NAIP及其与某些神经系统疾病的关系

NLR家族（nucleotide—binding domain,leucine rich repeat containing family）是一个胞浆蛋白家族,参与对细胞内病原相关分子模式（pathogen-associated molecular patterns,PAMPs）的识别,这个家族的成员之一——NAIP在许多神经系统疾病中发挥重要作用,参与这些疾病的发生、发展的调控。本文将对人NAIP基因及其同源基因鼠Naip基因以及两者编码的蛋白在相关疾病当中的作用进行综述。     

500种野菜野外识别速查图鉴

<正>化学工业出版社出版本书收录了野外较常见的植物500种,主要包括有文献记载可食用的植物、据研究证实有毒的植物、常用于中药的植物等。每一种植物均配有突出植物识别特征的彩色图片,并对植物的识别特征、分布、药用、食用、毒性等信息进行了简要的文字描述。本书内容按照野外观察植物的感官认识的层层深入进行编排,首先按照植物的大小、直立或匍匐、草     

500种野菜野外识别速查图鉴

正化学工业出版社出版本书收录了野外较常见的植物500种,主要包括有文献记载可食用的植物、据研究证实有毒的植物、常用于中药的植物等。每一种植物均配有突出植物识别特征的彩色图片,并对植物的识别特征、分布、药用、食用、毒性等信息进行了简要的文字描述。本书内容按照野外观察植物的感官认识     

利用神经网络对蛋白质家族进行预测

提出了一种利用神经网络为蛋白质家族建立模型的方法,这一方法的理论出发点是利用神经网络从一组同家族蛋白质序列中识别出共同的特征模式,建好的模型可用于预测蛋白质家族,使用这一方法。所能识别的模式在长度、位点等方面都不受限制。而且建模及预测过程中输入神经网络的蛋白质序列不需要作预对齐。对Pfam蛋白质库中的二十个家族运用此方法,预测的平均正确率达到了95．5％。     

Toll样受体识别机制及其生物学意义

Toll样受体介导的信号转导通路在对抗外来病原体的天然免疫应答中起重要作用。Toll样受体是一个天然模板识别受体家族,能识别固有性模板(微生物和哺乳动物所共有的病原相联的分子模板PAMPs)。Toll样受体通过巨噬细胞和其他免疫细胞来识别,其中TLR4识别内毒素、TLR2识别肽聚糖、TLR9识别细菌DNA、TLR5识别鞭毛蛋白、TLR3识别双链RNA等。本探讨了多种Toll受体家族成员在动物体内识别机理及功能,概述了其应用研究进展。     

500种野菜野外识别速查图鉴

正化学工业出版社出版本书收录了野外较常见的植物种,主要包括有文献记载可食用的植物、据研究证实有毒的植物、常用于中药的植物等。每一种植物均配有突出植物识别特征的彩色图片,并对植物的识别特征、分布、药用、食用、毒性等信息进行了简要的文字描述。本书内容按照野外观察植物的感官认识的层层深入进行编排,首先按照植物的大小、直立或匍匐、草     

500种野菜野外识别速查图鉴

正化学工业出版社出版本书收录了野外较常见的植物500种,主要包括有文献记载可食用的植物、据研究证实有毒的植物、常用于中药的植物等。每一种植物均配有突出植物识别特征的彩色图片,并对植物的识别特征、分布、药用、食用、毒性等信息进行了简要的文字描述。本书内容按照野外观察植物的感官认识的层层深入进行编排,首先按照植物的大小、直立或匍匐、草     

拟南芥中MATE基因家族的研究进展

多药和有毒化合物排出家族（Multidrug and Toxic Compound Extrusion, MATE）是一个新的次级转运蛋白家族,此类转运蛋白对氨基葡糖、阳离子染料、多种抗生素和药物有转运作用。拟南芥中的MATE基因家族是一个多基因家族,大概由56个成员构成,本文综述了拟南芥中MATE家族基因的研究进展,包括3个方面：第一是拟南芥中MATE家族成员的构成及主要特征;第二描述了转运蛋白的主要功能;第三分析了其功能多样的大致原因。此外,还展望了此家族研究的一些前景。     

C型凝集素

C型凝集素（C-type lectin）代表一个识别碳水化合物配体依赖于钙离子（Ca2＋）参与的糖原结合蛋白家族,含有一个或多个一级结构和二级结构同源的碳水化合物识别结构域。随着研究的深入,越来越多的C型凝集素能够识别体内的非糖类的配体,包括蛋白质和脂类等。这些C型凝集素在维持机体稳态、免疫防御以及免疫监视等重要生理病理过程中发挥着重要作用。就C型凝集素的结构、分类和在免疫系统中的功能作一介绍。     

GH79家族糖苷水解酶分子进化关系和蛋白结构研究

GH79家族的糖苷水解酶在碳水化合物改性、细胞免疫识别和信号传导等方面具有广泛的生理活性和重要的应用前景。然而,目前GH79家族的多样性催化机理仍不清楚,识别底物的结构基础和分子机制尚不清晰。本文总结了近几年GH79家族的研究进展,系统分析了GH79家族酶的来源与分布,通过对酶的序列特征、分子进化关系、蛋白结构解析等方面进行深入阐述,旨在为后续的GH79家族的蛋白质工程和功能催化机制的解析奠定基础。     

“面子”的进化

<正>一张脸,能倾国倾城?一个表情,能倾覆一个王朝?人类面部特征的重要性,怎么夸张也不过分。在个体识别、配偶选择和社会关系中,面部特征和面部表情所起的作用是任何语言和别的行为都无法替代的。DNA分析、指纹识别、瞳孔识别、各种各样的证件,从技术上讲,这些手段可能更可靠,但在日常生活中,一张脸足以。各个领域的科学家正在从不同的角度研究人的面容识别问题,得出若干令人难以置信的结     

分化抑制蛋白N端保守域结构预测及其基因突变体的构建

目的：对分化抑制蛋白（Id）家族的N端序列进行保守性结构分析,并构建其基因突变体。方法：用ClustalX（1.81）软件对Id蛋白家族中的3个成员（Id1～Id3）的N端序列进行同源性分析,用Swiss-PdbViewer3.7（SP5）软件模拟高同源区域中关键性氨基酸突变前后的三维结构模型;用PCR方法将突变点引入Id序列,再通过重叠PCR方法扩增出全长编码序列,酶切与测序确证突变序列的准确性。结果：Id1～Id3蛋白的N端存在一个由11个氨基酸残基形成的高度保守的环-螺旋（Loop-Helix）结构,将其中最保守的丝氨酸与亮氨酸分别突变为甘氨酸与缬氨酸,将突变后的Id基因序列重组到pGEX原核表达载体中。结论：在Id1～Id3蛋白N端识别了一个保守的Loop-Helix结构,为深入研究其协同的功能特征提供了结构依据;突变其中的丝氨酸为研究Id蛋白潜在的磷酸化修饰及相应功能特征的改变奠定了基础。     

寻觅春花——城市角落的缤纷

<正>春光旖旎,百花争艳,人们习惯性地将目光聚集在迎春、山桃、樱花、牡丹或者紫藤上,却时常忽略了身边的角落——在墙角、草丛、路边、树下,有很多野花也用自己的方式迎接着春天。精致的野花,顽强的野花,有故事的野花,纵然它们并不在乎人类的欣赏与感叹,我们又何妨为它们稍作停留、俯下身去,倾听它们讲述另一种版本的春天故事呢?     

味觉受体第一家族与味觉识别

哺乳动物味觉受体第一家族(taste receptor family 1 member,T1R)的发现提供了甜味与鲜味(氨基酸味)味觉识别与味觉概念一个重要的新视野。T1R包括T1R1、T1R2、T1R3三个成员。这些受体属于G蛋白偶联受体家族第3亚型,其中T1R2 T1R3以异二聚体形式共表达并参与甜味识别,而T1R1 T1R3也以异二聚体形式共表达并参与鲜味(氨基酸味)识别。对T1R的系列研究证明了味细胞对甜味和鲜味(氨基酸味)的选择性识别及其外周味觉编码的逻辑性。     

k-gram方法识别microRNA前体

MicroRNAs(miRNAs)是动植物中较短的参与调控基因表达的功能性非编码RNA序列.第一个miRNA是通过实验手段发现的,然而通过实验手段识别miRNA在技术上仍然具有很大的挑战性和不完整性.因此,miRNA基因识别需要寻求计算方法来弥补实验方法的不足.提出了一个全新的miRNA前体的识别方法.在构造识别模型中,把初级序列和序列二级结构相结合,采用k-gram方法把序列信息映射到高维特征空间中,然后通过特征选取方法提取特征,并用这些特征为miRNA前体的识别构造了基于SVM的识别模型.同时,采用隐马尔可夫模型(HMM)的学习方法进行了比较.实验结果表明,该方法是有效的,可以达到较高的敏感性和特异性.     

《柳叶刀-神经病学》:一种基因变异可致帕金森氏症

<正>日本顺天堂大学日前发表一份公报称,一种基因变异可致人罹患遗传性帕金森氏症,这一发现将有助于研发治疗帕金森氏症的药物。顺天堂大学医学部的研究人员以一个遗传性帕金森氏症家族为对象,研究了尚未出现症状的5人和8名患者的基因,结果发现这些患者的CHCHD2基因出现变异。他们还在其他3个遗传性帕金森氏症家族中发现了同样的基因变异,因此断定它是致病的基因变异。     

NOD:一类新的固有免疫模式识别受体

哺乳动物主要通过Toll样受体(TLR)识别微生物。最近,发现一个新的蛋白质家族,核苷酸结合寡聚化结构域(NOD),参与胞内微生物的模式识别。NOD是一类位于胞质有典型的LRR-NBS结构的蛋白质家族,可以识别细菌细胞壁成分——细菌肽聚糖(peptidoglycan,PGN),活化NF-κB,参与固有免疫应答并诱导炎症反应和细胞凋亡。其中最有代表性的是NOD1和NOD2。最近的研究发现,NOD1和NOD2能识别细菌特殊结构。对该家族的研究将有助于防治胞内病原体感染、探索炎症性疾病的发病机制和治疗方案。     

k-gram方法识别microRNA前体

MicroRNAs (miRNAs) 是动植物中较短的参与调控基因表达的功能性非编码RNA序列. 第一个miRNA是通过实验手段发现的，然而通过实验手段识别miRNA在技术上仍然具有很大的挑战性和不完整性. 因此，miRNA基因识别需要寻求计算方法来弥补实验方法的不足. 提出了一个全新的miRNA前体的识别方法. 在构造识别模型中，把初级序列和序列二级结构相结合，采用k-gram方法把序列信息映射到高维特征空间中，然后通过特征选取方法提取特征，并用这些特征为miRNA前体的识别构造了基于SVM的识别模型. 同时，采用隐马尔可夫模型(HMM)的学习方法进行了比较. 实验结果表明，该方法是有效的，可以达到较高的敏感性和特异性.     

野花带对京郊农田地表蜘蛛多样性的影响

蜘蛛作为农田生态系统中重要的天敌类群,其分布易受田块尺度因素的影响。在农田边种植野花带可以增加景观美感,而对于蜘蛛多样性的影响在国内研究不足。在北京市选取8对农业管理和周边景观组成相似的农田,每对中一块田地毗邻野花带,另一块周围无开花植物生境。通过对农田中的蜘蛛进行监测,探讨野花带对蜘蛛多样性的影响。结果表明:毗邻野花带的农田中蜘蛛多样性高于无野花带的农田,且这种差异在农田内部更为明显;蜘蛛优势种群落分布与野花带性状无统计学显著性相关关系,却与野花带物种多样性和野花带宽度呈一定的正相关。研究表明,构建农田边界野花带有助于增加蜘蛛多样性,进而有助于虫害的生物控制。     

葡萄中蔗糖转运蛋白家族的序列分析及功能推测

以葡萄中的蔗糖转运蛋白为主要研究对象,结合了功能研究较为深入的拟南芥和水稻蔗糖转运蛋白家族序列,分析讨论了这些基因在启动子区域顺式作用元件的异同,以及这些差异可能对mRNA的转录带来的影响;同时,根据蔗糖转运蛋白氨基酸序列对其家族进行了分类,分析了不同亚类蔗糖转运蛋白基因结构的特点;最后还对蔗糖转运蛋白家族中氨基酸的保守性进行了分析。这些分析将为后续蔗糖转运蛋白功能基因组学的研究以及通过基因工程技术精确调节植物代谢提供一定的依据。