利用系统作图(Systems mapping)研究大肠埃希菌和金黄色葡萄球菌的互作遗传机制

【背景】物种间相互作用是物种进化的重要推动力,然而如何将基因型和表型关联以及确定在物种相互作用过程中起重要作用的基因均面临挑战。【目的】通过系统作图(Systems mapping)得到两种微生物在相互作用过程中起重要作用的SNPs (Single nucleotide polymorphism),以及随着时间的变化,这些SNPs是如何相互联系进而影响大肠埃希菌和金黄色葡萄球菌的相互作用。【方法】分别对45株大肠埃希菌、45株金黄色葡萄球菌进行单独培养和混合共培养,通过实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qPCR)进行绝对定量,得到一定时间内各个菌株的生长量,比较相同菌株在不同培养条件下生长情况,以各个菌株重测序结果为基础,结合系统作图得到在相互作用过程中起重要作用的显著SNPs及其相互联系。【结果】通过系统作图分析,获得具有54对显著SNPs组合的三维曼哈顿图,这些组合中41个显著SNPs来自大肠埃希菌,12个显著SNPs来自金黄色葡萄球菌。在上述SNPs中已有6个SNPs所在的候选基因都可以直接或者间接影响微生物的生长量变化,从而影响两种微生物相互作用方式。它们分别是nhaR(E19056)参与生物膜的形成,rhlE(E832164)与核糖体的组装有关,csiD (E2789300)的表达可以使细胞面对恶劣环境,alk B (E2309274)可以参与DNA的损伤修复,sucA(E759230)和yjjW(E4614704)都参与细胞的代谢过程。【结论】系统作图可以检测到物种在相互作用过程中显著SNPs;物种相互作用过程中不同SNPs遗传效应随着时间变化;细菌的相互作用过程是直接遗传效应、间接遗传效应和上位性效应共同产生的结果。     

菊花提取物对金黄葡萄球菌及大肠埃希菌的抑制研究

为评估杭白菊提取物对两种常见病原菌——金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus,S.aureus）ATCC6538和大肠埃希菌（Esche richia coli,E.coli）CICCB0032的抑制作用,文章选取浙江桐乡杭白菊制备菊花提取液,并将其与标准培养基进行对比,观察其抑菌效果。研究发现,杭白菊提取物表现出了优异的抑菌性能,其对金黄色葡萄球菌的抑制作用尤为突出,为杭白菊提取物的应用提供了科学的依据。     

黑大蒜提取物联合抗生素对金黄色葡萄球菌和肠埃希菌的体外抗菌作用研究

评价黑大蒜提取物分别与头孢唑林或庆大霉素联合应用,对金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌的体外抗菌效应。采用液体稀释法分别测定黑大蒜提取物对金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌的最低抑菌浓度（MIC）。采用棋盘法设计,微量肉汤稀释法测定黑大蒜提取物联合头孢唑林或庆大霉素对金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌的MIC,并计算部分抑菌浓度（FIC指数）。测定黑大蒜提取物对金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌的时间-杀菌曲线。黑大蒜提取物对金黄色葡萄球菌的MIC为256μg/mL,黑大蒜提取物对大肠埃希菌的MIC为256μg/mL。时间-杀菌曲线结果显示黑大蒜提取物对金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌的抑菌作用呈现较强的浓度依赖性。黑大蒜提取物联合头孢唑林后对金黄色葡萄球菌的FIC指数为0.75;黑大蒜提取物联合庆大霉素后对大肠埃希菌的FIC指数为0.5。黑大蒜提取物与头孢唑林或庆大霉素联合用药,可明显降低抗生素对金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌的MIC,表现为相加和协同效应。     

苦参、黄芩、乌梅对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌和白假丝酵母菌抗菌活性的研究

目的观察苦参、黄芩和乌梅的体外抗菌活性。方法采用M-H琼脂连续稀释法做抗菌作用测定,测出各中药的最小抑菌浓度。结果苦参对金黄色葡萄球菌的MIC值最低（2.5mg/ml）,乌梅对大肠埃希菌的MIC值最低（1.25mg/ml）,乌梅对白假丝酵母菌的MIC值最低（2.5mg/ml）。结论苦参、黄芩和乌梅对革兰阳性球菌、革兰阴性杆菌和真菌均有较好的抑菌活性。     

乳酸杆菌细胞裂解物对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌的抑制作用

目的探讨乳杆菌DM8909裂解物在体内外对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌的抑制作用。方法通过对乳杆菌超声波破碎制成裂解物,分别用乳杆菌裂解物原液、裂解物稀释液、发酵上清液、乳杆菌活菌制剂进行体内、体外实验,观察乳杆菌各成分对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌的抑制作用。结果德氏乳酸杆菌裂解物对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌的抑制作用与乳杆菌活菌制剂的抑制作用相近。结论德氏乳酸杆菌裂解物在体内外对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌均有较强的抑制作用。     

非致病性大肠埃希菌能增多大肠埃希菌O157:H7志贺毒素的产生

大肠埃希菌(简称大肠杆菌)O157：H7毒力因子为志贺毒素2(stx2),其基因由温和噬菌体编码,由晚期基因启动子调控表达。stx2的合成与释放需要诱导噬菌体溶菌周期,而且正常肠道大肠杆菌感染了毒素编码的噬菌体就能制造毒素和噬菌体,使毒素水平远远超过病原性菌株本身的产量,作者在体外以及鼠肠道验证了这一假设。     

大肠埃希菌基因组研究

大肠埃希菌是最早启动全基因组测序的细菌之一,但是对于大肠埃希菌作为共生菌存在于人类和动物肠内的生物学本质尚不清楚。目前,研究人员正在对大肠埃希菌基因组中每个必需基因的功能进行研究,以期能进一步了解大肠埃希菌的生物学特性。本文就大肠埃希菌基因组研究现状、研究方法及其后基因组研究等方面进行综述。     

霍乱毒素和大肠埃希菌肠毒素的免疫调节作用

一般都知霍乱毒素和产毒性大肠矣希菌（大肠杆菌）不耐热肠毒素具有很强的免疫原性,这些细菌肠毒素的Ｂ亚单位尚有促进免疫耐受性的免疫调节作用,现综述这些有关分子调节白细胞群体的机制。     

秦皮素对大肠埃希菌作用机制的初步研究

目的以大肠埃希菌ATCC 25922为供试菌,探讨秦皮素的抑菌活性及其作用机制。方法利用TTC法测定秦皮素对大肠埃希菌ATCC 25922的最低抑菌浓度;通过测定加药前后菌体培养液电导率和大分子的变化及观察扫描电镜和透射电镜电镜结果,分析秦皮素对其细胞膜的影响;通过SDS-PAGE测定秦皮素对供试菌株蛋白含量的影响;采用逐个检出法研究秦皮素对大肠埃希菌ATCC 25922质粒合成的抑制作用。结果秦皮素可抑制大肠埃希菌ATCC 25922的生长,其最低抑菌浓度为40μg/mL。秦皮素作用菌体5 h后,培养液中的电导率比对照组增加1.96%,但DNA和RNA大分子增加的不明显。秦皮素作用大肠埃希菌20 h后,菌体可溶性蛋白总量比对照组降低42%。秦皮素对大肠埃希菌的质粒有消除作用,药物作用48 h后,秦皮素对大肠埃希菌的质粒消除率为60.3%。结论秦皮素可抑制大肠埃希菌的生长,其抑菌作用机制与抑制菌体内蛋白质合成和消除菌体内的质粒有关,但对大肠埃希菌细胞膜的影响不大。     

大肠埃希菌的分型研究

目的分析上海某医院各科室分离大肠埃希菌的药敏状况和致病性,了解大肠埃希菌在该院流行情况。方法采用K-B琼脂法进行药敏试验,多重PCR技术进行基因分型。结果药敏结果显示该菌对多种常用抗生素具有耐药性,仅对阿米卡星等药物敏感。85株菌分为4个基因型,其中B2型25株,致病性最强;D型37株,致病性次之。菌株间亲缘关系表明可能存在院内流行。结论实验获得菌株具有较强耐药性和致病性,应当采取相应的措施预防院内感染的流行。     

The phototoxicity of phenothiazinium derivatives against Escherichia coli and Staphylococcus aureus

Phenothiazinium dyes, and derivatives, were tested for toxicity to Escherichia coli and Staphylococcus aureus. The dyes were generally lipophilic (log P>1) and showed inherent dark toxicity (minimum lethal concentrations: 3.1-1000 microM). Dye illumination (total light dose of 3.15 J cm(-1) over 30 min) led to up to eight-fold reductions in minimum lethal concentrations. Most of the illuminated dyes showed significant relative singlet oxygen yields (phi'delta: 0.18-1.35) suggesting a type II mechanism of generating a phototoxic response. Although generally up to six-fold more effective against S. aureus, the dyes tested efficiently killed E. coli and may be of particular use in combating Gram-negative pathogens.     

A new gel tube method for the direct detection, identification and susceptibility testing of bacteria in clinical samples

We recently developed a simple new method which is designed to separate and concentrate bacteria from a sample by centrifugation in a gel system. Bacterial enzyme activity is then detected inside the gel without further manipulation using a colorimetric or fluorogenic substrate. The method provides a rapid, direct means of detecting bacteria in clinical samples, dispensing with the 24-h period normally required to isolate colonies on agar. Various applications of the method are described below, e.g. screening of negative urine samples, identification of Escherichia coli in urine samples, identification of Staphylococcus aureus in blood culture broths and detection of oxacillin-resistant S. aureus in blood culture broths. The advantages of the gel system and other applications are discussed.     

DOPA Production with Enterobacter cloacae NB 320 by Transamination Reaction

Taxonomical investigation was performed on the bacterium, strain NB 320 isolated from soil, and it was identified as Enterobacter cloacae. This bacterium produced the enzyme which catalyzed the transamination reaction between 3,4-dihydroxyphenyl pyruvate and an amino acid to form l-Dopa.

The optimum culture conditions for the enzyme production were studied along with the characteristics of the enzyme. The enzyme of the strain was different in some properties from that of Alcaligenes faecalis IAM 1015 which had been already studied. The former utilized glutamate as an amino donor best among the amino acids tested for transamination and was induced by the addition of glutamine and asparagine. Intact cells of the strain did not catalyze the reaction unless they were treated with sonication or with a detergent.     

不同浓度酒精对两种常见细菌生物膜的影响

目的 探讨不同浓度的酒精对金黄色葡萄球菌和大肠杆菌生物膜形成的抑制作用.方法 配制不同浓度的酒精(1.25％、2.5％、5％和10％),作用于培养24 h形成成熟生物膜的金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌,利用FDA/PI荧光染料染色,在激光共聚焦显微镜扫描生物膜并分析活菌与死菌比例.结果 不同浓度的酒精对两种细菌生物膜的形成均有一定破坏作用,5％、10％浓度酒精对金黄色葡萄球菌生物膜破坏最大,活菌与死菌比例为0.142 ±0.007、0.006±0.001;10％浓度酒精对大肠埃希菌生物膜破坏最大,活菌与死菌比例为5.751±1.779.结论 较低浓度的酒精可抑制金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌生物膜的形成,且10％浓度的酒精效果最好.     

不同类型铜合金板的杀菌特性

【目的】微生物对可接触表面的污染给公共卫生带来了极大的威胁。利用具有杀菌特性的铜及铜合金代替不锈钢等制品,可以降低消毒剂的使用和细菌的传播。【方法】通过分析3株金黄色葡萄球菌和2株大肠杆菌在铜及铜合金平板上的存活时间,对不同类型铜合金的杀菌特性进行了探索。【结果】铜合金平板的杀菌能力与其铜含量成正比;铜合金对同属细菌的杀菌能力相近,对不同属细菌则有一定差异;铜合金的杀菌效率与细菌对Cu2+抗性没有直接联系;铜合金杀菌的效率与细菌的细胞壁结构可能有很大关联。【结论】铜及铜合金是较好的杀菌材料。     

沙门菌、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的多重PCR检测

根据沙门菌invA基因、大肠杆菌phoA基因和金黄色葡萄球菌nuc基因序列,设计3对特异性引物进行多重PCR并对反应条件进行优化。结果表明3对引物能特异地扩增出284bp、622bp、484bp的目的条带;最佳反应条件为沙门菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌的引物浓度分别为40nmol／L、40nmol／L、80nmol／L,Mg^2＋浓度2．4mmol／L,dNTP浓度2001μmol／L,Taq DNA聚合酶1.5u,退火温度55．0℃-57．4℃之间;在此条件下多重PCR同时检测DNA的敏感性分别是10．2pg、10．2pg、102．0pg,检测时间4h。建立的多重PCR是一种敏感、特异、准确、快速的方法,为同时检测食品中沙门菌、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌奠定了基础。