DNA碱基组成的比较研究

当把各种生物的DNA中碱基鸟嘌呤和胞嘧啶(G+C)含量进行比较时,可以看出病毒DNA和原核细胞细菌DNA中G+C含量变化范围非常宽,分别为30.9一73％和22.8—73％。真核细胞原生生物的DNA中G+C含量变化范围也呈类似情况,G+C占碱基组成的     

节肢动物线粒体基因组碱基组成特征分析

利用93个节肢动物线粒体基因组数据,分析了线粒体基因组的碱基组成,及对氨基酸组成的影响。研究表明:(1)节肢动物线粒体基因组GC含量较低,分布范围较窄(13.28%～39.64%)。基因组GC含量与密码子第三位置的GC含量间的相关性(r=0.9432,p<0.01)比密码子第一、二位置上的相关性强。(2)在密码子的三个不同位置上均可以观察到C<->T和A<->G相互取代的现象。(3)从NC.004529和NC.003979两个序列的对比研究中可以发现碱基组成变化会引起氨基酸组成的变化,这种变化不仅体现在不同的物种之间,而且也体现在同一基因组内部的不同基因之间,这些影响可能是相互的。表明节肢动物线粒体基因组中的碱基变化是受多种因素共同作用的结果。     

基于碱基组成的横向基因转移预测方法研究概况

横向基因转移(Horizontal gene transfer,HGT)是指物种从亲代以外的个体中获取遗传物质的过程,它对研究生物进化、细菌多样性等有着重要作用。目前最常用的HGT预测方法是基于碱基组成的方法。本文主要介绍此类方法的常用特征及研究现状。     

木棉基因组DNA提取方法的比较研究

木棉组织细胞含有多酚类、糖类、萜类化合物和其他次生代谢物质,很难得到高质量的基因组DNA。为了获得高质量的木棉基因组DNA,本实验以两个不同地方采集的木棉成熟叶片为材料,采用CTAB法、SDS法、普通试剂盒、磁珠法试剂盒以及对以上4种方法进行改良后的4种方法,提取总的木棉DNA。通过微量紫外-分光光度计、琼脂糖电泳对所提取DNA的纯度、得率,毒害及耗时等方面进行了比较。结果表明:经改良后提取的DNA质量都有所提高,且改良的磁珠法试剂盒效果最佳,可直接用于下游分子生物学实验。     

植物细胞核DNA,叶绿体DNA和线粒体DNA的比较

植物一般有细胞核,叶绿体和线粒体三套遗传体系,本文结合近年来植物分子生物学研究的最新进展,系统比较了细胞核ＤＮＡ,叶绿体ＤＮＡ和线粒体ＤＮＡ在组织结构,遗传方式,基因表达（转录,翻译,ＲＮＡ加工）等方面的差异。     

木棉基因组DNA提取方法的比较研究

木棉组织细胞含有多酚类、糖类、萜类化合物和其他次生代谢物质,很难得到高质量的基因组DNA。为了获得高质量的木棉基因组DNA,本实验以两个不同地方采集的木棉成熟叶片为材料,采用CTAB法、SDS法、普通试剂盒、磁珠法试剂盒以及对以上4种方法进行改良后的4种方法,提取总的木棉DNA。通过微量紫外-分光光度计、琼脂糖电泳对所提取DNA的纯度、得率,毒害及耗时等方面进行了比较。结果表明:经改良后提取的DNA质量都有所提高,且改良的磁珠法试剂盒效果最佳,可直接用于下游分子生物学实验。     

玉米蛋白粉DNA提取方法比较研究

饲料样本本身的复杂性给进出口产品转基因（genetically modified,GM）成分的检测工作带来了巨大的压力和挑战。玉米蛋白粉主要包含蛋白质、淀粉和脂类等成分,从中提取高品质的DNA比较困难,而高品质的DNA是转基因检测研究的关键,能够大大降低进出口检验中的“假阴性”结果。采用市售主流品牌常用的7种试剂盒（Promega公司、Biotecon公司、天根生化科技有限公司、Invitrogen公司、Qiagen公司、TaKaRa公司）、CTAB法以及改良SDS?CTAB法提取玉米蛋白粉中的DNA。通过对玉米内源基因进行实时荧光PCR检测,发现改良SDS?CTAB法提取的玉米蛋白粉DNA质量明显优于其他方法,改良SDS?CTAB法内源基因zSSIIb的C_t值为28.14,较CTAB法提高了27%。研究建立的改良SDS?CTAB法在国内外尚属首次应用于饲料转基因产品中,并对7批次实验室送检样品进行转基因成分检测,成功检出2批次阳性样品。     

DNA测序技术比较

自从1953年,J.D.Watson和F.H.C.Crick发现DNA的双螺旋模型之后,DNA测序技术随着科学的进步得到了迅猛发展.1977年Sanger[1]发明DNA双脱氧末端终止测序技术,Maxam与Gilbert[2]发明利用化学降解法进行测序的技术,2种测序技术被誉为DNA测序技术的始祖.随后,在第1代DNA测序技术的基础上,相继出现了第2代测序技术、基因芯片技术以及第3代测序技术.总结并展望了每一代测序技术及基因芯片技术的诞生、原理及应用前景,为利用测序技术研究基因表达提供理论基础和实验依据.     

甘蓝型油菜WRKY基因家族碱基组成及密码子使用特性分析

WRKY转录因子广泛地参与植物的抗逆防卫反应。通过对甘蓝型油菜WRKY基因家族碱基组成和密码子用法的分析,发现其碱基组成不仅对密码子的偏好性选择有重要影响,而且与基因的表达水平参数(Nc、CAI、CBI等)显著相关。通过对密码子RSCU值的分析,得到了TTA、CTT、AGA等29个偏好密码子,且多以碱基A或T结尾。ENc-plot分析表明,除了碱基组成之外,自然选择等其它因素对密码子偏好性也有影响。     

棉花枯萎病菌异核体的三个不同核型分离子DNA碱基组成及18S rDNA序列

从棉花枯萎病菌（Fusarium oxysporum f.sp.vasinfectum）异核体菌株Ag149的菌落我变处分离得到3个培养特征和致病性差异明显的单孢分离子。分别测定了这3个分离子的总DNA和核DNA的碱基组成,以及它们的18S rDNA的部分序列（1477个碱基对）。它们的总DNA（G＋C）mol%差异在0.1%-0.4%之间;核DNA（G＋C）mol%的差异在0.4%-0.8%范围内;而18S rDNA的部分序列则完全相同。     

不同方法提取生物检材DNA的比较研究

目的:比较有机法、chelex100法和硅珠法提取不同检材DNA的优劣,从而为各类检材的DNA提取提供参考。方法:用有机法、chlex100法和SiO2法分别提取2组共24份生物检材DNA进行扩增检验,比较分析结果。结果:对不同生物检材的DNA检验,有机法、chlex100法和SiO2法各有其优势和局限性。结论:针对不同检材采用不同提取方法,可以有效节约检验时间,提高检验成功率。     

DNA拓扑异构酶Ⅰ生物学活性的比较研究

测定了3T3细胞、人和大鼠一些组织中DNA拓扑异构酶Ⅰ的活性;估计了核酸内切酶对拓扑酶Ⅰ松弛活性测定的干扰程度;发现增殖组织全细胞抽提液中酶比活高于正常分化组织,而且在异常增殖组织中酶比活的增高更为显著。     

短DNA片段缩合结构的比较研究

本文利用透射式电镜对四种短DNA片段(500、1100、1500、2700 bP)的缩合结构进行了比较研究得出很有意义的结果。定量研究证实短至500 bP的DNA分子仍可形成复曲面,且分子量相差5倍多的DNA片段缩合形成的复曲面尺度大小一致。复曲面外径为400A左右。从而进一步证实作者与Arscott及Bloomfield关于复曲面尺度独立于DNA分子量,及短DNA片段的缩合是多分子缩合的结论。此外,观测到缩合中间结构的尺度依DNA分子量大小不同而变化,同时分子量愈小的DNA片段产生另一种缩合结构—棒体的几率愈大。     

湖泊沉积物基因组DNA的提取方法比较研究

水体沉积物为一新型微生物种质资源库,不依赖于培养的菌种多样性研究的首要条件是获取优质的基因组DNA。本研究以改进的氯仿异戊醇法、蛋白酶K+SDS法、玻璃珠+蛋白酶K+SDS法提取湖泊基因组DNA,并与试剂盒提取结果进行比较,为沉积物分子生态学的研究提供参考和借鉴。结果表明,改进后的氯仿异戊醇法提取的DNA纯度较低,腐殖质明显,纯化后PCR产量较低;蛋白酶K+SDS法获得的DNA完整性较好,浓度高,PCR扩增应用效果最好;玻璃珠+蛋白酶K+SDS法提取的基因组DNA效果次之;试剂盒法提取的基因组DNA浓度较低,片段长度略小。蛋白酶K+SDS法为除试剂盒外适合于湖泊沉积物基因组DNA提取的较好方法。     

几种中药DNA提取方法的比较研究

以丹参、绞股蓝、三七为材料,分别采取CTAB法和SDS法提取基因组DNA,并通过紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对所提取的DNA样品进行检测,将它们在DNA产量、质量等方面的优缺点进行总结。结果表明,CTAB法能从丹参、绞股蓝中提取高质量的DNA,而三七的DNA更适合用SDS法提取。     

三个鲫品系DNA含量的比较研究

采用流式细胞术 (FCM)对红鲫、彭泽鲫、异育银鲫进行红血球DNA含量的检测分析比较 ,以鉴定它们的倍性。结果显示 ,红鲫红血球的DNA含量是 3 0pg ,彭泽鲫是 4 7pg ,异育银鲫是 4 8pg。显而易见 ,彭泽鲫的DNA含量是二倍体红鲫的 1 57倍 ,异育银鲫的DNA含量是红鲫的 1 6倍。采用肾细胞直接制作染色体的方法进行红鲫、彭泽鲫、异育银鲫的染色体倍性鉴定 ,结果红鲫的染色体数目是 10 0 ,为二倍体 (2n =10 0 ) ,彭泽鲫的染色体数目是 162 ,为三倍体 (3n =162 ) ,异育银鲫的染色体数目是 156— 162 ,为三倍体 (3n =156— 162 )。研究证明 :不同品系鲫的DNA含量高低与染色体的倍性有显著的正相关性     

人和小鼠血清DNA结合蛋白质的比较研究

血清DNA结合蛋白质中的某些成分与肿瘤有关。因此我们对人及小鼠血清DNA结合蛋白质作了对比研究。发现两者在蛋白质组成,分子量,等电点及氨基酸组成上颇为相近。但免疫扩散试验证实两者无免疫交叉反应。     

短DNA片段缩合结构的比较研究

本文利用透射式电镜对四种短DNA片段(500、1100、1500、2700 bP)的缩合结构进行了比较研究得出很有意义的结果。定量研究证实短至500 bP的DNA分子仍可形成复曲面,且分子量相差5倍多的DNA片段缩合形成的复曲面尺度大小一致。复曲面外径为400A左右。从而进一步证实作者与Arscott及Bloomfield关于复曲面尺度独立于DNA分子量,及短DNA片段的缩合是多分子缩合的结论。此外,观测到缩合中间结构的尺度依DNA分子量大小不同而变化,同时分子量愈小的DNA片段产生另一种缩合结构—棒体的几率愈大。