SARS-CoV-2（新冠病毒）变异流行株命名系统

SARS-CoV-2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2),又称“新型冠状病毒”或“新冠病毒”,正不断进化和变异,产生了大量的病毒变异株（Variant）,其致病性、宿主适应性和传播性变化显著,给COVID-19(Coronavirus disease-19),又称“新型冠状病毒肺炎”或“新冠肺炎”的防治带来巨大挑战。变异株的命名对COVID-19的分子流行病学调查和防控技术研究起到关键性的辨识作用。本文综述了GISAID、Nextstrain、Pango、TILE和希腊字母5种SARS-CoV-2变异株的命名原则、适用范围和重要的流行变异株,为SARS-CoV-2变异株的监测、研究SARS-CoV-2变异株的进化机制、传播特性及抗原位点设计提供一定的参考。     

新型冠状病毒肺炎并发神经系统疾病的研究现状及进展

新型冠状病毒肺炎(简称"新冠肺炎")是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)感染引起的一种新的高传染性疾病,目前已引发全球大流行。虽然由SARS-CoV-2引起的新冠肺炎主要作用于呼吸系统,但对神经系统亦可造成侵犯,表现出嗜神经性。重要的是,神经系统的受累可能与患者预后不良和疾病恶化有关。然而,这些SARS-CoV-2神经侵袭性的病理生理学机制尚不清楚,因此探索SARS-CoV-2感染对神经系统的影响意义重大,本文对SARS-CoV-2感染引起神经系统并发症和神经系统损伤的可能机制进行综述,以利于新冠肺炎患者的早期识别、干预以及促进患者的康复。     

“长新冠”的多系统症状及机制研究进展

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)及其变异毒株引发的疫情给全球的公共卫生安全带来了极大的挑战。尽管现阶段各国已进入后疫情时代,但目前面临的新的危机是SARS-CoV-2感染后给患者造成的长期影响,主要表现为呼吸、神经、精神、心血管和消化等系统的症状,部分患者的症状包括并发症可持续数月甚至数年,被称之为长新冠(long COVID)或后COVID-19综合征。在未来数年,这些症状可能会显著地影响患者的生活质量,增加社会医疗保健成本,给家庭和社会造成巨大负担。因此研究新型冠状病毒肺炎患者在恢复期的长期健康状况及其动态变化规律至关重要。     

SARS-COV-2感染引发人神经系统功能异常及其潜在机制的研究进展

严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2, SARS-CoV-2)的大流行已对全球人类健康造成了前所未有的巨大影响,其所引起的新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019, COVID-19)表现出多器官系统受累的特征,包括外周神经系统和中枢神经系统。新近的研究显示,SARS-CoV-2感染引起神经系统症状的人数正在迅速增加,包括无症状或轻症感染者,令人担忧的是所出现的神经系统症状可能持续半年甚至更久。虽然SARS-COV-2感染引发的神经系统病症的机制尚不十分清楚,但已发现一些病毒可能侵袭中枢神经系统的潜在途径。现就SARS-CoV-2感染引发的人神经系统功能异常、疾病及病毒可能侵袭中枢神经系统的潜在途径及机制作一概述,对COVID-19相关神经系统并发症的早期发现或预防提供了新思路。     

SARS-CoV-2引发缺血性脑卒中的机制研究进展

新型冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2）目前仍在全球肆虐传播，在引发2019新冠肺炎（Corona virus disease 2019,COVID-19）的同时，还能造成感染者中枢神经系统的损伤。缺血性脑卒中是COVID-19相关神经系统损伤常见病之一。本文归纳出SARS-CoV-2进入中枢的途径，以及该病毒是如何通过介导氧化应激反应、肾素-血管紧张素系统的失调、攻击血管内皮细胞、激活NLRP3炎症小体、释放中性粒细胞胞外陷阱、引发细胞因子风暴等一系列分子机制导致缺血性脑卒中的发病，以期为疾病的临床预防和治疗提供一些新的见解和思路。     

关于新型冠状病毒动物宿主和动物感染的研究进展

新型冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）是一种全新的病毒,是继严重急性呼吸综合征冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus, SARS-CoV）和中东呼吸综合征冠状病毒（Middle East Respiratory Syndrome Syndrome Coronavirus, MERS-CoV）之后引起人类大范围感染的第三种冠状病毒。目前不少研究提示SARS-CoV-2可能来源于动物,动物在疫情的发生与传播过程中起着重要作用。这篇综述总结了目前关于SARS-CoV-2动物宿主和动物易感性的最新研究进展。现有研究提示,SARS-CoV-2很可能起源于蝙蝠,穿山甲是中间宿主。恒河猴,水貂、白尾鹿,动物园里的老虎、狮子,以及宠物猫、狗等动物可能在暴露后发生SARS-CoV-2感染,此外实验室动物感染实验也证明了一些动物对SARS-CoV-2易感,提示下一步需要加强对动物宿主中的SARS-CoV-2监测,为病毒溯源、变异进化规律与传播机制分析...     

阿尔茨海默病嗅觉障碍研究进展

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)患者在出现认知功能障碍之前,普遍表现出嗅觉相关功能障碍,而且嗅觉系统病变程度与AD进展密切相关。因此,嗅觉系统功能障碍可能成为早期诊断AD及评价其进展的指标。近几年通过对AD患者和AD转基因动物模型的研究发现,嗅觉系统可能是AD退行性病变的始发部位,而且具有从外周向中枢发展的趋势,即病变首先发生于嗅觉系统的近外周部分(嗅上皮、嗅球等),然后发展至嗅皮层(梨状皮层、内嗅皮层等),进而累及海马和新皮层区等。此外,AD病理改变的这种时空模式与嗅觉相关行为障碍、神经通路及递质的改变等具有很高的相关性。重点综述了以上方面的研究结果。     

2019冠状病毒病对肺外系统的影响及可能机制探讨

2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)导致的感染性疾病。SARS-CoV-2感染人体后除作用于肺部的SARS-CoV-2功能受体外,还可以作用于心脏、消化道、肝脏、肾脏、中枢系统的SARS-CoV-2功能受体,引起肺外脏器的损伤,诱发多器官功能衰竭,增加COVID-19的病死率。但目前对SARS-CoV-2引起肺外各脏器损伤的具体作用机制还不是很清楚,需要更多临床和实验室数据支持。通过检索COVID-19相关的文献,对SARS-CoV-2导致的肺外系统影响及其可能作用机制作一综述。     

严重急性呼吸综合征冠状病毒2环境稳定性的研究进展

2019冠状病毒病疫情席卷全球,其病原体严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)主要通过呼吸道飞沫以及密切接触(直接或间接接触)传播。接触病毒污染物体导致感染的风险也受到了广泛关注。本文对SARS-CoV-2在环境中稳定性的相关研究进行了综述。对SARS-CoV-2不同变异毒株的环境稳定性研究发现,在室温和常规湿度条件下,不同毒株在环境中的存活时间均与病毒滴度有关,低滴度(<10^4.0 TCID₅₀)病毒可在不同材料表面存活1～3d,高滴度(>10^5.0TCID₅₀)病毒可存活3～7d。各种毒株在低温条件下均更加稳定。此外,研究未发现不同毒株对消毒剂的敏感性存在差异,醇基消毒剂、含氯消毒剂、表面活性剂等均能有效灭活SARS-CoV-2的不同变异株。当面临可能被病毒污染的环境时,应注意做好个人防护和手卫生,及时对环境表面进行消毒灭菌,以降低感染的风险。     

严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2感染/疫苗接种引起的免疫印记

先前发生的病毒感染或疫苗接种引起的免疫应答,强烈影响机体对该病毒后续暴露的免疫应答,这种现象被称为免疫印记。免疫印记也可出现在感染严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)或接种SARS-CoV-2疫苗的个体。发生了免疫印记的个体对再次遇到的完全相同的SARS-CoV-2毒株发动更强的免疫反应,而对新暴露的SARS-CoV-2变异株仅能发动微弱的免疫反应。免疫印记是SARS-CoV-2变异株在以前感染SARS-CoV-2或接种SARS-CoV-2疫苗的人群形成突破感染的一个不可忽略的原因。克服免疫印记是研制能预防未来SARS-CoV-2突变株感染的SARS-CoV-2疫苗的迫切任务。     

Visualizing in deceased COVID-19 patients how SARS-CoV-2 attacks the respiratory and olfactory mucosae but spares the olfactory bulb

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Stimulation of olfactory receptors alters regulation of [Cai] in olfactory neurons of the catfish (Ictalurus punctatus)

Summary Intracellular calcium was measured in single olfactory neurons from the channel catfish (Icatalurus punctatus) using the fluorescent Ca²⁺ indicator fura 2. In 5% of the cells, olfactory stimuli (amino acids) elicited an influx of calcium through the plasma membrane which led to a rapid transient increase in intracellular calcium concentration. Amino acids did not induce release of calcium from internal stores in these cells. Some cells responded specifically to one stimulus (l-alanine,l-arginine,l-norleucine andl-glutamate) while one cell responded to all stimuli. An increase in intracellular calcium could also be elicited in 50% of the cells by direct G-protein stimulation using aluminum fluoride. Because the fraction of cells which respond to direct G-protein stimulation is substantially larger than the fraction of cells responding to amino acids, we tested for possible damage of receptor proteins due to exposure of the olfactory neurons to papain during cell isolation. We find that pretreatment with papain does not alter specific binding ofl-alanine andl-arginine to olfactory receptor sites in isolated olfactory cilia. The results are discussed in terms of their relevance to olfactory transduction.     

新型冠状病毒抗原快速检测研发现状及展望*

新型冠状病毒肺炎疫情的全球大流行,对全球公共健康、社会和经济运转造成了重大影响。在药物研发迟滞及疫苗有效性未得到充分验证的情况下,对人群进行大规模的快速筛查,寻找潜在的感染者(尤其是轻症和无症状患者),并进行集中隔离,切断传播途径和保护易感人群是首要的任务。因此对于SARS-CoV-2感染,早期诊断尤为重要。总结现有市场上的新冠病毒抗原快速检测产品,对全球抗原快速检测市场进行分析,概述其研发的动向并展望了我国在新冠抗原检测新方法、新技术方面的自主创新能力。     

Anatomical barriers against SARS-CoV-2 neuroinvasion at vulnerable interfaces visualized in deceased COVID-19 patients

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Structural basis of SARS-CoV-2 and its variants binding to intermediate horseshoe bat ACE2

Coronavirus disease 2019 (COVID-19), caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), has caused a global pandemic. Intermediate horseshoe bats (Rhinolophus affinis) are hosts of RaTG13, the second most phylogenetically related viruses to SARS-CoV-2. We report the binding between intermediate horseshoe bat ACE2 (bACE2-Ra) and SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD), supporting the pseudotyped SARS-CoV-2 viral infection. A 3.3 Å resolution crystal structure of the bACE2-Ra/SARS-CoV-2 RBD complex was determined. The interaction networks of Patch 1 showed differences in R34 and E35 of bACE2-Ra compared to hACE2 and big-eared horseshoe bat ACE2 (bACE2-Rm). The E35K substitution, existing in other species, significantly enhanced the binding affinity owing to its electrostatic attraction with E484 of SARS-CoV-2 RBD. Furthermore, bACE2-Ra showed extensive support for the SARS-CoV-2 variants. These results broaden our knowledge of the ACE2/RBD interaction mechanism and emphasize the importance of continued surveillance of intermediate horseshoe bats to prevent spillover risk.     

Humoral Immunity against SARS-CoV-2 and the Impact on COVID-19 Pathogenesis

It has been more than a year since severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) first emerged. Many studies have provided insights into the various aspects of the immune response in coronavirus disease 2019 (COVID-19). Especially for antibody treatment and vaccine development, humoral immunity to SARS-CoV-2 has been studied extensively, though there is still much that is unknown and controversial. Here, we introduce key discoveries on the humoral immune responses in COVID-19, including the immune dynamics of antibody responses and correlations with disease severity, neutralizing antibodies and their cross-reactivity, how long the antibody and memory B-cell responses last, aberrant autoreactive antibodies generated in COVID-19 patients, and the efficacy of currently available therapeutic antibodies and vaccines against circulating SARS-CoV-2 variants, and highlight gaps in the current knowledge.     

Vaccine protection against the SARS-CoV-2 Omicron variant in macaques

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The One Hour COVID Test: A Rapid Colorimetric Reverse-Transcription LAMP–Based COVID-19 Test Requiring Minimal Equipment

At this writing, over 100 million people have tested positive for Corona Virus Disease-19 (COVID-19), and the global death toll from this disease has reached nearly 3 million. Despite the many tests currently available, we have not yet achieved the testing capacity needed to limit the spread of the virus and mitigate suffering worldwide. We have developed the One Hour COVID Test to address this challenge. Our test leverages an easy-to-use, commercially available oral swab kit for sample collection paired with a novel RNA processing protocol and a simple colorimetric assay that requires minimal equipment. The test can be easily scaled via automation and takes 1 h from sample collection to result.