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相似文献
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1.
分离提取树(treeshrew,TS)肝组织mRNA,以此为模板,反转录构建了TS肝组织cDNA文库。利用制备的兔抗TS载脂蛋白CI多抗血清为探针筛选该文库,获得两个阳性克隆。测序及序列分析表明:两个克隆均为TSapoCIcDNA基因。大的克隆由380个核苷酸构成,包括21bp、95bp组成的5′和3′非编码区,264bp组成的一个完整开放阅读框架,编码88个氨基酸的apoCI前体,含26个氨基酸构成的信号肽和62肽的成熟蛋白。其成熟肽长度与大鼠、小鼠和狗的相应结构一致,但较人和狒狒apoCI的成熟肽多5个氨基酸。并对其功能域进行了初步预测。RNA印迹显示TSapoCImRNA不仅主要在肝组织表达;而且不同于人和其他哺乳类动物,亦可少量在小肠表达。上述结果为进一步研究TSapoCI基因组结构、功能和体外表达奠定了基础。  相似文献   

2.
树Qu载脂蛋白CI cDNA序列及其组织表达   总被引:1,自引:0,他引:1  
分离提取树Qu肝组织mRNA,经皮为模板,反转录构建了TS肝组织cDNA文库。利用制备的兔抗TS载脂蛋白CI多抗血清为探针筛选该文库,获得两个阳性克隆。测序及序列分析表明:两个克隆均为TSapoiCIcDNA基因。大的克隆由380个核苷酸要成,包括21bp,95bp组成的5’和3‘非编码区,264bp组成的一个完整开放阅读框架,编码88个氨基酸的apoCI前体,含26个氨基酸构成的信号肽和62肽的  相似文献   

3.
人胎肝唾液酸转移酶基因的克隆及测序   总被引:1,自引:0,他引:1  
尚杰  金城 《生物工程学报》1999,15(3):277-280
根据已克隆的唾液酸转移酶的保守区的序列,以人胎肝mRNA为模板扩增出150bp的片段并测序。其中一个片段(s38)与已克隆的唾液酸转移酶的活性中心有57%~97%的同源性。根据s38的序列合成寡核苷酸并标记后用作探针筛选人胎肝cDNA文库。从文库中分离了一个编码α2,3唾液酸转移酶的cDNA。该cDNA序列含一个编码340个氨基酸的开放读框,推导的氨基酸序列与人颌下腺Galβ1,3GalNAcα2,3唾液酸转移酶相同,与猪颌下腺α2,3唾液酸转移酶有832%的同源性。表明从人胎肝cDNA文库中分离的cDNA所编码的蛋白为Galβ1,3GalNAcα2,3唾液酸转移酶  相似文献   

4.
47个早期人胚胎低丰度表达基因ESTs筛选及结果分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
构建高质量cDNA文库在基因克隆、mRNA差异展示、表达序列标签测序和基因定位等研究中具有十分重要的作用。为了从早期胚胎中分离人类新基因,构建了受精后3周龄的人cDNA文库,用标记的一链cDNA探针对该文库的6508个克隆子进行菌落原位杂交,得到1677个无任何杂交信号的低丰度表达克隆子,从中随机挑选了47个进行5′端部分测序,将测序结果与三大基因库进行序列同源性比较,发现18个克隆(38.3%)  相似文献   

5.
植物甜蛋白mabinlinⅡcDNA的克隆与序列分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
根据已由作者克隆的mabinlinⅡB亚基185bp的cDNA片段,设计合成系列引物.从马槟榔(CapparismasaikaiLévl.)种子提取总RNA并纯化mRNA,经反转录合成cDNA第一链.采用RACE方法,快捷克隆mabinlinⅡ全长cDNA.经序列测定与分析,该cDNA为583bp,其中编码序列长465bp,共编码155个氨基酸.  相似文献   

6.
用富集文库克隆人胰岛素基因组基因   总被引:1,自引:0,他引:1  
通过构建可富集人胰岛素基因的λ噬菌体文库,克隆了人胰岛素基因组基因.首先从中国人血液白细胞中提取到人基因组DNA,用EcoRⅠ和BglⅡ对基因组DNA进行全酶切,经0.4%琼脂糖凝胶电泳,特异回收9.5kb左右的DNA片段.将该片段与λEMBL3/BamHⅠ臂连接,构建成一个特殊的人基因组λ噬菌体文库(富集文库),效价为2×104.同时采用PCR方法及用引物Ⅰ:5′GGACAGGCTACATCAGGAAGAGG3′,引物Ⅱ:5′CTGCGTCTAATTGCAGTAGTTC3′,从人基因组DNA中扩增出一段含胰岛素基因的1.36kbDNA片段,做为放射性标记探针,对文库进行了噬菌斑原位杂交筛选,从1×104个噬菌斑中筛选到一个含人胰岛素基因组基因的阳性克隆,并进一步完成了亚克隆和该基因1732bpDNA序列的测定.结果该基因的1732bpDNA序列包括部分5′端和3′端与国外发表的人胰岛素α型等位基因的序列相同  相似文献   

7.
玉米苹果酸脱氢酶基因的分离与结构分析   总被引:9,自引:0,他引:9  
以一个玉米(ZeamaysL.)杂种一代超亲表达的cDNA片段为探针,从玉米幼苗期cDNA文库中筛选到一个全长1287bp的cDNA克隆。序列分析表明,该cDNA编码细胞质苹果酸脱氢酶,推导的氨基酸序列与龙须海棠(Mesembryanthemum crystallium L.)及拟南芥(Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.)同一编码基因的氨基酸序列同源性分别为90%和84%。这是禾谷类作物中首次克隆的编码细胞质苹果酸脱氢酶的完整基因。  相似文献   

8.
以人成骨肉瘤细胞株HOS-8603为热休克模型,在利用DDmRNA方法筛选和克隆了一个热休克后表达受抑基因的cDNA片段的基础上,以该片段为探针,筛选HOS-8603细胞的cDNA文库,获得该基因的全长cDNA克隆(HSSG-1);DNA序列测定表明该cDNA全长1456bp,编码276个氨基酸,经计算机辅助分析,该cDNA序列尚未被报道。经RNA斑点杂交证实,该基因的表达于多种组织细胞之中,并且  相似文献   

9.
两个东亚钳蝎抗哺乳动物神经毒素的cDNA序列   总被引:7,自引:0,他引:7  
从我国山东东亚马氏钳蝎尾腺中分离纯化mRNA,经逆转录构建了BmK蝎毒cDNA文库。利用PCR扩增,筛选到两个抗哺乳动物毒素的cDNA基因,并测定了序列。这两个cDNA阅读框均为252bp组成,可翻译84肽的毒素前体,包括N端19个氨基酸组成的信号肽,64个氨基酸残芭的成熟毒蛋白,以及C端一个额外的碱性氨基酸Arg。其中由一CDNA所推导的氨基酸序列(BmKM1)一已知的天然毒素BmK1蛋白序列完  相似文献   

10.
从裂叶牵牛(Pharbitis nil Choisy)子叶的cDNA文库中,分离了一个520 bp 的psaHcDNA 克隆,DNA序列分析表明其开放阅读框架由144 个氨基酸构成,包括49 个氨基酸长的转运肽和95 个氨基酸长的成熟PSⅠH(subunit Hofphotosystem Ⅰ)。利用Northern 杂交技术,发现在高等植物中psaH 基因的表达明显地受内生昼夜节奏的调控,在幼苗阶段呈现出组织特异性,并证明光是迅速启动PNpsaH基因高水平表达的重要因子  相似文献   

11.
豌豆卷须肌动蛋白Ⅱ类异型体cDNA克隆的序列分析   总被引:4,自引:0,他引:4  
分析15个豌豆卷须肌动蛋白cDNA 克隆的限制性内切酶图谱,发现在豌豆卷须中至少存在三类肌动蛋白异型体,分别命名为Ⅰ类(PEAc Ⅰ)、Ⅱ类(PEAc Ⅱ)和Ⅲ类(PEAc Ⅲ)异型体.三类异型体的克隆数目分别为10、4和1个,表明三类异型体在豌豆卷须中的表达是不同的,很可能具有组织或发育阶段的特异性.对Ⅱ类异型体的三个cDNA 克隆PEAc3、PEAc9和PEAc11进行了全序列测定,所测定的序列已被GenBank 数据库所接受.测序结果表明,PEAc3、PEAc9和PEAc11的序列长度分别为1550、1680和1091个核苷酸,其中编码区长1134个核苷酸,编码的氨基酸长度为377(PEAc11缺少编码氨基端前96个氨基酸的核苷酸序列).三个克隆的核苷酸序列完全相同,差别仅在于3′非翻译区的长度不同,即poly(A)的加入位点不同.这说明它们可能是由同一基因转录而来,但转录后的加工过程不同.豌豆卷须中肌动蛋白基因poly(A)加入位点的使用,可能与组织或发育的特异性表达有关.此外,豌豆卷须肌动蛋白三类异型体之间的核苷酸序列同源性为80% ,氨基酸序列同源性为94% .  相似文献   

12.
用差异显示法从人胎脑基因文库分离一个编码序列   总被引:1,自引:0,他引:1  
人18周、22周胎儿脑、肝肾组织总m RNA 用DDRT-PCR显示出差异的条带,回收胎脑和肝肾特异性表达的487条电泳条带.其中某些条带用3种组织的cDNA 探针作点杂交,筛选只对胎儿脑总呈阳性的DNA 片段.以其中某一条带DNA 为探针,从胎儿脑cDNA 文库筛选阳性克隆,得到GC58.经Northern 杂交和DNA 测序,表明它是人脑表达的序列,与数据库中KIAA0515有同源性,并编码一个有274个氨基酸的蛋白质,该蛋白质序列尚未见报道.探讨了DDRT-PCR的条件和假阳性问题.  相似文献   

13.
本文对北京鸭apoA-Ⅰ溴化氰裂解片段的理化性质、部分结构和抗原性以及其与鸭肝细胞膜HDL受体的结合进行了研究。apoA-Ⅰ用溴化氰裂解后经HPLC分离得两个纯的肽段P5和P6,对二肽段作了氨基酸组成分析,并分别测定了P5,P6N端的14和9个氨基酸残基序列。通过与鸡apoA-Ⅰ的比较,根据同源性及肽段大小,定出P5、P6分别位于鸭apoA-Ⅰ的第138-170aa和第75-136aa的区域。Immuno-blotting法测定结果表明,P5、P6都含有鸭apoA-Ⅰ的抗原决定簇;用Western-blotting免疫检测,发现鸭apoA-Ⅰ的P5、P6二片段都能与鸭肝细胞膜HDL受体结合,提示鸭apoA-Ⅰ的中间区域即第75-170aa区域可能参予鸭apoA-Ⅰ与鸭肝HDL受体的结合。  相似文献   

14.
大蒜花叶病毒外壳蛋白基因cDNA的克隆和序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
我们从自然发病的大蒜中分离得到了大蒜花叶病毒。以其基因组RNA为模板合成了3'末端部分cDNA。从中选出一批插入片段在2.0kb以上的重组克隆,经Northern点杂交分析证实了所选克隆与基因组RNA同源。通过对若干个克隆的插入片段两端部分序列的测定,选出一个克隆pGM495,其插入片段的长度约为2.4kb,3′末端存有一个Poly(A)结构,它应包含了编码该病毒外壳蛋白全部序列。序列测定的结果表明,这个cDNA片段全长为2379bp,其中含有与酶切图谱分析结果相符的EeoRI、PstI及BamHI酶切位点。第一个终止密码子TAA与3′g末端相距264bp,我们根据碱基序列推定的氨基酸序列与其它已发表的Potyvirus的外壳蛋白氨基酸序列以及外壳蛋白翻译后加工的蛋白酶专一切点相比较后推测,编码该病毒外壳蛋白序列可能起始于3′末端上游的1170bp处,共编码302个氨基酸,其分子量为36kD,略大于SDS-PAGE所测定的33kD,非编码区域长264bp,富含AT,并有多个终止密码子的存在。趾3′末端32~27bp处有一个AATAA序列。  相似文献   

15.
以AcNPV凋亡抑制基因p35为探针,与LsNPVDNA的限制性片段和LsNPVDNAEcoRV片段杂交,发现EcoRV5.5kb片段有强烈的杂交信号。将此片段亚克隆后,测定了1244bp序列,发现一个完整的ORF,推导的302个氨基酸与AcNPVp35蛋白有70.4%的氨基酸同源性,证明所测ORF为LsNPV的p35基因。结构分析发现其5′端有早期基因启动子元件GC、ACGT和TATAbox。有22bp的顺向重复序列,包括由两个重叠的TATAbox和上下游两个ACGTmotif组成的两套启动子元件,这些结构特征与AcNPV的凋亡抑制基因十分相似。  相似文献   

16.
黑曲霉T21是由黑曲霉3.795经诱变育种获得的糖化酶高产菌株,为阐明其高产的分子机制,由黑曲霉3.795克隆了糖化酶结构基因及其5′旁侧序列,并与黑曲霉T21的相应序列进行了比较.由黑曲霉3.795菌丝体分离染色体DNA,Southern杂交分析表明,糖化酶结构基因位于~2.5kb的EcoRⅠ-EcoRⅤ染色体DNA片段上,在此EcoRⅠ位点上游约1.0kb处有一SalⅠ位点.为构建糖化酶结构基因及其5′旁侧序列的基因组文库,该染色体DNA分别用EcoRⅠ+EcoRⅤ和EcoR+SalⅠ消化,琼脂糖凝胶电泳分离并回收长度在1.0kb左右和2.5kb左右的DNA片段,分别与pUC19载体连接后转化入E.coliDH5.用原位杂交方法筛选到了携带糖化酶基因编码区及其1505bp5′旁侧序列的阳性克隆.对克隆片段的DNA序列进行了测定并与黑曲霉T21的相应序列进行了比较,结果表明,在糖化酶基因编码区及其150bp3′非编码区内,未发现碱基差异,但在-340~-1505的5′上游区内发生了9个位置的碱基变化,包括缺失、插入和替换.这些结果表明,黑曲霉T21与3.795的糖化酶产量的差异与其结构基因无关,但可能与其  相似文献   

17.
溴化氰可裂解北京鸭apoA-I为11个肽段,通过测定纯化后各片段分子量和N末端氨基酸序列确定片段3~10在apoA-I分子中的位置,分别为64~240,74~240,64~206,1~136,1~63,171~206,207~240和137~170.并对上述片段功能进行研究,结果为:(1)这些片段均可与脂质结合形成大小不同的脂质体,其大小与片段长短成正比。(2)ApoA-I溴化氰片段3~10激活LCAT活性分别为完整apoA-I的65%、52%、60%、39%、8%、7%、0%和2%,说明激活LCAT的活性主要存在于64~136之间。(3)只有片段3、4和9形成的脂质体可与肝HDL受体结合,其他均无明显结合力,显示氨基酸207~240是apoA-I与HDL受体结合片段。  相似文献   

18.
蝶兰胚珠发育基因的表达及序列分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
对从蝶兰(Phalaenopsissp.)成熟胚珠的cDNA文库中获得的cDNA克隆O138的时空表达特性和序列进行了分析。Northern分子杂交结果显示出该基因的mRNA在成熟胚珠和根中大量积累,但在大孢子母细胞时期的胚珠和子房组织中积累水平很低。DNA序列分析表明,该基因含一个编码284个氨基酸,分子量为30kD蛋白的开放阅读框架。O138是一个与成熟胚珠发育相关的基因。  相似文献   

19.
黄明  郑学勤  邵寒霜   《广西植物》1998,18(2):165-168
以甘薯(Ipomoeabatatas(L.)Poir)叶为材料提取植物总RNA,经反转录后,利用多聚酶链式反应技术,扩增并克隆超氧化物歧化酶基因的cDNA,并进行测序分析。该序列全长482bp,其读码框编码152个氨基酸,与国外文献报道的甘薯块根SOD基因的cDNA序列相比,具有99%的同源性。  相似文献   

20.
人在早期胚胎时tPA基因表达,但mRNA丰度很低。以17日龄人胚胎为材料,分离mRNA,以表达质粒pSPORT1为载体,建立cDNA文库,重组子达到1.6×106个,能包含极低表达基因的CDNA。从人血白细胞基因组中扩增出一条175bp的tPA外显子片段作探针,用地高辛标记进行菌落原位杂交,获得六个阳性菌落。提取阳性菌落质粒,经限制性内切酶Sal Ⅰ和EcoRⅠ酶切分析鉴定,得到3个tPAcDNA重组子。  相似文献   

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