噬菌体肽库技术

80年代中期,George P.Smith在前人对丝状噬菌体分子生物学研究的基础上首先提出了噬菌体展示技术(Phage Display),其核心就是将蛋白质分子的表型和基因型巧妙地结合于丝状噬菌体这样一个便于对其进行一系列生化和遗传操作的载体上,从而大大简化了蛋白质分子表达库的筛选和鉴定。基于这一优点,噬菌     

从噬菌体表面展示肽库中筛选志贺毒素受体结合抑制剂

利用抗体捕获法 ,从表面展示随机肽序列的噬菌体文库中筛选到与志贺毒素B亚基 (StxB)结合 ,并能抑制志贺毒素细胞毒效应的噬菌体克隆 ;依据其中 1个克隆序列 (A12 )合成的肽可以与志贺毒素的受体Gb3竞争结合StxB ,并抑制志贺毒素(Stx)的细胞毒和肠毒活性 ;抑制 5×CD₅₀ 剂量的Stx细胞毒效应需 2 2 .7μmol的A12合成肽 .筛选得到的 2个噬菌体克隆 (A3 ,A12 )编码的氨基酸序列不同 ,但能竞争结合StxB ,推测它们形成相同或相似的空间结构 .为志贺毒素抑制剂进一步研究打下基础 ,对其他相关药物的研制亦有参考价值 .     

噬菌体抗体库筛选技术

噬菌体展示技术（Ｐｈａｇｅ Ｄｉｓｐｌａｙ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）为制备高亲和性抗体提供了有力的工具。噬菌体抗体库的筛选是其中关键的环节,为了提高筛选效率,用包被在固体表面的抗原进行筛选的传统方法不断地被改进,如宿主菌直接洗脱和双层膜筛选系统和抗抗体替代抗原筛选系统。将噬菌体感染宿主菌的过程与筛选过程相关联,产生了选择性感染筛选系统。     

从噬菌体展示肽库中筛选脂质A的结合肽

以脂质A为靶标,筛选噬菌体展示十二肽库,三轮后随机挑取14个噬菌体克隆进行结合活性鉴定,并对5个克隆进行序列分析。结果表明,14个克隆全部是阳性克隆,测序结果显示4个阳性克隆的序列完全一样。说明筛选到了一个脂质A的结合多肽。     

从七肽噬菌体展示库中筛选内毒素结合蛋白质配基

目的:研究从噬茵体展示库中筛选内毒素结合蛋白质配基,为其在内毒素致病作用机理及在内毒素血症防治研究中的应用奠定基础.方法:以内毒素为靶分子从随机七肽噬菌体展示库中筛选内毒素的高亲和力噬菌体配体,通过ELISA鉴定,DNA测序及相关软件分析.结果:所筛选的亲和力最高的噬菌体的ELISA检测值A405nm可达1.965通过比较亲和性噬菌体外源插入肽的DNA序列,认为FHENWPS肽段中包含有与内毒素分子发生亲和结合的一个共有序列.该序列展示肽的等电点为5.36,具有双嗜性,这有利于肽与LPS分子表面的位点相互作用从而产生亲和吸附.结论:运用亲和筛选方法从肽库中筛选内毒素结合蛋白质配基是可行的.     

噬菌体展示肽库在细胞信号转导研究中的应用

细胞信号转导是一个由信号分子相互作用介导的生物信息传递的过程 ,蛋白质之间以及蛋白质与其他分子间的相互作用是信号转导的基础。近年来 ,利用噬菌体展示肽库技术研究细胞信号转导 ,取得了很多有意义的结果。1.鉴定信号蛋白识别结合位点信号蛋白之间特异性的识别结合主要通过一小段保守区实现 ,如ＳＨ2区 (Ｓｒｃ ｈｏｍｏｌｏｇｙｄｏｍａｉｎ)、ＳＨ3区、ＰＴＢ区 (ｐｈｏｓｐｈｏｔｙｒｏｓｉｎｅ ｂｉｎｄｉｎｇｄｏｍａｉｎ)等。用噬菌体展示肽库技术可以快速获得与这些保守区结合的配体的结构信息。用Ｓｒｃ酪氨酸激酶的ＳＨ3区筛…     

噬菌体抗体库筛选技术研究进展

噬菌体抗体库技术是一项新兴的基因工程抗体技术,应用这项技术获得高特异性抗体的关键之一就是筛选环节。根据抗原性质以及筛选目的的不同,筛选方法的选择也不相同,各种筛选策略的优化对中和抗体的获得有至关重要的作用。     

噬菌体抗体库筛选技术

在过去的20年中,噬菌体抗体库筛选技术被广泛的应用于抗体筛选、疾病治疗,临床诊断以及基础研究之中。在该技术的应用过程中,快速有效的筛选出最适合的单克隆抗体并进行可靠和高效的数据管理和分析是十分重要的。文中总结了近年来噬菌体抗体库的高通量筛选方法并且对数据管理做了简要介绍。     

从噬菌体展示的构象限制性随机肽库中筛选有 trkB 结合活性的小肽

脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor, BDNF)能够促进多种神经元的存活和分化, 在神经退行性疾病的治疗中具有广阔的应用前景, 但由于其分子量大而无法穿过血脑屏障, 限制了其临床应用. 以表达于NIH 3T3细胞上的BDNF受体trkB为靶分子, 从噬菌体展示的随机肽库中筛选与trkB有亲和力的小肽, 采用不表达trkB 的NIH 3T3细胞预吸附和最后一轮筛选以1 μg/mL的BDNF竞争性洗脱策略, 使能与trkB天然构象结合、又能有效拮抗BDNF与trkB结合的特异性噬菌体得到了有效富集, 获得了5种trkB结合小肽, 它们有核心序列CRA/TXφXXφXXC(X代表随机残基, φ为T, L或I). 对展示有5种外源小肽的噬菌体进行了初步生物活性测定, 未发现有BDNF样活性, 反而能剂量依赖性地拮抗BDNF的生物功能. 依据其中一个克隆序列(C1)合成的肽也证实有拮抗BDNF的作用, 表明获得的5种小肽可能为trkB受体拮抗剂. 这些trkB拮抗性小肽在治疗神经母细胞瘤和慢性痛以及神经生物学研究中具有应用前景, 同时也为构建二级噬菌体展示肽库、继续筛选BDNF模拟小肽奠定了基础.     

从噬菌体表面展示肽库中筛选衣原体单克隆抗体识别的抗原表位

利用抗体捕获法,经三轮淘洗,从表面展示随机肽序列的噬菌体文库中筛选到与衣原体单克隆抗体C17特异结合的噬菌体克隆,其一致序列为：（L／I）PGGS（P／W）,竞争抑制实验表明含特异序列的克隆能与天然抗原竞争。据此,我们认为此序列为衣原体的B细胞抗原表位。     

噬菌体呈现肽库技术的应用

噬菌体呈现肽库是噬菌体显示技术的一个非常重要的分支。自问世以来,随着分子生物学技术的飞速发展,它已被广泛应用于免疫学、分子生物学、药理学、疫苗学等生命科学领域。简要概述了这一技术的应用。     

从噬菌体随机肽库中筛选流感病毒神经氨酸酶的抑制多肽

目的:从噬菌体呈现12肽库中筛选与流感病毒神经氨酸酶特异性结合的肽。方法:以甲三型流感病毒裂解疫苗原液为靶分子,经过3轮生物淘选,从噬菌体随机肽库中筛选与之结合的噬菌体。用ELISA方法鉴定噬菌体克隆与靶分子的结合力,用荧光方法测定噬菌体克隆对流感病毒A/Sydney/5/97(H3N2)神经氨酸酶的抑制活性。对筛选到的阳性克隆进行DNA序列测定并推导出相应的氨基酸序列。结果:经过3轮筛选后,42个噬菌体克隆与靶分子有高度亲和力,23个噬菌体克隆对流感病毒A/Sydney/5/97(H3N2)神经氨酸酶有抑制活性。对27个噬菌体克隆的测序结果表明,分别有10个和2个克隆的序列是一致的,其氨基酸序列分别为KSLSRHDHIHHH和WPRHHHSASVQT。结论:通过噬菌体肽库筛选到抑制流感病毒神经氨酸酶的12肽,为进一步研究对流感病毒神经氨酸酶有抑制活性的分子药物奠定了基础。     

利用噬菌体展示肽库筛选鸡传染性支气管炎病毒模拟抗原表位

目的：利用噬菌体展示肽库技术筛选鸡传染性支气管炎病毒（IBV）的模拟抗原表位。方法：用IBV阳性血清纯化IgG作为靶标。对噬菌体展示随机12肽库进行筛选，通过ELISA和竞争抑制ELISA鉴定筛选克隆的结合特性，并对阳性克隆提取ssDNA进行测序分析。结果：3轮生物淘洗后，目标噬菌体得到125倍富集。随机挑选50个克隆进行ELISA和竞争抑制ELISA。其中有12个噬菌体克隆可以与IBV阳性血清高特异性结合。测序分析发现，这12个克隆带有2种氨基酸序列。即KSPKHSSSALHF和SFFQLNLHRPTS。且未发现这2种序列与GenBank中已发表的IBV氨基酸序列有同源性。结论：结果提示。这2个肽可能是IBV抗原的模拟表位。     

多肽噬菌体展示

噬菌体展示技术已被广泛地应用于生物学研究的各个方面.利用它可融合表达多肽、蛋白质结构域和蛋白质.尤其是多肽噬菌体展示,已被作为一种便利的研究工具去发现和研究那些与受体、酶、凝集素、抗体、核酸以及其他生物分子亲和的多肽配基和酶的底物专一性,该技术在药物的发现,疫苗的设计等医学领域也有着潜在的应用价值.     

在肽库中筛选抗磷脂抗体的小肽抑制剂

β２糖蛋白Ⅰ（ｂｅｔａ－２－ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ⅰ,β２ＧＰＩ）是一分子量为５０ ｋＤ的糖蛋白．从抗磷脂抗体综合症（Ａｎｔｉｐｈｏｓｐｈｏｌｉｐｉｄ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｓｙｎｄｒｏｍ ,ＡＰＳ）患者身上获得的抗体可直接与β２ＧＰＩ作用．以β２ＧＰＩ为目标分子,在噬菌体十五肽库中筛选抗β２糖蛋白Ⅰ抗体的小肽抑制剂．通过四轮亲和性筛选,噬菌体的回收率从１．２６×１０－ ４％ 增加到３．１９×１０－ ２％ ．随机挑取噬菌体克隆测定其与β２ＧＰＩ的结合活性及其对β２ＧＰＩ与自身抗体结合的抑制活性,其中部分噬菌体克隆表现出４０％ 的抑制活性．经ＤＮＡ 序列测定,得到一组相关序列．该结果为研究β２ＧＰＩ的抗原表位奠定了良好的基础．     

Selection Dynamic of Escherichia coli Host in M13 Combinatorial Peptide Phage Display Libraries

Phage display relies on an iterative cycle of selection and amplification of random combinatorial libraries to enrich the initial population of those peptides that satisfy a priori chosen criteria. The effectiveness of any phage display protocol depends directly on library amino acid sequence diversity and the strength of the selection procedure. In this study we monitored the dynamics of the selective pressure exerted by the host organism on a random peptide library in the absence of any additional selection pressure. The results indicate that sequence censorship exerted by Escherichia coli dramatically reduces library diversity and can significantly impair phage display effectiveness.     

神经生长因子低亲和力受体(p75NTR)的模拟配基的筛选

人神经生长因子低亲和力受体 (p75NTR)转染R2细胞而建立的R2L1细胞 ,在去血清培养时发生凋亡 ,该作用可被神经生长因子 (NGF)所抑制 .用R2L1和R2两种细胞差式筛选噬菌体随机 7肽库和 1 2肽库 ,获得和p75NTR特异结合的噬菌体 .测定DNA序列后得到有关多肽的氨基酸序列 .7肽库共有序列为C (H D)LP(K M)HPM C ;1 2肽库优势序列为TLPSPLALLTVH .化学合成相应的 2个短肽 .用细胞结合法和ELISA方法证实阳性噬菌体和合成短肽能与p75NTR结合 ,并证实了它们对R2L1细胞去血清培养后的凋亡有抑制作用     

以重组TACE胞外功能域从噬菌体随机肽库中筛选TACE的抑制肽

肿瘤坏死因子转换酶 (TACE)是加工裂解TNF-α前体的关键酶 ,参与了许多炎症的发生发展过程。为通过肽库筛选得到TACE的抑制肽 ,首先制备筛选靶分子 ,用RT PCR从人外周血单核细胞中分别扩增出TACE的催化区 (T800 )和整个胞外区 (T1300 ) ,然后分别克隆至pET-28a和pET-28c中 ,转化大肠杆菌BL2-1(DE3) ,经IPTG诱导表达出带有His-tag的目的蛋白 ,两者均为包涵体 ,变性复性后过Ni²⁺-NTA亲和层析柱得到纯度达90%的重组蛋白。以纯化的重组T800和T1300分别筛选噬菌体展示随机 15肽库 ,对筛选克隆进行ELISA检测、竞争抑制实验和序列分析。从两个独立的筛选过程中得到一个相同的阳性克隆序列“TRWLVYFSRPYLVAT” ,固相Fmoc法合成该短肽 ,观察其在LPS诱导人单核细胞产生sTNF-α中的作用。结果表明 ,筛选到的短肽可显著抑制TACE的活性 ,减少TNF-α的分泌 ,抑制率可达 60.3% ,为抗炎小分子药物的设计和改造提供线索和依据。