海洲湾强壮箭虫的生态学特征研究

根据海洲湾2006年8月—2007年11月的强壮箭虫(Sagitta crassa)调查数据,采用聚集强度指标、Iwao和Taylor模型分析了强壮箭虫的空间分布特征和丰度的时空变化。结果表明:强壮箭虫在调查海域呈聚集分布;强壮箭虫平均丰度的时空变化差异显著,空间上,中、北部海域的平均丰度高于南部海域,时间上,强壮箭虫春、冬季节的平均丰度明显高于夏、秋季节。     

莱州湾及黄河口水域鱼类群落结构的季节变化

根据2011年5月—2012年4月对莱州湾及黄河口水域9个航次的渔业底拖网调查数据,对该水域鱼类群落结构特征及其季节变化进行了初步研究。结果表明:莱州湾及黄河口水域共捕获鱼类62种,隶属于11目、34科、53属,主要由暖水种和暖温种组成,其中鲈形目种类最多(37种),其次是鲉形目(7种)和鲽形目(6种)。春季优势种包括矛尾鰕虎鱼(Chaeturichthys stigmatias)、鲱衔(Callionymus beniteguri)、短吻红舌鳎(Cynoglossus joyneri)、矛尾复鰕虎鱼(Synechogobius hasta)和方氏云鳚(Enedrias fangi),其渔获量占总渔获量的70.8%;夏季包括矛尾鰕虎鱼、斑鰶(Konosirus punctatus)、鲱衔和短吻红舌鳎,占总渔获量的68.1%;秋季包括矛尾鰕虎鱼、赤鼻棱鳀(Thrissa kammalensis)、鳀(Engraulis japonicus)、青鳞小沙丁鱼(Sardinella zunasi)、斑鰶、小黄鱼(Larimichthys polyactis)和矛尾复鰕虎鱼,占总渔获量的87.1%。平均单位时间渔获量存在显著季节变化,以秋季最高(22.63kg/h),其次是夏季(16.75kg/h),春季最低(1.29kg/h)。春季(5月)平均单位时间渔获量为0.69kg/h,为1959年、2003年、2006年和2008年春季(5月)的0.3%、0.3%、1.7%和541.2%,鱼类资源量虽有所回升,但总体呈大幅下降的趋势。鱼类种类数、丰富度指数和多样性指数夏季较高,秋季次之,春季最低,但是以渔获尾数计算的均匀度指数,夏季最大,春季最小,以渔获量计算的均匀度指数则相反,且丰富度指数和多样性指数与表层温度呈极显著相关(P0.01),丰富度指数和均匀度指数与表层盐度呈极显著相关(P0.01)。     

兴化湾浮游动物群落季节变化和水平分布

兴化湾为福建北部最大的海湾,于2006年对该海湾浮游动物群落进行了四季9个站位的调查。共检出浮游动物及幼虫124种,其中春季42种,夏季89种,秋季71种,冬季20种;分属近岸暖温、近岸暖水和广布外海3个生态类群;优势种15种,春季以水母和桡足类占优势,夏季以水母占优势,秋季以水母、桡足类和箭虫占优势,冬季则以桡足类占优势。不同季节兴化湾浮游动物生物量湿重和丰度水平分布特征变化明显,并与温度和盐度呈显著相关。聚类分析显示兴化湾浮游动物群落夏季类群和秋季类群相似度较高;各季节水平分布基本可分为湾口区和湾内区两大类群。与20世纪80年代相比,尽管本次调查浮游动物群落没有表现出显著差异,但随着电厂等大规模工程的投产,兴化湾海域生态系统健康面临着极大威胁,其环境压力需引起持续关注。     

莱州湾三疣梭子蟹的生物学特征、时空分布及环境因子的影响

根据2011年5月—2012年4月进行的9个航次(月份)的底拖网调查,研究了莱州湾水域三疣梭子蟹的生物学特征、数量分布以及环境因子的影响.结果表明: 莱州湾三疣梭子蟹生物量密度的月间排序为9月>10月>7月>8月>6月>11月>3月>5月>4月.其中1龄以下个体占绝对优势,2011年7—10月4个航次所占比例平均值为86.1%.9个航次中,三疣梭子蟹的体质量、头胸甲宽及头胸甲长的平均值均以8月最高、4月最低.7—11月,雌、雄个体肥满度均以8月最高,分别为1.030和1.023,7月最低,雌雄均为1.007;雌雄个体肥满度的性别差异不显著.除6—8月外,其他月份性比(雌/雄)均小于1.0.莱州湾三疣梭子蟹5—7月主要集中在黄河口、龙口近岸,8—9月以潍坊及龙口近海密度最高,11月至翌年4月主要集中在湾口深水区.Pearson相关分析表明,莱州湾三疣梭子蟹数量分布与表层水温、溶解氧和水深的相关性最高,其次为盐度和浮游动物密度,与浮游植物密度及其他底层渔业生物个体数的相关性最低.与1981年同期对比,2011年莱州湾三疣梭子蟹的头胸甲长显著降低.建议适当降低捕捞强度,提高捕捞规格,进一步加强三疣梭子蟹增殖基础的研究,提出更加合理的增殖放流数量,以利于三疣梭子蟹资源的可持续利用.     

强壮粗体虫的线粒体基因组及棘头虫的系统发育研究

通过长距离PCR方法,克隆了鳜（Siniperca chuatsi Basilewsky）肠道内寄生虫强壮粗体虫（Hebesoma violentum Van Cleave）线粒体基因组全长序列,共13393 bp （GenBank登录号：KC415004）,有36个基因,其中蛋白编码基因12个,核糖体基因2个,tRNA22个。所有基因均由线粒体基因组同一条链按同一个方向转录。利用该线粒体基因组和已经报道的一些轮虫纲种类的线粒体基因组序列,构建了棘头虫和轮虫的系统发育树。系统发育研究表明：包括强壮粗体虫、隐藏新棘虫Pallisentis celatus（Van Cleave）和Paratenuisentis ambiguous（Van Cleave）在内的始新棘头虫纲（Eoacanthocephala）与古棘头虫纲（Palaeacanthocephala）亲缘关系较近,聚为一枝后再与原棘头虫纲（Archiacanthocephala）聚在一起;棘头虫与双巢类轮虫（Bdelloid）亲缘关系最近,聚为一枝,然后再与单巢类轮虫（Monogonont）聚在一起,表明棘头虫和轮虫具有较近的亲缘关系。     

尚勇保护区亚洲象种群数量动态、种群结构及季节分布格局

在2006 年6 月至2007 年9 月,通过种群个体识别、社区监测网络、样线调查和村寨访问等方法对尚勇保护区亚洲象的种群动态和季节性分布格局进行研究。结果显示:目前在尚勇保护区的亚洲象种群数量约为68头;拍摄到亚洲象共计347 头次,通过个体识别方法识别出亚洲象53 头,其中幼体、青少年体、亚成体和成体数量及所占比例分别为:3 (5.66%)、11 (20.75% )、15 (28.30% )、24 (45.28% ),在成体中雄性只有两头,成年象的雌雄性比为11∶ 1,高于已知国内外的其他区域。从1992 年至2007 年10 月,至少有32 头亚洲象死亡,其中确认死于猎杀的有7 头,保护区的核心区野牛河、金宝河一带是盗猎亚洲象最严重的地区。严重的盗猎和不断减少的栖息地对当地的亚洲象种群产生了巨大的威胁,也加剧了当地的人象冲突。在雨季和旱季,亚洲象各有五个核心活动区域,食物是导致雨季和旱季分布格局不同的主要因素。     

莱州湾大型底栖动物的次级生产力

2011年对莱州湾20个站位进行了4个航次的大型底栖动物调查,共发现177种大型底栖动物,以环节动物、软体动物和节肢动物为主。使用Brey经验公式进行大型底栖动物丰度、生物量、次级生产力和P/B值的计算。结果表明:莱州湾大型底栖动物年均丰度为3057.69 ind·m-2,生物量为3.45 g·m-2(去灰干质量),次级生产力为5.60 g·m-2·a-1(去灰干质量),P/B值为1.59 a-1。相关分析表明,除生物量和丰度之外,叶绿素a含量是影响次级生产力的重要环境因子。群落组成中以个体小、生活史短、代谢快的底栖动物为主。通过估算得出,莱州湾大型底栖动物的次级生产力约为3.48×104t·a-1(去灰干质量),约1.93×105t·a-1(鲜质量)。     

温州湾天河滩涂大型底栖动物群落分布与季节变化

2003年11月至2004年8月,在温州湾天河潮间带按季节取样对大型底栖动物群落进行了研究.共发现大型底栖动物38种,隶属7门8纲23科,主要为软体动物、节肢动物和环节动物多毛类.物种获得数季节间差异不显著(F3,9=1.76,P＞0.05),但潮位间种类获得数差异极显著(F3,9=9.56,P＜0.01).潮上带、高潮带、中潮带和低潮带的密度、生物量分别为:144.50±14.24 ind./m2,58.56±13.23 g/m2;171.00±16.52ind./m2,40.57±12.60 g/m2;182.50±39.38 ind./m2,50.26±10.57 g/m2和94.00±28.88 ind./m2,16.55±7.27 g/m2.密度的季节间差异和潮位差异均不显著(F3,9=2.78和F3,9=2.14,P＞0.05),而生物量在季节和潮位间差异极显著(F3,9=16.72和F3,9=22.24,P＜0.01).Margalef物种丰富度指数和Shannon-Weiner多样性指数4季平均数表现为:中潮带＞高潮带＞低潮带＞潮上带;Pielou均匀度指数平均数表现为:低潮带＞中潮带＞高潮带＞潮上带;Simpson优势度指数平均数表现为:中潮带＜高潮带＜低潮带＜潮上带.对4季4潮带16个群落进行聚类和排序分析可以看出,中高潮带界限不明显,低潮带和潮上带的界限明显.分析表明:生境条件的不同是大型底栖动物群落组成差异的主要原因,同一站位大型底栖动物群落物种构成数各季节之间差异不显著[动物学报52(1):45-52,2006].     

青岛湾小型底栖生物周年数量分布与沉积环境

2006年6月至2007年5月对青岛湾潮间带泥沙质和沙质沉积物中的小型底栖生物及环境因子进行了周年逐月采样。研究发现, 小型底栖生物在两个底质中的数量和分布上差异极大, 泥沙质中的年平均丰度高达(4853±1292) 个/10 cm², 沙质中为(1528±569) 个/10 cm², 生物量则分别为(3186.9±1993.4) μg干重/10 cm²和(1601.5±786.2) μg干重/10 cm²。在季节相上, 小型底栖生物丰度在沙质底呈双峰模式 (高值出现在6、12月份, 低值出现在3、9月份); 泥沙质中最高值出现在6月份, 最低值出现在11月份。在0-8 cm 深沉积物中, 48%的小型底栖生物集中于0-0.5 cm 表层, 分布在0-4 cm的逾86%。共发现13个主要类群, 线虫在丰度上占绝对优势(泥沙质中为95%, 沙质中为66%), 其它较优势类群在泥沙质依次为多毛类 (2%)、甲壳类幼体 (2%) 和桡足类 (1%); 沙质底则依次为甲壳类幼体 (13%)、腹毛类 (8%) 和桡足类 (6%)。泥沙质中线虫在生物量上的贡献达58%, 而在沙质中其所占生物量 (25%) 低于腹毛类 (28%)。聚类分析表明, 泥沙质和沙质沉积环境间的相似度为87%, 生物丰度组成间的相似度为71%; BIOENV分析表明, 温度、盐度、粒度及粘土粉砂含量的组合最能解释月份和站位间的差异 (r=0.614)。结合历史资料的对比研究表明, 青岛湾近海的沙质环境状况已有明显改观, 但泥沙质的污染状况仍然堪忧, 这由小型底栖生物的高丰度值、相较耐污的线虫所占的极高比例以及线虫与桡足类丰度的高比值即可看出。     

乐清湾浮游动物的季节变动及摄食率

2002年8月、11月、2003年2月和5月,在乐清湾进行了4个航次生物、化学和水文等专业综合调查。根据采集的浮游动物样品的分析鉴定及海上现场实验结果,对浮游动物的群落组成、生物量、丰度、多样性指数的分布和季节变动及其浮游动物对浮游植物的摄食率进行研究。结果表明,乐清湾已鉴定的浮游动物有56属,75种,17类浮游幼体,主要可划分为4个生态类群,以近岸低盐类群为主,其优势种为真刺唇角水蚤Labidoceraeuchaeta、太平洋纺锤水蚤Acartiapacifica、驼背隆哲水蚤Acrocalanusgibber、中华假磷虾Pseudeuphausiasinica和百陶箭虫Sagittabedoti等,半咸水河口类群、暖水性外海种和广布种的种数相对较少。浮游动物生物量和丰度的平面分布趋势基本一致,有明显季节变化。2月份和5月份,浮游动物生物量和丰度,从湾顶向湾口呈逐渐增加趋势;8月份,生物量和丰度的分布与2月份、5月份的分布趋势不同,从湾顶向湾口,生物量和丰度逐渐降低;11月份,生物量和丰度的平面分布相对均匀。浮游动物种类多样性指数有明显的季节变化,其动态变化与浮游动物种数和丰度的变化一致。微型浮游动物对浮游植物存在摄食压力,且摄食率有季节变化,摄食率的变化在0.15~0.48d-1。     

Distribution and Seasonal Dynamics of the Abundance of Centropages abdominalis Sato and C. tenuiremis Thompson et Scott (Copepoda) in Amursky Bay, Sea of Japan

The distribution and seasonal dynamics of Centropages abdominalis and C. tenuiremis (Copepoda) in Amursky Bay (Sea of Japan) were studied from May through November 1991. C. abdominalis occurred in plankton from May through August and in November, with a peak density of more than 40000 specimens/m³ in June, at a temperature of 15–18°C. C. tenuiremis occurred from late June through November, with a maximum total density of 6900 specimens/m³ in August, at 23°C. During the observation period, the distribution of species in the bay was irregular due to the hydrological regime and sanitary conditions of water.     

The circadian conidiation rhythm inNeurospora crassa

The filamentous fungusNeurospora crassais one of the best organisms for analysing the molecular basis of the circadian rhythm observed in asexual spore formation, conidiation. Many clock mutants in which the circadian conidiation rhythm has different characteristics compared to those in the wild-type strain have been isolated since the early 1970s. With the cloning of one of these clock genes,frq, the molecular basis of the circadian clock inNeurosporahas become gradually clearer. Physiological and pharmacological studies have also contributed to our understanding of the physiological basis of the circadian clock inNeurospora. These studies strongly indicate that the circadian clock is based on or is closely related to a network of metabolic processes for cellular activities. Based on these studies, it may be possible to isolate new types of clock mutants which should contribute to a better understanding of the molecular basis of the circadian clock inNeurospora.     

Circadian and light-induced expression of luciferase in Neurospora crassa

We have constructed a plasmid vector for expressing firefly luciferase in Neurospora crassa under control of the light- and clock-regulated ccg-2 (eas) promoter. The sequence of the luciferase gene in the vector has been modified to reflect the N. crassa codon bias. Both light-induced activity and circadian activity are demonstrated. Expression of luciferase in strains carrying mutant frequency alleles shows appropriate period length alterations. These data demonstrate that luciferase is a sensitive reporter of gene expression in N. crassa. Our results also show that the modified luciferase is expressed in Aspergillus nidulans.     

Observations on the seasonal abundance ofIcerya purchasi onAcacia baileyana in Adelaide,South Australia

Population estimates of the cottony-cushion scale,Icerya purchasi Maskell were obtained from 2Acacia baileyana F. von Mueller trees in Adelaide, South Australia. Most scales were located within 50 cm of the tip of the twig (sample unit), some adults being found on thick woody branches (5 to 10 cm Ø) and on the tree trunk (>50 cm Ø). Scales were present throughout the year, mostly in very low numbers, and completed 2 annual generations i.e. from April to October and from November to April. This was confirmed by data on the duration of development from a field experiment with 12 sets of monthly cohorts.     

紫皮石斛寡糖的酶法制备及单糖组成分析

从多糖提取后的紫皮石斛（Dendrobium devonianum Paxt.）渣上分离到一株能够水解石斛多糖的菌株,为丰富寡糖食品新原料种类,对该菌株的发酵产酶活性进行分析。利用酶法制备紫皮石斛寡糖,并进行小试和中试,采用硅胶柱色谱对寡糖进行初步分离,PMP衍生化后通过HPLC分析单糖组成。结果表明,水解石斛多糖的菌株为粗糙脉孢菌（Neurospora crassa）。该菌株液态发酵至第4天酶活最高,为0.1 U/μL,最佳酶解时间为24 h,粗酶液能够耐受30%的乙醇。通过粗酶液生物转化石斛多糖的小试和中试成功制备了大量的石斛寡糖,并对各组分进行了初步分离,单糖组成分析表明其主要由甘露糖组成,并含有少量的葡萄糖或果糖。通过粗糙脉孢菌酶法制备得到的紫皮石斛寡糖主要为甘露寡糖。     

In silico mining in expressed sequences of Neurospora crassa for identification and abundance of microsatellites

In the present study, 3217 UniGene sequences of Neurospora crassa downloaded from the National Center for Biotechnology Information (NCBI) were mined for the identification of microsatellites or simple sequence repeats (SSRs). A total of 287 SSRs detected gives density of 1SSR/14.6 kb of 4187.86 kb sequences mined suggests that only 250 (7.8%) of sequences contained SSRs. Depending on the repeat units, the length of SSRs ranged from 14 to 17 bp for mono-, 14 to 48 bp for di-, 18 to 90 bp for tri-, 24 to 48 bp for tetra-, 30 for penta- and 42 to 48 bp for hexa-nucleotide repeats. Tri-nucleotide repeats were the most frequent repeat type (88.8%) followed by di-nucleotide repeats (5.9%). An attempt was also made with the help of bioinformatics approach to find out primer pairs for identified SSRs and primers were found only for 239 sequences. But, this part needs experimental validation. Annotation of SSRs containing sequences was also carried out.     

前纤维蛋白点突变对粗糙脉孢菌生长的影响及其生化机制研究

【目的】为进一步了解前纤维蛋白(profilin,PFN)在丝状真菌中的功能,本文以粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)为研究对象,进行了前纤维蛋白对其菌落生长和肌动蛋白(actin)聚合特性影响的探究。【方法】通过采用定点突变、同源重组、分生孢子过膜和PCR等技术,获得粗糙脉孢菌前纤维蛋白F78 (F78A和F78D)和V113 (V113E、V113R和V113W)的点突变体。利用平板生长法、竞争性生长管和显微镜观察检测表型变化,并结合多聚脯氨酸亲和层析纯化、荧光分光光度技术和高速共沉淀等技术分析点突变的前纤维蛋白对肌动蛋白聚合特性的影响。【结果】获得的粗糙脉孢菌前纤维蛋白点突变株F78A、F78D、V113E、V113R和V113W,与对照菌株ku70RIP相比,突变株生长均明显减慢(P<0.05),其中PFN (F78D)和PFN (V113W)的突变体在生长的12–48 h,菌落直径分别仅为对照的20.0%–75.7%和12.7%–39.2%。竞争性生长管分析表明,PFN (F78D)和PFN(V113W)突变株菌丝生长速度受到显著抑制,分生孢子形成的节律并...