基因芯片数据分析与处理

基因芯片技术在基因表达分析等应用过程中产生大量的数据,如何处理和分析这些数据并从中提取出有价值的生物学信息是一个极为重要的问题.其过程包括原始数据的获取及处理、标准化数据的统计学分析、以及数据的存储和交流等.     

PsV中和技术检测方法在HPV检测中的应用

目的:研究假病毒(pseudovirions,PsV)中和技术检测方法在人乳头瘤病毒(HPV)检测中的应用.方法:分别用基因芯片技术和PsV中和技术检测新疆伽师县夏普吐勒乡维族妇女血清HPV16感染率;数据用EpiData3.0录入和整理,运用SPSS13.0软件进行统计学处理和分析.结果:基因芯片技术检测HPV16感染率为6.1%,PsV中和技术检测HPV16感染率为7.0%,两种方法检测HPV16感染率差异无统计学意义(p>0.05).结论:PsV中和技术检测方法是一种方便,快捷的HPV抗体检测方法.     

基于Size结构的乳腺肿瘤患病率最优控制的分析研究

目的:研究乳腺肿瘤高危因素分析方法,建立基于Size结构的乳腺肿瘤患病率最优控制模型并进行探究,得出结论并进行验证。方法:利用Excel、MATLAB数据处理软件进行数据的初步整理、处理,再将处理过的数据带入具有Size结构模型中进行深度分析实现乳腺肿瘤的最优控制。结果:运行程序后,得到的数据在设定的可控范围内。结论:基于Size结构的乳腺肿瘤患病率最优控制模型确实可应用于控制乳腺癌患病率的模型。     

短花针茅荒漠草原不同放牧处理地上现存量的对比及拟合优化

为探讨放牧强度季节调控下荒漠草原地上现存量的变化趋势及放牧强度与季节的耦合作用对地上现存量影响,本研究整理2010—2014年9月蒙古高原短花针茅荒漠草原地上现存量观测数据,采用对比分析和回归建模对荒漠草原地上现存量进行了研究。结果表明:荒漠草原地上现存量在试验处理间和年度间均存在极显著性差异(P0.01),且放牧处理效应大于年度间水温变化引起的生物量变化。回归建模分析显示,通过6个试验处理可建立拟合率达到99%以上的通用模型,根据通用模型可以预测27种试验处理组合的地上现存量变化;模型同时显示,春季放牧强度增加可导致草地可持续利用能力下降,且前一季节放牧强度对后一季节放牧存在明显影响,不同放牧季存在影响结果的叠加作用,导致前期的影响作用在放牧季被放大,使得草地在重牧过程后的可恢复能力降低。     

介绍用于数理统计的ST-l软件

数理统计方法是分析统计资料、处理实验数据、从偶然现象中揭示必然规律的科学方法,由于统计处理时数据多、计算繁、容易出错,目前已广泛采用电子计算机来解决数理统计领域的各类问题。 中国科学院遗传研究所技术室最近推出的ST-1软件就是为提供常用数理统计方法的程序而设计的,这些程序涉及了数据整理,常用分布函数的数值计算,参数的区间估计,统计检验(u 检验、t 检验、x~2 检验、F检验)、方差分析、回归分析等数理统计方法的主要内     

浅谈高中生物学的探究性实验(2)

(续 2 0 0 3年第 38卷第 9期第 33页 )2 .4　分析数据 ,得出结论分析数据是指在实验操作完成后 ,对收集的实验信息进行整理和解读的过程 ,通过对数据的分析找出研究对象的发展趋势或不同事物之间的联系 ,思考实验数据揭示的事实或规律 ,确定实验数据是否支持原先的假设 ,运用证据和逻辑分析对提出的问题做出答案或解释 ,从而得出最后的实验结论。由此可见 ,结论就是对实验研究发现的总结。绘制图表是整理数据的常用方法。整理数据首先从实验研究主题涉及的概念开始 ,如果主题中有较多概念 ,可以绘制概念图来揭示相关概念之间的关系。比较不…     

浅谈在生物化学实验中培养学生的数据处理与分析能力

在生物化学实验中,教师应该重视培养学生的数据处理与分析能力。教师可以通过课堂讲解、课堂设问和实验设计等结合的方式,培养学生建立数据与单位的概念,指导学生掌握有效数字的计算,同时引导学生使用基本的软件工具分析处理数据,最终运用统计学的定量与分析得到可靠合理的实验结果。     

氯仿薰蒸仓虫的用药量及其对种子发芽率的试验

在植物检疫工作中,经常需要在实验室内处理少量感染害虫的邮寄植物种子。过去大都用溴甲烷、氰酸气、氯化苦、二硫化碳等熏蒸,这些药剂对熏蒸大量种子是方便的,但处理少量种子就不甚方便。因为以上几种药剂除对人有剧毒外,有的还有易燃的危险。为比,我们曾试验了其他几种药剂,其中以氯仿的效果较好。现将结果整理如下。 材料与方法 试验昆虫为米象、锯谷盗、杂拟谷盗、四纹豆象。试验种子为玉米、小麦、花生、眉豆、绿豆、甘蓝、大白菜、胡罗卜等,含水量在14％以下,熏蒸窒温度30—35℃,     

使用Matlab 7.0处理林木育种非平衡试验数据——以三阶巢式设计为例说明之

为了解决林木遗传育种中,平衡不平衡,规则不规则的试验数据的统计处理问题,笔者利用杉木三阶巢式设计的非平衡试验数据为研究对象,采用M语言,编写该试验数据处理程序.该试验有8个种源,每个种源6个家系,造林时每个家系40个样株,家系密集型设计.经研究发现,Matlab7.0处理平衡不平衡、规则不规则的试验数据方面效果极好,值得推广应用.     

田间试验数据的统计分析——试验数据的整理

根据一定试验设计进行田间试验,经过一定观察记载,就可取得一些数据。由于这些数据是对于有限样本的观察得到的,它们通常具有变异性、局部性和偶然性。也就是说,从表面上看这些原始数据是杂乱无章的,必须对它们加以适当整理分析,才能发现其内在的规律,以便能根据试验结果得出科学性结论。数据分组如果数据较为复杂,通常采用分组的方法研究事物的分布及总体结构,同时还能简化运算程序。数据类型不同,分组的方法也不同。易于     

茶树种子干热处理对幼苗生长的影响

为了探求促进茶籽萌发,缩短育苗时间及培育壮苗,提早成园。近年来研究指出,利用在播种前高温及干燥处理种子,对于提高种子的吸水力,促进萌发和生长效果明显。本试验是研究茶树种子干热处理对其萌发及生长的影响,试验结果整理如下。材料及方法试验用品种为园湄潭苔茶籽,经过筛     

棉花的春化阶段分析工作简报

棉花是喜温作物,通过春化阶段需要较高的温度。在高温中进行春化处理的技术仍存在若干问题,而且在文献中各方面所用的温度和天数,以及处理后的效果很不一致。我组在1953年曾经对棉花的春化阶段分析进行了一年的工作。目的是结合春化阶段分析来试验棉     

基于商业智能的医院决策支持系统的应用

商业智能是利用数据仓库、联机分析处理和数据挖掘等核心技术,将大量的存储数据进行提取、整理、分析,为决策者进行经营决策提供支持的技术。基于商业智能的医院决策支持系统是从不同的角度抽象出反映医院管理及医疗、教育、科研业务的各类指标,集成医院运行产生的宝贵数据,全面、系统、实时地复用各类业务数据,建立相关的知识模型和知识库,满足支持决策的信息需求,实现通过信息技术辅助决策的功能。     

全球标本数字化建设及共享发展趋势

标本数字化建设是生物多样性保护和利用的重要工作基础,通过标本数据的整合分析,在生物分类学、生态学、生物工程、生物保护、粮食安全、生物多样性评估、教学教育和人类社会活动等方面提供数据支撑。为了了解全球标本数字化建设工作的现状以及数据共享的策略与技术发展趋势,该文分别调查梳理了北美洲、南美洲、欧洲、非洲、亚洲和大洋洲地区的标本数字化和平台建设情况,对标本数据共享现状和趋势从数据使用协议、新技术新方法和公众科学等方面进行了对比和分析,并为中国国内的标本数字化工作提出了工作建议,包括:(1)加强标本数字化建设、管理和动态更新方面的协同机制建设,确保实物资源和数字化资源信息同步;(2)加强数据整理和发布,促进数据质量的提升,充分开放数据使用协议,减少数据使用的阻碍;(3)加强对新技术的学习和引入,特别是开源软件、机器学习和人工智能技术的应用,能够在标签快速识别、自动鉴定和属性数据提取等方面发挥作用;(4)加强区域和国际合作,推动数据的整合应用;(5)推动公众科学项目发展,促进野外采集、室内整理、在线纠错、数据产品研发等工作的开展。     

基于转录特征的水稻WRKY转录因子功能注释

转录水平的变化是转录因子功能发挥的重要体现形式,高通量测序技术的发展和应用揭示了丰富的转录数据,对转录数据的深度分析有助于基因的注释和功能研究。本文以水稻WRKY转录因子家族为对象,在总结WRKY基因功能的基础上,对生物和非生物胁迫、发育、营养和激素处理等不同生物学过程中的转录数据进行了系统的整理和挖掘,获得了不同反应中转录变化的特定WRKY基因清单,丰富了水稻WRKY转录因子家族成员的注释信息,以期这些信息为后续的功能研究提供有价值的参考。     

冀中低洼内涝地区小地老虎防治方法的初步探讨

小地老虎(Agrotis ypsilon Rottemberg),是冀中低洼内涝地区为害农作物的重要害虫。1957-1963年,我们在任丘县对此虫进行了糖液诱蛾与拌种防治试验,以及大面积试验和示范。现将部分结果,初步整理于后。 材料及处理方法     

介绍用于数理统计的ST-1软件

数理绕计方法是分析统计资料、处理实验数据、从 偶然现象中揭示必然规律的科学方法,由于统计处理 时数据多、计算繁、容易出错,目前巳广泛采用电子计 算机来解决数理统计领域的各类问题。 中国科学院遗传研究所技术室最近推出的ST-1 软件就是为提供常用数理统计方法的程序而设计的, 这些程序涉及了数据整理,常用分布函数的数值计算, 参数的区间估计,统计检验（“检验、,检验、x=检验、r 检验）、方差分析、回归分析等数理绕计方法的主要内 容,共计31个,全部采用BASIC语言编写。使用时只需 从软盘上调出所用程序,按照有关提示输人相应的数 据,即可得到处理结果。     

中国地区汉族人类血小板抗原基因多态性研究

为探讨中国汉族人群的人类血小板特异性抗原(human platelet antigens,HPA)的基因多态性特点并对南北方汉族人群进行比较,本研究合并了24个地区的28篇HPA基因多态性调查文献中HPA-1、HPA-2、HPA-3、HPA-4、HPA-5、HPA-6和HPA-15的基因分型数据,利用统计学方法及相关软件进行整理,并对整理后数据进行对比分析。结果显示HPA-1、HPA-2、HPA-3、HPA-4、HPA-5和HPA-6位点的a、b基因频率差距很大且bb基因型频率接近于0,而HPA-3和HPA-15位点的a、b基因频率差距不大。南北方汉族人群的比较中,HPA-1和HPA-5的基因分型有所差异,而HPA-2的基因型频数分布差异有统计学意义(p0.05)。此结果旨在获取人类血小板抗原基因多态性的特点并提供建立人类血小板抗原数据库的相关资料,对临床输血的指导具有重要意义。     

非医学生对结核病的防治认知调查——以莆田学院为例

目的:调查高校非医学生对结核病的防治认知情况,为今后展开大学生健康教育提供新的思路和方法。方法:采用整群抽样法,对莆田学院学生进行问卷调查。采用Epi-Data3.1双录入,创建数据库,用Excel2003和SPSS13.0对数据进行整理分析,采用χ2检验进行各率的统计学检验,P0.05可认为有统计学意义。结果:90.1%对结核病有较正确的认知。44.3%认为结核病患者积极接受正规治疗后可痊愈。61.6%认为学校应该加大对结核病的宣传防治。结论:非医学生结核病防治知识认知度较低,应开展多种形式的结核病相关健康教育,加强高校结核病防治的各项工作。     

中国半翅目昆虫多样性和地理分布数据集

全球生物多样性逐渐丧失已成为最严重的环境问题之一, 探究各地生物多样性资源及形成机制是生态学和生物地理学领域关注的重要科学问题。生物多样性数据的整合和共享可以为相关研究的开展提供科学依据。昆虫是地球上多样性最高的生物类群, 但是由于目前关于昆虫多样性数据的整理不足, 相关研究较为缺乏。为了促进昆虫类群的多样性数据整理和共享工作的发展, 本研究选取昆虫纲中重要且多样的半翅目作为对象, 通过广泛的数据检索和收集, 系统整理了截至2017年已发表的中国半翅目昆虫的多样性及地理分布信息。数据集中共收集了102科2,090属7,822种半翅目昆虫的分类信息及其39,298条地理分布记录。该数据集可以为今后开展生物多样性格局、生物区系演化和害虫防治等方面的研究工作提供帮助。