结构互补是分子间相互作用的本质：——兼论分子设计

结构互补是分子间相互作用的本质──兼论分子设计王克夷（中国科学院上海生物化学研究所,上海２０００３１）关键词互补结构,分子设计尽管生物科学的各种学科对分子或物质有不同的分类方法,但是,都对它们的结构和功能的关系这一共同问题感兴趣。最近几年,除了基因的...     

从胰岛素研究看等构相互作用在分子识别中的作用

蛋白质分子识别的结构基础是蛋白质的三维结构或折叠,其信息存在于氨基酸序列中。在比较功能已知或未知蛋白质的结构同源性时,常常是根据氨基酸残基的疏水性或亲水性。胰岛素定位突变的研究显示出了“等构相互作用”＾＃在考虑蛋白质同源性中的重要性。“等构相互作用”这一概念使得蛋白质结构与功能研究的视野更加开阔,同时在制药工业中开发多肽与蛋白质的类似物或模拟物有更多的选择。     

Rituximab与CD20分子的相互作用的分子机制和结构基础

Rituximab（中文名：美罗华）是罗氏公司生产的一种广泛应用于治疗非霍奇金氏淋巴瘤和一些其他淋巴瘤、以及自身免疫性疾病的单克隆抗体类药物。它是第一种通过美国FDA认证的单抗类抗肿瘤药物,每年仅在美国的销售额就超过20亿美元,其作用靶标为B细胞表面抗原分子CD20。     

生物大分子溶液三维结构及分子间相互作用的波谱研究

生物大分子溶液三维结构及分子间相互作用的波谱研究吴厚铭（中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室２０００３２）生物活性分子的溶液空间结构及分子间作用（如蛋白质与核酸,信息分子,各种调节剂,拮抗剂,以及核酸与药物分子等相互作用）的研究是发...     

手性环方铂络合物与DNA相互作用中的分子识别

用生物微量热技术及ＤＮＡＴｍ测量研究了手性不同的三种环方铂络合物与小牛胸腺ＤＮＡ（２００ｂｐ）作用中的特异性,发现Ｒ,Ｒ构型的与ＤＮＡ作用最强,这与癌细胞的体外筛选结果相一致．而且通过ＨＰＬＣ及１３Ｃ－ＮＭＲ研究为环方铂络合物与ＤＮＡ作用的分子机理分析找到了直接的证据．     

筛分子的细微结构和发生

在从水生向陆生发展的历程中,植物面临的最大威胁是干旱。要解决这个生理生态的矛盾,只能在组织结构上进行调整和分化,这就是高等植物输导组织的出现和逐步完善的对立统一的运动过程。输导组织由木质部和韧皮部组成,它们分别是由多种形态和功能的细胞(群)构成,都是复合组织。在木质部中运输无机液流的主要是管胞和导管,统称为管状分子。在韧皮部中运输有机液流的主要是筛胞和筛管,统称为筛分子。     

木聚糖酶与XIP型木聚糖酶抑制蛋白相互作用分子机制的研究进展

Xylanase inhibitor protein (XIP)型木聚糖酶抑制蛋白对大部分GH10、GH11家族的真菌木聚糖酶具有抑制作用,但是却不能抑制细菌来源和植物自身所产生的木聚糖酶。XIP型木聚糖酶抑制蛋白对木聚糖酶的抑制作用主要是通过模拟底物接触酶的活性位点,迅速阻塞底物进入活性位点区域的通道。然而,在对XIP型木聚糖酶抑制蛋白具有抗性的GH10和GH11木聚糖酶晶体结构中,连接二级结构的Loop构象严重阻碍了XIP型木聚糖酶抑制蛋白的抑制功能。与对XIP型木聚糖酶抑制蛋白敏感的木聚糖酶相比,氨基酸残基的插入突变导致抗性木聚糖酶的Loop具有明显的凸出构象;而在GH11家族抗性木聚糖酶中,"拇指"结构中部分氨基酸的替换致使XIP型木聚糖酶抑制蛋白与"拇指"结构无法形成稳固的氢键和疏水建,从而削弱XIP的抑制作用。     

分子伴侣结构与功能的研究进展

分子伴侣是细胞内一类能够协助其他多肽进行正常折叠、组装、转运、降解的蛋白,并在 DNA的复制、转录,细胞骨架功能,细胞内的信号转导等广泛的领域,都发挥着重要的生理作用,其结构与功能异常会导致多种相关的疾病。简要综述了分子伴侣结构与功能方面的研究进展。     

植物分子生态学进展(Ⅰ)——遗传结构和杂交(英)

从物种遗传结构和杂交的角度介绍了当前植物分子生态学研究的新进展。对于物种遗传结构,文章分析了物种生物学特性、生态因子对它的影响,强调了种群不同世代遗传结构研究的重要性。而在杂交研究领域,文章揭示了分子生物学手段有着比传统形态分析方法更多的优越性。     

杀伤细胞抑制性受体P58分子的结构与功能

P58分子是存在于自然杀伤细胞（NK）和部分T细胞的跨膜受体,属免疫球蛋白（Ig）样杀伤细胞抑制性受体（KIR）家族成员,具有复杂的结构多态性和精细的配体特异性。P58的配体为靶细胞膜上的HLA－C分子,两者结合后启动P58细胞内段的免疫抑制基序（ITIM）中的酷氨酸磷酸化,磷酸化的ITIM可与激活信号传导所必须的含SH2结构的磷酸酶偶联,从而抑制免疫激活信号的细胞内传导,抑制杀伤细胞对靶细胞的杀伤活性。P58介导信号是杀伤细胞区分“异己”和外周免疫耐受形成的重要机制。与造血干细胞移植后的移植物抗宿主病（GVHD）密切相关。     

利用荧光寿命变化定量分子内和分子间相互作用的方法

荧光寿命是指荧光分子在回到基态前在激发态停留的平均时间.本文发展了基于荧光寿命测量来定量分子内和分子间相互作用的方法:通过G碱基猝灭对于荧光寿命的影响定量DNA二级结构的形成;通过荧光共振能量传递(FRET)中荧光寿命的变化来定量分子间的相互作用.第一种方法巧妙利用了G碱基会猝灭临近的染料分子的性质,结合荧光寿命的变化...     

染色体末端微小结构异常的分子细胞遗传检测

为检出易于被忽略的染色体末端微小结构异常,为生育提供指导,选取特异性7号全染色体探针,X染色体长臂探针和7q亚端粒（7q36→qter)探针,用荧光原位杂交（fluorescence in situ hybridzation,FISH)结合G显带技术分析2个病例,其中病例1有不良妊娠史并疑有末端微小易位,病例2在G显带水平已发现为X和7号染色体易位的卵巢早衰患者,结果表明,FISH确诊病例1为染色体末端的隐匿易位,病例2的易位断点得到精确定位,它不在7q36而在7q末端。应用特异性染色体探针及亚端粒探针,通过FISH技术可以确诊染色体末端区域的微小结构异常,在临床遗传学中有广泛的应用,是遗传咨询和生育指导的有效工具之一。     

植物管状分子三维重建的树脂复型法

介绍了用于观察植物管状分子内部三维结构的树脂复型法及其具体的操作步骤和适用范围     

RNA的二级结构在动物分子系统学研究中的应用

作为一类重要的信息和功能分子,RNA在分子系统学研究中有着特殊的重要作用。RNA除了其一级结构以外,其二级结构亦可用于同源性比较。由于高级结构与功能的关系更为密切,比较的结果可以揭示一些在一级结构比较中难以发现的现象。     

从超氧化物歧化酶的分布和结构看其分子进化

超氧化物歧化酶(SOD)是一种催化超氧化物阴离子自由基发生歧化反应, 生成氧和过氧化氢的金属酶. 按其结合的金属离子, 区分为Fe-SOD, Mn-SOD和CuZn-SOD三种. Fe-SOD主要存在于原核细胞中;Mn-SOD在原核和真核细胞中都存在;CuZn-SOD主要存在于真核细胞中. Fe, Mn-SOD的一级结构, 空间结构及其性质很相似, 来自一个共同的祖先; CuZn-SOD的结构与前两者相差较大, 是在以后的发展中单独进化的.     

神经细胞死亡的细胞和分子机制

神经细胞死亡的细胞和分子机制朱国璋,张永莲,龚岳亭（中国科学院上海生物化学研究所,上海２０００３１）关键词神经细胞死亡,细胞和分子机制无论是在脊椎动物或无脊椎动物的神经系统发育和神经网络构建过程中,在外周神经和中枢神经细胞增殖、分化、成熟的同时,伴随...     

蛋白质-蛋白质分子对接方法中分子柔性处理与近天然结构筛选的研究

蛋白质-蛋白质分子对接方法是研究蛋白质分子间相互作用与识别的重要理论方法。该方法主要涉及复合物结合模式的构象搜索和近天然结构的筛选两个问题。在构象搜索中,分子柔性的处理是重点也是难点,围绕这一问题,近年来提出了许多新的方法。针对近天然结构的筛选问题,目前主要采用三种解决策略:结合位点信息的利用、相似结构的聚类和打分函数对结构的评价。本文围绕以上问题,就国内外研究进展和本研究小组的工作作详细的综述,并对进一步的研究方向进行了展望。     

基于CRISPR/Cas的分子诊断传感器在非核酸分子诊断中的应用

CRISPR/Cas不仅是一种重要的基因编辑工具,而且还是一种有效的分子诊断工具。目前基于CRISPR/Cas建立了一系列的分子诊断传感器系统,广泛应用于核酸、非核酸等检测过程中。与应用较广泛的核酸分子诊断传感器系统相比,基于CRISPR/Cas的非核酸检测系统目前尚未见系统性综述,因此本文围绕基于CRISPR/Cas12和CRISPR/Cas13建立的两大类非核酸分子传感器诊断系统的基本特征、工作流程及其检测原理等进行了全面综述,期望能为CRISPR/Cas分子诊断系统在体外诊断中的应用提供依据。     

核磁共振波谱法在蛋白质三维结构解析中的应用

蛋白质特定的三维结构与其生物功能密切相关,因此,研究蛋白质的三维结构有助于揭示其生物功能机制。将核磁共振（NMR）波谱法应用于研究溶液状态下蛋白质的三维结构,能够更加准确地揭示蛋白质结构与生物功能之间的关系。本文综述了NMR解析蛋白质三维结构的理论和技术方法,以及NMR结合其他生物物理手段,并辅以分子建模计算法研究蛋白质三维结构的研究进展和最新方法,为精准解析蛋白质的三维结构提供思路及策略。