转基因作物生物安全:科学证据

通过对美国Web of Science数据平台的全部转基因作物生物安全SCI论文的检索,研究了有关转基因作物生物安全的科学证据。得出科学家比消费者更关心转基因技术的安全性;批准商业化生产的转基因技术经过了有史以来最为严格的生物学安全检验与检测,并建立了有史以来最为严格的监管体系;在所发表的全部9333篇转基因生物安全论文中,90%以上的论文证明转基因技术的安全性与传统非转基因作物无显著差异;而对于所有得出转基因食品不安全结论的论文的追踪研究发现,其研究结论被证明是在错误的研究材料或方法条件下得出的。     

塞拉利尼转基因“致癌”研究:从试验方法到结论

法国学者塞拉利尼的转基因致癌论文在学术界和国际社会引起了极大关注与争议。在对塞拉利尼论文发表的各界反应及相关研究文献追溯的基础上,对其试验材料、试验设计、数据统计等进行了分析。研究结果表明,塞拉利尼的研究,存在试验材料无法确保其结论的唯一性、试验样本不能保证其研究结论的可重现性,以及试验结果存在多种解读等问题。研究结果也对塞拉利尼论文所发杂志的审稿制度提出了质疑,认为这是塞拉利尼论文目前仍是影响国际社会对转基因安全性争议的原因之一。此外,在其施引文献中,有试验数据支撑的研究结果均表明了转基因作物饲喂动物未显著影响动物的健康。因此,"转基因致癌"是非科学研究的结论,学者和公众有必要回归科学理性的轨道探讨和解决有争议的问题。     

基于文献计量和内容挖掘的转基因玉米科研态势研究

玉米是全球种植最广泛谷类作物,在农业生产中具有重要地位。自20世纪80年代以来,转基因玉米研究一直是农业科学领域一个热点。为了解世界转基因玉米的科研态势,基于2005-2014年10年间Web of science收录的转基因玉米相关论文,分析了转基因玉米影响力较高的国家、科研机构、重点期刊、优秀作者、高被引论文。用内容挖掘方法抽取10个主题的核心句集,分析了转基因玉米研究的前沿热点。结果表明,整体上,从发文量、研究作者、出版期刊和高被引论文等方面综合分析,美国转基因玉米科研居世界领先水平。中国科研机构发文量较大,但主要集中在少数几个单位,而且中国的论文质量和影响力与美国有一定差距。刊载转基因玉米论文的优秀期刊集中分布在美国、英国、德国和荷兰。排名前16的高被引论文有9篇来自美国。转基因玉米的研究主要集中于抗虫、抗逆、环境的安全性评价以及作物性状改良这四个方面。其中的一些研究,如利用RNAi技术抗虫、玉米耐阴(耐密植)、雄性不育等方面,可能会成为未来转基因玉米的研究热点。     

实事求是是惟一的规则 反思科研本质防止捏造

最近,大阪大学研究人员在某著名医学杂志上发表的一篇关于被认为与肥胖有关的癌抑制性磷酸酶的论文被发现其数据是捏造的。对这一研究结果．不仅学术界和社会的反响强烈．而且研究结论被完全推翻、论文的主要执笔者承认捏造事实,这种情况在生命科学历史上是从未有过的,给从事这一领域工作的其他研究人员也带来了前所未有的冲击。     

转基因鸡研究现状及其展望

自1987年美国农业部地区家禽研究所(USDA,ARS,Regional Poultry Research Laboratory)成功地得到转基因鸡以来,有关研究已引起学术界和产业界的浓厚兴趣。今年6月25日至6月28日在美国康乃尔大学召开的第二届动物遗传工程国际学术讨论会上提交大会交流的20篇论文中,转基因鸡及有关研究就占了6篇。与其他转基因动物的研究相比较,转基因鸡的研究有其重要意义。     

2006—2009年《动物学研究》发表论文被SCI期刊引用情况

近期,本所图书馆通过Web of Knowledge中的Web of Science,在SCI-e上检索到2006—2009年《动物学研究》发表论文共有65篇被SCI期刊引用,其引用的SCI期刊有71种(见附录1),总引次数为109     

基于CNKI数据库的肠道菌群与中医药文献计量学研究

目的通过分析目前我国已发表的肠道菌群与中医药相关文献报道及其发展趋势,为科研工作者提供参考。方法研究资料来源于CNKI数据库,应用文献计量学的方法对该数据库中所收录的肠道菌群与中医药的文献进行分析研究。结果截止到2016年12月31日,总共检索到相关文献786篇。文献发表的数量在2003年以后增长速度显著提高;发表文献在10篇以上的单位共有15所,其中最多的单位发表42篇;25.70%的文献受到各级科研提供的资金支持和帮助。文献中以实验研究报告的类型为主,是总体数量的37.79%。文献被引用频次总体偏低,被引用次数在2次及以下的占60.43%。结论肠道菌群与中医药的科研工作还存在需要改进和完善的地方,并且应该在提高文献数量的同时,努力加强文献的质量。     

基于文献计量的食品组学研究发展态势分析

以截止到2017年6月Web of Science收录的食品组学相关论文为数据源,分析了食品组学概念提出、研究力量分布及主要发表刊物等,发现西班牙研究机构论文综合影响力较高,其发文量和被引频次均遥遥领先。已有文献研究表明,食品组学主要基于基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、生物信息学与化学计量学研究食品本身质量与安全以及食品营养如何影响人体健康等,未来将极大促进食品质量、营养、安全、溯源及新型食品、功能食品、保健食品及转基因食品等全方位研究。     

基于WOS与CSCD文献计量的中国昆虫学研究透视(2011—2016)

采用文献计量学的方法,统计2011—2016年中国昆虫学研究者发表的SCI与CSCD论文,客观地计量分析中国昆虫学研究的发展。在Web of ScienceTM核心合集中共检索到中国昆虫学研究者发表SCI文献6 589篇,被引频次40 649,论文来源于2 899个研究机构,来源出版物1 461种。研究的主要内容表现为昆虫生物化学与分子生物学、杀虫剂及其抗性生理、昆虫系统发育及分类学、昆虫的发育及生理学、害虫防治等方面。在CSCD中共检索到中国昆虫学研究文献6 407篇,被引频次7 641,文献来源于2 833个研究机构,来源出版物282种。研究的主要内容为昆虫分类学、昆虫生物化学与分子生物学、昆虫生理生态学、种群生物学、害虫生物防治及天敌与资源昆虫研究,昆虫超微结构、昆虫生物多样性与群落结构等方面。中国昆虫学研究形成了核心作者群,研究机构与研究人员与国内外的机构与团队有较广泛的合作,SCI研究论文数量逐年增加,论文被引用频次也迅速增加。CSCD昆虫学研究论文被引用频次迅速增加,但文献数量呈下降趋势。中国农业科学院植物保护研究所、中国科学院动物研究所等单位集中了中国昆虫学研究优势力量,在促进中国昆虫学学科发展中发挥了重要作用。     

“DNA之父”沃森获得世界首份个人基因组图谱

中国科学院网2007年6月18日报道：美国化学会刊物——《蛋白质组学研究》（Joumal of Proteome Research）近日发表了中科院大连化物所研究员邹汉法与上海国家组织工程中心专家崔磊合作的关于骨组织蛋白质提取方法和蛋白质组学分析的学术论文。论文被该刊选为Research Profile Paper进行评述和介绍。美国化学会出版的学术刊物在每期发表的学术论文中优选若干篇重妻论文进行点评。[编者按]     

转基因大米品尝会:中国情境下的公众参与科学

以转基因大米品尝会为例,通过问卷调查、访谈法、观察法研究由公众主动发起的科学传播活动及其参与者。描述了该类活动的发起和组织过程,发现参与者是一群热爱科学、认同科学价值并愿意传播科学的人,他们的行动对自己、对亲友、对社会都产生了一定的影响。转基因大米品尝会以及类似的活动是转型期中国情境下的公众参与科学实践。     

Atrazine and Pregnancy Outcomes: A Systematic Review of Epidemiologic Evidence

Atrazine (ATR) is a commonly used agricultural herbicide that has been the subject of epidemiologic studies assessing its relation to reproductive health problems. This review evaluates both the consistency and the quality of epidemiologic evidence testing the hypothesis that ATR exposure, at usually encountered levels, is a risk factor for birth defects, small for gestational age birth weight, prematurity, miscarriages, and problems of fetal growth and development. We followed the current methodological guidelines for systematic reviews by using two independent researchers to identify, retrieve, and evaluate the relevant epidemiologic literature on the relation of ATR to various adverse outcomes of birth and pregnancy. Each eligible paper was summarized with respect to its methods and results with particular attention to study design and exposure assessment, which have been cited as the main areas of weakness in ATR research. As a quantitative meta‐analysis was not feasible, the study results were categorized qualitatively as positive, null, or mixed. The literature on ATR and pregnancy‐related health outcomes is growing rapidly, but the quality of the data is poor with most papers using aggregate rather than individual‐level information. Without good quality data, the results are difficult to assess; however, it is worth noting that none of the outcome categories demonstrated consistent positive associations across studies. Considering the poor quality of the data and the lack of robust findings across studies, conclusions about a causal link between ATR and adverse pregnancy outcomes are not warranted.     

Research experience modifies how participants profit from journal clubs in academia

Because Journal Clubs (JClubs) represent valued educational tools, we often assume optimality of Journal Club practices. We analyze here JClubs records from a research group to identify factors that modify how much attendants benefit from discussing a paper. We demonstrate that attendants benefit most from papers focusing on systems similar to those they work on and that their ability to profit from different contribution types changes with research experience. Common JClubs practices such as the assignment of the paper selection to a single individual could thus compromise participant experience. Our conclusions may also be generalizable to situations outside academia.     

Global crop improvement networks to bridge technology gaps

To ensure future food security, there is an urgent need for improved co-ordination of agricultural research. While advances in biotechnology hold considerable promise, significant technology gaps exist that may reduce their impact. Examples include an incomplete knowledge of target breeding environments, a limited understanding and/or application of optimal crop management practices, and underfunded extension services. A better co-ordinated and more globalized approach to agricultural research through the implementation of Global Crop Improvement Networks (GCIN) is proposed. Such networks could underpin agricultural research and development by providing the following types of services: (i) increased resolution and precision of environmental information, including meteorological data, soil characteristics, hydrological data, and the identification of environmental 'hotspots' for a range of biotic, abiotic, and socio-economic constraints; (ii) augmented research capacity, including network-based variety and crop management trials, faster and more comprehensive diagnosis of emerging constraints, timely sharing of new technologies, opportunities to focus research efforts better by linking groups with similar productivity constraints and complementary skills, and greater control of experimental variables in field-based phenotyping; and (iii) increased communication and impacts via more effective dissemination of new ideas and products, the integration of information globally to elicit well-timed local responses to productivity threats, an increased profile, and the publicity of threats to food security. Such outputs would help target the translation of research from the laboratory into the field while bringing the constraints of rural communities closer to the scientific community. The GCIN could provide a lens which academia, science councils, and development agencies could use to focus in on themes of common interest, and working platforms to integrate novel research approaches on crop adaptation and rural development.     

Species Distribution Models and Impact Factor Growth in Environmental Journals: Methodological Fashion or the Attraction of Global Change Science

In this work, I evaluate the impact of species distribution models (SDMs) on the current status of environmental and ecological journals by asking the question to which degree development of SDMs in the literature is related to recent changes in the impact factors of ecological journals. The hypothesis evaluated states that research fronts are likely to attract research attention and potentially drive citation patterns, with journals concentrating papers related to the research front receiving more attention and benefiting from faster increases in their impact on the ecological literature. My results indicate a positive relationship between the number of SDM related articles published in a journal and its impact factor (IF) growth during the period 2000–09. However, the percentage of SDM related papers in a journal was strongly and positively associated with the percentage of papers on climate change and statistical issues. The results support the hypothesis that global change science has been critical in the development of SDMs and that interest in climate change research in particular, rather than the usage of SDM per se, appears as an important factor behind journal IF increases in ecology and environmental sciences. Finally, our results on SDM application in global change science support the view that scientific interest rather than methodological fashion appears to be the major driver of research attraction in the scientific literature.     

理性认识转基因植物食品的安全性

讨论现代生物技术的几个基本概念 ,如转基因生物、基因修饰生物、重组DNA植物以及对转基因植物食品安全性评价框架 ,阐明作者对转基因植物食品安全性的理解。     

转基因植物核酸成分检测技术研究进展

首先对转基因核酸成分检测的靶序列特征进行了阐述,对转基因植物核酸成分的定性、定量检测技术研究进展进行了综述,包括基于PCR的检测技术、基于等温核酸扩增的检测技术、基因芯片检测技术、基于高通量测序和新型转基因核酸检测技术(如生物传感器技术、毛细管电泳技术和纳米刻度技术等),重点介绍了各种检测技术的原理、特点、研究现状和发展动态,并对各种方法的优缺点进行了比较。     

数据挖掘在生物信息学中的应用——文献计量学视角

基因组和蛋白质结构与功能方面已积累了海量数据。如何从海量数据中获取有效信息成为生物信息学迫切要解决的问题。本文以相关主题词检索文献,分析了该领域历年文章数量、发文最多的机构和作者、被引用频次居前论文、期刊载文量,并对关键词和被引用频次居前论文的作者进行共现分析。我们发现,生物信息学中运用数据挖掘方法的文献逐年增多,该领域30.1%的文献发表在十个期刊上,分类、聚类、特征选择和支持向量机等数据挖掘方法使用较多。本研究描绘了生物信息学与数据挖掘这一交叉领域的研究概况,为后续数据挖掘方法与生物信息学研究相结合提供帮助。