SARS冠状病毒S蛋白候选细胞受体氨基肽酶N的基因变异研究

氨基肽酶N是人类冠状病毒HCoV 2 2 9E的细胞受体 ,可能为SARS冠状病毒 (SARS CoV)S蛋白的受体。应用变性高效液相色谱 (DHPLC)技术筛查了正常无关个体中氨基肽酶N编码基因ANPEP的全部外显子及其两侧部分内含子序列。对筛查中DHPLC峰型提示有基因变异存在的DNA片段行PCR产物直接测序 ,共发现 9种单核苷酸多态 (SNP) ,其中 4种为非同义SNP ,分别为T32 1M(96 2C >T)、S6 5 1L(195 2C >T)、S75 2N(2 2 5 5G >A)和G76 4R(2 2 90G >A) ;其余 5种SNP为T795T(2 385C >T)、IVS7+17G >A、IVS14 16A >G、IVS17+12C >G和IVS17+44C >T。这些SNP的发现 ,为SARS CoV的宿主遗传因素研究 ,特别是发现SARS CoV感染和SARS发病的易感基因或抗病基因 ,提供了遗传标记。     

猪流行性腹泻病毒功能性受体的鉴定

为研究猪氨基肽酶(Porcine Aminopeptidase N,pAPN)是否作为猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的细胞感染受体,通过转染技术,使PEDV非容许性细胞MDCK表达pAPN,并用PEDV感染转染细胞。结果发现转染的MDCK细胞可以感染PEDV,并且该病毒可以在转染细胞中连续传代。免疫荧光法鉴定存在病毒抗原。进一步实验证实,抗pAPN血清可以抑制PEDV感染转染的MDCK细胞。这些结果展示转染的MDCK细胞、pAPN表达及PEDV病毒复制之间存在直接联系,证明pAPN是PEDV的细胞感染受体之一。     

冠状病毒感染细胞的受体结合机制

病毒感染宿主细胞是病毒致病的关键所在,病毒感染细胞需要与其受体相结合,介导其与细胞的膜融合反应。本综述了冠状病毒受体结合机制的研究进展,以及其在SARS病毒致病机制中可能的作用。     

肠小体在猪肠道冠状病毒感染中的研究进展

猪肠道冠状病毒是引起仔猪腹泻的重要致病因素,主要感染小肠绒毛上皮细胞,给养猪业造成了巨大的经济损失。由于缺乏能模拟胃肠道高度复杂生理特性的体外研究模型,猪肠道冠状病毒感染与宿主肠上皮之间相互作用的研究也受到了极大的限制。随着干细胞技术的快速发展,一种能模拟肠道复杂的细胞类型及空间结构的体外模型——肠小体引起了人们的广泛关注。与传统的细胞系相比,肠小体不仅能模拟肠的结构和功能,同时还保留宿主的遗传特性,有望成为研究宿主-肠道病原相互作用的一种理想模型。本文就猪肠道冠状病毒以及肠小体在肠道病原研究中的应用进行综述,以期为猪肠道冠状病毒的基础研究提供新的思路与见解。     

二肽基肽酶4为人类中东呼吸道综合征冠状病毒MERS-CoV功能性细胞受体

中东呼吸道综合征冠状病毒（Middle East respiratory syndrome coronavirus, MERS-CoV）是继SARS冠状病毒（SARS-CoV）之后新近出现的又一种能够引发严重呼吸道感染的人类新发冠状病毒. MERS-CoV于2012年9月首次在中东一些国家被发现,截至2013年9月7日,MERS-CoV已经引起114例感染病例,其中54人死亡,死亡率约50%. 病毒受体研究为MERS-CoV等人类新发冠状病毒进化和跨种传播机制提供重要依据．最近,Raj等在Nature发表文章,首次报道了二肽基肽酶4（dipeptidyl peptidase 4,DPP4;又名CD26）为MERS-CoV感染细胞的功能性受体．MERS-CoV功能性受体的发现为人类新冠状病毒溯源和跨种进化研究、病毒传染和流行病学特征分析以及抗病毒药物和疫苗研究提供重要基础.     

1株猪δ冠状病毒N蛋白单克隆抗体制备与鉴定

【背景】猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)是一种新发现的猪肠道冠状病毒,主要引起以急性水样腹泻、呕吐和脱水等特征的胃肠道疾病。在PDCo V的4个结构蛋白中,核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,N)为高度保守的结构蛋白,在病原诊断方面具有重要意义。【目的】以纯化的重组PDCo VN蛋白为抗原,制备抗N蛋白的单克隆抗体并进行特性鉴定。【方法】利用已构建的p ET-28a-N表达菌,经IPTG诱导表达获得具有免疫原性的重组N蛋白,并将纯化的重组N蛋白免疫BALB/c小鼠制备杂交瘤细胞,经3次亚克隆筛选,选取抗体效价最高的一株杂交瘤细胞注射小鼠腹腔并制备腹水单克隆抗体,利用Protein G亲和层析柱纯化。通过腹水单克隆抗体效价测定、抗体亚型鉴定、Western blot鉴定其特性;利用细胞间接免疫荧光试验、组织石蜡切片荧光试验、免疫组化、流式细胞荧光分选技术鉴定其诊断应用价值。【结果】经筛选后得到一株杂交瘤细胞命名为4E88,其腹水单克隆抗体效价为1:105,亚型为Ig G1型,轻链为κ链,Western blot试验表明该单克隆抗体与重组N蛋白和超速离心纯化的PDCo V全病毒反应形成特异性条带。此外,单克隆抗体4E88可以用于猪δ冠状病毒检测的间接免疫荧光试验、免疫组化染色和流式细胞荧光分选技术。【结论】研究获得的单克隆抗体4E88具有较好的反应性,为后续开展PDCo V鉴定、诊断和N蛋白功能研究等奠定基础。     

SARS冠状病毒N蛋白和CYP4F3的相互作用

目的：研究SARS冠状病毒（SARS-CoV）N蛋白与CYP4F3的相互作用。方法：应用免疫共沉淀、GST—pull down、BIACORE实验验证SARS—CoVN蛋白与CYP4F3的相互作用。结果：SARS—CoVN蛋白与CYP4F3能够相互作用,BIA-CORE实验证实CYP4F3与SARS—CoVN蛋白的亲和常数为Ko=4．3×10^-11。结论：SARS—CoVN蛋白与CYP4F3在细胞内、外均能形成复合物,这为进一步探讨SARS—CoVN蛋白在SARS致病机理中的作用奠定了基础。     

SARS病毒与其他冠状病毒的基因组比较

本文利用生物信息学方法比较SARS病毒和其他冠状病毒基因组.通过数据库搜索,找出与SARS病毒基因组相似的核酸或蛋白质序列,并对相似序列进行比对,分析它们的共性和差异.结果表明,SARS病毒在基因组的组织上及结构蛋白质方面与现有冠状病毒有比较大的相似性,SARS病毒基因组与冠状病毒基因组相关.但是,SARS病毒基因组还存在一些特异性序列,ORF1a和S蛋白(特别是S1)的变化以及SARS-CoV特异性的非结构蛋白可能是SARS发病机理与传染特性区别于其他冠状病毒的分子基础.在全基因组水平上进行核酸单词出现频率分析,结果表明,SARS病毒远离已知的其他冠状病毒,单独成为一类.     

SARS病毒与其他冠状病毒的基因组比较

本文利用生物信息学方法比较SARS病毒和其他冠状病毒基因组。通过数据库搜索,找出与SARS病毒基因组相似的核酸或蛋白质序列,并对相似序列进行比对,分析它们的共性和差异。结果表明,SARS病毒在基因组的组织上及结构蛋白质方面与现有冠状病毒有比较大的相似性,SARS病毒基因组与冠状病毒基因组相关。但是,SARS病毒基因组还存在一些特异性序列,ORF1a和S蛋白(特别是S1)的变化以及SARS—CoV特异性的非结构蛋白可能是SARS发病机理与传染特性区别于其他冠状病毒的分子基础。在全基因组水平上进行核酸单词出现频率分析,结果表明,SARS病毒远离已知的其他冠状病毒,单独成为一类。     

氨肽酶N的表达及其与结石形成的关系(英文)

 为研究大鼠高胆固醇饮食时 ,肝脏氨肽酶N(APN)在实验结石形成中可能的结石发生作用 ,采用 1.2 %胆固醇饮食 4周 ,诱发新西兰兔胆囊结石形成 .根据兔APN基因cDNA序列设计引物 ,提取肝脏总RNA .利用RT PCR检测肝脏APNmRNA水平的变化 ,用组织化学方法观察肝脏毛细胆管膜上APN的表达 .观察新西兰兔胆囊结石形成过程中肝脏APN的mRNA水平的变化、APN表达及胆汁中APN活性、胆脂、总蛋白含量的变化 ,探讨APN在胆石形成中可能的作用 .经成石饲料饲养后 ,随着胆汁饱和度增加和APN活性加强 ,胆囊结石组肝脏APNmRNA水平较对照组明显增高 ,胆囊结石组胆汁中总胆固醇、CSI、总蛋白浓度及APN活性均明显高于对照组 ,且胆汁中APN活性与肝脏APN的表达及胆汁CSI增高呈正相关 .结果提示 ,当存在胆汁过饱和的情况下 ,APN很可能作为促成核因子在胆结石形成早期发挥重要作用     

Purification of an Aminopeptidase Preferentially Releasing N-terminal Alanine from Cucumber Leaves and Its Identification as a Plant Aminopeptidase N

In this study, a highly active foliar aminopeptidase preferentially releasing N-terminal alanine from artificial substrates was purified and characterized from cucumber (Cucumis sativus L. suyo). The enzyme had a molecular mass of 200 kDa consisting of two subunits of 95 kDa. It was a metalloprotease the pH optimum of which was 8 to 9. It cleaved Ala-, Gly-, Met-, Ser-, Leu-, Lys-, and Arg artificial substrates. An internal amino acid sequence was similar to those of aminopeptidase N (clan MA, family M1) of microorganisms, and was very similar to that of a putative aminopeptidase N of Arabidopsis thaliana. From these results, the highly active aminopeptidase in cucumber leaves was identified to be a plant aminopepitdase N.     

Epidemiology and Genotypic Diversity of Eurasian Avian-Like H1N1 Swine Influenza Viruses in China

Eurasian avian-like H1 N1(EA H1 N1) swine influenza virus(SIV) outside European countries was first detected in Hong Kong Special Administrative Region(Hong Kong, SAR) of China in 2001. Afterwards, EA H1 N1 SIVs have become predominant in pig population in this country. However, the epidemiology and genotypic diversity of EA H1 N1 SIVs in China are still unknown. Here, we collected the EA H1 N1 SIVs sequences from China between 2001 and 2018 and analyzed the epidemic and phylogenic features, and key molecular markers of these EA H1 N1 SIVs. Our results showed that EA H1 N1 SIVs distributed in nineteen provinces/municipalities of China. After a long-time evolution and transmission, EA H1 N1 SIVs were continuously reassorted with other co-circulated influenza viruses, including 2009 pandemic H1 N1(A(H1 N1)pdm09), and triple reassortment H1 N2(TR H1 N2) influenza viruses, generated 11 genotypes. Genotype 3 and 5, both of which were the reassortments among EA H1 N1, A(H1 N1)pdm09 and TR H1 N2 viruses with different origins of M genes, have become predominant in pig population. Furthermore, key molecular signatures were identified in EA H1 N1 SIVs. Our study has drawn a genotypic diversity image of EA H1 N1 viruses, and could help to evaluate the potential risk of EA H1 N1 for pandemic preparedness and response.     

Aminopeptidase N during the ontogeny of the chick

Little is known about the production and function of metallopeptidases in embryonic development. One such enzyme, aminopeptidase N (APN), is present in several epithelia, the brain and angiogenic vessels in adults. APN promotes vascular growth and endothelial cell proliferation in physiological and pathological models of angiogenesis. However, its possible role in embryonic angiogenesis or other developmental processes is unknown. Its expression profile in the early phase of embryonic development has not been reported. We report here the expression of this enzyme during the early development of the chick embryo, using complementary techniques for monitoring APN mRNA, protein, and enzymatic activity. We detected APN in the embryo as early as gastrulation. In addition to the known sites of APN production identified in both adults and rat fetuses toward the end of gestation, APN was found in unexpected sites, such as the primitive streak, the dorsal folds of the neural tube, the somites, and the primordia of several organs. APN was present mostly in the cardiovascular compartment during the first 13 days of incubation, and in the hematopoietic compartment (yolk sac and aorta-gonad-mesonephros region) early in development. This study provides clues as to the possible role of APN in embryonic development.     

冠状病毒入侵细胞途径的研究进展

近年来，冠状病毒严重威胁人类和动物的健康。病毒具有专性胞内寄生的特点，其需要利用细胞完成自身的增殖，因此入侵细胞的过程是其感染机制中非常重要的一部分。多项研究表明冠状病毒能通过细胞表面途径和内吞途径入侵细胞。通过对冠状病毒入侵途径研究有助于了解其生命周期，有利于冠状病毒的防治以及新型药物和疫苗的研发。本文对近年来不同冠状病毒的入侵途径及针对入侵途径所开发的潜在药物的相关研究进行总结，以期为全面了解冠状病毒的入侵方式提供参考。     

H1N1亚型猪流感病毒的拯救

利用8质粒拯救系统成功拯救出了猪流感病毒毒株A/Swine/TianJin/01/2004(H1N1)(A/S/TJ/04)。将猪流感病毒8个基因节段经RT-PCR合成cDNA后, 分别克隆到RNA聚合酶I/II双向表达载体PHW2000中, 构建成8个重组质粒。用8个重组质粒共转染COS-1细胞, 30 h后加入TPCK-胰酶至终浓度0.5 mg/mL。共转染48小时后收获COS-1细胞及其上清, 经尿囊腔接种9日龄SPF鸡胚。收获死亡鸡胚尿囊液并继续用SPF鸡胚传3代, 得到有感染性的病毒。经血凝、血凝抑制验、测序分析、电镜观察等均证实了A/S/TJ/04猪流感病毒的成功拯救。这是目前国内首次报道拯救出H1N1亚型猪流感病毒, 为进一步研究猪流感病毒基因组结构与功能的关系、流感跨种传播的机制以及构建新型猪流感疫苗株奠定了基础。     

H1N1亚型猪流感病毒的拯救

利用8质粒拯救系统成功拯救出了猪流感病毒毒株A/Swine/TianJin/01/2004(H1N1)(A/S/TJ/04)。将猪流感病毒8个基因节段经RT-PCR合成cDNA后, 分别克隆到RNA聚合酶I/II双向表达载体PHW2000中, 构建成8个重组质粒。用8个重组质粒共转染COS-1细胞, 30 h后加入TPCK-胰酶至终浓度0.5 mg/mL。共转染48小时后收获COS-1细胞及其上清, 经尿囊腔接种9日龄SPF鸡胚。收获死亡鸡胚尿囊液并继续用SPF鸡胚传3代, 得到有感染性的病毒。经血凝、血凝抑制验、测序分析、电镜观察等均证实了A/S/TJ/04猪流感病毒的成功拯救。这是目前国内首次报道拯救出H1N1亚型猪流感病毒, 为进一步研究猪流感病毒基因组结构与功能的关系、流感跨种传播的机制以及构建新型猪流感疫苗株奠定了基础。