大肠埃希菌蛋白指纹图谱的建立

目的建立大肠埃希菌（Escherichia coli,E．coli）蛋白指纹图谱,为Ecoli感染快速诊断奠定基础。方法收集临床分离E.coli88株,提取细菌DNA,PCR检测Ecoli 16S rRNA。蛋白提取液提取细菌蛋白,干化学法测蛋白浓度,应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）检测Ecoli蛋白,采用Ciphergen Pro-teinchip软件自动采集数据。重复测定20次Ecoli混合标本,评价SELDI检测Ecoli蛋白分子量的重复性。结果E．coil标准菌株ATCC 25922和临床分离株均可检出16S rRNA。AU芯片能捕获近30个E．coli蛋白峰,其中19个蛋白峰构成E．coli特征性蛋白指纹图谱,各蛋白峰在临床分离E．coli间分子量变异系数≤0．2％。SELDI重复检测20次E．coli混合标本显示同一蛋白峰的分子量变异系数≤0．05％。结论E．coli在分子量3～20kD范围内具有特征性蛋白指纹图谱,为快速诊断E.coli感染提供了新思路。     

临床常见葡萄球菌蛋白指纹图谱的建立

目的 建立临床常见三种葡萄球菌的蛋白指纹图谱,为其快速诊断奠定基础.方法 收集临床常见葡萄球菌包括金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌及溶血性葡萄球菌,利用16S rDNA测序技术对其进行鉴定;表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)技术检测其蛋白表达,采用Ciphergen Protein chip软件自动采集数据.评价该检测方法的重复性及细菌蛋白表达的稳定性.结果 在分子量3000 ～20000 Da范围内,3种葡萄球菌有各自特异的蛋白指纹图谱;SELDI-TOF MS检测细菌蛋白的孔间重复性和芯片间重复性好,同一株细菌4次重复的蛋白指纹图谱相似;同种细菌不同株之间蛋白指纹图谱表达稳定,共有蛋白峰分子量变异系数≤0.5％.结论 在分子量3000 ～20000 Da范围内,各细菌蛋白指纹图谱差异明显,为细菌的快速鉴定提供了新方法.     

SELDI-TOF-MS筛选慢性阻塞性肺疾病血清标志蛋白的初步研究

目的:利用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选慢性阻塞性肺疾病(COPD)血清特异标志物。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测30例COPD稳定期患者和30例健康对照者血清蛋白指纹图谱,采用Biomarker pattern软件进行分析,建立COPD的诊断模型。结果:COPD患者血清蛋白图谱与对照组相比,在相对分子质量2000-15 000范围内共检测到75个蛋白峰,发现19个有统计学差异的蛋白峰(P0.05)。通过对COPD组与对照组间的数据作进一步分析,经BPS软件分析,建立质荷比(M/Z)3 167、4 645的差异蛋白组成的诊断模型,其诊断敏感度为96.67%,特异度为96.67%。结论:SELDI-TOF-MS技术是一种快速、简单易行、用量少和高通量的分析方法。能直接筛选出COPD血清中特异表达标志物,用特异表达标志物建立的诊断模型能有效区分COPD患者与健康对照者,有望成为COPD诊断的辅助指标。     

血清蛋白质指纹图谱模型在子宫内膜异位症诊断中的应用

用表面加强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)和蛋白质芯片检测子宫内膜异位症(endometriosis,EM)患者血清蛋白质指纹图谱,探讨诊断模型在EM诊断中的临床应用价值。用SELDI-TOF-MS技术和H4蛋白质芯片检测16例EM和16例正常女性的血清蛋白质指纹图谱,并建立诊断模型。然后,对16名健康人和16例EM患者样本进行盲法测试验证该模型。筛选出4个有明显表达差异的蛋白质,其质荷比(m/z)分别为8141、6096、5894、3269。建立的诊断模型对EM检测的灵敏度为87.5%(14/16),特异性为93.75%(15/16),总准确率为90.625%(29/32)。SELDI-TOF-MS对小样本的EM诊断具有较高的敏感性和特异性,在EM的诊断及标志物筛选等方面具有较好的诊断价值。     

分枝杆菌特征性蛋白的筛选

目的研究分枝杆菌蛋白表达,筛选分枝杆菌特征性蛋白,为分枝杆菌的快速鉴定奠定基础。方法选取分枝杆菌标准菌株,提取细菌蛋白,干化学法测蛋白浓度,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-Ms）检测分枝杆菌蛋白表达,和非分枝杆菌蛋白指纹图谱比较,筛选分枝杆菌特征性蛋白。重复测定20次分枝杆菌蛋白标本,评价SELDI检测分枝杆菌蛋白分子量的重复性。结果耻垢分枝杆菌ATCC 14468有约20个蛋白峰,结核分枝杆菌ATCC 25177、土地分枝杆菌ATCC 15755、胞内分枝杆菌ATCC 13950、耻垢分枝杆菌ATCC 607有近40个蛋白峰。与非分枝杆菌蛋白指纹图谱相比,4个蛋白峰为分枝杆菌所特有。SELDI重复检测20次分枝杆菌蛋白标本显示同一蛋白峰的分子量变异系数≤0．05％。结论分枝杆菌有其特征性蛋白峰,可能有助于分枝杆菌的快速鉴定。     

微重力环境对大鼠血浆蛋白质谱的影响

目的:探讨模拟失重环境下大鼠血浆蛋白质组变化特征.方法:健康成年雄性 Wistar 大鼠88只,按模拟失重时相随机分为11组,分别为6 h、12 h、1 d、2 d、3 d、5 d、1周、2周、3周、4周及0 h 组(对照组).采用尾悬吊法建立模拟失重动物模型,实验结束时取动物静脉血,利用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及 MB-WCX 磁珠检测大鼠静脉血浆蛋白质谱,应用 Ciphergen Protein Chip Software 3.2.0和 Biomarker Wizard 3.1.0软件分析数据.结果:发现18个重力敏感蛋白,其中在模拟失重早期,相对分子质量较小的6个蛋白的表达呈上调趋势,而相对分子质量较大的12个蛋白的表达则逐渐下调;在模拟失重后期(悬尾2~3周后),上述蛋白的表达均呈回归趋势.结论:模拟失重环境对大鼠静脉血浆蛋白质谱产生明显影响,研究重力敏感蛋白对进一步揭示失重对机体的影响及机制具有重要意义,并对医监医保可能有一定的价值.     

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术用于常见益生菌鉴定的初步研究

目的建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MADLI-TOF MS)技术鉴定常见益生菌的实验方法并对MADLI-TOF MS技术的适用性进行初步评价。方法对MADLI-TOF MS技术鉴定常见益生菌过程中各影响因素进行考察,筛选出最佳的实验条件。利用19株供试菌株所得的蛋白指纹图谱对MADLI-TOF MS技术的适用性进行研究。结果建立了MADLI-TOF MS技术鉴定常见益生菌的最佳实验方法。初步证明MADLI-TOF MS技术具备在属、种、亚种以及菌株水平上鉴定常见益生菌的能力。结论建立的实验方法稳定性高、重复性好,可以作为MADLI-TOF MS技术鉴定常见益生菌的参考方法。MADLI-TOF MS技术可以作为常见益生菌鉴定的方法之一。     

应用基质辅助激光电离飞行时间质谱快速鉴定临床酵母菌

目的研究基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight MassSpectrometry,MALDI-TOF-MS)用于快速检测鉴定临床分离的酵母菌的可行性。方法应用Bruker MALDI-TOF-MS和VITEK 2-compact系统分别鉴定150株临床分离的酵母菌,结果不一致的菌株通过基因序列测定来鉴定。结果 MALDI-TOF-MS快速准确鉴定出了150株临床酵母菌,鉴定符合率在属水平上为100%,种水平上为94%。结论基于MALDI-TOF-MS鉴定方法具有很好的可重复性和准确性,并且其检测成本较低,实验准备时间很短,MALDI-TOF-MS可以用于临床分离的酵母菌的快速鉴定。     

中国玉米新品种标准DNA指纹库构建研究的几点思考

概述了中国玉米新品种DNA指纹库构建研究中的五个主要问题,即选用哪些品种材料、选用什么标记方法、SSR标记存在哪些问题、选用哪些SSR引物及如何提高建库效率等,并提出了相应的解决方案,对其应用前景及主要应用领域进行了探讨.     

真姬菇在高温胁迫下的差异表达蛋白分析

采用双向电泳分析Tris-饱和酚法获得的真姬菇菌丝体全蛋白,利用PDQuest8.0软件分析双向电泳图谱,比较最适温度(25℃)和高温胁迫条件下(42℃)真姬菇菌丝体蛋白的表达差异,筛选出与高温胁迫相关的蛋白,并对获得的差异蛋白进行基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定。结果显示,共鉴定7个蛋白点中,Spa2同源结构域的表达量下调,DEHA2G15532p、肽酶M76家族、HSP70、SNF2家族的DNA修复蛋白、细胞色素p450及AM域家族和锌指蛋白的混合物的表达量上调。这些蛋白参与了信号转导、蛋白处理、DNA修复等多种抗逆反应生理过程。     

血培养标本中病原菌的分布特征、耐药性变迁和耐药基因分型

目的 分析嘉兴市中医医院血培养标本中病原菌的分布特征、耐药性变迁和耐药基因分型。方法 将本院2013年1月至2016年12月送检的血培养标本进行培养、转种、分离鉴定和药敏试验,采用聚合酶链反应（PCR）技术进行产超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）革兰阴性菌和革兰阳性菌的耐药基因检测,并对阳性菌株、科室分布、耐药性等相关数据进行分析。结果 2013年1月至2016年12月共送检血培养标本27 003份,共分离出病原菌（剔除重复菌株）978株,阳性率为3.62%,2015‒2016年阳性率显著低于2013‒2014年,差异有统计学意义（P<0.01）。血培养阳性株数前三位为ICU、儿科和肾内科,2015‒2016年与2013‒2014年相比,ICU的阳性株数构成比显著下降,儿科、呼吸内科和其他科室显著上升,差异有统计学意义（P<0.01）。血培养致病菌检出率最高的为大肠埃希菌,占18.51%,其次为表皮葡萄球菌,占10.53%,不可忽视的是真菌,占4.91%。2015‒2016年与2013‒2014年相比,金黄色葡萄球菌检出率显著上升,粪肠球菌和近平滑假丝酵母菌的检出率显著下降,差异有统计学意义（P<0.05）。血培养分离的大肠埃希菌对氨苄西林的耐药率最高,肺炎克雷伯菌对呋喃妥因的耐药率最高。2015‒2016年与2013‒2014年相比,大肠埃希菌对氨苄西林/舒巴坦和庆大霉素的耐药率显著下降（P<0.01）,肺炎克雷伯菌对庆大霉素的耐药率显著上升（P<0.01）。分离的表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌对青霉素的耐药率最高,2015‒2016年与2013‒2014年相比,表皮葡萄球菌对红霉素和氯洁霉素的耐药率显著下降（P<0.01）,金黄色葡萄球菌对环丙沙星和左氧氟沙星的耐药率显著下降（P<0.01）。大肠埃希菌ESBLs（+）菌株对氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑啉等的耐药率以及所有基因型表达率均显著高于ESBLs（‒）菌株（P<0.05或P<0.01）;肺炎克雷伯菌ESBLs（+）菌株对头孢唑啉、头孢曲松、庆大霉素等的耐药率以及TEM、SHV、CTX-MⅡ基因型表达率均显著高于ESBLs（‒）菌株（P<0.05或P<0.01）。表皮葡萄球菌检出mecA基因（+）72株,金黄色葡萄球菌检出mecA基因（+）53株。屎肠球菌和粪肠球菌分离株中,未发现有vanA（+）、vanB（+）和vanM（+）万古霉素耐药株。结论 了解本院血培养致病菌整体变化趋势、病区分布特点及耐药性变迁和耐药基因分型,对临床合理使用抗生素和院内感染的控制有重要意义。     

Fingerprint of Hedyotis diffusa Willd. by HPLC-MS

A HPLC-MS fingerprint method has been developed based on the consistent chromatographic features of the major chemical constituents among 10 batches of Hedyotis diffusa Willd. Chromatographic separation was conducted on a Hypersil-Keystone Hypurity C(18) column using methanol:water:acetic acid as the mobile phase. Major compounds, including oleanolic acid, ursolic acid and ferulic acid, were analysed by HPLC-MS. Their analysis was ascertained by comparison with data derived from the standard compounds. The HPLC-MS fingerprint was successfully applied to analyse and differentiate samples from different geographical origins, or processing methods. H. diffusa was well distinguished from Hedyotis chrysotricha by HPLC-MS. Therefore the establishment of fingerprint of H. diffusa is critical in assessing and controlling its overall quality.     

替考拉宁在感染的血液病患者中血药浓度的监测与应用价值分析

目的:探讨替考拉宁在感染的血液病患者中血药浓度的监测与应用价值.方法:回顾分析2017年12月-2019年12月来我院治疗的42例革兰氏阳性球菌引起感染的血液病患者临床资料,按照临床替考拉宁的给药剂量分A组和B组,每组21例.利用高效液相色谱法(HPLC)检测患者第5天用药前30 min的血药浓度,利用酶联免疫荧光法检...     

不同起始剂量替考拉宁对革兰阳性菌感染重症肺炎患者的效果观察

目的 探讨不同起始负荷剂量替考拉宁治疗革兰阳性菌感染重症肺炎患者的临床效果。方法 选取2016年1月至2017年6月入住我院ICU的重症肺炎患者80例作为研究对象,随机分为观察组与对照组,两组患者均采用替考拉宁进行治疗,观察组起始剂量为800 mg,每天2次,对照组起始剂量为400 mg,每天2次,比较两组患者的炎症指标水平、临床疗效、细菌清除率以及不良反应发生情况。结果 80例重症肺炎患者共分离出革兰阳性菌86株,构成比位居前三位的分别是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（43.02%）、凝固酶阴性葡萄球菌（26.74%）、肠球菌属（17.44%）。治疗前,两组的WBC、CRP、PCT水平差异均无统计学意义（Ps>0.05）;治疗后,两组的WBC、CRP、PCT水平均降低,且观察组各指标水平低于对照组,差异有统计学意义（Ps0.05）。结论 800 mg起始负荷剂量替考拉宁治疗革兰阳性菌感染重症肺炎的临床疗效较好,细菌清除率更高,且不增加不良反应的发生。     

魔芋高效液相指纹图谱的建立方法研究

利用高效液相色谱建立了以魔芋叶片中水溶性氨基酸为标识的指纹图谱分析方法。分析结果表明:同一品种不同部位的魔芋叶片具有相似的指纹图谱;同一品种、不同育龄的叶片及不同品种相应部位叶片的指纹图谱不同。为此,采用该指纹图谱库分析方法,可以鉴别不同品种、育龄的魔芋资源,为魔芋的新品种选育提供依据。     

Organic solvent adaptation of Gram positive bacteria: applications and biotechnological potentials

Organic-solvent-tolerant bacteria are considered extremophiles with different tolerance levels that change among species and strains, but also depend on the inherent toxicity of the solvent. Extensive studies to understand the mechanisms of organic solvent tolerance have been done in Gram-negative bacteria. On the contrary, the information on the solvent tolerance mechanisms in Gram-positive bacteria remains scarce. Possible shared mechanisms among Gram-(−) and Gram-(+) microorganisms include: energy-dependent active efflux pumps that export toxic organic solvents to the external medium; cis-to-trans isomerization of unsaturated membrane fatty acids and modifications in the membrane phospholipid headgroups; formation of vesicles loaded with toxic compounds; and changes in the biosynthesis rate of phospholipids to accelerate repair processes. However, additional physiological responses of Gram-(+) bacteria to organic solvents seem to be specific. The aim of the present work is to review the state of the art of responsible mechanisms for organic solvent tolerance in Gram-positive bacteria, and their industrial and environmental biotechnology potential.     

mCIM试验检测临床产碳青霉烯酶革兰阴性杆菌的应用价值

目的评估改良碳青霉烯灭活试验(mCIM)在检测临床产碳青霉烯酶革兰阴性杆菌中的应用价值。方法采用mCIM、改良Hodge(MHT)及Carba NP试验分别检测106株碳青霉烯酶基因阳性的革兰阴性杆菌(36株肠杆菌科细菌、26株铜绿假单胞菌及44株鲍曼不动杆菌),并比较差异。同时,收集湘雅医院2016年1月-12月临床分离的非重复性耐碳青霉烯类革兰阴性杆菌106株,同期随机选取100株分离的碳青霉烯类敏感菌株作为对照组,mCIM试验检测碳青霉烯酶,PCR检测碳青霉烯酶基因,分析其敏感性及特异性。结果 (1)106株碳青霉烯酶基因阳性菌株,mCIM试验:肠杆菌科细菌的敏感性、特异性为88.9%(32/36),铜绿假单胞菌均为阴性。MHT试验:肠杆菌科细菌的敏感性、特异性为77.8%(28/36),铜绿假单胞菌的敏感性、特异性为69.2%(18/26)。Carba NP试验:肠杆菌科细菌的敏感性、特异性为97.2%(35/36),铜绿假单胞菌的敏感性、特异性为57.7%(15/26)。鲍曼不动杆菌3种方法均为阴性。肠杆菌科细菌中,MHT与Carba NP试验差异有统计学意义(χ~2=6.222,P=0.028),MHT与mCIM试验差异无统计学意义(χ~2=1.600,P=0.343),Carba NP与mCIM试验差异无统计学意义(χ~2=1.934,P=0.357);铜绿假单胞菌中,MHT与Carba NP试验阳性,二者差异无统计学意义(χ~2=0.746,P=0.565)。(2)144株临床分离肺炎克雷伯菌(碳青霉烯类耐药及敏感菌株分别为44株、100株),采用美罗培南和亚胺培南分别做mCIM试验,其敏感性和特异性均为100%,且与PCR的结果一致。结论 mCIM试验在肠杆菌科细菌中敏感性高、特异性强,操作简单,结果易于判断,具有良好的临床应用价值。     

宁夏水稻品种微卫星标记数据库的建立

本研究以47份经甄别鉴定的宁夏水稻品种(系)为试验材料,筛选出28对较均匀分布于12条染色体、条带清晰稳定、多态性丰富的SSR标记构建了宁夏水稻微卫星标记数据库。共检测到144个等位基因,标记间差异性位点数3~10个,平均5.14个;平均Nei's遗传多样性指数为0.6187。28个位点上参试材料间均有差异。只在1个位点上存在差异的是宁粳28号和宁粳23号,宁粳23和宁粳35号;其余品种差异性位点均在2个或2个以上,占参试材料的93.6%。28对引物中筛选出10对核心引物,各材料间至少有1对引物存在差异,能够把参试品种(系)一一区分开来。利用这10对引物,在相同的迁移位置上以1、0标记扩增片段的有无,构建了宁夏水稻DNA指纹图谱。