mRNA差别显示技术对肝再生调控基因的研究

以正常肝和再生肝为对比材料,利用mRNA差别显示技术,研究肝再生过程中基因的差别表达,旨在从基因选择性表达水平上探讨肝再生调控机理。得到4种未知肝再生相关cDNA,完成其克隆与序列分析,其一在再生肝中的表达低于正常肝,余者则高于正常肝。这些序列均已在EMBL(Europe Molecular Biology Laboratory)数据库中登录,登录号分别为X95721、X95722、X95723、X97973。     

mRNA差别显示技术的研究进展

ｍＲＮＡ差别显示是继ｍＲＮＡ差减杂交技术之后又一种显示ｍＲＮＡ差异表达的新方法。它通过ＰＣＲ随机引物与锚定引物的合理搭配,在特定ＰＣＲ条件下,展示不同条件下真核细胞ｍＲＮＡ的差异扩增片断,为寻找未知基因提供了新途径。     

发展中的mRNA差别显示技术

随着PCR技术的出现（1985）,在分子生物学界又相继出现了两个很有影响的新技术－PAPD技术（1990）和mRNA差示法（1992）,前者用于分子标记,后者用于基因分离。mRNA差示法的生物学基础是基因的差别表达,即：单个细胞中表达的基因仅占基因总数的15％,这种基因的差别表达决定了生命的所有过程,如：发育和经、对逆境的反应、细胞分裂、老化等。图一给出了该方法最初的技术路线。提取要比较的两种或两种以上样品的mRNAs,分别逆转录成cDNAs,经过PCR扩增后,直接进行测序胶电泳即可识别差别的mRNA。其中、关键是的PCR扩增时两个引物的设计。3′端引物Oligo(dT)MN很容易与具有N′M′－poly(A)-3′末端的大多数mRNA结合,进行cDNA的逆转录合成。M、N提供锚定位点,防止3′端引物在poly(A)序列不同位置上的随机结合。5′端为10个碱基的随机引物。这个经验上的碱基数较理论的6－7个碱基（表一）更能满足测序胶电泳要求的条件：分子大小在500bp左右,每条泳道上条带数在100条左右。该方法近年来又有如下改进：一、PCR退火温度由42℃改为40℃,可在保持特异性的同时,增加泳道上的条带数。cDNA合成的底物改用总RNA,可避免poly(dT）柱纯化mRNA时的污染,造成电泳抹带（smear）现象。二、第二代引物3′端的M位（3′端倒数第二位）碱基改用4个简单碱基,减少了引物的组合数,提高该法的效率和经济性。第三代引物在两种引物的5′端加HindIII酶切位点,3′端引物改为单随机碱基,既：5′－AAGCT11N－3′;5′端引物为5′－AAGCTT＋（AP）7。大大提高了克隆效率和克隆cDNA的可操作性。三、可能由于10个碱基随机引物的特异性还不够,泳道上出现的cDNA条带数多得超过了不可分辨的程度,造成了假阳性现象。有人尝试用不变性凝胶代替变性凝胶、或用Northern亲和层析加以解决。收效不大。也许,还是需要在引物设计上下功夫。四、经比较,^33P的半衰期和放射性强度介于^32P和^35S之间,价格最贵,但效果最好。通过对正常细胞与病变细胞、处理与未处理细胞、不同生理状态和不同发育时期的细胞,以及抗逆性强弱所作的mRNA差别显示分析,在动植物生理、病理以及抗性研究中取得了大量成果。但是,由于该技术要求底物有poly(A）尾,只能限于真核生物核基因组差异表达的研究。而且,所选择的研究材料除要求目的的基因有差异外,其它基因差异要尽可能小。GenHunter公司已推出了方便的专用试剂盒,但使用的是与人有害的、需要较长曝光时间的放射性同位素,这些都是需要进一步改进的,还包括向技术的自动化改进。     

mRNA差别显示技术及其应用

真核生物一般具有１０万个不同的基因,但同时表达基因只有很小一部分,约１５％,而且不同发育阶段、不同生理状态和不同类型的细胞中表达的基因也不尽相同。这种基因表达的差异决定了所有的生命过程：发育和分化、内环境的平衡、细胞周期、对刺激的反应、衰老和死亡等。...     

mRNA差别显示技术在植物发育研究中的应用

mRNA差别显示技术是近年发展起来的研究基因表达差异的有效方法,它不仅可比较基因表达差异、追踪已知基因的表达情况,而且可作为寻找特异表达基因的重要手段。本文介绍此方法在植物春化作用、光周期反应、花发育、雄性不育、成熟、衰老、种子发育和休眠及根发育等研究领域的应用概况。     

壳寡糖诱导植物抗性相关基因mRNA差别显示分析

壳寡糖是一种天然的信号分子,可以诱导植物产生各种防御反应。该文利用mRNA显示技术。研究壳寡糖引起的植物抗性相关基因的变化。以50mg/l壳寡糖喷洒的烟草叶片为材料,分别提取处理8h、7d和对照的叶片总RNA,利用一个锚定引物和三个随机引物组合,通过mRNA差别显示技术共获得壳寡糖处理后发生变化的8h差别条带22条,7d后的差别条带为74条。将壳寡糖处理8h得到的17条差别条带克隆到载体上后,进行反向Northern鉴定,有6条可能为真实条带。测序结果表明：其中一条差别片段与烟草热激蛋白90基因具有97％的核苷酸同源性。说明50mg/l壳寡糖处理的烟草叶片在mRNA水平上发生了明显的变化,烟草的热激蛋白90基因可能参与到壳寡糖诱导的抗性信号传导通路中。     

mRNA差别显示技术及其在生命科学中的应用

ｍＲＮＡ表达水平的变化决定细胞的功能状态,个体发育、细胞增殖分化与凋谢、生理刺激和药物治疗等过程,都会出现ｍＲＮＡ 表达水平的变化。阐明这种变化有助于揭示细胞生理过程的分子机制。该技术无需更多的背景资料,可快速有效地分离表达水平出现差别的基础,这些基因编剧编码的功能多肽在细胞生理过程中扮演着重要角色。     

mRNA差别显示技术在植物发育研究中的应用

mRNA差别显示技术是近年发展起来的研究基因表达差异的有效方法。它不仅可比较基因表达差异、追踪已知基因的表达情况,而且可作为寻找特异表达基因的重要手段。本文介绍此方法在植物春化作用、光周期反应、花发育、雄性不育、成熟、衰老、种子发育和休眠及根发育等研究领域的应用概况。     

研究基因表达的新方法—mRNA差别显示（DifferentialDisplay）：原理和应用

研究基因表达的新方法──ｍＲＮＡ差别显示（ＤｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌＤｉｓｐｌａｙ）：原理和应用何祖华,李德葆（浙江农业大学生物技术研究所杭州３１００２９）１原理和方法高等生物一般具有１０’个不同的基因,在单个细胞或个体中仅有约１５％的基因得到表达,产...     

mRNA差异展示研究胃癌差异表达基因

以胃癌细胞株GC7901与胃粘膜细胞株GES-1为对比材料,利用mRNA差异展示技术,研究胃粘膜至胃癌过程的差异表达基因,为建立胃癌预警系统打下基础.获得8个未知的与胃癌相关的cDNA,命名为GCYS-1,2,3,4,5,6,7,20,完成其克隆及序列分析,RNA印迹证实GCYS-1至7片段与GCYS-20基因在GC7901细胞株中呈高表达,在GES-1细胞株中呈低表达.此8个序列在GenBank数据库中登录,接受号为AF054162～AF056168及AF219140.     

真核生物mRNA差显技术(Differential Display)的研究进展

真核生物ｍＲＮＡ差显技术（ＤｉｆｅｒｅｎｔｉａｌＤｉｓｐｌａｙ）的创立及其对该技术的一系列改进,为研究与生殖、发育、细胞分化、癌变、病变、衰老、程序化死亡及抗逆性与抗病性等生命过程有关的基因的差异表达,以及有关基因的分子克隆提供了有效工具。本文简要概述差显技术的原理、优越性、主要缺陷、技术改进等方面的研究进展。     

mRNA差异显示技术在动物早期胚胎发育相关基因研究中的应用

动物从卵裂开始的早期胚胎发育始终伴随着ｍＲＮＡ不断的合成与降解。最初受着受精卵内母体ｍＲＮＡ的控制。当这些ｍＲＮＡ在发育过程中逐渐被降解时,有些动物（如小鼠）在比较早的时期已有新基因的转录;而有些动物（如鱼类、两栖类）迟到囊胚中期以后,合子核的基因才开始转录新的ｍＲＮＡ。ｍＲＮＡ这种有规律的代谢活动控制着细胞的分化、胚层的形成以及模式形成（ｐａｔｅｒｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）。所有这些ｍＲＮＡ水平上的变化都可以用ｍＲＮＡ差异显示法（ｍＲＮＡｄｉｆｅｒｅｎｔｉａｌｄｉｓｐｌａｙ）检测出来并进而获得与早期胚胎发育有关的基因。ｍＲＮＡ差异显示法是由Ｌｉａｎｇ和Ｐａｒｄｅｅ于１９９２年建立起来的,用于显示两种不同组织之间ｍＲＮＡ差异的方法。基于绝大多数ｍＲＮＡ有一个ｐｏｌｙ（Ａ）尾巴,选用一个较特殊的３’端引物─５’Ｔ１１ＭＮ３’,其中Ｍ可以是ｄＡＴＰ,ｄＣＴＰ,ｄＧＴＰ之一,而Ｎ可以是ｄＡＴＰ,ｄＴＴＰ,ｄＣＴＰ,ｄＧＴＰ之一,进行逆转录时,１／１２的ｍＲＮＡ可被逆转录为ｃＤＮＡ。这种ｃＤＮＡ第一链被用来ＰＣＲ扩增,所使用的３’端引物与逆转录引物相同,而５’端引物为１０个碱基的一段寡核苷酸,这类任意（ａｒｂｉｔｒａｒ     

Differential display of mRNA

Differential display of mRNA (DD) is a technique in which mRNA species expressed by a cell population are reverse transcribed and then amplified by many separate polymerase chain reactions (PCR). PCR primers and conditions are chosen so that any given reaction yields a limited number of amplified cDNA fragments, permitting their visualization as discrete bands following gel electrophoresis. This robust and relatively simple procedure allows identification of genes that are differentially expressed in different cell populations. Here we review DD including some recent modifications, and compare it with other techniques for analyzing differential mRNA expression.     

应用改良的mRNA差异展示法克隆人鼻咽上皮特异性表达的cDNA片段

本文对ｍＲＮＡ差异展示法进行了改良．利用一组随机引物与来源于ｍＲＮＡ翻译起始位点区域的引物组合进行ＲＴ－ＰＣＲ,使差异展示的片段来源于蛋白编码区,并对差异展示的条件进行了优化．应用此法对人鼻咽上皮与软腭口腔粘膜上皮的基因表达进行了比较研究,得到了１０个在鼻咽上皮特异表达的ｃＤＮＡ片段,并对其中的５个片段进行了亚克隆和序列分析．通过与ＧｅｎｅＢａｎｋ数据库中的序列进行同源性比较,确定其中两个片段为未知新序列,Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交证实其中一个片段ＮＥＳ１为鼻咽上皮特异性表达片段．     

利用mRNA差别显示技术分离盐胁迫下红树植物白骨壤耐盐相关cDNA

从福建龙海红树林自然保护区采集白骨壤的隐胎生果实 ,在实验室分别置于 0‰盐度海水和 50‰盐度海水进行沙培。分别取叶片 ,提取纯化RNA。通过锚定引物OligodT₁₂ GC反转录和 8个 10核苷酸随机引物进行PCR扩增 ,经 8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后发现了 3个差异DNA片段只在高盐培养条件的白骨壤基因组中表达 ,而在无盐培养条件中没有出现。这 3个差异cDNA片段分别命名为csrg1(600bp)、csrg2(550bp)、csrg3(480bp)。3个差异cDNA片段的RNA杂交结果显示 ,只有csrg1片段存在明显差异 高盐中有杂交斑点 ,无盐中无杂交斑点 ;而其余 2个片段在高盐和无盐条件下都没有杂交斑点出现。从而表明csrg1就是耐盐相关cDNA。进一步将csrg1片段克隆 ,并进行DNA序列分析。全序列在GenBank中查询后 ,未发现相关同源片段。耐盐相关cDNA片段的获得 ,将为分离全长耐盐基因 ,搞清该基因表达调控的机理提供条件.     

六种回收纯化差异显示PCR产物方法的比较

目的:建立mRNA差异显示PCR产物回收纯化方法。方法:采用了6种方法对干旱东亚砂藓mRNA差异显示技术的特异PCR产物进行分离回收纯化。结果:6种不同回收方法,显示不同的结果。结论:冻融法简单、方便、经济、有效,对东亚砂藓构建的mRNA差异显示技术中特异条带进行回收,具有有效性和可靠性。