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穿山甲标本和甲片的DNA提取及PCR扩增 总被引:1,自引:0,他引:1
为验证经处理后的穿山甲(Manis spp.)标本和甲片是否可以用于种间分子鉴定标记的开发及个体识别工作,本文在样品的预处理、消化、提取后纯化等方面对传统提取方法进行了改进,分别从穿山甲剥制标本、干皮标本及甲片中提取总DNA;然后用Cyt b基因扩增通用引物、12S rRNA基因全序列扩增引物、RAPD引物及微卫星引物进行了PCR扩增,并对部分扩增结果进行了序列测定.结果表明,除剥制标本的脚底皮张组织外,其他样品基本都可以提取出DNA.以此为模板的PCR扩增中,2种线粒体基因引物扩增出明显目的条带,RAPD引物扩增出种间特异条带,测序结果可用于种间特异性引物及SCAR引物的开发;微卫星引物在甲片样品中扩增稳定,可用于个体识别工作. 相似文献
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从石蜡包埋和甲醛浸泡组织中提取DNA进行PCR扩增的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
如何从石蜡包埋组织中高质量的提取DNA从而进行分子生物学特别是基因工程方面的科研工作,目前在国内尚未见报道。我们采用二甲苯或水浴法对2块胃癌石蜡包埋组织进行脱蜡,并提取、纯化了DNA,进行PCR扩增,获得了成功。另外对用甲醛浸泡的组织其DNA的受损程度与上述进行了比较,现报告如下。 相似文献
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用于扩增较大片段DNA的PCR方法方向东,陈淳(中科院上海生物化学研究所国家分子生物学实验室,上海200031)诸江(上海第二医科大学上海血液学研究所,上海200025)关键词DNA扩增,PCR自从Taq(Thermusaquaticus)DNA聚合... 相似文献
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Single Fish Egg DNA Extraction for PCR Amplification 总被引:1,自引:0,他引:1
Futoshi Aranishi 《Conservation Genetics》2006,7(1):153-156
Modern stock researches on marine biomass are basically genetic and rely increasingly on PCR-based manipulations of informative
DNA markers for detecting the genetic diversity. This study developed a simple and rapid single tube method for DNA extraction
from a single fish egg. The 15 min protocol was based on the use of Chelex 100 resin and urea to breakdown membrane and connective
tissue of eggs. From various sizes of a single egg of walleye pollack (Theragra chalcogramma), the amounts of total nucleic acids were reproducibly obtained to be 18.25 ± 1.92 μg per egg. Using DNA templates diluted
ranging 1/100–1/105, PCR amplification for the mitochondrial cytochrome b (Cytb) gene was successfully performed, and the 1/102 diluted template yielded the best result in PCR amplification for three different DNA marker genes. This method is quite
simple and economical, and enables to provide the high throughput often demanded by the stock identification of marine biomass,
in which large numbers of specimens of single fish eggs must be analyzed. 相似文献
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高效的植物DNA提取方法 总被引:22,自引:0,他引:22
利用液氮研磨植物幼芽,以苯酚─氯仿─异戊醇─核糖核酸酶法提取了大豆、菜豆、玉米、高梁等几种农作物的总DNA。所提取的DNA经岛津UV-265紫外分光光度计检测及0.6%的琼脂糖凝胶电泳,结果证明:该方法所提取的植物总DNA纯度高,片段长度整齐,约50kb左右,符合外源DNA导入作物的要求,并且DNA收率很高。 相似文献
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《Bioscience, biotechnology, and biochemistry》2013,77(10):2014-2017
Salmon eggs are common in Japanese sushi and other seafood products; however, certain fish eggs are used as counterfeit salmon eggs which are found in foods and processed products. This study develops a simple, rapid, and cost-effective method for DNA extraction, filtration (FT) and dilution (DL) protocols from a single salmon egg with good DNA quality for real-time PCR amplification. The DNA amount, DNA quality, and real-time PCR performance for different dilutions and different lengths of PCR amplicons were evaluated and compared with the common Qiagen tissue kit (QTK) and Chelex-100-based (CX) protocols. The extracted DNA from a single salmon egg using the FT or DL protocol can be applied in phylogenic research, food authentication and post-marketing monitoring of genetically modified (GM) food products. 相似文献
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活性污泥总DNA提取方法的研究 总被引:10,自引:0,他引:10
采用冻融+玻璃珠、溶菌酶+SDS和冻融+玻璃珠+溶菌酶+SDS的方法提取活性污泥的微生物总DNA,并对以上三种方法进行比较,从中确定最佳的方法,以实现普通实验条件下成功提取符合PCR扩增要求的DNA。经紫外光度分析及电泳结果表明,冻融+玻璃珠+溶菌酶+SDS方法所得的DNA的OD260/OD280为1.81,电泳结果显示,所提DNA片段分子量大于10kb,适于酶解和PCR扩增要求,为PCR技术应用于活性污泥的研究提供了一种简便、可靠的DNA提取方法。 相似文献
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可用于微生物群落分子生态学研究的活性污泥总DNA提取方法研究 总被引:47,自引:5,他引:47
活性污泥样品经液氮速冻、沸水浴融化、溶菌酶处理和 SDS裂解后 ,99%以上细胞裂解。所提取的 DNA经琼脂糖凝胶电泳检测和荧光法浓度测定 ,其片断大小在 2 0 kb左右 ,产量可达 1 .75 6± 0 .1 mg/g MLSS。样品 ABS2 6 0 nm/ABS2 80 nm的比值为 1 .96± 0 .2。以提取的总 DNA为模板 ,进行细菌核糖体小亚基 1 6Sr DNA基因 V3区和多组分苯酚羟化酶大亚基基因 (Lm PHs)的 PCR扩增 ,均获得成功 ,为活性污泥中微生物群落的分子生态学研究提供了一种简便、可靠的 DNA提取方法。 相似文献
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一种用于PCR扩增的丝状真菌DNA快速提取方法 总被引:4,自引:1,他引:3
丝状真菌在工业、农业、医药以及基础生物学研究中具有重要作用。利用遗传转化技术对丝状真菌进行菌株改良和基因功能分析, 也越来越受到重视。然而, 丝状真菌DNA提取方法繁琐、费时, 难以满足利用PCR技术高通量筛选转化子的需要。本文以曲霉菌为例建立了一种快速提取丝状真菌DNA的实验方法, 微波处理置于10 × TE buffer中的菌丝即可得到DNA。RAPD试验和PCR扩增证明, 该方法提取的DNA能够达到PCR扩增的要求。研究结果为高通量快速筛选丝状真菌转化子奠定了基础。 相似文献
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目的:为了从分子水平上了解厌氧颗粒污泥中微生物的种类和数量,研究一种高效提取环境微生物DNA的方法。方法:厌氧颗粒污泥样品经液氮速冻、沸水浴融化、溶菌酶处理和SDS裂解后,琼脂糖凝胶电泳检测所提取的DNA,以提取的总DNA为模板,进行细菌核糖体小亚基16S rDNA基因V8、V9区的PCR扩增。结果:经检测,其DNA片段约为20 kb,样品D260nm/D280nm值为1.88,扩增结果理想,与OMEGA公司提供的试剂盒提取效果基本一致。结论:为薯类酒糟厌氧发酵污泥中微生物群落的分子生态学研究提供了一种简便、可靠的DNA提取方法。 相似文献