关性(P＝0.041和0.009),而与NSCLC患者性别、年龄、有无吸烟史及肿瘤类型等临床特征无关(P=0.400,0.301,0.290和0.965).结论:Runx3基因启动子区异常甲基化是导致Runx3基因在NSCLC中表达下调的重要因素,有望成为NSCLC早期辅助诊断的分子标志物之一.     

COTE1在肝细胞癌中的表达及其与临床病理参数及预后的相关性

目的:探究重组人序列相似性家族189成员B(FAM189B,别名COTE1)在肝细胞癌组织中的表达及与肝细胞癌患者预后的相关性。方法:收集59例行肝细胞癌根治术的患者,取其肝细胞癌组织及癌旁组织,采用免疫组织化学法检测COTE1表达,分析COTE1表达与临床病理参数的关系,采用Kaplan-Meier生存曲线分析COTE1表达与患者预后的关系,并采用COX比例风险回归模型分析预后的影响因素。结果:免疫组织化学法检测结果显示,肝细胞癌组织中37例COTE 1高表达,癌旁组织中24例COTE1高表达,肝细胞癌组织中COTE1的表达率明显高于癌旁组织(P<0.05);COTE1表达与甲胎蛋白(AFP)值及肿瘤复发情况存在相关性(P<0.05),而与年龄、性别、肿瘤大小无关(P>0.05)。Kaplan-Meier曲线分析发现,COTE1高表达的肝细胞癌患者术后生存期较短(P<0.05)。COX比例风险回归分析发现COTE1表达可以作为影响肝细胞癌患者预后的一个独立危险因素(P<0.05)。结论:COTE1在肝细胞癌组织中表达高于癌旁组织,COTE1表达可以作为一个独立因素来预测肝细胞癌患者的预后。     

NF2基因甲基化及其mRNA表达与乳腺癌发病的关系(英文)

目的:探讨乳腺癌中NF2基因启动子甲基化状态及其mRNA水平与乳腺癌发病的关系。方法:应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,检测47例乳腺癌组织及相应的癌旁组织和15例乳腺良性病变组织,分析NF2基因的甲基化与某些临床参数及mRNA表达的关系。结果:NF2基因启动子区在乳腺癌、癌旁和乳腺良性病变组织中的甲基化频率分别为57.4%(27/47)、23.4%(23/47)和0%(0/15),且乳腺癌组明显高于其余两组(P<0.05)。NF2基因发生甲基化与发病年龄、组织分型、转移和组织分级无相关性。乳腺癌组NF2基因mRNA的相对表达量(0.16±0.11)明显低于相应的癌旁组(0.27±0.14)及乳腺良性病变组(0.64±0.17()P<0.05)。NF2基因启动子区甲基化频率与其mRNA表达呈负相关(Spearman’sr=-0.314,P<0.05)。结论:NF2基因发生甲基化与乳腺癌的发生密切相关,NF2mRNA表达与NF2基因启动子高甲基化呈负相关。     

氨基酸转运载体SLC1A5在胃癌组织中的表达及其临床病理学意义

目的:研究氨基酸转运载体溶质载体家族1成员5(Solute Carrier Family 1 Member 5, SLC1A5)蛋白在胃癌组织中的表达情况,并探讨其与胃癌临床病理特征及预后的相关性。方法:收集进展期胃癌组织及对应癌旁组织90例,应用免疫组化技术检测SLC1A5在上述组织中的表达情况,并统计分析其表达与胃癌临床病理特征及预后的关系。同时通过基因数据库分析SLC1A5在胃癌组织和癌旁组织中表达情况及其对胃癌患者预后的影响。结果:与癌旁组织相比,胃癌组织中SLC1A5表达明显上调(P0.0001)。数据库研究也显示SLC1A5在胃癌组织中表达明显上调(GSE 65801,P=0.0046;GSE 63809,P0.0001;GSE 27342,P=0.0147)。胃癌组织中SLC1A5高表达与肿瘤大小(P0.05)、肿瘤浸润深度(P0.01)、淋巴结转移(P0.05)、TNM分期(P0.05)和Ki-67(P0.01)相关,而与年龄、性别、肿瘤位置及分化程度均无显著相关性(P0.05)。胃癌组织中SLC1A5表达强度与患者预后相关,表达越高,患者预后越差(总体生存率,P=0.0131;无复发生存率,P=0.0293)。数据库分析也显示SLC1A5高表达可明显缩短患者的总体生存期(GSE 14210,P=0.011;GSE 22377,P=0.0015)和无进展生存期(GSE 14210,P=0.0095;GSE 22377,P=0.0012)。结论:SLC1A5蛋白表达在胃癌组织中明显上调,且与肿瘤大小、肿瘤浸润深度、淋巴结转移及TNM分期有关。SLC1A5高表达与胃癌患者预后不良密切相关。     

食管鳞癌组织中TNFAIP3的表达及其预后意义

目的研究肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(tumor necrosis factorα-induced protein 3, TNFAIP3)在食管鳞癌中表达的临床病理意义及其对鳞癌预后的判断价值。方法免疫组织化学法检测100例随访食管鳞癌及80例癌旁组织中TNFAIP3蛋白的表达,并分析了其与食管鳞癌临床病理特征及预后的关系。结果 TNFAIP3在食管鳞癌中高表达阳性率为47.0%(47/100),显著高于癌旁组织中的高表达率15.0%(12/80),且与肿瘤的分化程度有关;生存分析显示高表达TNFAIP3的患者预后不良,单因素生存分析显示TNFAIP3的表达、肿瘤的浸润深度、淋巴结转移、临床分期与食管鳞癌预后密切相关,多因素生存分析显示TNFAIP3的表达、肿瘤的浸润深度、淋巴结转移、临床分期为食管鳞癌的独立预后预测因子。结论表达增高的TNFAIP3可能参与了食管鳞癌的发生发展,TNFAIP3的高表达可能成为食管鳞癌的独立预后因子。     

p27~(Kip1)和CyclinD1在非小细胞肺癌中表达及意义

为了探讨p27Kip1蛋白和CyclinD1蛋白在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达及意义,收集临床手术切除的非小细胞肺癌组织蜡块64例及正常肺组织10例,应用免疫组化(S-P法)检测组织中p27Kip1蛋白和CyclinD1蛋白的表达,结合临床病理资料和随访资料进行回顾性研究。实验发现NSCLC组织中p27Kip1蛋白表达和CyclinD1蛋白表达均明显不同于正常肺组织(P<0.01)。p27Kip1蛋白表达降低与NSCLC肿瘤大小、病理分级、分期增加、淋巴结转移之间有相关性(P<0.05),但与肿瘤组织学分型无相关性(P>0.05)。CyclinD1蛋白过表达与组织学分型、肿瘤大小、病理分级、临床分期、淋巴结转移无相关性(P>0.05)。p27Kip1蛋白表达与CyclinD1蛋白表达之间呈显著负相关(P<0.01)。cox单因素及多因素分析,p27Kip1蛋白低表达及CyclinD1过表达是影响NSCLC患者预后的主要因素。实验结果显示,NSCLC组织中,p27Kip1蛋白表达降低,而CyclinD1过表达,二者与NSCLC的发生发展机制有关,可作为预后指标,有利于NSCLC患者预后判断及个体化治疗。     

FN1在GBM中的表达差异及对预后的影响

[目的]探究纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)在多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及对患者预后的影响,为GBM的早期诊断和治疗提供生物标志物。[方法]CCLE数据库分析FN1在不同肿瘤细胞系中的表达;UALCAN和GEPIA2数据库分析FN1在GBM肿瘤组织和正常组织中的表达差异;The Human Protein Atlas数据库分析FN1蛋白在GBM肿瘤组织和正常组织中的表达;GEPIA2数据库分析FN1在肿瘤组织中的异常表达对GBM患者总体生存率和无病生存率的影响;DAVID 6.8在线软件对FN1相关基因进行KEGG通路富集。[结果]在所有类型肿瘤细胞系中,GBM肿瘤细胞系中FN1 mRNA表达水平中排第八;FN1在GBM肿瘤组织中的表达高于正常组织(***P<0.001和*P<0.05),并且FN1高表达后GBM患者的总体生存率和无病生存率均降低(P=0.028和P=0.0056);KEGG分析结果表明与FN1正相关的基因富集通路有57个,癌症通路位于第三位。[结论]FN1在GBM中明显上调,是GBM诊断和预后的有效生物标志物。