普通野生稻和亚洲栽培稻线粒体DNA的RFPL分析

通过７个探针、１７种内切酶探针组合对１１８份普通野生稻和７６份亚洲栽培稻的线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）ＲＦＬＰ分析表明,籼粳分化是亚洲栽培稻线粒体基因组分的主流,７６个栽培稻中,３６个品种ｍｔＤＮＡ为籼型,４０个品种ｍｔＤＮＡ为粳型。普通野生稻ｍｔＤＮＡ以籼型为主（８６份）,粳型较少（７份）,１份类型难以确定,还有２４份没有籼粳分化。     

使君子科风车子亚科核糖体DNAITS区序列分析及系统学意义

使君子科（Ｃｏｍｂｒｅｔａｃｅａｅ）主要分布于热带非洲和亚洲,美洲和澳洲也有少量分布。全世界有约２０属,近　５００多种（Ｅｘｅｌｌ　＆　Ｓｔａｃｅ,　１９９６）　。我国有　６属约　２５种,均分布于长江以南各省区,主产云南及海南岛（徐廷志,１９８４）。其中,除使君子属（Ｑｕｉｓｑｕａｌｉｓ）仅有２种外,桃仁树属（Ｔｅｒｍｉｎａｌｉａ）和风车子属（Ｃｏｍｂｒｅｔｕｍ）是全科最大的两属,榆绿木属（Ａｎｏｇｅｉｓｓｕｓ）在我国只有一种,它是我国北热带季节性雨林中的建群树种之一（傅立国,１９９２）,萼翅藤…     

蓖麻蚕rDNA5‘—非转录间隔区的DNA序列及结构特征

我们测定了蓖麻蚕ｒＤＮＡ５‘－非转录间隔区ＳａｃⅡ－ＥｃｏＲＩ片段的ＤＮＡ序列,它的长度为１０２５ｂｐ,Ａ＋Ｔ含量大于７０％。本文报道该片段的序列特征,用计算机对其内所具的结构基序进行分析结果说明。其中含有多个与核骨架结合区有关的结构基序和酵母自主复制序列的核心序列。包括９个弯曲ＤＮＡ,１０个Ｔ盒,５个Ａ盒结构基序以及１３个拓扑异构酶的ＩＩ的识别位点的同源序列,３４个反向重复序列,３０多个ＡＴＴＡ     

核糖体DNA序列分析在昆虫系统学研究中的应用

随着分子生物学技术的迅速发展,DNA序列分析在昆虫系统学研究中的应用不断增多。本文系统阐述了核糖体DNA的结构、分类学意义、以及在昆虫不同类群不同阶元之间系统发育关系研究中的应用,概要介绍了序列分析方法,并对其应用前景进行了展望。     

蓝藻OscilatoriaceaerDNA16S-23S基因间隔区的序列分析及其分类学意义

采用末端终止法对蓝藻类颤藻科Ｏｓｃｉｌａｔｏｒｉａｓｐ．ｒＤＮＡ１６Ｓ－２３Ｓ基因间隔区进行了序列测定,获得了Ｏｓｃｉｌａｔｏｒｉａｓｐ．ｒＤＮＡ基因间隔区４２７个核苷酸,其中包含１个异亮氨酸ｔＲＮＡ基因（ｔＲＮＡＩｌｅ）。并通过计算机联网从国际分子生物学数据弹库中获取颤藻科其它种的ｒＤＮＡ基因间隔区序列,通过比较分析,从分子水平对颤藻科Ｏｓｃｉｌａｔｏｒｉａｃｅａｅ属间的某些分类学问题进行了讨论,并根据序列中核苷酸差异值探讨了颤藻科属间界定的分子标准。提出了ｒＤＮＡ基因间隔区是良好的分子标记,可用于“赤潮”或“水华”蓝藻专一性核酸分子探针的研制     

野生稻和栽培稻的随机多态DNA(RAPD)分析

应用 RAPD方法对药用野生稻、普通野生稻、粳稻和籼稻进行基因组多态性分析。 1 2个随机引物共扩增出 1 3 2条 RAPD带 ,片段大小在 3 0 0～ 3 5 0 0 bp之间 ,其中有 1 0 6条表现出多态性 ,占总扩增片段的86.4%。根据遗传距离分析 ,用 UPGMA法构建了聚类树状图 ,结果表明 ,普通野生稻的遗传特性比药用野生稻更接近于栽培稻。     

植物核基因组核糖体基因间隔区序列的结构特点及其在系统发育研究中的应用

目前,在植物系统发育研究中应用较多的核基因组的核糖体DNA基因间隔区序列主要有5S rDNA基因间隔区、内转录间隔区ITS和基因间间隔区IGS.虽然这些间隔区序列在长度、结构等方面各不相同,但都具有进化速率较快的特点,在植物属及属下分类水平的系统发育关系研究中非常有用.本文重点就核基因组的5S rDNA基因间隔区以及IGS在植物中的特点以及各自在植物系统发育研究中的应用进行了综述.     

蓝藻Oscillatoriaceae rDNA16S-23S基因间隔区的序列分析及其分类学意义

采用末端终止法对蓝藻类颤藻科Oscillatoria sp.rDNA 16S-23S基因间隔区进行了序列测定,获得了Oscillatoria sp.rDNA基因间隔区427个核苷酸,其中包含1个异亮氨酸tRNA基因(tRNAIle).并通过计算机联网从国际分子生物学数据弹库中获取颤藻科其它种的rDNA 基因间隔区序列,通过比较分析,从分子水平对颤藻科Oscillatoriaceae属间的某些分类学问题进行了讨论,并根据序列中核苷酸差异值探讨了颤藻科属间界定的分子标准.提出了rDNA 基因间隔区是良好的分子标记,可用于"赤潮"或"水华"蓝藻专一性核酸分子探针的研制.     

普通野生稻和亚洲栽培稻线粒体DNA的RFLP分析

通过７个探针、１７种内切酶探针组合对１１８份普通野生稻和７６份亚洲栽培稻的线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）ＲＦＬＰ分析表明,籼粳分化是亚洲栽培稻线粒体基因组分化的主流,７６个栽培稻中,３６个品种ｍｔＤＮＡ为籼型,４０个品种ｍｔＤＮＡ为粳型。普通野生稻ｍｔＤＮＡ以籼型为主（８６份）,粳型较少（７份）,１份类型难以确定,还有２４份没有籼粳分化。     

ITS1 Sequences of Nuclear Ribosomal DNA in Wild Rices and Cultivated Rices of China and Their Phylogenetic Implications

he first internal transcribed spacer (ITS1) of nuclear ribosomal DNA of three wild rice species and two subspecies of cultivated rice, which are distributed in China, was amplified using PCR technique and sequenced with automated fluorescent sequencing. The sequences of ITS1 ranged from 193 bp to 218 bp in size and G/C content varied from 69.3%to 72.7%. In pairwise comparison among the five taxa, sequence site divergence ranged from 1.5 % to 10.6%. Phylogenetic analysis of ITS1 sequences using Wagner parsimony generated a single well-resolved tree, which revealed that Oryza rufipogon was much more closely related to cultivated rice species than to the other two wild species. Oryza granulata was less closely related to either cultivated rice species or the other two wild species, and might be a unique and isolated taxon in the genus Oryza. The phylogenetic relationships of the three wild rice species and two cultivated rice subspecies inferred from ITS1 sequences is highly concordant with those based on the molecular evidence from isozyme, chloroplast DNA (cpDNA), mitochondrial DNA (mtDNA) and nuclear DNA (nDNA) of the genus Oryza.     

粒毛盘菌属种间关系的分子系统学初探*

粒毛盘菌属包括晶杯菌科中子囊盘表面具有毛状物,毛状物全表面具有颗粒状纹饰以及外囊盘被结构为矩胞组织的部分种类,种间形态解剖结构多样,研究采用ITS15.8S rDNAITS2序列分析的方法探讨该属种间的系统发育关系。在供试的粒毛盘菌15个分类单元中,14个以89%的支持强度值相聚在一起,其中Lachnum clandestinum与 L. fuscescens关系最近,其支持强度值为100%;其次为L. controversum 与L. spartinae,其支持强度值为97%;而姊妹群L. euterpes,L. pteridophyllum,L. singerianum和L. lushanense彼此关系较远,其支持强度值均小于50%;L. sclerotii位于系统发育树的最外侧,为供试15个分类单元中距离最远的一个,结果表明粒毛盘菌属可能是多起源的。     

金缕梅科银缕梅属与帕罗堤属的亲缘关系——核糖体DNA ITS序列证据

本文对金缕梅科弗特吉族(Molinadendron和Matudaea除外)的细胞核核糖体DNA ITS片段进行了序列分析,在此基础上对该族的演化关系、尤其是中国特有属银缕梅属的系统位置进行了最简约分支分析。基本结果如下：其一,蚊母族和狭义的弗特吉族均不形成自己的单系分支,因此,支持Endress的处理,即合并两族为广义的弗特吉族;其二,银缕梅属同帕罗堤属有着密切的亲缘关系,支持形态学和解剖学结论;其三,根据该片段核苷酸序列的演化速率推算出的银缕梅属和帕罗堤属间分化时间为晚中新世。此结论大致与化石记录相符。     

野生大豆与栽培大豆rDNA ITS1区的研究

采用ＰＣＲ 技术从野生大豆（Ｇｌｙｃｉｎｅ ｓｏｊａ）、半野生大豆（Ｇ．ｇｒａｃｉｌｌｉｓ）、多年生野生大豆（Ｇ．ｔｏｍｅｎｔｅｌｌａ、Ｇ．ｔａｂａｃｉｎａ）和栽培大豆（Ｇ．ｍ ａｘ）的两个品种ＵＮＩＯＮ、文丰７ 中扩增和克隆了ｒＤＮＡ第一转录间隔区（ＩＴＳ１）。其在Ｇ．ｍ ａｘ 基因组中的拷贝数约为２×１０３。序列分析表明Ｇ．ｓｏｊａ、Ｇ．ｇｒａｃｉｌｌｉｓ、Ｇ．ｍ ａｘ 中的Ｇ／Ｃ含量为６１．４０％ ,而Ｇ．ｔａｂａｃｉｎａ和Ｇ．ｔｏｍ ｅｎｔｅｌｌａ的Ｇ／Ｃ含量分别为５８．１１％ 和５９．０１％ ,与绿豆Ｇ／Ｃ含量（５９．８１％ ）相近。Ｇ．ｔａｂａｃｉｎａ的Ｇ／Ｃ含量是已知的植物中ＩＴＳ１ 最低的。最大同源性分析表明,大豆属植物ＩＴＳ１ 的同源程度很高,同其近缘属绿豆的同源性明显高于其它作物。同时分析了栽培、多年生和一年生野生大豆间的亲缘关系。另外还发现在已知的植物ＩＴＳ１ 序列中均含有ＧＡＣＣＣＧＣＧＡＡ 及ＧＣＧＣＣＡＡＧＧＡＡ 两个区段     

依据ITS rDNA序列探讨我国盾腹虫属种类的系统发育关系(英文)

盾腹吸虫为寄生扁形动物中一小的类群。我国已报道7种盾腹吸虫,其中5种隶属于盾腹虫属(Aspidogastridae,Aspidogastrinae)。研究测定了在我国采集到的4种盾腹虫属吸虫的核糖体DNA转录内间隔区(ITSrDNA)序列,并分别采用邻接法和最大似然法构建分子系统发育树。结果显示,这4种盾腹吸虫的ITS-1和ITS-2序列的长度分别在728—877bp和518—645bp之间,其G+C含量分别在50.1%—52.3%和49.2%—52.2%范围内。4种盾腹吸虫的种间遗传距离在0.2%—26.9%之间,其中重庆盾腹吸虫(Aspidogaster chongqingensis)和似螺盾腹吸虫(A.limacoides)间仅为0.2%。所构建的最大似然树和邻接树具有相同的拓扑结构,均支持重庆盾腹吸虫和似螺盾腹吸虫亲缘关系最近,它们与饭岛盾腹吸虫(A.ijimai)亲缘关系较近,而与位于系统树基部的贝居盾腹吸虫(A.conchicola)关系较远。此外,对我国盾腹属种类的宿主特异性进行了讨论。     

野生稻与栽培稻及种间杂种F1叶表面亚显微结构的研究

用扫描电镜对原产中国的３种野生稻、２个栽培稻品种及栽培稻与野生稻间的杂种Ｆ１,就气孔频度、气孔器乳突、大瘤状乳突及本栓细胞乳突等叶片表面亚显微结构作了比较观察研究。结果显示这些性状具有种的特性,发现种间杂种的亚星微性状与两个亲本 特性及亲缘关系远近有关。     

中国野生稻的种类、地理分布及其特征特性综述

野生稻在世界上主要分布于热带和亚热带。由于所处生态环境的复杂性 ,野生稻在其漫长的进化过程中 ,形成了极其丰富的遗传多样性 ,是宝贵的种质资源 ,是发展稻作育种的重要物质基础。中国南方地处热带、亚热带 ,气候炎热 ,夏日长暖 ,雨量充沛 ,十分适宜野生稻的生长与繁衍 ,野生稻分布很广 ,资源十分丰富。据调查 ,我国有 3种野生稻 ,即普通野生稻、药用野生稻和瘤粒野稻 (中国“疣粒野生稻”)。我国野生稻分布广泛 ,南自海南省三亚 ,北至江西省东乡 ;东自台湾省桃园 ,西至云南省盈江。纬度约跨 1 0度 ,经度约跨 2 3度。中国野生稻的特征特…     

两种疱脐衣的核rDNA ITS2序列变异及其系统学意义

本文从分子系统学角度为石耳科两个疑难种的分类处理提供了佐证。真菌DNA是从淡腹疱脐衣及露西疱脐衣不含藻细胞的亚茶渍型子囊盘中提取后,用聚合酶链式反应(PCR)技术对于核中核糖体脱氧核酸((rDNA)的转录间区2 (ITS2)片段进行了扩增,并进行了核苷酸序列测定。在分子水平与形态特征以及化学与分布学相结合中进行了比较系统学分析。     

PHYLOGENETIC SYSTEMATICS OF THE ULVACEAE (ULVALES,ULVOPHYCEAE) USING CHLOROPLAST AND NUCLEAR DNA SEQUENCES1

Systematic hypotheses for the Ulvaceae were tested using phylogenetic analysis of sequences for the gene encoding the large subunit of RUBISCO, small subunit rDNA and a combined data matrix. Representatives of eight putative ulvaceous genera and twelve additional taxa from the Ulvophyceae and Trebouxiophyceae were included in analyses using maximum parsimony and maximum likelihood criteria. Molecular data supported hypotheses for the Ulvaceae that are based on the early development of vegetative thalli and motile cell ultrastructure. Ulvaceae sensu Floyd and O'Kelly, including Percursaria Bory de Saint‐Vincent, Ulvaria Ruprecht and a complex of closely related species of Chloropelta Tanner, Enteromorpha Link and Ulva L. was supported; however, monophyly of Enteromorpha and Ulva was not supported. The Ulvales and Ulotrichales sensu Floyd and O'Kelly were monophyletic. Blidingia Kylin and Kornmannia Bliding were allied with the former and Capsosiphon Gobi with the latter, although relationships among these and other taxa in these orders remain uncertain. The Ulvales are characterized by an isomorphic life history pattern, gametangia and sporangia that are identical in structure and development, motile cells with bilobed terminal caps and proximal sheaths consisting of two equal subunits. Method of motile cell release and the gross morphology of vegetative thalli are not systematically reliable characters.     

BIOGEOGRAPHY OF CLADOPHOROPSIS MEMBRANACEA (CHLOROPHYTA) BASED ON COMPARISONS OF NUCLEAR rDNA ITS SEQUENCES1

Nucleotides were compared at 988 sites, spanning both internal transcribed spacers (ITS1 and ITS2) of the nuclear ribosomal DNA, among 17 isolates of the green alga Cladophoropsis membranacea (Hofman Bang ex C. Agardh) Boergesen and two isolates of Struvea anastomosans (Harvey) Piccone and Grunow. Collections were made from Bonaire, Curaçao, St. Croix, the Canary Islands, the Cape Verde Islands, Mauritania, Syria, the Red Sea, Okinawa, and Hawaii. Two nucleotide substitutions were found between the sequenced coding regions of C. membranacea and S. anastomosans. Of the 720 nucleotides compared in ITS1 and ITS2, an average of 6.7% sequence divergence was found within C. membranacea and 17.4% between C. membranacea and S. anastomosans. Sequences were analyzed using maximum parsimony. Phylogenetic hypotheses were compared with the biogeographic hypothesis of an east-west Tethyan vicariance. Results of the study allow the identification of widely dispersed biogeographic populations, the identification of an underlying Tethyan imprint, and support for the hypothesis that dispersal has occurred between the Caribbean and the tropical eastern Atlantic. These results demonstrate the usefulness of ITS sequences at the sub-specific level in C. membranacea.