中国汉族人群MASP2基因单核苷酸多态性的连锁不平衡和单体型分析

目的：探讨中国汉族人群甘露糖结合凝集素相关的丝氨酸蛋白酶（MASP2）基因单核苷酸多态性（SNP）的连锁不平衡和单体型,为相关研究提供更为详实的数据。方法：选取30例广州汉族无关个体,用重新测序的方法进行MASP2基因SNP的发掘,构建连锁不平衡（LD）模式,与HapMap公布的其他4个人群数据相比,并选择4个标签SNP（tagSNP）在232例北京汉族个体和291例广州汉族个体中分析MASP2的多态性和单体型。结果和结论：对MASP2的重测序共检测出16个SNP,LD分析显示来自中国不同地区人群的LD模式基本相同,与来自美国和日本的人群存在差异;北京和广州地区汉族人群tagSNP的等位基因和基因型频率分布不存在显著差异。     

PON基因簇序列变异筛查研究

摘要：系统筛查PON1、PON2及PON3基因编码、剪接及侧翼序列,以期发现所有潜在功能多态基因座,为进一步探讨PON基因家族与心血管疾病的关系做准备。随机选择48例冠心病患者作为筛查对象, 以PCR产物直接测序检测DNA序列变异。扩增片断涵盖整个外显子, 其两侧部分内含子区域及5’和3’侧翼序列。（1）13.9kb测序范围内共发现31个多态性基因座,均为单核甘酸多态（SNP）,其中17个SNP为首次报道。（2）国人中SNP构成和等位基因频率与高加索人群存在显著差异。（3）一个基因内部两个或多个多态性基因座间存在完全或近乎完全连锁不平衡相当常见。中国汉族人群中PON基因簇多个潜在功能多态基因座的识别及这些基因座间的强连锁不平衡状态,为在国人中探讨PON基因簇与心血管疾病关系提供了重要的基础数据。     

心脏钠离子通道α亚单位基因单核苷酸多态性及其在汉族人群中的分布

实验旨在研究中国汉族人群心脏钠离子通道α亚单位(voltage-gated sodium channel type Ⅴ,SCN5A)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其分布。应用荧光标记自动测序法测定120名非亲缘关系中国南方汉族人群的SCN5A基因序列,确定其单核苷酸多态位点及基因型。结果如下,在中国南方汉族人群中共检测到5个SNPs:3个位于编码区,另2个分别位于3’侧翼区和intron23邻接供体剪接位点的区域。各个SNP在基因中呈不均匀分布,其基因频率分别为G87A(A29A)27.5％,A1673G(H588R)10.4％,4245+82A>G 32.8％,C5457T(D1819D)41.3％和G6174A44.9％。其中G87A(A29A),G6174A和4245+82A>G为新发现的SNP。A1673G(H588R)的基因频率在中国南方汉族人群、日本人群和美国人群之间无显著差异(P>0.05)。C5457T(D1819D)在中国南方汉族人群和日本人群中的分布非常接近(P>0.5),但都明显高于美国人群中的分布(均P<0.005)。各SNP在不同性别中的分布无显著差异(均P>0.05)。S1102Y及其余10个国外已经报道的多态位点在本研究中未检测到。各SNP等位基因频率在人群中的分布符合Hardy—Weinberg平衡。结果提示,SCN5A基因SNP具有较大的民族差异。     

CYP1A1基因单核苷酸多态性与肺癌的相关性研究

目的:探讨代谢酶CYP1A1基因MspI位点多态性与新疆汉族人群肺癌遗传易感性之间的相关性.方法:应用聚合酶链式反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)技术检测59例新疆汉族肺癌和84例新疆汉族健康人的CYP1A1基因MspI位点多态性分布频率,并分析了CYP1A1基因MspI位点多态性与新疆汉族人群肺癌遗传易感性和患者性别之间的相关性.结果:(1)CYP1A1基因MspI位点3种多态基因型分布频率在两组间比较差异有统计学意义(χ2=6.682,P=0.035),CC基因型在病例组的分布频率显著高于正常对照组.(2)携带突变CC基因型的个体较携带TT基因型的个体患肺癌的危险性增加(OR=3.759.95%CI=1.228-11.494,P=0.035).(3)男女肺癌患者的CYP1A1基因MspI位点基因型及等位基因频率的差异均无显著性(P>0.05).结论:(1)CC突变基因型可能是新疆汉族人群的肺癌易感因素.(2)CYP1A1基因MspI位点多态性可能与新疆汉族肺癌患者的性别无关.     

脂联素基因SNP45 T/G多态性与2型糖尿病相关性研究

目的:探讨脂联素基因(APM1)SNP45 T/G多态性与湖北汉族人群2型糖尿病的相关性.方法:采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)方法分析了479例样本的APM1基因SNP45T/G多态性,并测定身高、体重、腰围、臀围、血压和空腹血糖等生理指标.结果:两种实验设计中对照组与病例组基因型和等位基因频率差异均无统计学意义.结论:脂联素基因SNP45T/G多态性在湖北汉族人群2型糖尿病的发生发展中可能不起主要作用.     

中国北方汉族人群sTnT基因单核苷酸多态性分析

目的：研究中国北方汉族人群sTnT基因的单核苷酸多态性（SNP）,观察其在北方汉族人群中的分布。方法：用PCR-RFLP的方法对204名中国北方汉族人群sTnT基因的SNP进行分析,确定其等位基因频率。结果：美国国立生物技术信息中心报告的外显子11上的27916722 A／C未在本项研究人群中检测到。27930097 C／G和的27920978 C／F的等位基因频率与美国国立生物技术信息中心（NCBI）报道均有显著性差异。结论：sTnT基因SNP分布具有种族差异性。     

A-FABP基因多态性与肉鸡生长和体组成性状的关联

为探讨A-FABP基因多态性对肉鸡生长和体组成性状的影响,文章选用肉鸡高、低脂双向选择品系第十世代肉仔鸡为实验材料,采用测序、PCR-RFLP、PCR-LP、DHPLC方法进行基因多态性检测和个体基因型分析,通过对8个SNPs进行连锁不平衡分析并选择5个标签SNPs构建单倍型,进而利用单位点和单倍型分别与鸡生长和体组成性状进行关联分析。结果表明,7个SNPs(除SNP 5以外)及单倍型同时对鸡肌胃重、肌胃率有显著影响(P<0.05),而对生长和其他体组成性状无显著影响(P>0.05)。鉴于不同物种A-FABP基因现有的功能研究均没有发现其对消化系统有重要作用,因此该基因是否为影响肉鸡肌胃重和肌胃率的主效基因还有待于进一步研究。     

Calpain10基因多态性与2 型糖尿病的相关性研究

目的：探讨钙蛋白酶10（Calpain10）基因第3内含子SNP19多态性在湖北汉族人群2型糖尿痛发生发展中的作用。方法：采用同胞对（家系内对照）和随机病例-对照两种实验设计,结合聚合酶链反应-限制性片断长度多态性（PCR-RFLP）．技术分析共403个样本的Calpain10基因第3内合子SNP19多态性,并测定身高、体重、腰围、臀围、血压和空腹血糖等生理指标。结果：两种实验设计中对照组与病例组的基因型和基因频率均无显著差异（PO．05）。结论：Calpain10基因SNP19多态性在湖北汉族人群2型糖尿病的发生发展中可能不起主要作用。     

TLR4基因启动子区多态性及其对蛋白表达的影响

目的:检测中国人群Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)基因5′调控区的单核苷酸多态性(single nucleotidepolymorphisms,SNPs),探讨其与TLR4蛋白表达的关系.方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法(PCR-RFLP)对正常汉族人群样本TLR4启动子区-2242、-1892和-1837这3个可能有意义的SNP位点进行基因分型,以确定中国人群中TLR4基因启动子区SNP基因型和发生频率.取其中89例全血标本用全血培养模型检测内毒素刺激前后TLR4蛋白的表达变化,进一步探讨TLR4启动子区单核苷酸多态性对其蛋白表达的影响.结果:TLR4启动子区-2242、-1892和-1837这3个可能有意义的SNP住点等位基因频率分别是43.27%、27.70%和42.75%.TLR4蛋白表达检测结果表明内毒素刺激后-2242位点TC与CC基因型TLR4蛋白的表达显著高于TT基因型(P<0.05),其它位点则没有影响.结论:中国汉族人群中TLR4基因启动子区-2242位点可能是脓毒症关联分析重要的遗传标记.     

云南汉族酒精依赖综合征与COMT遗传多态性的关联研究

目的:研究儿茶酚胺氧位甲基转移酶(COMT)的不同基因型及等位基因频率在云南汉族酒精依赖综合征患者组和健康对照组的分布差异。方法:应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析法,对COMT基因的rs2075507、rs737865、rs4680、rs165599四个基因位点进行特异性扩增,限制性内切酶酶切分型。结果:上述4个候选基因中,COMT基因rs737865位点C/C基因型频率在健康对照组较酒依赖组高,其基因型分布在两组中有差异,且具有统计学意义(P<0.05)其余3个位点统计学分析均无显著性差异(P>0.05)。单倍型分析:上述四个候选基因构建出12种主要单倍型(每种单倍型在对照组和酒依赖组中的频率至少有一个大于1%),单倍型A-C-A-A有可能是云南汉族酒精依赖发生的一种危险因子(OR:2.865,P=0.003347)连锁不平衡分析显示:云南汉族人群中,COMT基因的rs2075507和rs737865之间存在着强连锁(D>0.8)结论:在云南汉族人群中,COMT基因rs2075507、rs4680和rs165599位点与酒依赖无关联性,rs737865C/C基因型可能是酒精依赖的保护因子,可能降低嗜酒的发生率。单倍型A-C-A-A有可能是云南汉族酒精依赖发生的一种危险因子云南汉族人群中,COMT基因的rs2075507和rs737865之间存在着强连锁。     

中国汉族人群DNA酶I基因多态性与不稳定性心绞痛的关系

目的：探讨脱氧核糖核酸酶（IDNA酶I）基因多态性与汉族人群不稳定性心绞痛（unstable angina pectoris,UAP）易感性的关系。方法：以196例UAP患者为病例组,排除冠心病的297例体检者为对照组,应用PCR及PCR-限制性片段长度多态（PCR-RFLP）分析DNA酶I基因8外显子单核苷酸多态位点A2317G及4内含子56bp可变串联重复序列（HumDN1）多态性;协方差分析A2317G、HumDN1各基因型与UAP患者血脂的关系,将年龄、性别、高血压、糖尿病及吸烟作为协变量;x2检验分析UAP患者冠脉血管病变支数与DNA酶I基因型的关系。结果：UAP组与对照组A2317G、HumDN1各基因型及等位基因分布无明显统计学差异（P〉0.05）,两组DNA酶I单体型分布亦无差异。UAP患者DNA酶I各基因型血脂水平、冠脉血管病变支数的差异无明显统计学意义,所有P值均〉0.05。结论：DNA酶I基因多态性与中国汉族人群不稳定心绞痛及其血脂水平无明显相关性。     

胆囊收缩素及受体基因多态性与精神分裂症的相关性研究

目的：探讨胆囊收缩素（cholecystokinin,CCK）基因、胆囊收缩素A受体（cholecystokininAreceptor。CCKAR）基因和胆囊收缩素B受体（cholecystokinin A recepmr,CCKBR）基因多态性与精神分裂症之间的相关性。方法：采用聚合酶链式反应．限制性片段长度多态性方法,对420例精神分裂症患者（病例组）和455例健康个体（对照组）三个基因的6个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNPs）位点（rs11571842、rs13069836、rs1800908、rs1800857、rs1042047、rs4758092）的多态性进行检测。并比较两组人群中基因型和等位基因频率分布的差异。结果：对照组6个SNPs位点的基因型频率分布均符合Hardy-Weinbere平衡（P〉0．05）;CCKAR基因rs1800857位点基因型频率分布在精神分裂症组与正常对照组间存在显著性差异（P〈0．000）,病例组T等位基因频率显著高于对照组（P〈0．01）。结论：CCKAR基因多态性与精神分裂症相关,携带T等位基因的个体可能更容易患精神分裂症。     

Systematic polymorphism analysis of the CYP2D6 gene in four different geographical Han populations in mainland China

In this study, we systematically screened the polymorphisms of the whole CYP2D6 gene in the populations of four different geographical locations in China, namely, Shanghai, Shantou, Shenyang, and Xi'an, using a sample of 100 subjects from each population. Forty-eight different polymorphisms were detected as well as 12 novel ones. One novel nonsynonymous SNP was detected, and one novel intronic SNP was revealed that might inactivate a cryptic donor site 392 nucleotides downstream of the exon 6 natural donor site. In addition, the frequencies of some polymorphisms and alleles demonstrated significant differences among the four populations. Linkage disequilibrium analysis and tag SNP selection were performed separately for each population. Haplotypes were analyzed within the selected tag SNPs. Tag SNP selection and haplotype distributions showed differences across the four populations. This is the first large-scale study to analyze polymorphisms systematically across the whole CYP2D6 gene in the Chinese Han population.     

中国汉族人群肿瘤坏死因子-α（TNF-α）基因-238G/A和-308G/A多态性与强迫症的关联分析（英文）

目的：探讨在中国汉族人群中强迫症与TNF-a基因-238G/A和-308G/A多态性之间的关联。方法：我们的研究所招募的161例强迫症患者和325名健康对照中,应用PCR-RFLP比较了OCD组和对照组之间的TNF-α基因在-238G/A（rs361525）和-308G/A（rs1800629）位点的基因型和等位基因频率多态性。结果：在中国大陆汉族人群TNF-α基因的OCD组与对照组之间-308 G/A等位基因频率及-238G/A的基因型频率和等位基因频率无显着差异,而-308G/A基因型频率有显著不同。在-308G/A位点,女性强迫症患者和对照组之间的基因型频率关联分析有增高的趋势。结论：我们的研究结果表明,肿瘤坏死因子-α在-308G/A点位多态性可能会影响在中国大陆汉族人群强迫症的发展。     

NR2A基因启动子区GT二核苷酸短串联重复序列多态性与精神分裂症相关性研究

目的：NR2A基因是精神分裂症的重要候选基因,本研究旨在探讨NR2A基因启动子区GT二核苷酸短串联重复序列多态性与精神分裂症相关性。方法：根据DSM—IV诊断标准,随机选取陕西汉族无亲缘个体420例精神分裂症患者（精神分裂症组）及410例体检健康者（正常对照组）提取基因组DNA,采用特异荧光物质羧基荧光素FAM标记引物,聚合酶链反应（PCR）扩增,377测序仪基因扫描电泳分型,采用SPSS16．0统计软件分析各等位基因在组间的差异。结果：发现NR2A基因GT基因座在830个无关个体中共检测出19种等位基因,精神分裂症组（GT）21、（GT）22、（GT）23等位基因频率显著低于正常对照组（P〈0．05）;精神分裂症组（GT）26等位基因频率显著高于正常对照组（P〈0．05）。结论：NR2A基因启动子区GT二核苷酸短串联重复序列多态性可能通过影响NR2A蛋白的表达从而对精神分裂症的发生产生发展影响,（GT）2、（GT）22、（GT）。可能是精神分裂症的保护等位基因,而携带有（GT）M等住基因的个体个能更容易患精神分裂症。     

脂蛋白酯酶基因HindIII和PvuII位点多态与中国人2型糖尿病的关联及meta分析

目的：探讨脂蛋白脂酶基因HindIII（rs320）和PvuII（rs285）位点多态与中国人2型糖尿病的相关性。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,对919个湖北地区汉人（包括2型糖尿病患者481人,健康对照438人）脂蛋白脂酶基因内含子6PvuII和内含子8HindIII位点多态进行基因分型和关联分析,同时对中国大陆人群的相关研究进行meta分析。结果：HindIII和PvuII位点湖北汉族2型糖尿病人和正常人的基因型和等位基因频率均无显著差异。5个研究包括2型糖尿病患者1252例,健康对照1075例的PvuII位点meta分析表明该位点与中国人2型糖尿病无显著相关性（P=0.39）;9个研究包括2型糖尿病患者1515例,健康对照1022例的HindIII位点meta分析表明该位点与中国人2型糖尿病也无相关性（P=0.14）。结论：脂蛋白脂酶基因HindIII和PvuII位点多态与中国人2型糖尿病的发生无关。     

新疆维吾尔族人2型糖尿病患者AMPKα2基因多态性的分析研究

目的：研究腺苷酸活化蛋白激酶（AMP-activated protein kinase,AMPK）单核苷酸多态性（SNPs）rs2143754位点与新疆地区维吾尔族人2型糖尿病之间的关系。方法：以聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性（polymerase chain reaction-restriction flagmerit length polymorphism,PCR-RFLP）技术,对150例2型糖尿病和150例正常对照者AMPK-rs2143754位点进行基因分型。结果：AMPKet2位点T／T、G／T和G／G基因型频率在病例组为（40％,51％和9％）,正常对照组为（28％,49％和29％）,两组基因型和等位基因频率分布差异有显著性（P〈0．05）。结论：AMPKα2多态性与新疆维吾尔族人2型糖尿病有明显相关性。     

ABCG2基因rs2231142位点多态性与汉族女性痛风的相关性

目的：ABCG2基因第5外显子区单核苷酸多态性位点rs2231142与中国汉族男性痛风密切相关,基于痛风易感基因存在性别差异的考虑,本研究旨在探讨该单核苷酸多态性位点与中国汉族女性人群痛风易感性之间的相关性。方法：选取185例女性痛风患者和311例女性正常对照者,提取外周血基因组DNA,采用聚合酶链式反应（PCR技术）,特异性扩增ABCG2基因所需要的目的片段并测序,比较痛风组和正常对照组的基因型频率及等位基因频率分布情况。结果：rs2231142位点的CC、CA、AA基因型频率在两组间存在显著差异（x2=16.519,P〈0.001）,且痛风组中A等位基因频率显著高于正常对照组（分别为42.2%和29.3%,P〈0.001,OR 1.76[95%CI：1.35-2.31]）。结论：ABCG2基因第五外显子区rs2231142（C/A）位点的单核苷酸多态性与中国汉族女性人群痛风易感性密切相关,携带A等位基因的汉族女性人群有更高的痛风患病率。ABCG2基因首次被证实为中国汉族女性人群的痛风致病易感基因。     

2型糖尿病家系患者LEPR基因Gln223Arg多态性的研究

目的：研究黑龙江地区汉族人2型糖尿病家系的LEPR基因Gln223Arg多态性,探讨其与2型糖尿病发病的关系。方法：应用聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性（PCR-RFLP）技术,对来自于黑龙江地区120个2型糖尿病家系中的210例2型糖尿病患者及319例正常对照的LEPR基因Gln223Arg（668 A→G）位点进行基因分型。结果：LEPR基因Gln223Arg三种基因型在病例组和对照组间整体分布有统计学意义（P=0.034,df=2）;除AG基因型（x2=4.550,P〈0.01）外,其余各基因型及等位基因在病例组和对照组间分布未见显著性差异（P〉0.05）。结论：LEPR基因Gln223Arg多态性与黑龙江地区汉族人2型糖尿病有关,LEPR基因可能为中国人2型糖尿病发病的相关易感基因。