葡萄品种莎巴珍珠及其衍生品种的演化和遗传多样性分析

莎巴珍珠是极早熟葡萄品种之一,以莎巴珍珠为亲本材料,经过简单杂交或多亲多代杂交,培育了一系列早熟和无核葡萄品种;莎巴珍珠衍生品种选育的最主要途径为杂交育种,其次为芽变选种。并对莎巴珍珠衍生品种在种类、染色体倍型、果实香味、果实颜色、果实成熟期等方面的遗传多样性进行了简要分析。     

七鳃鳗遗传多样性与演化研究进展

七鳃鳗(Petromyzonidae)是目前已知最古老的脊椎动物中惟一的幸存者.对其资源保护和演化发育生物学的研究正日益受到重视.本文从染色体、蛋白质和DNA水平总结近年来七鳃鳗遗传多样性与演化方面的研究进展.重点介绍了限制性酶切片段长度多态性、DNA随机扩增多态性、DNA扩增片段长度多态性、微卫星DNA标记等技术及线粒体DNA和功能基因研究应用于七鳃鳗种群遗传多样性、遗传分化、遗传结构、种质鉴定与渔业资源管理及系统进化等方面的新进展.     

油莎豆SRAP指纹图谱构建及遗传多样性分析

利用SRAP分子标记构建了14份不同地理来源、表型具有差异的油莎豆品系的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。结果表明100对引物中共有多态性引物42对,扩增出多态性带328条,平均每对引物7.8条。28对引物在12个品系上具有特征谱带,除品系4和14外,均可用1对引物进行鉴定;采用引物组合法仅用Me2/Em6和Me8/Em11这2对引物就可将14份材料区分开,并利用这2对引物构建了上述品系的数字指纹图谱。UPGMA聚类分析表明,所有参试材料间的遗传距离在0.12～0.75之间,平均为0.42,表明我国不同地理来源的油莎豆品系遗传差异较大,具有较为丰富的遗传多样性。     

谷子地方品种和育成品种的遗传多样性研究

对河南、河北和山东等地的482份谷子地方品种和近30年培育的谷子品种的11个形态性状和农艺性状进行种植观察,研究两类品种的遗传多样性。与地方品种相比,育成品种形态性状的多样性指数大多低于地方品种,育成品种的株高比地方品种显著降低,稳重、穗粒重和出谷率等性状显著提高。地方品种的广泛变异类型是现代谷子育种的重要遗传资源。     

天津和唐山小豆地方品种遗传多样性分析

利用SSR分子标记对唐山红小豆、天津红小豆的96个品种（按品种地地理来源划分为14个品种群）进行遗传多样性分析,表明197对引物中共有89对的扩增谱带清晰稳定,共扩增出285条带,多态性条带百分率（PPB）达100%,经Popgene32软件分析,遵化品种资源的遗传多样性的水平最高[PPB=85.39%,I（信息指数）=0.567],其次为玉田和迁安的品种资源,而在天津红小豆资源中,除静海县（排位第5）外,遗传多样性水平相对较小,其中宁河的遗传多样性水平最低（PPB=22.47%,I=0.1575）。聚类分析表明,96个品种可分为三个组群,唐山红小豆组群中包含了天津静海小豆;天津红小豆中的大港品种资源单独为一组群;其它天津红小豆为第二大组群。本研究可为地方品种的保存及杂交组配提供参考。     

天津和唐山小豆地方品种遗传多样性分析

利用SSR分子标记对唐山、天津的96个红小豆品种(按品种地理来源划分为14个品种群)进行遗传多样性分析,结果表明,197对引物中共有89对的扩增谱带清晰稳定,共扩增出285条带,多态性条带百分率( PPB)达100％,经Popgene32软件分析,遵化品种资源的遗传多样性水平最高[PPB= 85.39％,I(信息指数)=0.567],其次为玉田和迁安的品种资源,而在天津红小豆资源中,除静海县(排位第5)外,遗传多样性水平相对较小,其中宁河的遗传多样性水平最低(PPB= 22.47％,I=0.1575).聚类分析表明,96个品种可分为三个组群,唐山红小豆组群中包含了天津静海小豆;天津红小豆中的大港品种资源单独为一组群;其他天津红小豆为第二大组群.本研究可为地方品种的保存及杂交组配提供参考.     

广东甘蔗品种遗传多样性的AFLP分析

采用15对多态性较好的AFLP引物对广东育成的41个甘蔗品种的遗传多样性进行分析.结果表明:每对引物的多态性位点平均为61.5,多态性位点百分率为77.40%.41个甘蔗品种间的遗传相似系数为0.5210～0.9211,平均为0.6842,遗传多样性属中等水平.聚类分析把41个品种分为2大类,在系谱中亲缘关系密切的大多数品种,如粤农81-762与粤农85-1285和粤农86-295,粤糖57-423与粤糖85-5和粤糖85-177等都能分别聚在一起.但也有例外,如粤糖83-251和粤糖83-271,都是CP72-1210×华南56-12组合的后代,但没有归为同一类.遗传多样性指数分析显示,不同年代的品种多样性指数差异明显,最高是80年代,为0.3072,最低是60年代,为0.1162;不同单位选育的品种遗传多样性指数变化不大,为0.2756～0.3061.加强新种质利用是有效提高甘蔗品种遗传多样性的重要措施.     

桂花品种资源的遗传多样性分析

根据桂花（Osmanthus fragrans）品种的形态特征,结合AFLP分子标记,对部分桂花栽培品种进行了遗传多样性分析。结果表明,桂花品种之间存在着较为丰富的遗传多样性,AFLP分子标记检测到的多态性条带占总扩增条带的57.46%。根据桂花品种的主要性状特征,利用数值分类法对其进行分类,并用UPGMA法对AFLP结果进行聚类分析,结果均显示桂林地区的桂花品种存在明显的区域性,花色可以作为重要的分类标准,同时对桂花品种的分类系统进行了探讨。     

桂花品种资源的遗传多样性分析

根据桂花(Osmanthus fragrans)品种的形态特征, 结合AFLP分子标记, 对部分桂花栽培品种进行了遗传多样性分析。结果表明, 桂花品种之间存在着较为丰富的遗传多样性, AFLP分子标记检测到的多态性条带占总扩增条带的57.46%。根据桂花品种的主要性状特征, 利用数值分类法对其进行分类, 并用UPGMA法对AFLP结果进行聚类分析, 结果均显示桂林地区的桂花品种存在明显的区域性, 花色可以作为重要的分类标准, 同时对桂花品种的分类系统进行了探讨。     

中国主要黑芝麻品种的遗传多样性分析

利用SRAP和SSR各23对引物对20个中国主要黑芝麻品种进行了遗传多样性分析。结果显示,23对SRAP引物共扩增出DNA带672条,其中多态性带152条,比率为22.62%,平均每对引物扩增总带数和多态性条带分别为29.22条和6.61条。23对SSR多态性引物共扩增出DNA带92条,每对引物扩增出3~6条,平均4.00条;每对引物扩增出多态性带1~5条,平均3.09条,多态性带比率平均为77.17%。20个黑芝麻品种间的遗传相似系数为0.8547~0.9804,遗传距离为0.0159~0.0921,遗传多样性匮乏,遗传基础狭窄。聚类结果表明,来自主产区江西的11个品种明显聚在一起,且江西黑芝麻品种的遗传相似系数高于其他省份品种,遗传距离低于其他省份品种,与其他省份品种的差异均达到极显著水平。加强资源引进和利用是拓宽中国黑芝麻品种遗传基础的迫切要求。     

分子生物学技术在轮虫遗传多样性和系统发生研究中的应用

分子生物学技术,如等位酶分析、DNA序列分析、限制性片段长度多态性、随机扩增多态、重复DNA序列多态性,在轮虫研究中的应用始于上世纪70年代,研究领域主要是轮虫群体遗传学、生物变异与多样性和系统发生与进化,被研究的轮虫种类主要集中在臂尾轮虫属、晶囊轮虫属和蛭态轮虫的一些种类。着重介绍分子生物学技术在轮虫遗传学和系统学研究中的应用,并对今后的研究热点提出了展望。     

基于SSR标记的宁夏水稻遗传多样性分析

选择自上世纪80年代以来的59份宁夏水稻种质,利用分布于12条染色体的82对SSR引物进行遗传多样性和遗传相似性分析。共检测到339个等位基因,品种间不同位点等位基因数目2~19个,平均4.13个。Nei基因多样性指数变幅为0.0333~0.9164,平均为0.4394。按种质释放或审定年代,55份水稻分为3组分析,随着年代的增加,等位基因数和遗传多样性指数均呈增大趋势,且3群体间等位基因数和多样性指数差异均达极显著水平（P<0.001）。UPGMA聚类分析表明,参试59份水稻种质在遗传相似系数0.78水平上聚为5大类,其中第Ⅰ类为1份香稻种质;第Ⅱ、Ⅳ类均为3份种质;第Ⅲ类有5份种质,与吉林水稻相似;绝大多数品种被聚为第Ⅴ类,占参试材料数的79.7％。对比宁夏水稻选育品种系谱,大多数种质具有宁夏骨干亲本红旗12、京引39、东方红2号、京引59等的血缘,种质间亲缘关系较近。虽然近年来宁夏水稻的遗传多样性有增加的趋势,但遗传基础狭窄,参试种质的相似系数在0.75以上,最高达0.97。应继续加大力度引进和创新亲本材料,拓宽宁夏水稻的遗传基础。     

不同亲和性水稻材料的同工酶遗传多样性分析

采用同工酶标记对亲籼、亲粳、广亲和及非亲和4组不同亲和性水稻材料的遗传变化和遗传结构进行分析。10种同工酶在95个材料中共检测到34个同工酶位点和55个等位基因,其中多态位点15个,多态位点百分率为44.12%。各组的平均期望杂合度在0.354到0.456之间,在物种水平上为0.454。AMOVA分析表明,80.21%的遗传变化分布于组内,19.79%的遗传变化分布于组间。各组间的遗传距离变化范围从0.1129到0.3673,基因流变化范围从1.0242到2.5451。根据遗传距离进行的UPGMA聚类分析,将广亲和与亲粳水稻聚为一类,亲籼与非亲和水稻聚为一类。     

臭柏天然居群遗传多样性及演变历史分析

为了合理有效地保育天然臭柏(Juniperus sabina L.)种质资源,追溯和阐释其分布格局的历史成因,本文对我国内蒙古自治区、陕西省、甘肃省和青海省共10个天然臭柏居群388个个体的核糖体内转录间隔区(ITS)序列片段进行测序分析。结果显示:臭柏ITS序列总长度为1089 bp,共含有25个变异位点,定义32个单倍型,其中H4和H6单倍型为共有单倍型;分子变异分析(AMOVA)显示,臭柏居群变异主要来源于居群内,遗传变异为95.04%,而居群间遗传变异仅4.96%,居群间差异水平极显著(F ST=0.0496,P<0.001);Network单倍型网络分析表明,H4和H6为古老单倍型,其他单倍型是由他们衍生而来;遗传分化系数N ST(0.072)0.05)。推测臭柏起源于第三纪中新世(Miocene)中期约12.38 Mya,在第四纪冰期可能存在多个小型避难所。沙埋产生不定根的扩繁能力和较好的有性更新环境可能是沙地居群遗传多样性高于山地居群的决定性因素。     

我国茶树主要骨干亲本及其衍生品种(系)的SSR分析

铁观音、黄棪和福鼎大白茶分别是我国乌龙茶和红绿茶育种中的骨干亲本,由他们衍生出了一系列的优良品种,研究他们的遗传多样性及构建指纹图谱将有助于今后茶树育种工作中骨干亲本的合理利用和品种权的保护。本研究利用40对SSR引物对我国乌龙茶骨干亲本铁观音、黄棪及其衍生品种(系)和红绿茶骨干亲本福鼎大白茶及衍生品种进行了研究。结果表明,34份供试品种(系)的基因多样性指数（H）为0.54,平均遗传距离0.58,表明我国茶树主要骨干亲本及其衍生品种(系)具有较高的遗传多样性水平和较大的遗传变异,且90%的遗传多样性来自品种之间的遗传差异。聚类结果表明两套品种(系)各自聚为一类,遗传结构分析也显示两套品种(系)之间存在明显的差异。利用其中5对引物组合构建了供试材料的数码指纹图谱。     

基因组学方法在玉米种质资源研究中的应用

近年来,分子生物学和植物基因组学得到了飞速发展,包括分子标记技术在内的基因组学方法在玉米种质资源研究中得到了广泛应用。本将对玉米种质资源研究的主要领域如玉米的起源和进化、遗传多样性的形成机制及评估、基于多样性的新基因发掘等方面的最新进展进行评述,并提出我国在应用基因组学方法进行玉米种质资源研究的策略。     

缢蛏种群遗传多样性的周年变异分析

利用线粒体COI标记分析了福建省宁德市漳湾镇横屿村滩涂5个月份缢蛏群体(S3,S5,S7,S9,S11)的遗传结构,以期评估不同月份时期种群的遗传多样性差异。基于线粒体COI基因的结果表明,5个缢蛏群体的平均核苷酸差异数位于2.7836-3.6894之间,核苷酸多样性指数位于0.0050-0.0066之间,遗传多样性水平大致表现为S3和S5群体较高于S7和S9群体,明显高于S11群体。AMOVA分析结果显示,群体间遗传变异量占总变异的7.18%,而群体内变异达到了92.82%,说明遗传差异主要来自于群体内部。由此可见,从3月份到11月份,缢蛏群体的遗传多样性水平呈现出下降趋势,尤其是在11月份,差异最为明显。     

Microsatellites in Zea - variability,patterns of mutations,and use for evolutionary studies

To evaluate the performance of microsatellites or simple sequence repeats (SSRs) for evolutionary studies in Zea, 46 microsatellite loci originally derived from maize were applied to diverse arrays of populations that represent all the diploid species of Zea and 101 maize inbreds. Although null phenotypes and amplification of more than two alleles per plant were observed at modest rates, no practical obstacle was encountered for applying maize microsatellites to other Zea species. Sequencing of microsatellite alleles revealed complex patterns of mutation including frequent indels in the regions flanking microsatellite repeats. In one case, all variation at a microsatellite locus came from indels in the flanking region rather than in the repeat motif. Maize microsatellites show great variability within populations and provide a reliable means to measure intraspecific variation. Phylogeographic relationships of Zea populations were successfully reconstructed with good resolution using a genetic distance based on the infinite allele model, indicating that microsatellite loci are useful in evolutionary studies in Zea. Microsatellite loci show a principal division between tropical and temperate inbred lines, and group inbreds within these two broad germplasm groups in a manner that is largely consistent with their known pedigrees. Received: 10 February 2001 / Accepted: 21 May 2001     

Natural hybridization within seed sources of shortleaf pine (Pinus echinata Mill.) and loblolly pine (Pinus taeda L.)

Shortleaf and loblolly pine trees (n = 93 and 102, respectively) from 22 seed sources of the Southwide Southern Pine Seed Source Study plantings or equivalent origin were evaluated for amplified fragment length polymorphism (AFLP) variation. These sampled trees represent shortleaf pine and loblolly pine, as they existed across their native geographic ranges before intensive forest management. Using 17 primer pairs, a total of 96 AFLPs between shortleaf pine and loblolly pine were produced and scored on the sample trees and two control-pollinated F1 interspecies hybrids and their parents. In addition, the well known isocitrate dehydrogenase (IDH) isozyme marker was scored for all trees. IDH detected two putative hybrids among the loblolly pine samples and two among the shortleaf pine samples, while either 13 or 12 putative hybrids were detected using all AFLP markers and IDH and either NewHybrids or Structure software, respectively. Results of this study show that later generation hybrids can be reliably identified using AFLP markers and confirmed that IDH is not a definitive marker for detecting hybrids; that is, at least in some seed sources, the alternative species’ IDH allele resides in the source species. Based on all the markers, hybridization frequency varied geographically, ranging from 30% in an Arkansas seed source to 0% in several other seed sources. The hybridization level was higher in populations west of the Mississippi River than in populations east of the river; the shortleaf pine hybridization rates were 16.3% and 2.4% and the loblolly pine rates were 4.5% and 3.3%, west and east of the river, respectively. The results suggest that hybridization between these two species is significant but varies by seed source and species, and the potential for the unintended creation of hybrids should be considered in forest management decisions regarding both natural and artificial regeneration.