麂属(Muntiacus)的分类及其系统发育研究

麂属(Muntiacus)是一群中小型草食有蹄类,为东洋界的特有属,是典型的热带、亚热带类群。在我国,麂属的分布仅限于长江流域及其以南各地,为我国南方的重要毛皮兽。 以往对麂属的研究多限于一般的形态分类,对其系统发育尚未深入研究。在种级分类上至今还存在一些混乱现象。本文试图用分支系统学(Cladistics)的方法,对麂属的种级分化进行系统整理,并对其系统发育作一初步探讨。     

画眉科鸟类系统发育及分类地位商榷

原记录在中国有分布的鹛类计142种,占世界鹛类纪录种总数284种的50%.由于该类群的种类繁多,形态和生态习性多样,其分类问题历来受分类学者的关注,且争议较大.本文尝试以分子生物学手段来解决传统分类中遗留的问题.在系统发育分析中共有20属59种鹛类作为内群、14个相关物种作为外群,分子标记分别采用线粒体细胞色素b(Cty 6,846 bp)和核内重组引导基因(RAG-1,870 bp),以最大似然法和贝叶斯法重建系统发育树.结果表明,画眉科鸟类明显被分为2大支系,一支由噪鹛Garrulax、希鹛Minla、薮鹛Liocichla、相思鸟Leiothrix、奇鹛Heterophasia、穗鹛Stachyris、钩嘴鹛Pomatorhinus、凤鹛Yuhina、及部分雀鹛Alcippe等属的种类构成,另一支由鸦雀属Paradoxornis和山鹛Rhopophilus pekinensis、及部分雀鹛属的种类构成,2支都有相当高的支持率;各个属之间的相互关系大致得到解决,传统分类体系中噪鹛属、雀鹛属、鸦雀属、凤鹛属、穗鹛属的单系性不能成立;证实绣眼鸟属Zosteropidae、山鹛和林莺属Sylvia鸟类的亲缘关系较近,而白腹凤鹛Yuhina.zantholeuca、鹏鹛属Pteruthius和文须雀Panurus biarmicus与鹛类的亲缘关系较远;并提出小鳞胸鹪鹛Pnoepyga pusilla有可能不是画眉科种类,其分类地位需要重新认识.     

根瘤菌的系统发育及其分类研究进展

根瘤菌与豆科植物这一共生体系的突出特点是固氮量大,抗逆能力强和为人畜提高高蛋白质营养,在农业生产及固氮生态系统中占重要地位,对根瘤菌系统发育研究作一概述并描述了1997年后正式发表的根瘤菌新属种。     

有瓣蝇类分类、系统发育及演化

有瓣蝇类(Calyptratae)隶属于昆虫纲(Insecta)四大超适应辐射类群之一的双翅目(Diptera),占双翅目已知物种多样性的近20%。有瓣蝇类分布广泛,生物学习性极为多样,在维系生态系统稳定中发挥着重要作用,是媒介、法医、传粉和天敌昆虫学研究领域的热点类群,也是探究双翅目系统演化及其成功适应辐射的关键类群。为了还原有瓣蝇类的演化历史,许多著名昆虫学者先后对该类昆虫开展过不同层面的研究。有瓣蝇类的单系性得到了普遍支持,并被分为3个总科——虱蝇总科(Hippoboscoidea)、蝇总科(Muscoidea)和狂蝇总科(Oestroidea),其中单系的狂蝇总科与多系的蝇总科聚为一支,再与虱蝇总科成为姐妹群。在科级阶元水平,蝠蝇科(Streblidae)(虱蝇总科)、花蝇科(Anthomyiidae)(蝇总科)、丽蝇科(Calliphoridae)(狂蝇总科)、邻寄蝇科(Rhinophoridae)(狂蝇总科)等类群的单系性仍有待验证,且新的科仍在不断被建立［如粉蝇科(Polleniidae)、乌鲁鲁蝇科(Ulurumyiidae)］,因此,有瓣蝇类科级系统发育关系仍不十分明晰。已有研究对虱蝇总科虱蝇科(Hippoboscidae)、蝠蝇科、蛛蝇科(Nycteribiidae),蝇总科蝇科(Muscidae)、粪蝇科(Scathophagidae),狂蝇总科麻蝇科(Sarcophagidae)、狂蝇科(Oestridae)胃蝇亚科(Gasterophilinae)的演化历史进行研究,明确了起源与扩散、寄主转移、取食策略等关键生物学习性的演化历史。但由于部分关键类群生活史信息的缺失,以及尚未有效解决的系统发育关系,有瓣蝇类演化历史仍有许多待解之谜。本文综述了有瓣蝇类分类、系统发育及演化研究进展,是在系统学研究进入系统发育基因组学时代后对该类群相关研究进展的首次全面总结。     

中国鸟类的DNA分类及系统发育研究概述

鸟类分类是鸟类学其他研究领域的基础,近年来分子技术的发展,以及计算机技术的应用为鸟类分类学和鸟类系统演化研究提供了新的研究手段,给传统的系统分类研究带来了新的机遇.Tautz等于2002年首先提出运用DNA序列作为生物分类系统的主要平台,即DNA分类学(DNA Taxonomy).而Hebert等于2003年则首次提出了DNA条形码(DNA Barcoding)的概念,并对其物种分类和鉴定意义予以肯定,建议利用线粒体细胞色素C氧化酶亚单位Ⅰ(COI)的特定区段来做DNA条形编码的基础.在鸟类DNA分类方面,国内学者应用线粒体基因Cut b,COI,c-mos,c-myc,12s rRNA,16s rRNA,ND2,ND3,CR,RAG-1以及核基因myoglobin introⅡ等不同片段对很多类群进行了分类探讨和系统发育研究.但是主要集中在鸡形目及雀形目鸟类.中国是鸟类多样性极其丰富的国家,近年来很多亚种、种及以上分类阶元依然存在问题,因此,中国鸟类物种的分类地位、系统发育与演化关系等依然有很多问题等待深入研究.目前国内基于COI的鸟类分类及系统发育研究有了一些报道,但是真正的DNA条形码工作尚需继续、深入地开展.     

车轮虫分类与系统发育研究进展

车轮虫属一大类寄生性纤毛虫原生动物,可不同程度地给宿主造成危害,故对其研究既具有理论意义,又具有经济价值。文中简单回顾了车轮虫的分类研究和系统发育研究的历史。在分类学研究领域方面,全面介绍了目前车轮虫科已发现属的寄生部位和地理分布等;而系统发育研究领域方面,则介绍了车轮虫研究在萌芽期、探索期和发展期这三个时期的进展,包括形态学和分子生物学两方面的研究内容。并对该领域今后应进行的研究提出了建议。     

桦木科植物的系统发育和地理分布

本文对桦木科植物的研究历史作了详细的总结。在钻研文献的基础上,补充了部分系统学资料,使得花序、花、芬粉、叶表皮等各类性状能够在属间进行比较。根据外类群比较、和谐性分析等原则确定了性的演化极性,利用最大同步法和最小平行演化法对桦木科植物进行了分支分析。对各属的现代分布和地史分布作了描述,在此基础上,讨论了桦木科植物的分布中心、起源地、起源的时间和散布途径。作者试图回到遥远的晚白垩纪和早第三纪,从描绘     

纤毛虫分子系统发育学的研究进展

在回顾纤毛虫分子系统发育学产生发展历史的基础上,介绍了随着20年中RFLP、RAPD和DNA序列分析等分子生物学技术作为该学科的主要研究方法在种群遗传多样性与进化、种上阶元系统发育学两方面取得的研究成果和近期研究进展,最后在探讨纤毛虫分子系统发育学存在的一些问题和解决方法的同时,预测了纤毛虫分子系统发育学今后将极大地推动真核生物的起源与进化,内共生等重要生物进化问题的研究。     

介绍系统发育分析计算机程序HENNIG86（1.5版）

Hennig86(1.5版)是一个适用于MS-DOS、IBM-PC及其各类兼容机的全交互式系统发育分析程序。该程序由著名的支序分类学理论家 James S. Farris博士编写,1988年正式问世。与现有的其它几个系统发育分析程序包如PHYLIP、PAUP等相比,Hennig86 具有体积小(49K),容量大,功能齐全,操     

我国晚白垩世恐龙与现代爬行类及鸟类骨组织的比较研究

报道了我国山西北部晚白垩世蜥臀目巨龙科的一种大型恐龙和鸟臀目甲龙科的一种小型恐龙的骨组织结构特征,以及这两种恐龙的骨组织与现代鸟类和现代爬行类的典型骨组织比较研究的结果。通过对两种恐龙的腿骨、肢骨近端部、肋骨、椎骨微观结构的观察,获得了对这些恐龙骨组织基本结构特征的认识。通过对这两种恐龙的腿骨组织与现代爬行类湾鳄（Crocodylusporosus）和非洲鸵鸟（Struthiocamelus）的腿骨组织进行的直观比较和应用计算机图象分析技术及统计方法进行的比较研究,获得如下的结果：（1）两种恐龙的骨组织和现代爬行类的典型骨组织之间有显著差异;（2）两种恐龙的长骨组织具有快速后生生长特点,因而比较接近现代鸟类骨组织的生长模式;（3）两种恐龙、非洲鸵鸟和湾鳄的腿骨组织的血管分布密度有统计学的显著差异,恐龙的骨组织血管密度介于非洲鸵鸟和湾鳄之间。     

核基因在鸟类分子系统发育学研究中的应用

核基因作为一种新的遗传标记,近年来被广泛应用于鸟类分子系统发育研究中.核基因与线粒体基因位于不同的遗传载体上,因此被引入到系统发育学研究中为物种树的重建提供独立的证据.常用的外显子标记为重组激活基因1(RAG-1),重组激活基因2(RAG-2),癌基因c-myc,原癌基因c-mos,它们由于缓慢的进化速率而被用于鸟类高级分类阶元的系统学研究中.常用的内含子标记是β纤维蛋白原基因内含子7(β-fibrinogen intron7,β-fibint7),肌红蛋白基因内含子Ⅱ(myoglobin intionⅡ).内含子标记通常与线粒体序列联合使用,形成具有互补系统发育信号的数据集,应用于各种分类阶元的系统学研究中.     

MOLECULAR PHYLOGENETICS AND THE DINOFLAGELLATE CHLOROPLAST

Delwiche, C. F., and Bachvaroff, T. R. Cell Biology and Molecular Genetics, University of Maryland - College Park MD 20742-5815 USA The chloroplasts of dinoflagellates have been among the last chloroplasts to be studied with molecular phylogenetic methods. DNA sequences from peridinin-containing chloroplasts are now available, and have begun to be examined with molecular phylogenetic methods. The high rate of sequence evolution in these genes increases noise and makes analyses difficult. We have evaluated phylogenetic signal in several dinoflagellate chloroplast genes using parametric bootstrapping and other methods. Although some aspects of the tree topologies found in phylogenetic analyses of dinoflagellate chloroplast genes are clearly artifactual, there are some features that seem to reflect genuine phylogenetic information. We find support for the concept of monophyletic chromophyte chloroplasts, but contradictory information concerning the relationships among the host cells that contain these plastids. The best hope for determining the evolutionary history of chromophytic plastids lies in the analysis of nuclear-encoded, chloroplast expressed genes.     

血雉分类地位和遗传分化的探讨

长期以来对血雉Ithaginis应划归雉类还是鹑类和是多型属还是单型属一直存在着争议.在此对3个亚种,西藏亚种Ithaginis cruentus tibetanus,甘肃亚种I.c.berezawskii和四川亚种I.c.geoffroyii的6个个体的血雉与典型的雉类雉属Phasiamus、锦鸡属Chrysolophus、长尾雉属Syrmaticus及典型的鹑类石鸡属Alectoris、鹌鹑属Coturnix和雪鸡属Tetraogallus的线粒体DNA细胞色素6的部分基因序列比较,系统进化树中血雉与雉类聚在一起.根据血雉地理分布,多亚种中心理论,区域地理历史,环境演变和分子钟指示的时间,血雉可能于早上新世起源于横断山脉.3个亚种之间序列差异为4.1%-7.2%,与雉科其它属的种问差异度比较,其遗传分化已达到种的水平,与形态差异相吻合.     

MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION OF SEXUAL DICHROMATISM AMONG POPULATIONS OF THE YARROW'S SPINY LIZARD (SCELOPORUS JARROVII)

Understanding evolution of geographic variation in sexually dimorphic traits is critical for understanding the role that sexual selection may play in speciation. We performed a phylogenetic analysis of geographic variation in sexual dichromatism in the Yarrow's spiny lizard (Sceloporus jarrovii), a taxon that exhibits remarkable diversity in male coloration among populations (e.g., black, red, green, yellow, blue, brown). An mtDNA phylogeny based on approximately 880 bp from the 12S ribosomal RNA gene and 890 bp from the ND4 gene was reconstructed for 30 populations of S. jarrovii and eight other species of the torquatus species group using maximum-likelihood and parsimony methods. The phylogeny suggests that S. jarrovii consists of at least five evolutionary species, none of which are sister taxa. Although intraspecific diversity in male coloration is less than indicated by previous taxonomy, two species formerly referred to as S. jarrovii exhibit impressive geographic variation in sexual dichromatism. In one of these species, the phylogeny shows the independent evolution of a distinctive blue color morph in different parts of the species range. This pattern suggests that sexual selection may lead to striking phenotypic divergence among conspecific populations and striking convergence. Results also demonstrate the importance of a phylogenetic perspective in studies of evolutionary processes within nominal species and the problematic nature of “polytypic” species recognized under the biological species concept.     

THE CYTOLOGY AND PHYLOGENETICS OF THE DIPLOID SPECIES OF GOSSYPIUM

Meiotic chromosome behavior of 11 inter-genomic hybrids of Gossypium (2n = 26) were investigated. Per cell univalent frequencies at meiotic metaphase I in these hybrids were: A genome × Cgenome—G. herbaceum × sturtianum, 10.53; G. herbaceum × australe, 18.05. A genome × E genome—G. smnalense × arboreum, 21.82. B genome × C genome—G. anomalum × sturtianum, 9.23; G. anomalum × australe, 13.11. B genome × D genome—G. anomalum × klotzschianum, 17.45; G. anomalum × raimondii, 18.83. C genome × D genome—G. robinsonii × davidsonii, 12.77; G. sturtianum (armourianum × thurberi), 8.63. C genome × E genome—G. somalense × australe, 23.78; G. somalense × bickii, 25.58. Trivalent and quadrivalent frequencies were relatively high for those hybrids involving a C genome species, indicating that a reciprocal translocation differentiates the C genome from the A, B, D, and E genomes. The results of this study and the data of similar studies cited from the literature on Gossypium cytogenetics are discussed relative to the phylogenetics and evolution of the major (genome) groups of Gossypium and their constituent taxa.     

广西现代植物分类学研究的发展

广西现代植物分类学研究历史可以区分为３个时期。第一个时期是欧洲、美洲人研究广西植物分类时期。第２个时期开始于２０世纪２０年代,是中国植物学家研究广西植物分类时期。第３个时期是建国以后。在这一时期中,广西植物分类学家在我国兄弟所和同行支持下,做了大量研究工作,包括发表了许多在农、林、医药等方面有重要价值的新种,研究了广西植物区系,出版了广西植物志第一卷等书。有些广西植物学家还参加中国植物志的编著,描述了若干个科的植物。     

STUDIES ON THE LIFE CYCLE AND TAXONOMY OF LIGNIERA VERRUCOSA

Miller , Charles E. (A. and M. College of Texas, College Station.) Studies on the life cycle and taxonomy of Ligniera verrucosa. Amer. Jour. Bot. 46(10): 725–729. Illus. 1959.—A study of the roots of Veronica persica Poir. and V. hederaefolia L. plants infected with Sorosphaera veronicae Schroeter revealed intracellular cystosori and zoosporangial sori of Ligniera verrucosa. The zoosporangial phase of this species has been heretofore unknown. The plasmodia of L. verrucosa occur in root hairs, and other epidermal and sub-epidermal cells of the roots. Zoosporangial and cystosoral plasmodia are indistinguishable until cleavage has started. It is thought that plasmodia produced during early infection develop into zoosporangia, while those produced later develop into resting spores. Zoospores discharged from zoosporangia may reinfect host cells developing there into zoosporangial or cystosoral plasmodia. No evidence for any sexual process was observed. The spherical zoosporangia making up a single zoosporangial sorus may be interconnected; a single discharge pore may serve to liberate zoospores from different zoosporangia. In the Plasmodiophorales the classical basis for generic distinction has been the arrangement of the resting spores in the sorus. Ligniera, because of the supposedly uncharacteristic nature of its cystosori, has been suggested as a host-variety of Sorosphaera. A comparative study of the cystosori and zoosporangia of Ligniera and Sorosphaera growing in a single host has led to the conclusion that these genera should be considered distinct.     

中国新石器时代居民体质类型及其承继关系

运用数理统计方法把我国新石器时代居民分为华南、华北两大类群,其中华北类群又可分为三个小类群。在人类发展过程中,南、北两群间及华北各类群间都发生过血缘混杂的过程。运用数理统计方法也可把我国旧石器晚期人类——山顶洞人和柳江人在体质特征上与我国新石器时代各组居民明显地区别开来。山顶洞人和柳江人分别代表我国旧石器晚期南北两个不同的地方类型。我国新石器时代居民的所谓澳大利亚—尼格罗人种或南亚人种特点可以追溯到我国旧石器时代晚期人类——柳江人、山顶洞人,这些特点是我国新石器时代组人类固有的特点,只不过在不同的类群中表现有所差异而已。