新疆阿勒泰冷水鱼屎肠球菌耐药性及耐药机理研究

对分离自新疆阿勒泰冷水鱼的屎肠球菌进行耐药性、耐药基因和毒力因子分析从而对冷水鱼的安全性进行评估。采用纸片法检测屎肠球菌对12种抗生素的敏感性及PCR检测相关耐药基因、毒力因子分布。13株分离自冷水鱼肠道的屎肠球菌对12种抗生素均未表现出耐药性,但是有11株对环丙沙星表现中介(中度敏感),2株对链霉素表现中介(中度敏感)。13株屎肠球菌都携带环丙沙星耐药基因gyrA,其中有2株同时携带环丙沙星耐药基因parC。13株屎肠球菌中有1株菌携带四环素耐药基因tetK基因,1株菌仅携带tetL基因,4株同时携带tetM和tetL基因。13株屎肠球菌对毒力因子的检测结果均呈阴性。新疆冷水鱼肠道屎肠球菌的耐药及毒力因子的分析显示冷水鱼的消费对消费者并无安全隐患。     

不同分离源粪肠球菌的毒力基因比较

【背景】粪肠球菌作为一种重要的乳酸菌在食品和医药领域应用广泛。由于很多粪肠球菌为条件致病菌,因此充分了解粪肠球菌基因组中毒力基因(Virulence genes)的携带情况对合理利用该菌种有重要的意义,但目前还没有研究专门报道不同分离源粪肠球菌基因组中毒力基因的携带情况。【目的】了解不同分离源粪肠球菌毒力基因的携带情况,评估分离自自然发酵乳制品中的粪肠球菌的安全性。【方法】利用比较基因组学方法确定107株分离自乳源、血液、尿液、粪便和水源中的粪肠球菌携带毒力基因情况,使用主成分分析比较不同分离源菌株毒力基因的差异,通过卡方检验筛查出环境特异性毒力基因。【结果】在107株粪肠球菌基因组共找到88种编码不同功能蛋白的毒力基因,其中与粘附相关的毒力基因最多。同时发现乳源分离株与其他环境分离株所携带的毒力基因没有显著差异。【结论】乳源分离株中携带的毒力基因与其他环境分离株无显著差异,表明分离自自然发酵乳制品中的粪肠球菌可能同样存在致病风险,因此在食品工业中使用粪肠球菌时一定要对菌株的安全性做全面的评估。     

基于全基因组关联分析研究粪肠球菌发酵食品分离株的耐药性

【目的】研究15株分离自自然发酵食品的粪肠球菌(Enterococcus faecalis)和1株粪肠球菌模式株对15种(1种β-内酰胺类和14种非β-内酰胺类)抗生素的耐药性,并通过菌株耐药表型与基因型的关联分析找到粪肠球菌潜在的耐药基因。【方法】利用微量肉汤稀释法检测试验菌株对15种抗生素的耐药性,运用Scoary软件进行表型与基因型的关联分析。【结果】16株粪肠球菌对卡那霉素、万古霉素、利奈唑胺和红霉素100%敏感;对其余11种抗生素均表现出不同程度的耐药,其中对克林霉素为100%耐药。基因组关联分析发现了9个功能基因与5种抗生素(氯霉素、环丙沙星、甲氧苄啶、新霉素和四环素)存在显著相关关系,其中基因FAM000296和FAM005768与氯霉素、甲氧苄啶和环丙沙星的耐药性有关。进一步分析发现基因FAM000296和FAM005768同被注释为Sec G,但基因FAM005768与基因FAM000296相比在3′端丢失了21个碱基。【结论】分离自自然发酵食品的粪肠球菌对多种抗生素具有耐药性,其基因组中携带有潜在的耐药基因。因此,对分离自自然发酵食品的粪肠球菌需要进行全面的安全性评估后方可考虑应用。     

粪肠球菌对泰利霉素药物敏感性与 耐药基因erm的分布

目的了解粪肠球菌对泰利霉素和其他常用抗菌药物的耐药性,以及泰利霉素耐药与红霉素耐药相关基因ermA、ermB、ermC之间的关系。方法对本院2010-2016年从各种临床标本收集鉴定的320株粪肠球菌,用微量肉汤稀释法测定这些菌株对泰利霉素及8种临床常用抗菌药物的最小抑菌浓度,并用PCR法检测耐药基因ermA、ermB、ermC的分布。结果320株粪肠球菌对泰利霉素中介耐药26株,耐药138株,耐药率达51.3%;对红霉素耐药率达95.6%,泰利霉素抗粪肠球菌效果优于红霉素。对利奈唑胺、万古霉素、呋喃妥因和氨苄西林耐药率分别为15.6%、0.6%、2.2%和0.6%。共10株(3.1%)携带ermA基因,207株(64.7%)携带ermB基因,对泰利霉素中介组中有23株ermB基因阳性,耐药组有131株ermB基因阳性,仅1株(0.3%)ermC基因阳性,该菌同时携带ermB基因。结论粪肠球菌对泰利霉素已有较高耐药率。粪肠球菌对泰利霉素MIC值改变与ermB基因密切相关,与ermA、ermC基因无明显相关性。     

一株牛源都柏林沙门氏菌的全基因组测序及毒力与耐药性分析

【背景】沙门氏菌(Salmonella spp.)是重要的人畜共患病原菌,其毒力和耐药性的不断增强引起广泛关注。【目的】了解从通辽市一犊牛死亡病例中所分离牛源都柏林沙门氏菌的毒力及耐药性情况。【方法】以病死犊牛肺脏为材料,经细菌分离纯化及16S rRNA基因测序,鉴定病原为沙门氏菌。采用动物试验、药敏试验和PCR方法对分离菌进行毒力、耐药性,以及毒力基因和耐药基因检测,并对其进行全基因组测序分析。【结果】分离菌具有较强毒力,对小鼠半数致死量为2.8×10⁶ CFU/mL。分离菌为多重耐药菌,仅对多粘菌素B和噻孢霉素敏感,对强力霉素和恩诺沙星中度敏感。检测13种沙门氏菌常见毒力基因,检出率为92.3%。对分离菌进行全基因组测序分析,该菌株为都柏林沙门氏菌,基因组大小为4 965 370 bp,GC含量为52.12%,同时携带2个质粒,大小分别为79 524 bp (pTLS-1)和45 301 bp (pTLS-2)。分离菌中共携带996个毒力基因和24个毒力岛;共携带42个耐药基因,其中4个为可水平转移基因,基因组中存在9个可移动遗传元件,包括插入序列和转座子等。【结论】分离牛源都柏林沙门氏菌菌株具有较强毒力且为多重耐药株,携带大量毒力基因及耐药基因。     

重庆市1264株粪肠球菌和屎肠球菌耐药性监测

【摘 要】 目的 了解2011年中国重庆市主要7所教学医院临床分离粪肠球菌和屎肠球菌对各类抗菌药物的耐药性。方法 重庆市主要7所教学医院(6所综合性医院,1所儿童医院)按统一方案、采用统一的材料、方法和判断标准(CLSI 2011年版)进行粪肠球菌和屎肠球菌的耐药性监测。数据用WHONET 5.5软件按照CLSI 2011年版折点进行分析。结果 共分离到非重复粪肠球菌589株、屎肠球菌675株,对利奈唑胺、万古霉素、替考拉宁仍极敏感,耐药率<2%,万古霉素耐药粪肠球菌和屎肠球菌检出率分别为0.3%、0.7%。粪肠球菌对青霉素、氨苄西林、呋喃妥因的耐药率较低,分别为14.8%、8.6%和5.1%,对高浓度庆大霉素的耐药率分别为46.9%;屎肠球菌耐药性明显高于粪肠球菌,对青霉素和氨苄西林耐药率接都在90％左右。儿童和成人耐药率存在一定差别。结论 本市医院肠球菌感染以屎肠球菌为主, 粪肠球菌次之,两者耐药性明显不同, 监测其耐药情况对指导临床用药具有重要意义。     

60株胆汁病原菌耐药性分析

目的了解胆道感染患者胆汁中病原菌种类及耐药情况,指导胆道外科合理应用抗菌药物。方法对永康市第一人民医院2004年3月至2007年3月间胆道手术患者胆汁分离的60株细菌种类和耐药性进行回顾性分析。结果60株细菌中革兰阴性（G^-）菌12种34株,占56.67%,主要以大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌为主,革兰阳性（G^＋）菌7种26株,占43.33%,主要以粪肠球菌和屎肠球菌为主。G^-菌对亚胺培南和氨基糖苷类的耐药性较低,G^＋菌对万古霉素的耐药率最低。结论胆道感染以G^-菌为主,推荐阿米卡星用于治疗胆道细菌感染。     

一株猪葡萄球菌的分离鉴定、生物学特性研究及全基因组测序分析

【背景】2021年6月,广东省茂名市某散养户送检了一头发病仔猪,猪身上长有脓疱,四肢关节肿大,关节内可见脓液。【目的】确定引起仔猪发病的病原菌,分析其药物敏感性,为临床用药提供指导;对分离菌株进行全基因组序列分析,挖掘其毒力因子和耐药基因,揭示该菌致病和耐药的分子机制。【方法】取关节脓液分离细菌;通过革兰氏染色、16S rRNA基因和全基因组测序分析,鉴定细菌种类;通过溶血试验、血浆凝固酶试验和生长曲线测定,确定分离菌株的溶血活性、血浆凝固酶活性和生长特性;用小鼠感染模型评估分离菌株的致病性;用纸片扩散法测定分离菌株的药物敏感性;通过全基因组序列分析挖掘分离菌株的毒力因子和耐药基因。【结果】分离菌株被鉴定为猪葡萄球菌(Staphylococcus hyicus);该菌不溶血,无血浆凝固酶活性,在胰蛋白胨大豆肉汤培养基中于37℃、120r/min条件下生长良好;小鼠感染试验结果显示,该菌具有高致病性;药敏试验结果显示,该菌对苯唑西林、大观霉素等7种药物敏感,对青霉素G、红霉素等9种药物耐药;全基因组序列分析结果显示,该菌携带多个毒力因子和耐药基因。【结论】从发病仔猪的关节脓液中分离到一株猪葡萄球菌,可用苯唑西林、大观霉素等药物防控该菌感染;解析了该菌的基因组信息,为后续深入研究该菌致病和耐药的分子机制奠定了基础。     

尿路感染相关病原菌的分布及耐药性分析

目的调查尿路感染病原菌的分布和耐药特点,为临床的抗感染治疗提供依据。方法收集2013年至2015年荆州市中心医院门诊和住院患者中,尿路感染患者送检的尿培养和血培养标本中检出的病原菌,采用Vitek2 Compact全自动微生物检测仪进行细菌鉴定,采用纸片扩散法和仪器法分别对革兰阴性杆菌和革兰阳性球菌进行药敏试验,药敏结果的判断依照CLSI M100-S24标准。数据分析采用WHONET5.6和SPSS 19.0软件,统计分析采用x~2检验。结果从尿路感染患者送检的标本中共检出各类非重复病原菌2 306株,其中门诊患者中检出19种100株,住院患者检出56种2 206株。导致尿路感染最多的两种病原菌为大肠埃希菌和粪肠球菌,分别检出1 241株和232株。导致尿脓毒血症最多的两种病原菌为大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌,分别检出36株和10株。大肠埃希菌产ESBL.s率达67.9%,其对多种抗菌药物的耐药性均高于60.0%。粪肠球菌对大多数抗菌药物的耐药性均高于50.0%,仅对呋喃妥因和高浓度链霉素的耐药性较低,分别为12.0%和38.7%;未检出对万古霉素、利奈唑胺和替加环素耐药的粪肠球菌。结论导致尿路感染的病原菌种类繁多,大肠埃希菌和粪肠球菌是主要病原菌,其耐药情况严重;为保证治疗的有效性,临床医生应注重相关病原学和药敏检查结果。     

老年脑梗死并发尿道感染患者病原菌分布及耐药性分析

目的:分析老年脑梗死并发尿道感染的病原菌分布及其耐药性。方法:选取2014年9月-2016年9月于我院治疗的240例老年脑梗死并发尿道感染患者为研究对象,收集患者中段尿标本进行细菌分离培养鉴定,分析病原菌分布情况并测定其耐药性。结果:共检出160株病原菌,其中革兰阴性菌108株,占67.50%,革兰阳性菌43株,占26.88%,真菌9株,占5.63%,前五位病原菌分别为大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、溶血性葡萄球菌及粪肠球菌。在主要革兰阴性菌中,大肠埃希菌对头孢曲松耐药率最高(69.81%),对亚胺培南最敏感(3.77%);铜绿假单胞菌对环氧沙星耐药率最高(88.24%),对头孢曲松、头孢唑啉、头孢他啶、阿米卡星、哌拉西林、亚胺培南最敏感,耐药率均为0.00%;肺炎克雷伯菌对头孢唑林耐药率最高(75.00%),对呋喃妥因最敏感(6.25%)。在主要革兰阳性菌中,金黄色葡萄球菌对红霉素耐药率最高(85.71%);肠球菌属(粪肠球菌及屎肠球菌)对氨苄西林耐药率最高(70.00%);凝固酶阴性葡萄球菌(溶血性葡萄球菌及表皮葡萄球菌)对头孢曲松耐药率最高(93.75%);主要革兰阳性菌对万古霉素、利奈唑胺最敏感,耐药率均为0.00%。结论:老年脑梗死并发尿道感染病原菌种类多,应根据耐药性结果合理选用抗生素。     

Recent advances in the study of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus replication and pathogenesis

It has now been over twenty years since a novel herpesviral genome was identified in Kaposi's sarcoma biopsies. Since then, the cumulative research effort by molecular biologists, virologists, clinicians, and epidemiologists alike has led to the extensive characterization of this tumor virus, Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus(KSHV; also known as human herpesvirus 8(HHV-8)), and its associated diseases. Here we review the current knowledge of KSHV biology and pathogenesis, with a particular emphasis on new and exciting advances in the field of epigenetics. We also discuss the development and practicality of various cell culture and animal model systems to study KSHV replication and pathogenesis.     

The structure, reproduction and taxonomy of Vidalia and Osmundaria (Rhodophyta, Rhodomelaceae)

Comprises species occurring mostly in subtidal habitats in tropical, subtropical and warm-temperate areas of the world. An analysis of the type species, V. spiralis (Sonder) Lamouroux ex J. Agardh, a species from Australia, establishes basic characters for distinguishing species in the genus. These characters are (1) branching patterns of thalli, (2) flat blades that may be spiralled on their axis, (3) width of the blade, (4) primary or secondary derivation of sterile and fertile branchlets and (5) position of sterile and fertile branchlets on the thalli. Application of the latter two characters provides an important basic method for separation of species into three major groups. Osmundaria , a genus known only in southern Australia, was studied in relation to Vidalia , and its separation from the Vidalia assemblage is not accepted. Species of Vidalia therefore are transferred to the older genus name, Osmundaria. Two new species, Osmundaria papenfussii and Osmundaria oliveae are described from Natal. Confusion in the usage of the epithet, Vidalia fimbriala Brown ex Turner has been clarified, and Vidalia gregaria Falkenberg, described as an epiphyte on Osmundaria pro/ifera Lamouroux, is revealed to be young branches of the host, Osmundaria prolifera.     

New or rare chromosome counts in Artemisia L. (Asteraceae, Anthemideae) and related genera from Kazakhstan

Fifteen chromosome counts of six Artemisia taxa and one species of each of the genera Brachanthemum, Hippolytia, Kaschgaria, Lepidolopsis and Turaniphytum are reported from Kazakhstan. Three of them are new reports, two are not consistent with previous counts and the remainder are confirmations of very scarce (one to four) earlier records. All the populations studied have the same basic chromosome number, x = 9, with ploidy levels ranging from 2x to 6x. Some correlations between ploidy level, morphological characters and distribution are noted.     

肝癌中HBV和HCV基因和抗原的分布及意义

采用原位分子杂交方法检测HCV RNA及HBV X基因;采用免疫组织化学方法研究HCV核心抗原,非结构区C33c抗原及HBxAg在肝细胞肝癌中的定位及分布.结果表明(1)HCV RNA、HBV X基因在肝细胞肝癌组织检出率分别为40%(55/136)和82%(112/136).HCV RNA定位于癌细胞的胞浆内,阳性细胞呈散在、灶状及弥漫分布三种形式;HBV X基因在肝癌细胞中的分布呈胞浆型、核型及核浆型,阳性细胞也呈上述三种分布形式;(2)HCV C33c抗原、核心抗原在肝细胞肝癌中的阳性率为81%(133/164)及86%(141/164).C33c抗原定位于癌细胞及肝细胞的胞浆内;核心抗原既定位于癌细胞核中,又可定位于胞浆中.C33c抗原阳性细胞以灶状分布为主;而核心抗原阳性细     

Selection with two alleles and complete dominance

For a plant selection model with frequency-independent viabilities, fertilities and selfing rates, it is shown that apart from global fixation, for certain parameter combinations a protected polymorphism and facultative fixation (either allele may become fixed according to initial frequencies) may both occur. Facultative fixation requires different selling rates for the dominant and recessive type. Protection of the polymorphism requires resource allocation for male and female function. In this connection the problem of purely genetically caused population extinction is discussed.
For general frequency dependence and regular segregation, the chances for establishment of a completely recessive gene are compared to those of a completely dominant gene. It is proven that the process of establishment of the recessive gene, despite a fitness advantage, may be considerably endangered by drift effects if random mating prevails. The recessive gene may reach the same effectivity in establishment as a dominant gene, only if the recessive homozygote mates exclusively with its own type during the period of establishment.