乌鳢肝5S rRNA的核苷酸序列

应用Peattie,Maxum等化学裂解法,辅以酶解直读法等测定了乌醴(Ophiocephalus argus)肝5S rRNA的核苷酸序列;与已知的虹鳟鱼和纵带泥鳅5S rRNA序列比较,发现它们之间的核苷酸序列具有高度的保守性.利用其一级结构所给出的信息,初步提出二级结构模型.     

蜜蜂5SrRNA核苷酸序列及与其他5SrRNA的比较

蜜蜂5SrRNA由119个核苷酸组成。与其他几种昆虫的5SrRNA比较,其序列的同源性在80％以上,具有较高的保守性。在二级结构的模式基础上,证明了单链突环区比双链螺旋区保守的现象;通过计算5SrRNA每年每个核苷酸位点上的碱基平均替换率,揭示了昆虫5SrRNA比脊椎动物的5SrRNA有较高的替换速率,其主要原因是双链螺旋区碱基高替换所致;并提出了用比较较保守的单链压的方法,修正计算碱基替换率的公式,以便由小分子rRNA推导出的遗传变异速率的结论更具有广泛性。     

芹菜(Apium graveolens L.)叶细胞质5SrRNA的序列测定

应用Gupta等和Tanaka等建立的RNA序列双向直读技术,并辅以部分酶解法、化学法等,测定了芹菜叶细胞质的5SrRNA的全序列:与菠菜和蕃茄细胞质已知5SrRNA序列进行了比较,发现它们之间在序列上有高度的保守性。     

大黄鱼16SrRNA和18SrRNA基因的测定与序列分析

利用多对引物,扩增并测定出大黄鱼16SrRNA基因和18SrRNA基因的部分序列,其长度分别为1202bp和1275bp,16SrRNA基因序列的GC含量为46．12％,18SrRNA基因的Gc含量为53．oo％。将大黄鱼16SrRNA基因序列与GenBank中15种硬骨鱼类的同源序列结合,同时将其18SrRNA基因序列与GenBank中9种脊索动物的同源序列相结合,运用软件获得各自序列间差异百分比,转换和颠换数值等信息。基于这两种基因序列,利用NJ法和BI法,分别构建16种硬骨鱼类和10种脊索动物的分子系统树。18SrRNA构建的系统树包括三大支,一支为哺乳类、鸟类和爬行类共6个物种,一支为两栖类的1个物种,另一支为2种硬骨鱼类。16SrRNA构建的系统树显示大黄鱼所在的石首鱼科与鲈科和盖刺鱼科亲缘关系较近。此外还讨论了这两个基因的序列特征。     

RNA二级结构的最小自由能算法

RNA(即tRNA,rRNA,mRNA和SnRNA)有两大主要功能：一是某些病毒的遗传物质;二是参与蛋白质的合成,这些与细胞分化、代谢、记忆的储存等有重要关系,这些功能与RNA二级结构的稳定性。自由能密切相关．常用的计算自由能的方法有热力学微扰法及热力学微积分法等．本文以寻找最小自由能二级结构为目的,给出了RNA二级结构的最小自由能算法,该算法的时间复杂性不超过O(n^4)。     

中国甜菜坏死黄脉病毒RNA5的检测及其核苷酸序列分析

利用反转录 Ｐ Ｃ Ｒ 方法,对甜菜坏死黄脉病毒（ Ｂ Ｎ Ｙ Ｖ Ｖ）５ 个中国分离物的 Ｒ Ｎ Ａ５进行了检测,结果表明新疆分离物、黑龙江分离物和内蒙古乌拉特前旗分离物不含有 Ｒ Ｎ Ａ５ ,只有包头分离物和呼和浩特分离物有 Ｒ Ｎ Ａ５ 。序列分析结果,包头分离物和呼和浩特分离物 Ｒ Ｎ Ａ５ 基因组分别为１３３８ ｎｔ 和１３５８ ｎｔ,均只包含１ 个开放阅读框架,编码产生２６ ｋ Ｄ 蛋白。与法国 Ｆ７２ 分离物和日本 Ｄ５ 分离物相比, 各分离物间核苷酸序列同源性为９３７ ％ ～９８５ ％ ,由此推导的氨基酸序列同源性为９１８ ％ ～９８２ ％ 。     

非编码RNA的生物信息学研究方法:RNA结构预测及其应用

近10多年来的研究逐步揭示了RNA的各种生物学功能。RNA不仅是信息从DNA传递到蛋白质的中间体,还直接参与基因沉默、表观遗传学修饰等生物学过程。单链的RNA在体内通过碱基配对折叠成一定的二级结构。介绍了现在预测RNA二级结构的主要算法及其应用,其中包括基于热力学、同源比对和统计学习的各种算法,以及如何引入实验数据辅助预测。二级结构预测算法被广泛用于寻找RNA功能单元和预测新非编码RNA等各种问题。如何利用高通量实验数据帮助结构预测,探索长非编码RNA功能,研究RNA与蛋白质相互作用,是RNA二级结构预测算法和应用的一些前沿方向。     

基于18S rRNA和线粒体16S rRNA基因序列的柳蚕进化分析

为探讨柳蚕Actias selene Hübner与鳞翅目昆虫的系统发育关系,本研究利用PCR扩增获得了柳蚕核糖体18S rRNA和线粒体16S rRNA基因的部分序列,长度分别为391bp和428bp。并采用邻近距离法(NJ)、最大简约法(MP)、类平均聚类法(UPGMA)构建系统进化树。结果表明,柳蚕线粒体16SrRNA基因序列与大蚕蛾科昆虫的16SrRNA基因序列均表现出偏好于碱基AT的倾向。柳蚕与所研究的其它蚕类的遗传距离介于0.016至0.140之间,其中与温带柞蚕Antheraea roylii的遗传距离最小,与野桑蚕Bombyx mandarina的遗传距离最大。而基于鳞翅目昆虫18S rRNA基因部分序列的进化分析显示,柳蚕与柞蚕Antheraea pernyi之间的遗传距离最小(0.010),与蓖麻蚕Samia ricini的遗传距离最大(0.017)。     

中国甜菜坏死黄脉病毒RNA5的检测及其核苷酸序列分析*

利用反转录PCR方法,对甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)5个中国分离物的RNA5进行了检测,结果表明新疆分离物、黑龙江分离物和内蒙古乌拉特前旗分离物不含有RNA5,只有包头分离物和呼和浩特分离物有RNA5。序列分析结果,包头分离物和呼和浩特分离物RNA5基因组分别为1338nt和1358nt,均只包含1个开放阅读框架,编码产生26kD蛋白。与法国F72分离物和日本D5分离物相比,各分离物间核苷酸序列同源性为93.7%～98.5%,由此推导的氨基酸序列同源性为91.8%～98.2%。     

淀粉酶的同源性研究

对α－淀粉酶、麦芽四糖淀粉酶和葡萄糖淀粉酶进行的氨基酸序列比较表明,它们之间的氨基酸等同性相当低。本文在对这三种淀粉酶的氨基酸残基进行疏水性分析的基础上,采用国际上近期发展的疏水簇分析方法对这三种淀粉酶的氨基酸序列进行了二维描述,其结果清楚地显示了它们之间的同源性差异。这也被测定的三维结构所证实。这一研究结果表明,与蛋白质三维结构密切相关的蛋白质的二级结构及其相互配置主要取决于蛋白质序列中不同类型氨基酸残基的排列。     

乌鳢肝5S rRNA的核苷酸序列

应用Peattie,Maxum等化学裂解法,辅以酶解直读法等测定了乌醴(Ophiocephalus argus)肝5S rRNA的核苷酸序列;与已知的虹鳟鱼和纵带泥鳅5S rRNA序列比较,发现它们之间的核苷酸序列具有高度的保守性.利用其一级结构所给出的信息,初步提出二级结构模型.     

蓖麻蚕微孢子虫的超微结构研究

用电镜技术研究蓖麻蚕微孢子虫各发育阶段的超微结构,发现其裂殖体和母孢子具双核,其细胞核由双层单位膜所包裹,核具半圆形的纺锤空斑,细胞质中有内质网和丰富的核糖体,但无线粒体。成熟的孢子壁由外壳、内壳及孢子膜组成,孢子器具有片层结构的极质体和后液泡,极丝为10—11圈,孢质含有核糖体和一对细胞核。     

蓖麻蚕卵黄磷蛋白鉴定、纯化及抗血清制备

本文通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS—PAGE)法,分析了蓖麻蚕卵黄蛋白质组分,对即黄磷蛋白(Vitellin Vn.)进行了鉴定、纯化,并制备了抗血清。对卵黄磷蛋白的分子量及相对含量进行了测定。并证明卵黄磷蛋白若处在酸性pH条件下能降解。     

蓖麻蚕个体发育中蜕皮甾类滴度的变化

用放射免疫分析法(RIA)测定了蓖麻蚕(Philosamia cynthia rieini)从卵期到成虫个体发育整个过程的蜕皮甾类(MH)水平.卵期在6天时有一个MH峰.一龄到四龄各龄均有一个MH峰,出现在停食前一天,导致幼虫蜕皮.五龄期有两个MF峰.第一个小峰出现在第三天,使进食的幼虫向预蛹转化;第二个高峰在上簇两天后,导致蛹表皮的形成.与其它鳞翅目昆虫一样,蛹期只有一个MH峰,发生在蛹期的前半段.成虫期血淋巴内MH含量很低.     

20-羟基蜕皮酮对蓖麻蚕蛹体液免疫的调节作用(英)

本研究指出20—羟基蜕皮酮(20-OHE)参加蓖麻蚕蛹对大肠杆菌的体液免疫反应。20-OHE的作用方式是多方面的,包括提高血淋巴蛋白质含量,产生抗菌蛋白,增加溶菌酶活性,和激活原酚氧化酶系统。这表明多个免疫控制系统参与蓖麻蚕蛹体液免疫反应的可能性。     

杂交蚕后代的5S rRNA一级结构

本文用化学降解和核糖核酸酶降解凝胶电泳直读法,测定了广西蚕业指导所用人工授精方法获得的蓖麻蚕(Philosamia cynthia ricini♂)和家蚕(Bombyx mori ♀,)的杂交第六代个体(具有花斑)的5SrRNA的一级结构。以同法测定了其母本家蚕5S rRNA的一级结构。结果见到两者一样,说明杂交蚕的 5S rRNA基因来自母本。它们的结构与Komiya等(1981)测定的未知品种家蚕5S rRNA有二个核苷酸的差别。     

Phylogeny of protozoa deduced from 5S rRNA sequences

Summary The nucleotide sequences of 5S rRNAs from three protozoa,Bresslaua vorax, Euplotes woodruffi andChlamydomonas sp. have been determined and aligned together with the sequences of 12 protozoa species including unicellular green algae already reported by the authors and others. Using this alignment, a phylogenic tree of the 15 species of protozoa has been constructed. The tree suggests that the ancestor for protozoa evolved at an early time of eukaryotic evolution giving two major groups of organisms. One group, which shares a common ancestor with vascular plants, contains a unicellular green flagellate (Chlamydomonas) and unicellular green algae. The other group, which shares a common ancestor with the multicellular animals, includes various flagellated protozoa (includingEuglena), ciliated protozoa and slime molds. Most of these protozoa appear to have separated from one another at a fairly early period of eukaryotic evolution.