分支系统学简介

分支系统学简介史立群分支系统学（Ｃｌａｄｉｓｔｉｃｓ）（也有人译为分支分类学、支序学等等）,是推测生物体之间相互关系的一种特殊方法。象其他方法一样,它有着一套自身的假设、程式和局限性。它于１９５０年由德国昆虫学家和分类学家Ｗ．Ｈｅｎｎｉｇ首次提出并兴...     

分支系统学简介

分支系统学简介樊晋江（浙江省医学科学院寄生虫病研究所杭州３１００１３），关键词分支系统学，分支分类，系统发育１９５０年诞生的分支系统学，现在已经发展成为探索生物系统发育的有效工具之一。分支系统学与现代计算机技术的结合形成了新的分支学科─—数值分支系统...     

分支系统学简介

分支系统学是本世纪70年代以来发展起来的一个新的系统学派。本文扼要地介绍了分支系统学的创立、历史和发展,分支系统学的基本概念、特征分析法以及分支系统学的广泛应用给现代生物系统学所带来的广泛影响和冲击。     

分支系统学简介

分支系统学是本世纪70年代以来发展起来的一个新的系统学派。本文扼要地介绍了分支系统学的创立、历史和发展,分支系统学的基本概念、特征分析法以及分支系统学的广泛应用给现代生物系统学所带来广泛影响和冲击。     

双星藻科的分支系统学研究

双星藻科是1933年由Smith建立的,隶属于绿藻门(Chlorophyta),接合藻纲(Conjugatophyceae),双星藻目(Zygenematales)。此科包含的属的多少,依不同观点而有不同。饶钦止认为应该包含下列11属,即1)双星藻属(Zygnema),2)拟双星藻属(Zygnemopsis),3)膝接藻属(Zygogonium),4)转板藻属(Mongeotia),5)拟转板藻属(Mongeotiopsis),6)单极藻属(DebaFya),7)切胞藻属(Temnogametum),8)水绵属(spirogyra),9)链枝藻属(Sirocladium),10)双盘藻属(Pleurodiscus),11)链膝藻属(Sirogonium).       

中鲤亚属的分支系统学分析

基于外部形态特征和内部骨骼特征对鲤科鲤属中鲤亚属进行了分支系统学分析,内群包括中鲤亚属的全部5种和鲤亚属的2种鱼类,外群采用乌原鲤。在鲤属鱼类和外群间共有48个性状存在变化。系统发育分析采用PAUP^*软件的Parsimony和Bootstrap两种方式的Branch-and-Bound算法,排除不能极化的特征和特有离征之后,还有28个特征可用,由这28个特征可得到唯一的系统树,树长69,一致性系数0.7246,排除无用特征的一致性系数0.6122,保留系数0.6346。由5种中鲤组成的中鲤亚属明显不构成一个单系群。结果表明：中鲤亚属是一个复系群,该类元应该被撤销。     

分支系统学与中国北部寒武纪高肌虫分类探讨

古生物学者在进行化石生物分类时,常以形态总体相似性或者某几个甚至某一个所谓的“主要性状”为分类依据。由此而产生的分类系统就常常不可避免地引起争议甚至产生错误。这是分类学者自觉或不自觉受到数值系统学(Numerical systematics)和进化系统学(Evolutionary systematics)影响的结果。究其原因,主要是由于不少分类学者对于生物分类的目的往往可能理解不全,或者即使完全了解也未予足够重视(当然,这与化石性状的局限性亦有一定关系)。许多分类学者可能以为,生物的分类就是同类相合,异类相分,如同图书馆的检索一样。其目的主要在于方便应用。然     

基于广义形态学性状对木通科的分支系统学分析

基于43个广义的形态学性状,对木通科进行了分支系统学分析。经过简约性分析,得到了68个同等简约的分支树。50％多数规则一致树的分支结构与以前建立的族划分系统基本一致。外类群大血藤属与木通科的勃奎拉藤属形成姐妹群,与以前的分支分析结果一致,但在分子系统发育树中,大血藤属却是整个木通科的姐妹群;除此之外,形态分支树的结构与分子树的结构差别不大,但一致性指数、保持性指数和各分支内部支持率均较低。单型的猫儿屎族和串果藤族位于分支树的基部,拉氏藤族与木通族是姐妹群,在木通族内,长萼木通属和木通属是姐妹群,作为一个分支;另一分支是PHS（牛藤果属、八月瓜属和野木瓜属）复合群,牛藤果属位于八月瓜属和野木瓜属各类群的基部。但八月瓜属和野木瓜属的属内系统发育关系仍有待进一步研究。     

运用分支系统学方法对逆珊瑚亚科的修订

运用分支系统学方法，考察有可能归入Ａｎｔｉｐｈｙｌｌｉｎａｅ亚科的各属。根据个体发育极向标准对选取的７个性状进行分析，这７个性状为：主隔壁的长短，主内沟的形状和大小，对隔壁的长短和加厚程度，侧隔壁的长度，一级隔壁的排列，一级隔壁从轴部退缩程度，轴部构造等。据以上各性状在每个属中的表现编制出性状极向数据矩阵，输入计算机运算，得到分支图。并得到以下结果：ＡｎｔｉｐｈｙｌｌｉｎａｅＩｌｉｎａ应包括下列１０属：ＡｃｔｉｎｏｐｈｒｅｎｔｉｓＩｖａｎｏｗｓｋｉ，１９６７；ＦａｌｓｉａｍｐｌｅｘｕｓＦｅｄｏｒｏｗｓｋｉ，１９８７；ＬｏｎｇｉｃｌａｖａＥａｓｔｏｎ，１９６２；ＬｙｔｖｏｌａｓｍａＳｏｓｈｋｉｎａ，１９２５：ＮｅｏｚａｐｈｒｅｎｌｉｓＧｒｏｖｅ，１９３５；ＭｏｎｏｐｈｙｌｌｕｍＦｏｍｉｃｈｅｖ，１９５３：ＦａｓｃｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌｕｍＴｈｏｍｓｏｎ．１８８３：ＢｒａｄｙｐｈｙｌｌｕｍＧｒａｂａｕ．１９２８：ＲｏｔｉｐｈｙｌｌｕｍＨｕｄｓｏｎ，１９４２；ＣｌａｖｉｐｈｙｌｌｕｍＨｕｄｓｏｎ，１９４２。     

柳属的分支系统学分析

基于61个广义的形态学性状,以杨属为外类群对柳属进行了分支系统学分析.经简约性分析,得到了21个同等简约的分支树,其严格一致树支持柳属为一个自然的分类群,但不支持将钻天柳属和心叶柳属从柳属中划分出去独立成属,也不支持对柳属进行属级水平上的细分,后两个结果得到孢粉学和分子系统学研究的支持.柳亚属为一个单系分支,皱纹柳亚属和黄花柳亚属也形成了一个单系分支.根据本研究的结果,建议将柳属划分为钻天柳亚属、柳亚属及黄花柳亚属3个亚属.由于较低的靴带支持率,其系统发育关系难于探讨.鉴于分支分析的一致性指数、保持性指数、各分支内部的支持率均不高,柳属的属下分类系统的划分有待进一步的研究.     

分支系统学评述

本文论述了分支分类学说的主要内容及有关问题。全文包括7方面的内容：(1)分支分类学说 的哲学原理为波普尔的证伪主义科学哲学;(2)分支分析的三个基本原则是近裔共性原则、严格单系 原则及简约性原则;(3)分支分析的工作步骤包括：单系类群的确立、性状分析、分支分析运算、分支图与分类系统的建立及分支图与性状再分析;(4)本文讨论厂分支分类学派、表型分类学派与演化 分类学派;(5)由于板块构造理论及分支分析的兴起,生物地理学发生了重大变化,出现了传统的演化生物地理学、系统发育生物地理学及替代生物地理学争鸣的局面;(6)由于杂交导致性状矛盾,因 此可以由分支分析识别杂种;(7)由科学理论的三条标准来看,分支系统学属于严格意义的科学理论。     

分支系统学当前的理论和方法概述及华东地区山胡椒属十二个种的分支系统学研究

本文概述了当前分支系统学研究中涉及的主要理论和方法,包括性状的选取、性状状态和极性的确定、数据矩阵的分析计算、结果分支图的处理、分支图可靠性的评价及分支图的应用。本文同时以华东地区樟科山胡椒属Linderal2个种的分支系统学研究为例,讨论了用形态性状进行分支系统学研究中可能遇到的问题,也揭示了一些分支系统学与传统的系统学在应用性状推导进化关系上的不同点。对这12个种的分支系统学研究得出了一些不同于传统系统学方法所推测的山胡椒属内的系统发育关系,如分支系统学研究显示山胡椒组和球果组很近缘。在严格一致性分支图上,杯托组的黑壳楠和江浙山胡椒分别位于最原始和最进化的分支,表明这个组是复系类群。分支图也显示山胡椒组可能是复系类群。     

分支系统学的外群分析方法中外群性状状态确定的探讨

分支系统学(cladistics)在生物系统学(“分类学”)中已得到广泛的应用,它引起了整个生物系统学理论和方法的巨大变革,且在不断的运用中,其理论和力法得到不断的发展和完善。 Hennig在1953年研究昆虫系统发育的文章中,仍没有讨论性状极性(character polarity)的确定方法,虽然他已明确地认识到单系(monophyly)的确定只能依据离征(apomorphy),只有基于离征建立的系统关系才是真正的系统发育关系(phylogeny)。那么正确地判定祖征(plesiomorphy)和离征就是一个至关重要的问题,也即关系到正确地判定性状极向的问题。极向判定错误,必然导致系统发育关系分析的错误。     

化石记录的再评估

分子生物学和分支系统学的发展以及化石记录自身的局限性使得古生物地层资料在生物演化研究中的地位遭到质疑。连续的化石记录的发现肯定了化石分析的意义,数据库的建立与定量分析方法的应用为古生物学的研究增添了新生力量。     

广义飞蛾藤属(旋花科)的分支系统学分析

基于33个广义的形态学性状,对广义飞蛾藤属Porana s．l．进行了分支系统学分析。经过简约性分析,得到了10个同等简约的分支树。10个同等简约树的严格一致化树表明,广义飞蛾藤属是一较为自然的分类群。与广义飞蛾藤属的孢粉学、种皮微形态学研究结果一致,分支分析的结果不支持将广义飞蛾藤属拆分为4个或5个独立的属,应在属内划分分类等级。在整个形态分支树中广义飞蛾藤属4个亚属呈并列2个分支,其中飞蛾藤亚属(subg．Porana)和白花叶亚属(subg．Poranopsis)形成姐妹群构成一分支,三翅藤亚属(subg．Tridynamia)和棒状亚属(subg．Dinetus)以姐妹群的关系构成另一支。鉴于分支分析的Bootstrap支持率不高,广义飞蛾藤属范畴的最后界定和属内等级的划分仍有待于进一步研究。     

分支系统学当前的理论和方法概述及华东地区山胡椒属十二个种的…

本概述了当前分支系统学研究中涉及的主要理论和方法,包括性状的选取、性状状态和极性的确定、数据矩阵的分析计算、结果分支图的处理、分支图可靠性的评价及分支图的应用。本同时以华东地区樟科山胡椒属Ｌｉｎｄｅｒａ１２个种的分支系统学研究为例,讨论了用形态性状进行分支系统学研究中可能遇到的问题,也揭示了一些分支系统学与传统的系统学在应用性状推导进化关系上的不同点。对这１２个种的分支系统学研究得出了一些不同     

分支系统学和种系发生种

简要评述进化系统学和分支系统学的物种概念问题。介绍了关系物种问题研究的一些新进展,特别是种系发生种概念和种系发生种的划定方法－居群聚合分析和分支单型聚合。     

中值淘汰分支分析法的应用研究

中值淘汰分支分析法的应用研究周志钦（西南农业大学园艺系,重庆６３０７１６）ＳＴＵＤＹＯＮＴＨＥＡＰＰＬＩＣＡＴＩＯＮＯＦＴＨＥＭＥＤＩＡＮＥＬＩＭＩＮＡＴＩＯＮＳＥＲＩＥＳＺｈｏｕＺｈｉ－ｑｉｎ（ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＨｏｒｔｉｃｕｌｔｕｅ,Ｓｏｕ...     

裸藻类植物的分支系统学研究

本文选取了裸藻类的33个属级分类单位,以及它们的35个性状,利用分支系统学的原理和方法,对性状的演化极性进行了分析,同时对性状间的极性关系进行了和谐性分析,使性状间极性关系处在较为合理的状态,然后建立了分支分析的数据矩阵。应用徐克学建立的“演化极端结合法”进行微机运算．得简约系数远小于1(o．2159)的分支谱系图。根据分支诺系图对裸藻类的系统发育关系进行了探讨,井与已有的关于裸藻类分类系统和演化假设进行了比较。在此基础上按照裸藻类的亲缘关系及单系原则,对裸藻类的分类等级进行了划分,初步提出了建立1门1纲5目的分类系统。按照在分支谱系中的演化地位,认为裸藻属的5个亚属,明显地都应是独立的属。同时对裸藻类的共生起源与演化的关系也进行了讨论。     

铁线莲属尾叶铁线莲组(毛茛科)基于形态学证据的分支系统学

选取铁线莲属（Clematis）尾叶铁线莲组（sect．Campanella）中37个种以及西南铁线莲组（sect．Bebaeanthera）中的2个种为内类群，以Clematis altemata作为外类群，通过对全世界10个标本馆的近2000份腊叶标本的形态学特征统计，选取了35个性状进行编码，利用PAUP 4．0 beta 10软件进行系统发育重建。通过最简约法（maximum parsimony）分析共得到182棵最简约分支树，树长为182步，一致性指数（CI）=0．385，保持性指数（RI）=0．685。结果表明：（1）尾叶铁线莲组并非是一个单系类群：（2）以花序发生位置这一性状建立的sect．Bebaeanthera不能成立，应并入尾叶铁线莲组：（3）本研究结果不支持在尾叶铁线莲组中建立subsect．Henryianae或ser．Henryianae；（4）C．ranunculoides等萼片外面具纵翅的一群植物与本组中萼片红色的种类C．lasiandra和C．dasyandra有较近的亲缘关系：（5）C．otophora、C．pogonandra、C．repens和C．barbellata等几个种聚为一支，且支持率很高，它们具有一系列的共衍征，即萼片质地较厚，花丝扁平，宽条形，被短柔毛，花药被黄色短毛，药隔先端凸起，因此不支持建立Ser．Pogonandrae；（6）本组中非洲分布的2个种无论从形态上还是从地理分布和生境上都十分特殊，是本组植物的特化类群。