美国国家植物基因组计划资助情况分析

美国植物基因组计划（National Plant Genome Initiative,NPGI）于1998年正式启动,该计划在美国国家科学基金会（NSF）的支持下,成立了由美国农业部（USDA）、能源部（DOE）、国立卫生研究院（NIH）、国家科学基金会（NSF）、科学与技术政策办公室（OSTP）、管理与预算办公室（OMB）和美国国际开发署（USAID）等组成的植物基因组跨机构工作组（Interagency Working Group on Plant Genomes,IWG）,IWG每5年制定一项5年计划来指导协调基因组研究工作。对1998～2009年期间,美国国家科学基金会（NSF）资助国家植物基因组计划（NPGI）的目标、经费、项目变化情况进行了分析,以期得到某些启示和借鉴。     

脊椎动物基因组进化原因的争论

脊椎动物基因组进化原因的争论马德如（南开大学生命科学学院分子生物学研究所,天津３０００７１）关键词基因组进化７０年代以来,Ｂｅｒｎａｒｄｉ等发现在温血脊椎动物（鸟类和哺乳类）与冷血脊椎动物（鱼类、两栖类、爬行类）间基因组的结构特点有明显不同。温血脊椎...     

美完成犬基因组序列草图

Ag Biotech Reporter 2004年21卷8期7页报道：美国国立人类基因组研究所最近宣称，在Kerstin Lindblad-Toh的领导下，已完成了第一幅犬基因组序列草图，并将其输入数据库，供全世界的生物医学和兽医学研究工作者参考。     

通过RNAi和干细胞来进行筛选打破基因组新药开发的僵局

进行基因组新药的研发不一定就能发明新药。美国大型企业和国立卫生研究院（NIH）的生物技术相关预算一方面在迅速上升：另一方面美国食品与药物管理局批准的新药数量却在减少。解决上述问题的秘诀就在于RNAi和干细胞组合起来的高通量筛选（11ighthroughputscreening，HTS）技术。[第一段]     

人类基因组学的新战略：全基因组随机测序

人类基因组学的新战略：全基因组随机测序吴家睿（中国科学院上海生物化学研究所,上海２０００３１）关键词人类基因组ＤＮＡ测序遗传图谱物理图谱人类基因组计划（ＨＧＰ）的战略构想是,以“作图”（Ｍａｐｐｉｎｇ）为测序的基础。也就是说,首先将人类的整个基因组一...     

新加坡科学技术研究厅进行大规模干细胞基因研究

新加坡科学技术研究厅下属的新加坡基因组研究所（GIS）和分子细胞生物学研究所（IMCB），进行了人胚干细胞（hES）的历史上首次大规模的、全基因组范围内的RNAi筛选，并宣布在人胚胎干细胞中发现了重要基因。     

科学家完成12种果蝇基因组对比研究“壮举”其中10种是首次测序；研究发现新基因和进化痕迹

要详尽刻画一种生物模型的特征,需要多少个基因组序列?对果蝇而言,一打可能是不错的开始。由美国国立人类基因组研究所(NHGRI)资助的一个国际科研组织11月8日宣布,他们完成了12种“近亲”果蝇的基因组对比研究工作,其中有10种果蝇的基因组是首次测序。对比分析确定出了数千个新     

人基因组百万碱基级巨型YAC的构建

人基因组百万碱基级巨型ＹＡＣ的构建戴长虹,柴建华（复旦大学遗传学研究所,上海２００４３３）关键词人基因组;酵母人工染色体（ＹＡＣ）;百万碱基;巨型ＹＡＣ人类的全部遗传信息包含在３ｘ１０＇核着酸对（ｈｐ）中,共编码５００００～１０００００个基因。人类基...     

双探针原位杂交揭示稻属BB,CC和EE基因组之间的分化

利用双探针原位要交技术,揭示了稻属Ｏｒｙｚａ ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓ复合体中ＢＢ、ＣＣ和ＥＥ基因组之间的分化。以标记的ＢＢ基因组（来自二倍体的Ｏ．ｐｕｎｃｔａｔａＫｏｔｅｃｈｙ ｅｘ Ｓｔｅｕｄ．）的总ＤＮＡ为探针,同ＢＢＣＣ基因组（Ｏ．ｍｉｎｕｔａＪ．Ｓ．Ｐｒｅｓｌ．ｅｔ．Ｃ．Ｂ．Ｐｒｅｓｅｌ）的中期染色体杂交,结果表明,ＢＢ基因组的ＤＮＡ探针同与四倍体Ｏ．ｍｉｎｕｔａ中的ＢＢ基因组的染色体之间     

烟草花叶病毒蚕豆株系基因组全序列 分析及结构特征*1)

根据已报道的TMV-U1株系核苷酸序列合成引物,利用RT-PCR技术获得了覆盖整个烟草花叶病毒蚕豆株系（TMV-B）基因组的cDNA重组克隆.结合末端测序技术,完成了TMV-B全基因组序列测定.TMV-B全基因组共有6 395个核苷酸组成,包括4个开读框（ORF）,分别编码126 ku（含1 116个氨基酸）、183 ku（含1 616个氨基酸）、30 ku（含268个氨基酸）和17.5 ku蛋白（含159个氨基酸）.TMV-B与TMV-U1相比全基因组同源率达99.4%,两病毒基因组5′,3′非编码区和CP基因完全相同.TMV-B与TMV-U1之间在126 ku蛋白中有6个氨基酸差异,54 ku蛋白中有2个差异,30 ku蛋白中有3个差异.对导致TMV-B侵染蚕豆的可能致病机理进行了分析.     

人基因组表达图谱分析和疾病相关基因搜寻──现状与展望(续前)

人基因组表达图谱分析和疾病相关基因搜寻──现状与展望（续前）康毅滨,柴建华（复旦大学遗传学研究所上海２００４３３）二、ｃＤＮＡ随机部分ｆ三、测序及ＥＳＴ的建立以上所讨论的方法均是从基因组ＤＮＡ出发寻找表达序列,与之恰好相反的另一种构建表达图的思路是随机挑选ｃＤＮＡ文库中的克隆进行测序并在染色体上定位,即ｃＤＮＡ策略。人类基因组计划的一个重要目标是获得人基因组３０亿个碱基对的顺序,而以目前的测序技术要在近期内完成这一目标还略显力不从心。     

针叶树基因组特征及其序列资源挖掘进展

针叶树是裸子植物中最大也是分布最广的一支。作为多年生木本植物,针叶树不仅为工业提供建筑、造纸等重要原料和其它可再生能源,而且在北半球的生态平衡中也起着重要作用。因其独特的分类地位、重要的经济价值和生态价值,针叶树序列资源挖掘备受重视。然而其庞大且复杂的基因组阻碍了这一进程,截至2013年4月,尚无获得全基因组序列的针叶树种。随着第2代测序技术的出现及生物信息学的快速发展,针叶树序列资源挖掘也从转录组过渡到全基因组测序,后者己在松属（Pinus）、云杉属（Picea）和黄杉属（Pseudotsuga）部分树种中开展。该文首次归纳了针叶树基因组特征．回顾了针叶树序列资源挖掘进程,并重点介绍了火炬松（Pinustaeda）、欧洲云杉（Piceaabies）和白云杉（Piceaglauca）的全基因组测序项目。     

从酵母基因组测序得到的启示

从酵母基因组测序得到的启示高向东李育阳（复旦大学遗传学研究所,上海２００４３３）关键词酵母基因组计划孤儿基因基因置换反向遗传学酵母基因组计划从１９８９年１月开始启动,经历了近七年时间,已于１９９６年１月测完了酿酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒ...     

人类基因组研究新进展

人类基因组研究新进展柴建华（复旦大学遗传学研究所人类基因组实验室上海２００４３３）人类基因组研究在全世界范围内展开已经是第八个年头了。研究任务分为两个：一是染色体ＤＮＡ的大片段克隆、排序和核耷酸顺序分析;另一个是全部基因的顺序识别及功能研究,包括突变...     

用PCR方法从基因组DNA中扩增人睫状神经营养因子基因

用ＰＣＲ方法从基因组ＤＮＡ中扩增人睫状神经营养因子基因杜方勇,甘思德,范明,刘淑红（北京军事医学科学院基础医学研究所１００８５０）ＰＣＲ方法具有操作方便、对模板要求不高、能快速高效地从原材料中得到微克水平的基因片段等优点,但用它从基因组ＤＮＡ扩增长片...     

基因鉴定集成法:全基因组基因表达研究的新策略

人类基因组包含的核苷酸数目庞大,基因鉴定（识别）的技术策略是基因克隆研究至为重要的基础。在全基因组基因表达分析策略方面,已相继建立了ｍＲＮＡ差异显示、代表性差异分析、抑制性消减杂交、基因表达系列分析和ｃＤＮＡ微阵列等技术。基因鉴定集成法是新近在综合上述技术的优缺点的基础上建立的全基因组分析新策略,具有充分利用生物基因信息数据库进行基因鉴定（识别）,并能提高稀有拷贝基因鉴定效率的优点。本文简要介绍其     

元基因组文库分析技术研究进展

随着新的分析技术的不断出现和成熟,促进了微生物分子生态学及相关学科的诞生和迅速发展。其中,元基因组文库分析技术即是近年来微生物分子生态学研究领域兴起的一种新的分析技术。就元基因组分析技术诞生的背景及该技术的原理进行了讨论,着重阐述了元基因组文库分析技术在寻找新基因、开发新的生物活性物质、研究群落中微生物多样性、人类元基因组测序等方面的应用。另外,归纳总结了目前国际上常用的诸如PCR为基础的筛选、荧光原位杂交（fluorescent in situ hybridization,FISH）、底物诱导的基因表达筛选（substrate induced gene expression screening,SIGEX）、基因芯片等元基因组文库筛选方法,并就不同方法的优缺点进行了分析和讨论,指出了目前元基因组文库分析技术存在的主要问题并对今后该技术的发展进行了展望。     

糖皮质激素非基因组效应的研究

在过去的几十年间,人们认为糖皮质激素（glucocorticoid,GC）仅仅是通过改变基因的表达来发挥其生理作用,这个过程需要几个小时来完成。然而,近年来越来越多的证据表明GC对激素分泌、神经元兴奋性、机体行为及细胞形态、糖类代谢等具备快速效应,这些过程往往在数秒钟或者分种内完成,这种作用机制被称为GC的非基因组作用机制。GC的非基因组作用主要可能通过两种不同的机制起作用：（1）通过细胞膜上或者细胞质内结构未知的糖皮质激素受体（glucocorticoid Recptor,GR）来发挥非基因组作用,即为特异性非基因组效应,（2）GC主要通过改变细胞膜理化作用来发挥效应。也称为非特异性非基因组效应（non-specific nongenomic effects,NSNE）。本文通过阐述近年来GC的非基因组的作用的最新研究进展并且讨论了这些非基因组作用临床治疗过程中的联系。对糖皮质激素基因组和非基因组作用机制的深入了解有助于指导我们在临床合理用药并减少其副作用。     

昆虫基因组及其大小

昆虫基因组大小是由于基因组各种重复序列在扩增、缺失和分化过程中所致的数量差异造成的。这些差异使得昆虫不同类群间、种间和同种的不同种群间表现出基因组大小的不同。目前有59种昆虫已经列入基因组测序计划, 其中6种昆虫（黑腹果蝇Drosophila melanogaster、冈比亚按蚊Anopheles gambiae、家蚕Bombyx mori、意大利蜜蜂Apis mellifera、埃及伊蚊Aedes aegypti和赤拟谷盗Tribolium castaneum）的全基因组序列已经报道。有725种昆虫的基因组大小得到了估计, 大小在0.09~16.93 pg （88~16 558 Mb）之间。本文还介绍了昆虫基因组大小的估计方法, 讨论了昆虫基因组大小的变化及其意义。     

日本研究人员在植物杂志上发表糙米组学成果

日本理化学研究所植物科学研究中心（PSC）代谢组功能研究小组的齐藤和季主任、松田史生客座研究员等与农业生物资源研究所，在英国的植物杂志（ThePlantJournal）（影响因子为6．9）上发表了在水稻品种改良上将发挥重要作用的组学研究成果。该研究的一部分得到了日本农林水产省“新农业基因组计划”的资助。