我看负协同性变构酶

我看负协同性变构酶赵登蔚（蚌埠医学院生化教研室,蚌埠２３３００３）关键词变构酶,负协同性对于天冬氨酸转氨基甲酰酶（ＡＴＣ酶）这样的酶来说,天冬氨酸既是它的底物又是变构剂,它能触发所谓同促正协同效应,即底物分子结合到酶（寡聚体）的第一个亚基所引起的构象...     

Kappa乘积法在寡聚体变构酶反应速度方程中的应用

寡聚体变构酶所催化的反应中,酶与底物的结合是逐步的,形成链式反应.因此,酶与底物结合的每一种形式可用一组相应的速度常数乘积来表示,这是根据平衡理论建立微分方程组所导出来的,本文应用Kappa乘积法简易导出MWC及KNF模式的速度方程,并对这种方法应用范围的扩大作了讨论.     

蛋白质构象病提示的疾病防治新思路

蛋白质构象病是由于组织中特定的蛋白质承受了构象变化,进而聚集并产生沉积所引起的一种疾病。构象病概念的提出提示人们可以通过抑制或者逆转组织蛋白的变构来防治疾病,本文就蛋白质构象病的概念以及近年关注较多的β折叠形成阻断肽和分子伴侣两种防治思路予以综述。     

核糖糖基化BSA单体对SH-SY5Y细胞的毒性明显

研究显示,蛋白质异常修饰形成的寡聚体,与其多聚体、淀粉样纤维相比,具有更强的细胞毒性．这一发现被认为是蛋白质错误折叠和聚集研究领域中的重要进展．蛋白质的异常修饰如还原糖的非酶糖基化,是糖尿病最基本的病理特征．2型糖尿病患者尿液中的核糖浓度显著升高,表明糖尿病不仅与葡萄糖代谢紊乱相关,同时也与核糖代谢失调相关．以牛血清白蛋白(BSA)为研究对象,通过荧光分光光度计检测、原子力显微镜、透射电子显微镜观察以及分子排阻色谱分离,观察到核糖糖基化能够诱导BSA聚集,从单体、寡聚体逐渐形成多聚体．通过CCK-8 Kit、乳酸脱氢酶细胞活性检测、TUNEL染色、caspase-3活性检测以及流式细胞检测等方法,发现核糖糖基化的BSA单体对SH-SY5Y细胞(人神经母细胞瘤细胞系)具有明显的毒性,与此同时,糖化寡聚体和多聚体没有表现出显著的毒性．进一步研究发现,核糖糖基化的BSA单体通过与AGEs的受体RAGE相互作用,激活细胞内的MAPK通路,从而导致细胞凋亡．     

核糖糖基化BSA单体对SH-SY5Y细胞的毒性明显（英文）

研究显示,蛋白质异常修饰形成的寡聚体,与其多聚体、淀粉样纤维相比,具有更强的细胞毒性.这一发现被认为是蛋白质错误折叠和聚集研究领域中的重要进展.蛋白质的异常修饰如还原糖的非酶糖基化,是糖尿病最基本的病理特征.2型糖尿病患者尿液中的核糖浓度显著升高,表明糖尿病不仅与葡萄糖代谢紊乱相关,同时也与核糖代谢失调相关.以牛血清白蛋白(BSA)为研究对象,通过荧光分光光度计检测、原子力显微镜、透射电子显微镜观察以及分子排阻色谱分离,观察到核糖糖基化能够诱导BSA聚集,从单体、寡聚体逐渐形成多聚体.通过CCK-8 Kit、乳酸脱氢酶细胞活性检测、TUNEL染色、caspase-3活性检测以及流式细胞检测等方法,发现核糖糖基化的BSA单体对SH-SY5Y细胞(人神经母细胞瘤细胞系)具有明显的毒性,与此同时,糖化寡聚体和多聚体没有表现出显著的毒性.进一步研究发现,核糖糖基化的BSA单体通过与AGEs的受体RAGE相互作用,激活细胞内的MAPK通路,从而导致细胞凋亡.     

二氢叶酸还原酶天然状态可能存在两种构象

鸡肝二氢叶酸还原酶（ＤＨＦＲ）平衡态的去折叠曲线符合二态模型,但在４．０ｍｏｌ／Ｌ脲中的去折叠动力学为两相。该酶的ＡｒｒｅｈｉｕｓＰｌｏｔ有一个拐点,但在低浓度变性剂存在下,拐点消失。用二氢叶酸还原酶的天然状态存在两种构象可以很好地解释上述现象。二氢叶酸还原酶去折叠过程中没有稳定存在的中间体,动力学过程中的两相可能是两种天然构象态的去折叠速度常数不同造成的。ＡｒｒｅｈｉｕｓＰｌｏｔ的拐点是由于在不同的温度条件下,两种天然构象的含量不同造成的,低浓度变性剂对两种构象的影响不同,使拐点消失。ＫＣｌ可以改变两种构象的平衡     

不同聚集状态的Aβ寡聚体在阿尔茨海默病发生中的作用机制研究进展

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是一种以智力损害和认知障碍为主要临床表现的神经退行性疾病.AD的发病因素和发病机制十分复杂,国际上对AD多年的研究提出几种假说,其中以β淀粉样蛋白(β-amyloid,Aβ)为AD主要致病因子的Aβ假说一直占据重要地位.Aβ可以分为单体、寡聚体和纤维状Aβ,其中寡聚体Aβ是导致AD中认知功能障碍和神经退变的主要因素.Aβ寡聚体又可以细分为不同的聚集状态,不同聚集状态的Aβ寡聚体在AD发生发展过程中起到的作用不同.本文主要综述几种不同聚集状态的寡聚体在AD发病中的作用及机制.     

变构现象中的类似相变重整化群研究

一、引言所谓变构现象,是指寡聚蛋白(例如变构酶)这样的大分子与配位体(例如底物)这样的小分子结合中表现的协同现象,是分子生物物理中研究得很活跃的课题。如果令θ_s表示酶蛋白分子的亚基结合底物分子的百分数,θ_c表示酶蛋白分子亚基的某种构象呈现的百分数,则在热平衡条件下,实验观测到在不同配位体浓度s下,θ_s或θ_c与s的关系皆呈s-型曲线,如图1。S-型曲线表现了系统的宏观景像在某个配     

高梁叶片磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶疏水微区的荧光研究

应用疏水荧光探针－－ＡＮＳ在不同浓度的变构效应剂存在时进行荧光滴定,磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶分子中疏水微区的微环境能被效应剂或底物诱导产生变构,不同的变构效应所诱发的构象态是不一致的。这进一步证明了高梁叶片磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶在溶液中的多构象态。     

高粱叶片磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶疏水微区的荧光研究

应用疏水荧光探针──ＡＮＳ在不同浓度的变构效应剂存在时进行荧光滴定．磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶分子中疏水微区的微环境能被效应剂或底物诱导产生变构,不同的变构效应剂所诱发的构象态是不一致的。这进一步证明了高粱叶片磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶在溶液中的多构象态。     

药靶的变构调节剂：可调光开关型药物的研发动态

包括一些大型制药公司在内，越来越多的公司开始研究能够调节靶物的分子——变构调节剂（分为调幅、调频和调相）。构象激动剂和拮抗剂的作用就如同灯的开关一样，可以将受体独立地、与内源性配基结构性地打开或者关闭，而变松调节剂却可以起到一种调节开关的作用，在数量上调节某种受体的活性。不再是以前那样的只是打开或者关闭靶物。本文深入阐述了这种具备可调开关功能型药物的研发动态。     

锌离子对氨基酰化酶构象及其稳定性的影响

天然氨基酰化酶和脱谷氨基酰化酶无论在二级结构（用ＣＤ和ＦＴＩＲ监测）还是三级结构上（以荧光发射光谱监测）都有明显的差异,表明了脱锌后酶的有序度降低;当比较天然和脱锌氨基酸化酶对去圬剂的稳定性时,结果表明脱锌后酶的构象的稳定性明显降低．因此可以认为锌离子对维持酶分子活性部位的特定构象以及构象的稳定性具有重要的作用．     

微生物几丁质酶研究进展及应用*

几丁质由N-乙酰-D-氨基葡萄糖聚合而成,是自然界中仅次于纤维素的第二大类聚合物。微生物几丁质酶来源丰富,是生物降解或利用几丁质的主要媒介。野生型菌株几丁质酶产量低、活性弱,故近年来有关几丁质酶的研究侧重于对其产量及催化活性的提升等方面。此外,几丁质酶具有水解病原真菌细胞壁、破坏害虫体壁、生产N-乙酰氨基葡萄糖寡聚体或单体的应用价值,在医药、农业、食品加工等领域表现出巨大的市场潜力。综述微生物几丁质酶的来源、分类及工程改造,为后续几丁质酶的研究及开发利用提供参考。     

叶绿素寡聚体的光化学性质及其水悬浮液在光下的pH变化

单体叶绿素α在含水的石油醚中形成叶绿素α-水寡聚体,在含二氧六圜的石油醚中形成叶绿素α-二氧六圜寡聚体。两者除吸收光谱有所不同外,其光化学性质也有明显区别:叶绿素α-二氧六圜寡聚体的延迟发光强度比叶绿素α-水寡聚体的大一个数量级;叶绿素α-二氧六圜寡聚体带有负电荷,电镀时趋向正极,叶绿素α-水寡聚体带正电荷,电镀时趋向负极;两种寡聚体电镀所成的膜在光下产生相反的光电位。叶绿素α-水寡聚体水悬浮液在照光时有pH值变化,变化幅度0.2—0.3pH单位,停止照光pH恢复原值。     

蛇肌果糖1，6－二磷酸酯酶的R态和T态的构象

几种高活性形式的蛇肌果糖１,６－二磷酸酯酸的紫外差光谱与酶在尿素或盐酸胍中差光谱相似,它们的酶学性质及巯基暴露的程度各不相同,提示这些高活性形式的酶的构象呈稳定的松驰状态（Ｂ态）,构象松驰的程度也各不相同。受果糖２,６－二磷酸、ＡＭＰ和过量底物抑制的酶处于三种不同的低活性状态,它们的构象特征与Ｒ态相反,提示此三种低活性酶构象处于较紧凑状态（Ｔ态）。这几种Ｔ态酶流基暴露的程度,受蛋白水解酶限制性酶解的速度不同,说明这些Ｔ态酶的构象的紧凑程度是有差异的。蛇肌酶的不同的活化状态所具有不同的稳定的构象状态,在能量上可能相差很小,便于受到多种因子的调节。这可能是别构酶所普遍具有的现象。     

微生物脂酶及其在环境生物技术领域中的应用

脂酶是生物体内脂类物质 (三酰甘油脂 )生物转化过程中不可缺少的催化剂。除其生物学意义外 ,脂酶在食品加工、生物医学、化工及环境保护等众多领域中有着巨大的应用前景。脂酶具有在液相和非液相 (即有机相 )界面间起催化作用的独特性能 ,使其与酯酶不同。脂酶界面激活的概念源自以下事实 ,即脂酶的催化活性通常依赖于底物的聚集状态。可以认为脂酶的激活涉及到酶的活性部位的暴露和结构变化 ,这种变化需要在有水包油液滴存在下通过构象的改变来实现。脂酶的活性与反应体系的表面积有关。最近对几种脂酶结构的研究结果为深入理解其水解活性…     

ACSBAIA方法及其在烯丙胺类抗真菌药物设计中的应用

根据活性类似物活性基团在能量补偿许可范围内能够到达受体活性部位与各作用位点结合 ,而无 (低 )活性类似物的活性基团由于构象限制因素等不能与之结合的原理 ,建立一种新的搜寻药物分子的活性构象程序ACSBAIA .该程序包括 4个子系统 :构象抽样、活性构象限定、无活性构象排除、活性预测 .用此方法搜寻了烯丙胺类抗真菌药物的活性构象 ,并对 2个高活性和无活性的类似物进行了预测和检验 ,证明该方法较科学实用 .该方法的应用不受受体三维结构知识多少的限制 ,对目前绝大多数受体三维结构未知的情况尤其适用     

新型Aβ42寡聚体模拟表位疫苗的制备

旨在获得一株特异靶向致病性Aβ42寡聚体的模拟表位疫苗。在前期工作中,应用亲和层析的方法从人静脉用免疫球蛋白(Intravenous immune globulin,IVIG)中纯化获得特异性识别Aβ42寡聚体的抗体组分IVIG-AOB。以IVIG-AOB为靶蛋白,应用噬菌体展示技术淘选出一系列Aβ42寡聚体的特异性环状模拟表位多肽,随后将表位多肽融合表达至乙肝病毒核心蛋白(HBcVLP)构建成表位载体疫苗,进而将免疫小鼠,从中筛选出能有效免疫产生抗Aβ42寡聚体抗体的模拟表位疫苗。从噬菌体环形七肽库中筛选出5条特异性结合IVIG-AOB的模拟表位多肽,将其克隆至HBc载体,并在大肠杆菌中成功表达和组装成嵌合表位的HBc-VLP,通过免疫小鼠优选出一株效果最好的Aβ42寡聚体构象表位疫苗HBc-C4。Aβ寡聚体是AD发生发展的主要致病因素。基于Aβ42寡聚体独特的构象表位研制的表位HBc-VLP疫苗诱导机体产生的抗体将能够特异靶向并中和毒性Aβ42寡聚体,而不影响Aβ42的正常生理功能,从而起到从根本上治疗AD的作用。     

蛇肌果糖1,6—二磷酸酯酶的R态和T态的构象

几种高活性形式的蛇肌果糖１,６－二磷酸酯酶的紫外差光谱与酶在尿素或盐酸胍中差光谱相似,它们的酶学性质及巯基暴露的程度各不相同,提示这些高活性形式的酶的构象呈稳定的松驰状态,构象松驰的程度也各不相同,受果糖２,６－二磷酸、ＡＭＰ的过量底物抑制的酶处于帮种不同的低活性状态,它们的构象特征与Ｒ态相反,提示此三种低活性酶构象处于较紧凑状态,这几种Ｔ态酶巯基暴露的程度,受蛋白水解酶限制性酶解的速度不同,说明     

超螺旋DNA的碱变构研究

对超螺旋ＤＮＡ（ＤＮＡⅠ）的碱处理产物进行了琼脂糖凝胶电泳,氯化铯－溴化乙锭密度梯度超离心分析,紫外吸收光谱分析和电镜观察。实验结果表明超螺旋ＤＮＡ在碱性环境中的结构改变发生在很窄的ｐＨ范围内（ｐＨ１２．８８─１３．００）．超过ｐＨ临界点的超螺旋ＤＮＡ碱变构产物紫外吸收高于同浓度天然ＤＮＡ紫外吸收的２９％。变构产物在ＣｓＣｌ－ＥＢ密度梯度超离心中的高密度区形成稳定的区带．用透射电镜的观察表明碱变构的超螺旋ｐＢＲ３２２ＤＮＡ具有高电子密度并呈中空颗粒状,以上事实表明,ＤＮＡ在高ｐＨ下可产生一种结构有序的相对稳定的产物．这些结果意味着在碱处理过程中,超螺旋ＤＮＡ在构象上发生了改变,使其分子由扭曲线形变成球形颗粒状。根据实验事实本文对超螺旋ＤＮＡ的碱变构产物（ＤＮＡⅣ）提出一个新的结构模型──压缩模型。这个模型能更合理地解释一些实验现象。