血清SELDI蛋白质指纹图谱在乳腺癌术前分级中的应用

应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选能反映乳腺癌术前分期的蛋白质峰并构建检测模型。采用CM10芯片,对34例Ⅰ～Ⅱ期乳腺癌患者和31例Ⅲ～Ⅳ期乳腺癌的血清进行了检测,发现11个蛋白质峰在两组患者之间表达量有显著性差异（P<0.05）,M/Z为 M2042.87、M2459.83、M3881.37、M4804.47、M6683.24和 M6706.06的6个蛋白质峰被选为分类变量构成决策树分类模型,该模型的交叉验证（测试组）总准确率为80.0%,Ⅰ～Ⅱ期乳腺癌检出率为82.4%,Ⅲ～Ⅳ期检出率为77.4%。SELDI技术在乳腺癌患者术前分级的判断方面具有一定的应用价值。     

大肠埃希菌蛋白指纹图谱的建立

目的建立大肠埃希菌（Escherichia coli,E．coli）蛋白指纹图谱,为Ecoli感染快速诊断奠定基础。方法收集临床分离E.coli88株,提取细菌DNA,PCR检测Ecoli 16S rRNA。蛋白提取液提取细菌蛋白,干化学法测蛋白浓度,应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）检测Ecoli蛋白,采用Ciphergen Pro-teinchip软件自动采集数据。重复测定20次Ecoli混合标本,评价SELDI检测Ecoli蛋白分子量的重复性。结果E．coil标准菌株ATCC 25922和临床分离株均可检出16S rRNA。AU芯片能捕获近30个E．coli蛋白峰,其中19个蛋白峰构成E．coli特征性蛋白指纹图谱,各蛋白峰在临床分离E．coli间分子量变异系数≤0．2％。SELDI重复检测20次E．coli混合标本显示同一蛋白峰的分子量变异系数≤0．05％。结论E．coli在分子量3～20kD范围内具有特征性蛋白指纹图谱,为快速诊断E.coli感染提供了新思路。     

人子宫内膜异位症裸鼠模型的建立

目的建立人子宫内膜异位症裸鼠模型。方法通过开腹手术方法将人子宫内膜组织块种植于裸鼠盆腹腔,观察其生长情况,并进行病理检查。结果成功建立人子宫内膜异位症裸鼠模型,种植病灶能保持原有内膜组织的形态结构,并可见血管生成明显。结论子宫内膜异位症裸鼠模型的建立是子宫内膜异位症早期临床研究的理想模型。     

子宫内膜异位症动物模型研究进展

为研究子宫内膜异位症的病因、发病机制、治疗和预防对策,需要构建实验动物模型。本文通过分析各种模型的优点和缺点,为选择性应用动物模型提供指导,从而更利于对该病的研究。     

子宫内膜异位症动物模型研究进展

为更好的把动物模型应用于子宫内膜异位症的病因、发病机制及治疗等方面的研究,本文将对子宫内膜异位症实验动物的选择、传统动物模型、新型特殊动物模型的构建方法及优缺点进行综述,以期为子宫内膜异位症疾病动物模型的研究提供参考。     

血清与腹腔液中趋化因子RANTES水平在子宫内膜异位症患者中的临床应用

目的:探讨血清与腹腔液中趋化因子RANTES水平在子宫内膜异位症(EM)患者中的临床意义。方法:选取2012年5月-2013年5月本院收治的33例EM患者(观察组)、33例良性卵巢肿瘤患者(对照组)和33例健康体检者(健康对照组),应用ELISA法对血清与腹腔液中趋化因子RANTES水平进行检测,分析RANTES水平与患者r-AFS分期及痛经程度的相关性。结果:观察组血清RANTES水平明显高于对照组和健康对照组,差异均有统计学意义(t=7.163,6.743,均P0.05);观察组腹腔液RANTES水平亦高于对照组,两组比较差异有统计学意义(t=5.927,P0.05);观察组血清及腹腔液中RANTES水平与r-AFS分期呈正相关(r=0.975,0.893,均P0.05),且随分期增高而呈递增趋势;观察组血清RANTES水平与患者痛经评分无明显的相关性(r=-0.312,P0.05);而腹腔液中RANTES水平与患者痛经评分呈正关(r=0.517,P0.05)。结论:EM患者血清与腹腔液中趋化因子RANTES水平明显上升,应用ELISA法检测RANTES水平可辅助EM诊断,有利于提高诊断准确率。     

子宫内膜异位症的药物治疗

子宫内膜异位症(EMS)是妇科常见病,近年来发病率逐年上升,仅次于子宫肌瘤。虽然为良性疾病,却表现为恶性行为,主要特征为疼痛、不孕及性交困难,导致生活质量下降。其治疗目的在于消除病灶、缓解疼痛和解决生育问题,降低术后复发也不可忽视,因此,药物治疗尤为重要,不同的药物有不同的作用机理、副作用及用药时间。不同的患者需要根据其治疗目的、身体情况及经济状况选择不同的治疗方案。所以药物治疗应注意个体化、阶梯化和规范化。本文就近年来内异症的药物治疗做一综述。     

VEGF和IGF-I在子宫内膜异位症患者血清中的表达及临床意义

目的：探究血管内皮生长因子（VEGF）和胰岛素样生长因子-I（IGF-I）在子宫内膜异位症患者血清中的表达及临床意义,为 子宫内膜异位症的治疗提供参考。方法：选取我院2015 年1 月至2016 年1 月收治的子宫内膜异位症患者50 例为实验组,另选 体检中心健康妇女50 例为对照组。实验组患者根据疾病不同分期分为I、II期（n=24）和III、IV 期（n=26）。通过酶联免疫吸附法 （ELISA）检测两组对象血清中VEGF和IGF-I的水平,采用Pearson相关分析法分析实验组患者血清中VEGF 和IGF-I 表达的相 关性。结果：实验组患者血清中VEGF和IGF-I的水平均明显高于对照组,差异有统计学意义（P<0.05）;实验组III、IV期患者血清 中VEGF和IGF-I的水平明显高于I、II期患者,差异有统计学意义（P<0.05）;Pearson 相关性分析显示实验组患者血清中VEGF 和IGF-I的水平变化呈正相关关系（r=0.507,P<0.05）。结论：子宫内膜异位症患者血清中VEGF和IGF-I的水平高于正常水平,并 随着病情的加重而不断升高,且二者呈正相关关系,可协同作用加快病情发展。     

子宫内膜异位症与子宫内膜息肉发病机制的相关性研究进展

子宫内膜异位症(endometriosis,EMT)和子宫内膜息肉(endometrial polyp,EP)是两类常见的良性妇科疾病,以子宫内膜组织的异常种植或增生为主要病理特征。流行病学数据显示,EMT患者的EP发生率攀升,EP患者合并EMT的风险也增加,提示二者可能存在密切关系与潜在的关联机制。尽管EMT和EP的发病机制尚未完全明确,但近年研究表明,EMT和EP的发生可能与长期高水平雌激素刺激、雌激素受体与孕激素受体表达失衡、细胞凋亡与增殖异常、细胞因子的表达、局部慢性炎症刺激、免疫系统失调、氧化应激、微生物群紊乱、代谢异常等因素有关。两者共有多种危险因素,可能参与彼此的疾病进程,从而在临床治疗上显示出消极的相互作用。本文通过对EMT和EP发病机制的相关性进行综述,为二者的基础研究和临床治疗提供更多理论依据。     

米非司酮治疗子宫内膜异位症疗效的临床研究

目的:研究米非司酮治疗子宫内膜异位症的疗效及副反应。方法:选择94例卵巢子宫内膜异位症患者,采用随机抽样的方法分为米非司酮组(简称米组)和内美通治疗组(简称内组),米组46例,内组48例。利用t检验和x~2检验。结果:米组有效率为91．42%,内组有效率为43．75%,二者比较,P＞0．05,差别无统计学差异;而副反应米组明显低于内组,体重增加米组为15．00%,内组为43．75%,二者比较,P＜0．01,说明存在统计学差异;谷丙转氨酶(ALT)异常米组为4．40%,内组为25．00%,二者比较,P＜0．05,存在统计学差异。结论:米非司酮治疗卵巢子宫内膜异位症与内美通具有相同的疗效,副反应明显低于内美通。     

SELDI-TOF-MS分析结直肠腺瘤血清蛋白质谱的变化

目的：分析结直肠腺瘤血清蛋白质谱的变化,寻找结直肠腺瘤的特异性生物标志物。方法：采用SELDI-TOF-MS技术（表面增强激光解析电离飞行时间质谱）对比分析31例结直肠腺瘤患者和11例正常人的血清蛋白质谱,用Biomarker Wizard软件对获得的蛋白质谱进行分析。结果：结直肠腺瘤组与正常对照组有24个蛋白峰有差异,其中有三个蛋白峰（8565.84D、8694.51D和5910.50D）的差异非常显著,8565.84D和8694.51D在结直肠腺瘤中高表达,在正常人中低表达,而5910.50D在两组人群中的表达相反。结论：这三个蛋白峰可能为结直肠腺瘤特异性的生物蛋白标志物。     

SELDI-TOF-MS技术在实验诊断中的应用

表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface-enhanced laserdesorption/inionation-time of flight-mass spectra,SELDI-TOF-MS)为蛋白质组学研究提供了最为有效的技术平台。它将芯片技术和飞行时间质谱技术相结合,整合样品分离、纯化及检测分析为一体,实现了快速、高效、高通量检测,是在分子水平上诊断疾病的非常重要的工具。     

SELDI-TOF-MS技术的改善和优化

表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(Surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight,SELDI-TOF-MS)技术是目前蛋白质组学研究较为有效的手段之一,已被广泛的应用于肿瘤、传染性疾病、心血管病和神经系统等疾病的研究.然而SELDI-TOF-MS技术本身存在着一些问题,如分析结果有效性差和实验重复验证率低等,使其不能完全的应用于常规的临床诊断,现有许多研究致力于解决这些问题,如规范化实验室操作、预处理原始标本和数据、提高统计学方法等极大的改善和优化了这项技术.     

SELDI-TOF-MS技术寻找肿瘤转移相关的标志蛋白研究进展

由于SELDI-TOF-MS技术简便、快速、灵敏度高、重复性好等优点,目前大量应用于肿瘤相关的研究,不但为肿瘤早期诊断相关标志蛋白的寻找提供了有效的手段,而且它在寻找肿瘤转移相关的标志蛋白中的作用越来越受到人们的关注。因为对于肿瘤转移相关标志蛋白的检测有利于人们更清楚地认识肿瘤转移的机制,更重要的是为临床医生提供对病人情况的更全面的判断,制定更适合病人自身的个体化的治疗方案。本文对国内外发表的利用SELDI-TOF-MS技术寻找在大肠癌、胃癌、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、肝细胞肝癌、头颈部癌等转移相关标志蛋白的研究文献作一综述。     

SELDI-TOF-MS技术诊断早期乳腺癌的文献系统评价

目的：系统评价表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）对乳腺癌的诊断效能,正确理解和分析乳腺癌SELDI-TOF-MS检测结果并论证其用于早期诊断和筛查的准确性。方法：检索2001-01～2007-12的万方中文科技期刊数据库、维普数据库和MEDLINE数据库中关于利用SELDI-TOF-MS技术早期诊断乳腺癌的中、英文文献,对纳入文献进行质量评价、异质性检验,用统计分析软件计算综合受试者工作特征（SROC）曲线方程。结果：共检索到相关文献62篇,对其中8篇符合纳入标准的文献数据进行了Meta分析,样本量735例,综合灵敏度、特异度和综合优势比分别为85.55%、79.18%和22.90,SROC曲线下面积为0.90。结论：SELDI-TOF-MS技术对早期乳腺癌的诊断具有重要价值。     

大鼠子宫异位症模型建立方法的比较

目的将自体子宫内膜组织同时种植于大鼠体内三个不同部位,建立的子宫内膜异位症模型进行比较评估。方法取30只雌性未交配性成熟大鼠,将自体子宫内膜组织种植于左侧腹壁、子宫卵巢韧带和右侧皮下筋膜层与腹壁肌层间,术后第21天取出异位组织,进行组织形态学观察。结果异位内膜可以在大鼠不同部位同时生长,体积和重量均无显著性差异,其种植成功率差异不显著（93%-100%）,且种植物组织形态相似。结论此手术方法建立的大鼠子宫内膜异位症模型异位内膜病理改变与EMs患者类似,但皮下种植更简单,更直观,可减小损伤,便于反复实验及连续性观察研究。     

表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术筛查肺癌血清特异性蛋白质及其临床意义

目的:探讨用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛查肺癌血清特异性蛋白质的临床意义。方法:应用SELDI-TOF-MS对35例正常对照组、43例治疗前肺癌病人的血清样品进行蛋白质指纹图谱测定,用BioMarker Wizard 3．01及BioMarker Parrern System 5．01分析软件对测得的数据进行处理及建立诊断模型。结果:共检测到251个蛋白质峰,筛选出差异蛋白质峰11个,以质荷比(m/z)分别为M2799_26,M3227_41,M5739_70和M8164_30的4个蛋白质峰为依据组合构建分类决策树模型,分出5个终节点。决策树模型的原始判别总准确率为91．0%(71/78),敏感性为88．4%(38/43),特异性为94．3%(33/35);交叉验证总准确率为85．9%(67/78),敏感性为88．4%(38/43),特异性为82．9%(29/35)。结论:SELDI-TOF-MS在肺癌血清特异性蛋白质的筛选及诊断模型的建立有一定的临床意义。     

Feature Selection for Classification of SELDI-TOF-MS Proteomic Profiles

BACKGROUND: Proteomic peptide profiling is an emerging technology harbouring great expectations to enable early detection, enhance diagnosis and more clearly define prognosis of many diseases. Although previous research work has illustrated the ability of proteomic data to discriminate between cases and controls, significantly less attention has been paid to the analysis of feature selection strategies that enable learning of such predictive models. Feature selection, in addition to classification, plays an important role in successful identification of proteomic biomarker panels. METHODS: We present a new, efficient, multivariate feature selection strategy that extracts useful feature panels directly from the high-throughput spectra. The strategy takes advantage of the characteristics of surface-enhanced laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS) profiles and enhances widely used univariate feature selection strategies with a heuristic based on multivariate de-correlation filtering. We analyse and compare two versions of the method: one in which all feature pairs must adhere to a maximum allowed correlation (MAC) threshold, and another in which the feature panel is built greedily by deciding among best univariate features at different MAC levels. RESULTS: The analysis and comparison of feature selection strategies was carried out experimentally on the pancreatic cancer dataset with 57 cancers and 59 controls from the University of Pittsburgh Cancer Institute, Pittsburgh, Pennsylvania, USA. The analysis was conducted in both the whole-profile and peak-only modes. The results clearly show the benefit of the new strategy over univariate feature selection methods in terms of improved classification performance. CONCLUSION: Understanding the characteristics of the spectra allows us to better assess the relative importance of potential features in the diagnosis of cancer. Incorporation of these characteristics into feature selection strategies often leads to a more efficient data analysis as well as improved classification performance.     

评估SELDI-TOF-MS技术检测肾移植术后病人尿液的能力

目的:研究表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测肾移植术后病人尿液中蛋白质的能力。方法:根据尿液标本中蛋白质浓度进行稀释处理,采用SELDI-TOF-MS技术,用3种不同芯片(NP20、CM10、IMAC30)与蛋白质浓度的不同组合分别检测肾移植术后病人的尿液。结果:采用NP20/蛋白质未稀释、CM10/蛋白质浓度约0.1g/L、IMAC30/蛋白质浓度约2g/L时,质谱图中蛋白质峰的个数和丰度达到最佳;单一芯片中NP20捕获质荷比为5000～20000的蛋白质能力最佳,而CM10和IMAC30在质荷比为2000～5000时有较大的捕获能力;3种芯片中CM10具有最大的捕获蛋白质的能力。结论:3种芯片检测尿液中蛋白质的能力不同;为了更好地发现疾病特异性标志物,最好多种芯片同时检测,且在各种芯片得到最佳质谱图时的浓度进行检测。