cDNA3‘端代表差异显示分析

根据真核ｍＲＮＡ３’端一般含Ｐｏｌｙ（Ａ）的原理,可使用共同引物将不同的ｍＲＮＡ反转录成ｃＤＮＡ,然后设计特殊引物进行反转录ＰＣＲ,或者将限性酶切与呱转录ＰＣＲ偶联使用,均可获得对应于ｍＲＮＡ３’端的ｃＤＮＡ３’端代表扩增子。     

cDNA3′端代表差异显示分析

根据真核ｍＲＮＡ３′端一般含Ｐｏｌｙ（Ａ）的原理,可使用共同引物将不同的ｍＲＮＡ反转录成ｃＤＮＡ,然后设计特殊引物进行反转录ＰＣＲ,或者将限制性酶切与反转录ＰＣＲ偶联使用,均可获得对应于ｍＲＮＡ３′端的ｃＤＮＡ３′端代表扩增子。比较不同条件下的ｃＤ－ＮＡ３′端代表扩增子,可以获得两种或多种细胞中ｍＲＮＡ的表达差异谱,并分离、克隆差异表达的基因序列 。     

3′端非翻译区影响TNFα cDNA在大肠杆菌中的表达

采用PCR方法改变了表达构建物pRL-rhTNF中的结构,即去掉rhTNFαcDNA3＇端非翻译区序列110bp(命名为pRL-rhTNFα2),转入大肠杆菌后,观察数个阳性转化子的表达情况,并与原型pRL-rhTNFα的表达进行比较。结果表明,去掉3＇端非翻译区的pRL-rhTNFα2能稳定表达rhTNFα,其发酵及纯化产品的生物学特征均等同于原型的,且其表达量比原型的有提高,提示3＇端非翻译区序列对表达有影响。3＇端非翻译区内存在一个相似于TA的重复序列——TTTA TTA七聚体。这可能是本研究中影响TNFα表达量的原因之一。     

燕麦β-1,3-葡聚糖酶Ⅱ基因3′端cDNA的克隆及分析

实验利用3′-RACE技术进行燕麦β-1,3-葡聚糖酶Ⅱ(Oglc13Ⅱ)3′末端cDNA的快速扩增并进行序列分析。将0.01%的HgCl2诱导处理24h之后的燕麦(Avena Sativa)幼叶作为材料,利用RT-PCR技术得到Oglc13Ⅱ的部分cDNA片段,根据此片段设计一条特异性上游引物,反转录引物中的部分序列即3′sites Adaptor Primer作为下游引物,按3′RACE试剂盒(Takara)操作流程进行Oglc13Ⅱ3′末端cDNA的快速扩增,成功获取837bp的3′-RACE反应产物,通过BLAST技术,发现该片段与许多植物β-1,3-葡聚糖酶基因具有较高的相似性(50.0%~72.0%)。因此认为成功克隆了Oglc13ⅡcDNA的3′末端序列。     

黑木耳核糖体失活蛋白cDNA 3′-端的克隆与分析

为了克隆黑木耳核糖体失活蛋白cDNA 3′-端,根据随机测得的中间一段蛋白质序列设计简并引物,应用RT-PCR和3′-RACE反应方法,将得到的基因片段与质粒连接,并转化至大肠杆菌中,进行蓝白筛选,再通过琼脂糖凝胶电泳法和PCR法验证白斑,从而得到阳性重组质粒,最后克隆出该目的蛋白基因片段。结果表明,克隆出的cDNA 3′-端为330bp的开放阅读框(ORF),编码107个氨基酸和2个终止密码子。经试验证明和文献检索,克隆得到的cDNA 3′-端为一种新基因。     

两步PCR快速扩增东亚钳蝎BmKIT3 3′cDNA末端序列

对3′-RACE方法进行了修改,采用一条特异性引物和一条通用Oligo dT引物成功地克隆了东亚钳蝎BmKIT3 3′cDNA末端,与常规3′-RACE方法相比,两步PCR方法具有节约成本、节省时间、增加反应特异性等优点,尤其适用于生物活性肽基因的快速克隆和鉴定.     

百合斑驳病毒浙江分离物的基因组3′端序列分析

经RT-PCR扩增从浙江丽水的亚洲百合［Lilium cvs.(Asiatic Hybrids)］获得2个Potyvirus病毒分离物G和X的3′端cDNA片段,序列分析表明均为百合斑驳病毒（Lily mottle virus,LMoV）;将12个来源于不同地区百合与郁金香上的Potyvirus分离物进行序列同源性比较和系统进化树分析,结果表明G、X、ML61、1229、2b、MD、HZ、J这8个分离物的CP核苷酸序列同源性达85.9%～100%,在进化树中聚集成簇,归为LMoV;2b2、TM和TBV1 3个分离物同源性达91.2%～99.3%,在进化树中也单独成簇,归为郁金香碎色病毒（Tulip breaking virus,TBV）;2b3 与其它11个分离物同源性在74.4%～79.8%之间,为伦布兰特郁金香碎色病毒（Rembrandt tulip breaking virus,ReTBV）。Nib基因序列和3′UTR序列分析也表明G、X、ML61、1229、J、HZ这6个分离物之间亲缘关系较近,属于LMoV,而TM与它们的亲缘关系很远,属于TBV。LMoV分离物存在着两个群体,G和X分别处在第1群体和第2群体中,不表现地域相关性及寄主相关性。根据研究结果,将迄今世界各地侵染百合与郁金香的Potyvirus分离物归为LMoV、TBV和ReTBV 3个种。     

人αD型干扰素cDNA 3′端非编码序列对该基因在大肠杆菌中表达的影响

本文采用DNA体外重组技术,研究了人αD型干扰素cDNA 3′端非编码序列对该基因在大肠杆菌中表达的影响。发现3′端非编码序列的缺失,使得人αD型干扰素基因在大肠杆菌中的表达水平降低约87倍。这一结果提示,在进行人αD型干扰素cDNA在大肠杆菌中的表达设计时,有必要保留其3′端非编码序列。     

大麦条纹花叶病毒新疆株(BSMV-XJ)RNA_2的cDNA克隆及5′端序列分析

分离了大麦条纹花叶病毒(BSMV)新疆株基因组的3个RNA组份。以RNA2为模板,3′端互补寡核苷酸为引物,合成了第一条cDNA链和第二条cDNA链,将ds-cDNA重组在pUC9质粒中,转化大肠杆菌细胞,获得含RNA3′端的克隆,并证明所选克隆的cDNA含有新疆株几近全长的RNA2组份。对于插入片段为3.3kbp的112号克隆进行了酶谱分析,得到了与国外典型株类似的结果;用双脱氧终止法分析了相当于RNA 2 5′端250bp的cDNA酶切片段,表明与国外典型株有十分相似的一级结构。     

蝴蝶兰全长cDNA文库构建及F3′H基因克隆

以红色蝴蝶兰为材料,利用SMARTer技术构建蝴蝶兰全长cDNA文库,分析从文库中获得的EST序列,获得蝴蝶兰类黄酮3′羟化酶基因（PhF3′H）的全长,并对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR方法,研究PhF3′H基因在红色蝴蝶兰和黄色蝴蝶兰花瓣中的表达情况。结果表明:（1）从构建的蝴蝶兰文库中随机挑选24个单克隆进行测序,结果显示均含有插入片段,重组率为100.0%,其中扩增片段长度在750bp以上的克隆有22个,占91.7%。（2）获得的PhF3′H基因编码的氨基酸序列与大丽花（Dahlia pinnata,ADB₇7826.1）、毛油点草（Tricyrtis hirta,BAH₂2519.1）等多种观赏植物F3′H编码的氨基酸序列均具有较高的一致性。（3）实时荧光定量PCR检测结果显示,PhF3′H在红色蝴蝶兰中的表达量大约是黄色蝴蝶兰的19倍,说明该基因对蝴蝶兰花青素苷的积累有重要影响。该研究结果为蝴蝶兰新基因的挖掘及花色育种奠定了理论基础。     

应用A蛋白亲和层析法纯化单克隆抗体

应用Protein A亲和层析法,从采集的小鼠腹水中纯化出了抗凝血因子Ⅶ单克隆抗体,用SDS-PAGE和ELISA法分别检测了纯化后单克隆抗体的纯度及效价,结果显示,电泳为两条带,分别为免疫球蛋白G(IgG)的重链和轻链,纯化后的单克隆抗体纯度达到电泳纯,应用间接ELISA法测定腹水效价为1×10-7左右,与未纯化前无差异。结果表明,应用A蛋白亲和层析法能够得到纯度较高的单克隆抗体,适用于高纯度单克隆抗体的制备。     

用亲和层析技术分离纯化天冬氨酸酶

<正> 亲和层析技术做为现代生化实验室常用的提纯方法,具有专一性强,活力损失小,分离步骤少等优点。天冬氨酸酶是重要的酶制剂,以往见报的分离纯化工艺步骤繁琐,活力损失大。本文报道的新工艺是用聚乙二醇(PEG)/磷酸钾双水相抽提;DEAE-sophadex A-50柱层析除PEG和部分杂蛋白;环氧氯丙烷活化载体,底物作配基的亲和层析技术获得了电泳纯的天冬氨酸酶。     

疏水层析纯化人重组白细胞介素－4

应用疏水层析对大肠杆菌表达的人重组白细胞介素－４（ｒｈＩＬ－４）进行了纯化,含有ｒｈＩＬ－４的包涵体,经洗涤、变性、复性后,以Ｂｕｔｙｌ－Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ层析,得到了高纯度的ｒｈＩＬ－４．纯度达９７％;回收率为３２％;比活性为２×１０~７Ｕ／ｍｇ,讨论了ｒｈＩＬ－４疏水层析的条件,并对不同的方法纯化白细胞介素－４进行了比较．     

疏水作用层析纯化脂肪酶

报道了以对β-硫酸酯己砜基苯胺（SESA）为活化剂制备疏水作用层析剂方法及其柱层析纯化脂肪酶的工艺条件。实验结果表明：活化剂对-β-硫酸酯己砜基苯胺（SESA）最适用量为1．0g／g湿纸纤维素。笨胺：丙酮比为1：4．以0．2mol／L磷酸缓冲液（pH8.0）=1mol／LNaCl为淋洗剂,以0．2mol／L磷酸缓冲液（pH8．0）＋8％吐温80为洗脱刘纯化脂肪酶具有较好的分辨率,酶活回收率64．0％,比活提高6．70倍。     

离子交换法提取茶氨酸的研究

本研究应用国产７３２阳离子交换树脂,从茶愈伤组织浸提液中提取茶氨酸。通过静态、动态试验,对洗脱液的ｐＨ、离子强度、样液浓度和流速等因素进行了考察,比较在不同条件下,树脂对茶氨酸的吸附情况。结果表明用ｐＨ９．１８,２／１５ｍｏｌ／ＬＮａ２ＨＰＯ４作洗脱液,控制流速在０．７ＢＶ／ｈ,可分离到茶氨酸,得率７０％。     

Purification of Adenine Phosphoribosyltransferase by Affinity Chromatography

The purine salvage pathway enzyme adenine phosphoribosyltransferase (AMP: pyrophosphate phosphoribosyltransferase EC 2.42.7) has been purified to greater than 85% homogeneity from crude rat liver 100,000 × g supernatant in one step by affinity chromatography. The enzyme binds to an AMP-agarose column and is eluted off the column by 1 mM 5-phosphori-bosyl pyrophosphate with a 50 to 80% recovery. Enzyme kinetics indicate that the mechanism of the specific elution is due to competition of the product AMP and substrate 5-phosphoribosyl pyrophosphate for the same site on the enzyme.     

Purification of NADH-Nitrate Reductase by Affinity Chromatography

Assimilatory nitrate reductase (NADH: nitrate oxidoreductase, EC 1.6.6.1) from Chlorella vulgaris has been purified to electrophoretic homogeneity with an overall yield of 60% by a procedure that utilizes blue dextran-agarose as an affinity column. Nitrate reductase binds to blue dextran and is not eluted in the presence of high ionic strength buffer but is rapidly eluted in the presence of μmolar concentrations of NADH.     

腺苷转运体亲和层析分离

本文合成了一种腺苷亲和层析凝胶,并采用亲和层析法从牛脑细胞膜上分离出了几种膜上结合的腺苷结合蛋白质。这些蛋白质在ＳＤＳ－ＰＡＧＥ电泳凝胶上为单一或主要的蛋白带,分子量分别为６４ｋｄ,４５ｋｄ,３５ｋｄ。腺苷转运体抑制剂潘生丁和ＮＢＭＰＲ对６４ｋｄ蛋白与＾３ｈ－腺苷的结合抑制作用远强于腺苷受体的激动剂ＮＥＣＡ和Ｒ－ＰＩＡ;这表明６４ｋｄ蛋白为牛脑细胞膜上结合的腺苷转运体。     

Ochratoxin A: Isolation and Subsequent Purification by High-Pressure Liquid Chromatography

A purification method for ochratoxin A, using liquid-liquid extractions and a final cleanup by high-pressure liquid chromatography, is described.     

强大的广谱基因表达分析技术——基因表达系列分析法

基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一项强大的数字化分析基因组整体表达模式的技术。它的诞生为定量、全局性地分析特定细胞内的基因表达情况提供了可能。本文介绍了SAGE技术的基本原理、最新进展和应用。