R钙粘蛋白抑制涎腺腺样囊性癌的侵袭和转移

目的 明确R钙粘蛋白（R-cadherin,R-cad）在涎腺腺样囊性癌（salivary adenoid cystic carcinoma,SACC）中的作用。方法 首先通过免疫组织化学染色比较R-cad在涎腺腺样囊性癌组织和癌旁正常涎腺组织中的表达差异。之后,选取涎腺腺样囊性癌高转移细胞株SACC-LM,通过siRNA干扰技术有效下调R-cad表达,通过迁移小室迁移实验和侵袭小室侵袭实验以及裸鼠肺转移瘤模型实验,检测R-cad表达下调后,SACC-LM细胞迁移和侵袭能力的改变。结果 免疫组织化学染色显示,相对于癌旁正常涎腺组织,R-cad在涎腺腺样囊性癌组织中的表达量降低;迁移小室和侵袭小室实验证明,Rcad表达下调后,SACC-LM细胞的迁移能力和侵袭能力增强;裸鼠肺转移瘤模型实验证明,R-cad表达下调的SACC-LM细胞在裸鼠体内形成更多的肺转移灶。结论 在涎腺腺样囊性癌中R-cad可能有抑制涎腺腺样囊性癌细胞迁移、侵袭和远处转移的作用。     

表皮生长因子受体在涎腺腺样囊性癌不同细胞系中的表达

目的通过检测在涎腺腺样囊性癌两个细胞系中受体型酪氨酸蛋白激酶EGFR的表达,探讨其与腺样囊性癌发生发展的关系.方法采用Western Blot技术并利用电泳凝胶成像分析软件对结果进行量化分析;采用SPSS11.5统计软件对结果进行统计学分析.结果在SACC-83和SACC-LM细胞中,前者胞膜中EGFR的表达明显高于后者,而胞浆中的表达却明显低于后者(均为P<0.01);在SACC-83细胞系中,EGFR在细胞膜中呈现高表达(P<0.01),而在SACC-LM细胞系, EGFR在胞浆中呈现高表达(P<0.01).结论 EGFR基因在胞浆中的高水平积累可能在侵袭癌的进展中发挥重要作用,对其深入研究,有望为腺样囊性癌治疗带来新的策略.     

Pten^＋/＋MEFs与Pten^-/-MEFs细胞系的差异表达蛋白质组分析

目的：研究PTEN缺失细胞的蛋白表达规律。方法：用双向电泳技术比较Pten^＋/＋MEFs与Pten^-/-EFs细胞的蛋白表达差异;用基质辅助激光解吸／电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）对差异蛋白进行质谱分析;用肽质量指纹图谱检索数据库对差异蛋白进行鉴定;用Northern印迹和Western印迹验证蛋白的差异表达。结果：与Pten^＋/＋MEFs细胞相比。Pten^-/-MEFs细胞有明显的差异性蛋白表达谱,Pten^-/-MEFs细胞中表达下降的蛋白有铜锌超氧化物歧化酶、过氧化物氧化还原酶5和6等,表达增加的蛋白有低分子量蛋白酪氨酸磷酸酶和丝切蛋白（cofflin）1。结论：PTEN的缺失引起细胞内多种蛋白表达改变,这些表达改变的蛋白可能与PTEN缺失后细胞癌变相关。     

涎腺腺样囊性癌组织中COX-2, Survivin及livin的表达及临床意义

目的:探究涎腺腺样囊性癌(SACC)组织中COX-2、Survivin及livin的表达及临床意义。方法:收集2013年1月~2016年11月我院肿瘤外科收治的63例SACC患者癌变病理组织标本与30例SACC患者癌旁正常组织标本为研究对象;应用免疫组化法(SP法)检测COX-2、Survivin及livin蛋白在SACC组织和正常组织中的表达情况,分析SACC组织COX-2、Survivin及livin的表达与临床病理特征的关系,采用Spearman秩相关分析COX-2、Survivin及livin之间的关系。结果:Survivin、livin及COX-2在SACC组织中的阳性率依次为66.67%(42/63)、57.14%(36/63)及73.02%(46/63),其阳性主要表达于肿瘤细胞胞浆或胞膜上,而正常组织细胞中未发现阳性表达;Survivin、livin及COX-2在不同性别、年龄、肿瘤部位的阳性率无统计学差异(P0.05);实体型、淋巴转移、中低分化及III+IV期患者Survivin、livin及COX-2的阳性率高于筛孔型+管状型、淋巴未转移、高分化、I+II期患者,差异均有统计学意义(P0.05);Spearman秩相关显示,Survivin与COX-2呈正相关(r=0.632,P0.05);livin与COX-2呈正相关(r=0.453,P0.05);Survivin与livin无相关(r=0.143,P0.05)。结论:Survivin、livin及COX-2在SACC患者中呈高表达,可能对SACC的发生、发展具有促进作用;Survivin、livin及COX-2可作为临床早期筛查SACC并预测疾病转归的指标。     

蛋白激酶CK2-β及其相关的p53在涎腺腺样囊性癌中的表达及意义

目的　通过对蛋白激酶CK2 β (proteinkinaseCK2 β)及 p5 3蛋白在涎腺腺样囊性癌 (salivaryadenoidcysticcarcinoma ,SACC)中表达分布特征的研究 ,探讨其在该肿瘤发生发展中的作用及临床病理意义。方法　应用免疫组化技术检测 45例SACC及 12例正常涎腺组织中蛋白激酶CK2 β及 p5 3的表达变化。结果　SACC标本中蛋白激酶CK2 β阳性 37例 ,阴性 8例 ;正常腺体组织中蛋白激酶CK2 β阳性 2例 ,阴性 10例 (P <0 0 1) ;p5 3在SACC标本中阳性 6例 ,阴性 39例。二者的表达在病理学各分型及临床各分期之间无显著差异 (P >0 0 5 )。结论　蛋白激酶CK2 β在SACC组织中呈高表达 ,与其相关的 p5 3在SACC中呈低表达。但二者与SACC病理学分型及临床分期无关。     

涎腺腺样囊性癌细胞蛋白激酶C的活性阻抑对其侵袭能力的影响

用蛋白激酶Ｃ（ＰＫＣ） 抑制剂Ｈ７ 作用于人涎腺腺样囊性癌ＳＡＣＣ８３ 系, 利用扫描电镜观察对人羊膜基底膜侵袭能力的影响。癌细胞接种于羊膜基底膜表面４８－ ７２ 小时后, 在扫描电镜下可以观察到对照组癌细胞侵袭现象, 侵袭的细胞伸出丝状伪足且侵入基底膜内, 伪足周围的基底膜断裂和被溶解, 而实验组癌细胞侵袭现象很难发现。细胞附于基底膜表面, 细胞表面较光滑且无明显伪足伸出, 基底膜无明显受损改变。实验结果表明, 降低涎腺腺样囊性癌细胞的ＰＫＣ活性可明显降低其侵袭能力, ＰＫＣ与涎腺腺样囊性癌的侵袭能力有密切的关系     

瞬时转染金属硫蛋白-3基因后人神经母细胞瘤细胞系SH—SY5Y细胞的蛋白质差异表达

金属硫蛋白 3(MT 3) ,又称神经生长抑制因子 ,主要表达于中枢神经系统。它属于金属硫蛋白家族 ,但具有几项其他家族蛋白质如MT 1/ 2等所不具有的独特性质 ,是一种多功能蛋白质 ,可在中枢神经系统中发挥重要的神经调节和神经保护作用 ,但是具体发挥机制还很不清楚。实验以人神经母细胞瘤细胞系SH SY5Y为模型 ,运用最近发展起来的比较蛋白质组学研究方法对MT 3基因瞬时转染引起的SH SY5Y细胞蛋白质的整体变化进行了系统的研究。经考马斯亮蓝染色 ,结果表明 ,MT 3转基因后平均每块胶上可检测到约 75 0个蛋白质点。利用ImageMaster 2DElite软件对胶上的蛋白质点进行半定量分析 ,发现共有 17个蛋白质点呈显著的变化 :和对照组比较 ,在这 17个点中 ,有 12个表达明显上调 ,有 5个表达水平明显下降 ,实验结果具有可重复性。结合pI值和分子量 ,应用基质辅助激光解吸 /电离飞行时间质谱对这 17个点进行分析 ,鉴定了其中 10个点 ,包括类锌指蛋白 ,谷氨酸转运蛋白和增强蛋白等。这些蛋白质都可在神经系统功能的调节中发挥作用。实验结果表明MT 3可能是通过调节和 /或协同这些蛋白质来发挥它的多种功能的。     

Genistein对腺样囊性癌cyclinB1蛋白表达和细胞增殖周期的影响

目的研究酪氨酸蛋白激酶抑制剂genistein抑制人涎腺腺样囊性癌(SACC-83)细胞生长与cyclin B1蛋白表达和细胞增殖周期的关系.方法 MTT法测定genistein对SACC-83细胞体外生长的作用;流式细胞仪测定细胞增殖周期;Western Blot技术检测cyclin B1和Cdk1蛋白,并利用电泳凝胶成像分析软件对其结果进行量化分析;采用SPSS11.5统计软件对结果进行统计学分析.结果 Genistein对SACC-83细胞生长有抑制作用,且当其作用到一定时间达到一定的浓度后,该作用与剂量及时间呈依赖关系;Genistein作用的细胞与对照细胞比较,G0/G1期细胞数减少, G2/M期细胞数增多,cyclin B1和Cdk1蛋白水平降低.结论 Genistein对SACC-83细胞生长的抑制作用与其调节cyclin B1和Cdk1蛋白表达和细胞增殖周期有关.     

大豆种子萌发过程中的差异蛋白质组研究

运用蛋白质组学技术对大豆(Glycinemax)N2899种子萌发0h、8h、36h、60h4个时期蛋白质的差异表达情况进行了研究.结果发现,在考马斯亮蓝染色的双向电泳pH3～10胶上,PDQuest图像分析软件可识别的点约350个,其中表达量变化2.5倍以上的蛋白质点有24个,而绝大部分大豆种子贮藏蛋白在萌发期尚未降解.在萌发的第一阶段,24个差异表达蛋白中有10个蛋白质的丰度发生变化.第二阶段,差异表达蛋白的种类和量增加,其中15个蛋白质是动态变化的,14个蛋白质在胚根突破种皮时表达量达到峰值,表明吸胀后种子内的生命活动越来越强.对这24个蛋白质点进行胶内酶解,用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱测定均获得肽质量指纹图谱.搜索大豆的UniGene库初步鉴定出6个蛋白质,分别是核苷二磷酸激酶、热激蛋白、硫氧还蛋白、35ku种子成熟蛋白及种子成熟蛋白PM36.对这些蛋白质在种子萌发过程中可能的作用进行了讨论.     

新基因BRD7对鼻咽癌蛋白质表达谱影响的初步研究

BRD7基因是与鼻咽癌相关的候选抑瘤基因.为了进一步研究该基因的作用机制,将pcDNA3.1(+)/BRD7的表达质粒经脂质体导入HNE1细胞,RNA斑点杂交筛选出阳性克隆,通过双向电泳分离过表达BRD7的HNE1细胞内蛋白质,筛选出差异表达的蛋白质点,并进行质谱分析鉴定.鉴定出10种表达上调的蛋白质点,包括精氨(基)琥珀酸裂解酶,TSA(thio-specific antioxdant), Proteaseome activator28 beta subunit(PA28),金属蛋白酶抑制因子-2前体等,这些蛋白质涉及细胞生长,细胞代谢等很多相关事件.这些结果说明BRD7基因可能通过多种途径影响鼻咽癌的发生发展.     

Protein and mRNA characterization in high and low metastasis adenoid cystic carcinoma cell lines

Metastasis and invasion, the important characteristics of malignant tumors, are closely associated with a series of changes in the expression of genes and proteins. In this study, we compare mRNA and protein expression in high and low metastasis adenoid cystic carcinoma cell lines by mRNA suppression subtractive hybridization and two-dimensional electrophoresis combined with peptide mass fingerprint analysis. 34 differentially expressed genes were obtained using suppression subtractive hybridization experiments including 6 highly expressed gene sequences in the high metastasis cell line, and 28 in the low metastasis cell line. RNA dot blot hybridization further confirmed the results after excluding false positives. For protein analysis, ten significantly different protein spots were detected using two-dimensional gel electrophoresis technique combined with matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometer (MALDI- TOF-MS). The results then compare with the SWISS PROT database. These results suggest that high tumor metastasis of adenoid cystic carcinoma is associated with multiple genes whose function include angiogenesis, protein synthesis, signal transduction, modulation of cell cycle, molecular chaperones, and immune co-stimulating molecule. Moreover, the results of the phenotypic function-related expression mapping analysis at the mRNA and protein level revealed obvious complementarities, providing important clues for further study of the molecular mechanism of metastasis, metastasis control and possible targets for cancer gene therapy.     

青枯菌诱导的花生基因表达谱SSH分析

以抗青枯病花生种质‘J4’和‘中花6号’、感青枯病花生品种‘中花12号’为材料,用强产青枯菌毒菌株(Ralstonia solanacearum)对其根系分别接种,采用抑制差减杂交(SSH)技术检测花生根系应答侵染的基因表达谱变化,并对文库中差异基因进行Real-time PCR分析。结果表明:经菌液PCR检测对挑选出的1 036阳性克隆片段进行测序及片段整合分析,获得162条花生基因,有功能注释的基因58条,其中44条基因参与了细胞结构(6%)、信号转导(12%)、抗病防御(5%)、转录调控(12%)等生理过程。用Real-time PCR技术对7个基因在‘中花6号’和‘中花12号’中的表达模式分析结果表明,6个基因在青枯菌侵染早期在抗病材料‘中花6号’中呈上调表达,可能与青枯病抗性直接相关。     

肾癌相关基因克隆——肾癌cDNA消减文库的构建

应用抑制性消减杂交技术,构建人肾癌与正常肾差异表达的cDNA消减文库.分别从肾癌及正常肾细胞系中提取poly(A)⁺RNA,依次合成单链及双链cDNA,经酶切成平均大小为400～600 bp的片段,将肾癌cDNA分为两组,分别与两种不同的接头衔接,再与正常肾cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR后,将产物与T/A载体连接构建成功cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增.构建成功具有高消减效率的人肾癌cDNA消减文库,非特异性cDNA片段被有效地消减,特异表达的cDNA得到富集.文库扩增后得到6 500个克隆,随机挑取350个制备质粒,酶切分析均得到400～600 bp插入片段.所构建的人肾癌cDNA消减文库为进一步大批量筛选、克隆肾癌特异性表达的未知新基因奠定了基础.     

腮腺腺样囊性癌中PTEN、MDM2表达

目的:研究腮腺腺样囊性癌组织中抑癌基因PTEN、癌基因MDM2蛋白表达,探讨PTEN、MDM2在腮腺腺样囊性癌中两者之间的相关性,为将来临床应用提供参考。方法:选取腮腺腺样囊性癌手术存档石蜡标本30例,另取10例腮腺腺样囊性癌癌旁正常组织石蜡标本作为对照组,采用免疫组化SP法检验PTEN、MDM2表达情况。结果:腮腺腺样囊性癌和癌旁正常组织中PTEN蛋白的阳性率分别为20%(6/30)和70%(7/10),二者存在显著性差异(P0.05)。MDM2蛋白在两种组织中阳性率分别为66%(20/30)和20%(2/10)(P0.05),二者存在显著性差异(P0.05)(r=-0.657),在腮腺腺样囊性癌中PTEN、MDM2的表达负相关。结论:PTEN、MDM2蛋白异常表达在腮腺腺样囊性癌的发生发展中起重要作用。     

通过小麦Ms2近等基因系的抑制缩减杂交分析揭示小穗和花药中差异表达基因

以Ms2近等基因系处于减数分裂期的可育小穗cDNA作为驱动因子(driver),以同一时期的不育小穗cDNA作为测验因子(tester)进行缩减杂交(SSH),将扩增后的缩减杂交产物进行克隆,构建了一个包含882个重组克隆的SSH文库.分别以可育小穗和不育小穗的cDNA为探针与SSH文库克隆进行反式Northern杂交,结果显示接近90%的克隆在不育小穗中呈上调表达.对文库中21个克隆插入片段的序列相似性分析表明其中有18个与来源于穗部或减数分裂期的花药cDNA同源.13个克隆的编码产物与已知功能的蛋白质同源,其中5个参与碳代谢活动,4个参与胞内分子的运输,2个蛋白产物参与染色体的构成及染色体的结构变化,1个是生长素抑制蛋白,1个是转录因子.用中国春缺体四体材料对9个克隆进行了染色体定位,其中一个克隆定位于第四染色体同源群,与Ms2所在的染色体同属一个同源群.通过搜索水稻的同源BAC(bacterial artificialchromosome)和PAC(P1 artificial chromosome)克隆,推测另外11个克隆的染色体位置,其中4个克隆可能位于第四染色体同源群.用RNA点杂交对11个克隆进行表达谱分析,其中8个克隆在不育株的小穗和花药中呈上调表达.     

拟耧斗菜昼夜差异表达ESTs的分离与分析

应用磁珠介导的抑制消减杂交方法,以青藏高原白马雪山流石滩地区植物拟耧斗菜为实验材料,分别在白天与夜晚采样,以白天样品为目标,晚上样品为驱动样品,分离昼夜差异表达的基因。随机挑选了96个差异ESTs克隆并进行测序,测序结果进行blastx网上数据库比对、Blast2go功能注释和KEGG代谢路径分析。结果表明：绝大部分ESTs功能与物质能量代谢、生物合成、蛋白和核酸结合、转移酶活性相关,还有少数与逆境胁迫相关等。这为进一步研究高山植物逆境适应的分子机制奠定了基础。     

抑制差减杂交法分离玉米幼苗淹水诱导表达基因

以淹水处理(submergence-treated, ST)的玉米(Zea mays L.)幼苗根部cDNA为目标群体,未处理(untreated, UT)的玉米幼苗根部cDNA为对照群体,进行抑制差减杂交.用经过UT差减的ST cDNA构建了一个含有大约2 000个独立克隆的差减文库.对随机挑取的408个克隆进行差异筛选,获得了184个在ST中特异表达或表达增强的候选克隆.对其中155个cDNA克隆测序并去除重复克隆后,共得到95个差异表达的cDNA片段.GenBank中BLAST查询结果表明:6个克隆为已知的玉米核苷酸序列;68个克隆与已知基因或EST序列部分区域的同源性为60%～90%;21个克隆在GenBank中无法查到对应的同源序列,可能代表了新基因,或者由于序列位于变异丰富的3′端而无法查到与其他物种基因的同源性.     

Identification of over-expressed genes in human renal cell carcinoma by combining suppression subtractive hybridization and cDNA library array

To isolate the over-expressed genes in human renal cell carcinoma (RCC) and analyze its molecular basis of carcinogenesis, we used the mRNA from human RCC tissues as tester and that from the matched normal kidney tissues as driver to construct the suppression subtractive hybridization library. 379 of the subtracted clones were arrayed onto a nylon membrane and the over-expressed genes were then screened by hybridizing the filter with radioactively labeled cDNA from RCC and matched normal kidney tissues. 67 clones over-expressed in RCC by a factor of 6 or more were sequenced and its identities were analyzed in GenBank database. 4 clones were previously unknown fragments and 2 clones represent KIAA genes. The rest clones were the known genes and some of them were RCC-related, including vascular endothelial growth factor, vimentin and tissue factor. Most of the known genes were the RCC-related genes previously unknown, including zinc ribbon domain-containing 1 protein (ZNRD1), pituitary tumor transforming gene1 (PTTG1). Northern blot and semi-quantitative RT-PCR confirmed that the mRNA levels of the 3 novel fragments and 1 KIAA and 3 known genes were significantly higher in RCC than in the matched normal kidney tissues. Immunohistochemical and Western blot analysis for PTTG1 and ZNRD1 revealed increased protein level in RCC. The over-expressed genes in RCC are the potential molecular targets for diagnosis and therapy and it is very important to understand the molecular mechanism of RCC through the profile of over-expressed genes.     

镍胁迫下安氏伪镖水蚤SSH文库的构建及铁蛋白cDNA的克隆与差异表达

为探讨镍胁迫下桡足类的分子响应机制,以安氏伪镖水蚤为研究对象,利用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术,构建了镍胁迫下安氏伪镖水蚤SSHcDNA文库,并随机挑取生长菌落140个克隆子,进行菌液PCR鉴定,计算文库重组率为98.6％,文库容量为1.12×106 cfu.将重组子测序,经BLAST一致性搜索比对分析发现,有一重组片段含有铁蛋白保守结构域,该片段大小为859 bp,连续编码170个氨基酸残基,Gen-Bank登录号为JK312601.半定量PCR证实,镍胁迫24 h后,安氏伪镖水蚤中铁蛋白表达显著上调.本文库的成功构建及铁蛋白cDNA片段的获得为进一步研究镍胁迫下桡足类的分子响应机制奠定了基础.     

抑制差减杂交法分离玉米幼苗淹水诱导表达基因

以淹水处理（submergence-treated,ST)的玉米（Zea maysL.)幼苗根部cDNA为目标群体,未处理（untreated,UT)的玉米幼苗cDNA为对照群体,进行抑制差减杂交。用经过UT差减的STcDNA构建了一个含有大约2000个独立克隆的差减文库。对随机挑取的408个克隆进行差异筛选。获得了184个在ST中特异表达或表达增强的候选克隆。对其中155个cDNA克隆测序并去除重复克隆后,共得到95个差异表达的cDNA片段。GenBank中BLAST查询结果表明;6个克隆为已知的玉米核苷酸序列;68个克隆与已知基因或EST序列部分区域的同源性为60%-90%;21个克隆在GenBank中无法查到对应的同源序列。可能代表了新基因。或者由于序列位于变异丰富的3′端而无法查到与其他物种基因的同源性。