湖南等三地区东方田鼠遗传特性的分析比较

用染色体G带核型分析、生化位点、随机扩增多态性DNA(RAPD)标记等方法,对湖南洞庭湖湖滨、宁夏青铜峡市农田和黑龙江伊春市金山屯草甸3个地区的东方田鼠遗传特性进行了分析。结果表明,湖南和宁夏地区东方田鼠染色体数均为2N＝52,黑龙江东方田鼠染色体数则为2N＝42;生化位点结果显示3个地区的东方田鼠均呈遗传非均一性;湖南、宁夏和黑龙江鼠的个体间RAPD遗传距离分别为0．244（0．143—0．353)、0．226(0．161—0．294)、0．541(0.357—0．692)。湖南和宁夏两地区鼠种群间的遗传距离为0．367,湖南和宁夏鼠杂交一代与其亲代的RAPD遗传距离在0．310以下;但黑龙江鼠与湖南和宁夏鼠种群问的遗传距离分别为0．619和0．633。总的表明,3个地区的东方田鼠均呈遗传非均一性,但湖南与宁夏鼠在染色体、生化位点和RAPD标记等方面都具有相似性,并可杂交,而黑龙江鼠与其它两地的鼠不能杂交,且黑龙江鼠在遗传特性方面与前二地鼠有很大差异,因而后的“种”级分类地位值得进一步研究。     

两个不同地区东方田鼠杂交子代RAPD标记分析

目的研究不同地区东方田鼠杂交后产下的子代的遗传特性.方法筛选4条10bp随机引物对宁夏和洞庭湖地区东方田鼠杂交子代的基因组进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析,并对不同地区亲代以及子代相互之间的基因组DNA进行相似性分析.结果①所有东方田鼠均有相同的扩增片段出现;②两个不同地区的亲代分别有特异性片般;③亲代的DNA带型均能在子代中找到;④同一胎次东方田鼠之间基因共享度大约在72%～96%之间.结论RAPD分析能在一定程度上反映出东方田鼠种的特性以及亚种的特异性,而且同一胎次之间基因共享度较高.     

东方田鼠长江亚种和指名亚种基因组DNA序列比较分析

根据东方田鼠基因组DNA序列片段(CenBank登录号：AF277394),通过PCR方法扩增东方田鼠长江亚种(Microtus fortis calamorum)和宁夏指名亚种(Microtus fortis fortis)基因组DNA,得到-670bp左右的特异扩增片段。将PCR扩增产物克隆到pGEM-Teasy裁体,进行DNA序列分析,并用生物信息学方法比较东方田鼠长江亚种与指名亚种之间该序列的差异。结果表明：在东方田鼠两个亚种中共发现19个不同的等位基因,不同的个体在该序列存在广泛的单个核苷酸多态性(SNP),多态性位点多达25个;变换类型包括：转换(G→A、A→G、T→C、C→T)、颠换(G→T、A→T、T→A、C→A)、插入(CA)和缺失(TGTTTT)。东方田鼠长江亚种和指名亚种两个种群之间存在明显差别,尤其是在146、192、223、224、235位,但两种群间同源性仍高达98％。同时采用系统发育树(phylogenetic tree)分析方法,对两个亚种的亲缘关系进行了分析和比较,结果显示,东方田鼠长江亚种和宁夏指名亚种基因组DNA明显的分为两大组别。     

东方田鼠特异DNA片段的克隆及核苷酸序列分析

目的获得东方田鼠的特异DNA序列.方法Aβ基因使用PCR,基因克隆,斑点杂交,DNA序列分析,生物信息学技术.结果根据小鼠MHCⅡ外显子2及其两侧序列,合成引物并扩增东方田鼠基因组DNA,将PCR产物回收、测序后,分别设计内引物扩增东方田鼠基因组DNA,其中一对引物可得到特异性扩增带,将得到的DNA片段插入PGEM-Teasy载体,进行序列分析.用这对引物扩增人、昆明小鼠、BALB/c小鼠及C57BL/6J小鼠基因组DNA,均无扩增产物.以东方田鼠特异性扩增产物为探针进行斑点杂交,除东方田鼠基因组DNA外,其他几种动物基因组DNA均为阴性结果.进一步对该DNA片段进行了BLAST同源性搜索和外显子预测,在Genbank中没有发现高度同源序列,并且找到一个可能的外显子,该外显子由69个氨基酸组成.结论获得的DNA片段为东方田鼠的特异片段,这将为从分子水平深入研究东方田鼠的遗传背景、生物进化规律以及东方田鼠抗日本血吸虫的机理奠定基础.     

东方田鼠两亚种幼体生长特征参数的比较

在相同驯养条件下同步测定东方田鼠(Microtus fortis)指名亚种和长江亚种幼体的生长特征参数。两亚种初生幼体表型特征无明显差异。采用Von Bertalanffy生长模型对两亚种幼体的体重、体长和尾长,以Logistic生长方程对后足长生长过程进行拟合与描述。指名亚种雄体渐近体重、体长和尾长均大于或显著大于长江亚种,雌体前者小于后者;两亚种在17~20 d体重均已产生性二型分化,长江亚种两性个体渐近体重、体长和尾长差值大于指名亚种。两亚种雌体体重、体长、尾长和后足生长速率均相应地大于雄体,体重生长曲线拐点出现时间、瞬时生长率曲线拐点出现时间较体长、尾长和后足长明显迟缓。两亚种两性个体的后足长生长速率要大于其体重、体长和尾长。结果表明,(1)雌体较雄体早熟;(2)雄性体重指名亚种大于长江亚种,雌体相反,指名亚种性二型现象较长江亚种明显;(3)后足长较体重、体长和尾长较早地达到成熟时的大小;(4)两亚种幼体性二型分化时间早于其性成熟过程。     

东方田鼠四个种群线粒体D-loop区遗传多态性分析

东方田鼠(Microtus fortis)主要分布在我国和俄罗斯、朝鲜、蒙古等地,我国是东方田鼠主要分布区,在东北、西北、黄河流域、长江流域和浙江、福建等省都有分布.     

条纹斑竹鲨基因组的RAPD分析初报

采用11种随机引物对4 条条纹斑竹鲨基因组进行了RAPD检测.结果表明,11种引物在每条个体上扩增的 DNA片段总数在77～84之间,单个随机引物扩增的DNA片段数目由1至11条不等,平均为7.5条 DNA 片段,片段的大小在 300～2 800bp之间.个体之间的相似率在90%以上.     

用RAPD标记检测六种蛇基因组DNA多态性

用 ＲＡＰＤ技术检测了乌梢蛇 Ｚａｏｃｙｓ ｄｈｕｍｎａｄｅｓ、王锦蛇 Ｅｌａｐｈｅ　ｃａｒｉｎａｔａ、黑眉锦蛇 Ｅ．ｔａｅｎｉｕｒａ、双斑锦蛇 Ｅ． ｂｉｍａｃｕｌａｔａ、赤链蛇 Ｄｉｎｏｄｏｎ ｒｕｆｏｚｏｎａｔｕｍ和日本蝮短尾亚种 Ａｇｋｉｓｔｒｏｄｏｎ ｂｌｏｍｈｏｆｆｉｉｂｒｅｖｉｃａｕｄｕｓ等６种蛇的基因组ＤＮＡ的多态性。经２０个随机引物扩增得到２５３个多态片段，其中锦蛇属３个种共有片段８条，游蛇科５个种共有片段５条。在这些共享片段中未检测出种内多态现象。片段分布和片段共享度聚类分析所得的游蛇科５种蛇之间的亲缘关系与染色体、颅骨和半阴茎研究的结果基本一致。     

洞庭湖区东方田鼠繁殖特性研究

１９９２年１月～１９９４年１２月,作者在东洞庭湖区岳阳县麻塘区调查,３年捕获并剖检东方田鼠１３９２只,其中雌鼠５９９只,雌性比♀／（♂＋♀）＝４３．０％。该鼠全年繁殖,盛夏５～７月怀孕率较低,冬季１２～２月怀孕率比同域其它鼠种显著偏高。３年合计总怀孕率为２９．２％．平均胎仔数（ｘ±ＳＥ）为５．１３±０．１２只,平均窝仔数４．６０±０．２７只,雌鼠和雄鼠的繁殖强度随年龄增长而递增。室内饲养的东方田鼠妊娠期约２０天,窝仔数４．３３±０．３３只,雌鼠５０～６０天成熟,雄鼠稍迟。枯水期（１１月～翌年４月）东方田鼠主要栖息于湖洲草地,汛期（５～１０月）主要栖息于过垸内稻田。在不同栖息地其繁殖力差别较大,湖洲的繁殖强度最高,稻田区次之,岗地最低,反映它在各栖息地生态适合度不同。文中还对全国４个亚种的繁殖参数作了比较。     

利用RAPD法对虹鳟鱼基因组DNA多态性研究初报

本文通过利用RAPD（随机扩增多态DNA）方法,选用20种10bp的随机引物（OPC－01－OPC—20）,用于虹鳟鱼基因组DNA多态性分析,其中发现一种引物（OPC－02）在虹鳟鱼群体中能扩增出多条带,说明该引物能反映其基因组DNA的多态性,可用于检测出不同品系间的差异。     

东方田鼠在生物医学研究中的应用及展望

东方田鼠在分类、分布、形态、生态、实验室饲养、部分生物学特征、遗传学、微生物学和寄生虫学等方面的研究取得了一系列进展。近年来,东方田鼠开发为日本血吸虫病、糖尿病和自发性卵巢癌实验动物模型新品系。应用这些模型可对日本血吸虫病、糖尿病和自发性卵巢癌的病理学改变、发病机制、药物治疗和疫苗开发等多方面进行研究。本文就东方田鼠在生物医学研究中的应用研究现状作一综述。     

洋葱细胞质雄性不育系70及其保持系71基因组DNA的RAPD分析

采用RAPD技术,对洋葱细胞质雄性不育系70及其保持系71的基因组DNA的多态性进行分析。结果表明,在被检测的100条随机引物中,46条引物具有扩增产物,5条引物扩增出多态性条带。对这5条引物进行重复筛选和单株验证,只有G02扩增出的多态性片段,且表现稳定。推测该标记与育性有关。     

大花蕙兰基因组DNA提取及RAPD反应条件探索

用SDS、CTAB和改良CTAB法分别提取大花蕙兰叶片基因组DNA,发现以改良CTAB法提取的DNA纯度高,产率也较高。以5’-GGTGCTCCGT-3(’BA440)为随机引物,并以大花蕙兰品‘种金杯(’Cymbidiumhybridiumcv.HiroshimaGoldenCu“pSunnyMoon”)的DNA为模板,对RAPD(RandomAmplifiedPolymorphicDNA)反应体系进行了优化研究,结果表明,25μl反应体系中,Mg2 、TaqDNA聚合酶、引物、模板DNA和dNTP5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:2.0mmol/L、1.0U、0.20μmol/L、25ng和0.20mmol/L。扩增程序优化为:94℃预变性4min;94℃变性0.5min,37℃退火1min,72℃延伸1min,40个循环;最后72℃延伸7min。     

直接从人工老化的菜心干种子中提取基因组DNA用于RAPD分析

利用 4 0℃、1 0 0 %RH对菜心种子进行人工加速老化处理获得了不同活力的种子批 ,利用平衡酚_氯仿法直接从人工老化的菜心干种子中提取基因组DNA ,并对提取的基因组DNA进行了RAPD扩增。结果表明 ,所提取的基因组DNA量多 ,而且比较整齐一致。引物S2 0 8扩增所获得的基因组DNA指纹图谱上的DNA带清晰、明亮 ,从而表明利用本方法从人工老化菜心干种子中直接提取的基因组DNA完全可以用于RAPD分析。     

石斛干品基因组DNA的提取与RAPD分析

市场中药干品的药性差异一直是影响中药标准化的瓶颈,而检测技术相对落后是导致这一现象的主要原因。DNA分子水平检测的困难是药材干品的基因组DNA难以提取。本文以铁皮石斛(Dendrobium candidum)干茎为材料,采用了四种方法从干品石斛中提取基因组DNA。结果表明,采用改良的CTAB法可从石斛干品尤其是干茎皮中提取质量较高的基因组DNA,其分子量大于23kb,以此DNA为模板进行不同引物的PCR扩增可获得清晰的RAPD条带。该研究初步建立了石斛干品合适的RAPD技术体系。