RNA序列测定始末

一、历史的回顾 生物大分子的序列分析,即一级结构的测定,是分子生物学的核心问题,许多科学家为之呕心沥血奋斗终生,取得了巨大成就。 1963年著名的英国科学家Sanger和Thompson揭开了生物大分子序列分析的帷幕,成功的测出了胰岛素51个氨基酸的顺序,获得了1968年诺贝尔奖。1965年Holley等用经典法测定了酵母tRNA~(Ala)的75个核苷酸的全序列。同年Sanger又创造了测定RNA的指纹图谱法,但DNA序列测定的研究工作进展缓慢。     

测定RNA序列的化学裂解直读法

1979年Peattie在Maxam和Gilbert的DNA化学裂解序列测定直读法的基础上,建立了RNA的化学裂解直读法。该法利用几种不同化学试剂,在~(32)P末端标记的RNA链上进行碱基特异性的、限制性的修饰。经苯胺作用后,RNA分子在修饰部位断裂。凝胶电泳分离和放射自显影后,可以从G.A>G、C>U和U四组区带上直接读出RNA的序列。该法快速、微量、不需特殊酶试剂。不受被测RNA二级结构影响,因而比较准确,现已逐     

一种新型反义RNA技术:RNA错折叠

反义RNA技术的发现对现代医疗技术的发展有着重要的作用,常规的反义RNA技术是设计出与靶RNA互补的寡核苷酸,通过它与靶RNA结合来干扰转录或翻译过程,使蛋白质不能被表达出来。目前,一项新的技术——寡核苷酸导向的RNA错折叠将反义RNA技术进一步简化,从另一个角度丰富了反义RNA技术。     

一种改进的沙蒿总RNA的提取方法

介绍了一种适用于沙蒿总RNA提取的方法。此方法有效地克服了沙蒿中富含的多糖类物质———沙蒿胶对总RNA提取的干扰。运用此方法所提取的RNA纯度高 ,完整性较好 ,可满足多数分子生物学实验的需要。     

一种家兔呼吸频率直读装置

在生理和药理的动物实验中,常常以呼吸频率的改变为指标来观察刺激或药物对呼吸的影响.呼吸频率的变化可以做为呼吸功能改变的一项重要参数.可见,快速、准确地记录呼吸     

一种优化的植物组织RNA原位杂交技术

一种优化的植物组织ＲＮＡ原位杂交技术①陈绍荣毕学知吕应堂杨弘远（武汉大学生命科学学院,武汉４３００７２）ＡＯｐｔｉｍｉｚｅｄｉｎＳｉｔｕＲＮＡＨｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎＴｅｃｈｎｉｑｕｅｉｎＰｌａｎｔＴｉｓｕｅｓＣＨＥＮＳｈａｏｒｏｎｇＢＩＸｕｅｚｈ...     

一种有效的花粉线粒体RNA分离技术

线粒体有自己的基因组和独特的表达系统,对其研究可以了解ＲＮＡ编码及核与线粒体之间协同调控等机制,进而阐明呼吸作用、植物细胞质雄性不育等生命现象［１,２］。因此线粒体基因组结构及其表达是目前生命科学研究中一个很活跃的研究领域。由于花粉是世代交替的关键阶段,雄性不育仅表现花粉不育而其他营养器官正常,因此研究花粉线粒体基因表达显得尤为重要。花粉线粒体基因表达研究中重要的步骤之一是分离线粒体ＲＮＡ（ｍｔＲＮＡ）。目前仅见营养器官ｍｔＲ－ＮＡ［３］,而未见花粉（特别是不同发育时期的花粉）ｍｔＲＮＡ提取技术…     

环状RNA:一种基因调控RNA

环状RNA是一种通过共价结合线性RNA分子的3′端和其上游5′形成的闭合环状结构RNA,广泛存在于真核生物系统内,其结构具有稳定性,序列具有保守性,表达具有时空特异性。目前研究发现环状RNA的形成是受多个因素调控的,并可通过吸附miRNA分子,在pre-mRNA的剪切过程中与线性RNA形成竞争或促进其来源的基因表达,对基因的表达具有调控作用,同时在组织的分化发育和肿瘤、心肌肥厚、动脉粥样硬化、神经系统等多种疾病的发生发展过程中具有重要作用。     

一种含有端粒重复序列非编码RNA的发现及最新研究进展

端粒是染色体末端的特化结构,由简单呈串联线性排列的核酸重复序列及相关蛋白质组成。其核酸序列具有高度的保守性,均富含GC。在人类为TTAGGG的高度重复序列具有维持基因组完整性的作用。端粒功能异常会导致染色体失去稳定性,促进肿瘤的发生和发展。以往认为端粒附近区域不具有转录活性,但最近在Science杂志上Azzalin等首次报道了该区域可以转录一种非编码RNA,即端粒RNA(telomeric RNA)。该分子具有特殊的UUAGGG重复序列,在调控端粒长度和端粒酶活性上具有重要作用,在发育、衰老和肿瘤发生发展等研究中已成为热点。该文将对近期有关端粒RNA的研究进展予以综述。     

一种引人注目的生物工程新技术-重组RNA技术

近十余年,由于重组DNA技术的问世和应用,迅速兴起和发展的生物工程已涉足十遗传工程、细胞工程、发酵工程、酶工程、工业、农业、医学、食品、化工及能源等各个方面,取得了长足的进展,并已开始向第二代生物工程迈进,去开发应用人们曾经期望而又尚未实现的愿望。     

世纪之交的蛋白质序列测定技术

对蛋白质序列测定技术的发展过程作了简要回顾，介绍了近年在该方法学领域的主要进展，其中包括Ｎ－端顺序测定的微量化、毛细管ＨＰＬＣ与毛细管电泳的应用，新的Ｃ－端化学降解测序方法，以及快原子轰击（ＦＡＢ）、电喷雾（ＥＳＩ）和基质辅助激光解吸电离－飞行时间（ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ）质谱在蛋白质序列测定中的应用，还对世纪之交该领域的发展趋势作了扼要的展望。     

一种结合SELEX与二代测序技术筛选RNA结合蛋白特异识别序列新方法的建立

RNA结合蛋白通过特异识别RNA底物发挥重要的生物学作用。指数富集的配体系统进化(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术是一种体外筛选核酸底物的基本方法,SELEX技术通过重复多轮筛选从随机核酸序列库中筛选出特异性与靶物质高度亲和的核酸底物,本研究将利用该技术与二代高通量测序(NGS)相结合,体外合成含有20个随机碱基的RNA文库,将所要研究的蛋白构建到带有可被链亲和酶素磁珠捕获的SBP标记的载体上去,显著提高筛选效率,仅需1轮筛选即可获得所需RNA底物motif。通过该方法获得了人的hn RNP A1的UP1结构域特异识别AGG和AG二种RNA序列,并通过EMSA实验证实其可以与获得的RNA motif结合。这一方法的建立对于研究RNA结合蛋白识别底物的序列特异性,并进一步了解其在生物体内的调控机制有重要意义。     

一种从RNA Blot杂交膜上脱除探针的改进方法

目的：探讨脱除RNA Blot膜上的杂交探针的方法,解决杂交中RNA Blot膜重复使用的问题。方法：经NBT／BCIP化学显色的RNA Blot杂交膜先用二甲基甲酰胺在60℃处理90min,然后用脱探针溶液(50％去离子甲酰胺、50mmol/L Tris—HCl pH7．5、5％SDS)在80℃处理90min,经过处理的膜再次用于下一轮的杂交。结果：用这一改进的方法,可以完全脱除杂交膜上的地高辛标记的cDNA探针,RNA Blot膜可以重复杂交5轮以上,杂交带仍然保持清晰锐利。结论：该改进方法操作简便,能有效地脱除杂交膜上的地高辛标记的cDNA探针。     

一种用于基因芯片可靠的RNA线性扩增技术

基因芯片是大规模表达谱分析的有力工具 ,有助于阐明疾病发生的分子机制及发现新的诊治靶标。但常规方法需要大量RNA ,每张芯片需要 5 0～ 2 0 0 μg总RNA ,2～ 5 μgmRNA。许多珍贵难得样本都不能满足这一要求 ,成为限制芯片广泛应用的瓶颈。结合模板转移效应 ,优化了基于T7的RNA线性扩增技术 ,可从 3μg以下总RNA得到足量的反义RNA ,克服了这一难题。同一RNA样本的自身比较试验结果显示反义RNA标记的芯片与总RNA、mRNA标记的芯片假阳性率相似。同一对RNA样本的表达谱分析也显示反义RNA标记的芯片与总RNA、mRNA标记的芯片无明显差异。     

女贞的一种小分子闭环RNA

女贞(Ligustrum Cornpactum)叶片的核酸提取物,经聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE),出现两条低分子量的核酸带,DNase 1及RNase A处理证实两条核酸带均为RNA,初步测得迁移率较小的RNA的分子量约为0.7×10~5道尔顿,5＇末端标记,双相及双方向PAGE分析证实,该RNA是存在于女贞叶片细胞内的一种小分子闭环RNA(简称psc RNA),不同离子强度下的RNase A处理揭示,psc RNA分子内有大量碱基互补结构,从点杂交结果推断psc RNA的一级结构中,不含绝大多数闭环类病毒RNA所共同具有的中心保守区段,在本实验的条件下pscRNA不能感染爪哇三七,女贞叶片汁液和按照提取,纯化病毒粒子的程序制备的溶液。在电镜下均没有观察到病毒颗粒,结果表明,女贞叶片细胞中存在一种无蛋白质外壳包被的、具有次量分子内碱基互辅结构的共价闭合环状RNA分子,在其它两种植物中,亦初步检测到此类闭环RNA分子,讨论了此种闭环RNA分子的意义。     

一种改进的图象模糊增强技术

本文简要地讨论了传统模糊增强算法的原理,并详细讨论了这种算法所存在的缺陷。针对传统模糊增强算法的缺陷,本文提出了一种改进的模糊增强算法。实验证明,改进的的算法在图象的处理质量上得到了提高。     

用一种改进的电泳方法测定抗冻蛋白的分子量

针对抗冻蛋白分子量较小的特点,该文采用了一种改进的Ｔｒｉｃｉｎｅ－ＳＤＳ－ＰＡＧＥ法测定其分子量。采用三层胶系统并在电极缓冲液中以Ｔｒｉｃｉｎｅ代替Ｇｌｙｃｉｎｅ。