对EcoRI作用于DNA的新认识

对ＥｃｏＲＩ作用于ＤＮＡ的新认识邹国林皮新春（武汉大学生物化学与生物物理学系,武汉４３００７２）关键词蛋白质与核酸相互作用ＥｃｏＲＩ模体蛋白质与核酸的相互作用是分子生物学研究的中心问题之一。当前以阐明ＤＮＡ结合蛋白的结构与蛋白质－ＤＮＡ复合物的结构为...     

酵母双杂合系统的改进和发展

酵母双杂合系统是在１９８９年由ＳｔａｎｌｅｙＦｉｅｌｄｓ和Ｏｋ－ｋｙｕＳｏｎｇ等提出并初步建立的［１］,该系统是在酿酒酵母（Ｓａｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）中研究蛋白质间相互作用的一种非常有效的分子生物学方法。近几年来随着人们对该系统的广泛应用,这一系统得到了不断的完善及改进,同时也衍生出单杂合系统,三杂合系统等一系列相关的技术。这些技术在不同研究领域中的广泛应用有力地推动了蛋白质与ＤＮＡ,蛋白质与ＲＮＡ,以及多种蛋白质分子间相互作用的研究。     

转录协同激活因子p300与增殖细胞核抗原

转录协同激活因子 ｐ30 0与许多转录因子相互作用参与多种生命活动如 :细胞分化、维持内环境稳态、调节生长等。而近年来研究表明增殖细胞核抗原 (ＰＣＮＡ)与ＤＮＡ聚合酶结合参与ＤＮＡ修复合成的许多步骤。但 ｐ30 0是否通过与ＰＣＮＡ相互作用参与ＤＮＡ的修复合成尚不清楚。瑞士苏黎士大学的Ｈａｓａｎ等利用免疫沉淀法、Ｗｅｓｔｅｒｎ印迹杂交、氚胸腺嘧啶标记与流式细胞术等技术对 ｐ30 0与ＰＣＮＡ的相互作用以及在ＤＮＡ修复合成中的作用进行研究 ,发现二者在细胞核的颗粒结构中形成一复合体 ,该复合体不依赖细胞周期Ｓ期 ,在体外…     

蛋白质－DNA相互作用与真核基因转录

结合最近几年对真核转录调节因子和ＤＮＡ的结构与机能研究,概述了蛋白质－蛋白质及蛋白质－ＤＮＡ相互作用方式以及介导相互作用的分子结构基础,论述了转录因子之间,转录因子与ＤＮＡ之间相互作用过程中的同与拮抗作用,发生机制及其在真核基因转录调节中的遍性和重要意义。     

生物传感芯片质谱及其在蛋白质组研究中的应用

目前蛋白质组研究技术在已有的研究基础上取得了长足进展 ,包括固相 ｐＨ梯度双向凝胶电泳、生物质谱技术、蛋白质双向电泳图谱的数字化和各种分析技术、蛋白质间相互作用分析的方法如酵母双杂交系统、噬菌体展示、表面等离子共振等。但均各有其利弊。目前质谱是进行蛋白质组成分鉴定的支撑技术 ,但是它在蛋白质间相互作用分析及结构与功能的关系分析方面显得无能为力 ,而生物分子相互作用分析技术 (Ｂｉｏｍｏｌｅｃｕｌａｒｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓ ,ＢＩＡ)是进行蛋白质相互作用分析的较好技术 ,将两者结合起来在蛋白质组…     

植物基因表达调控的机制：核因子作用

植物基因表达调控的机制：核因子作用邵宏波（四平师范学院生物工程研究所四平１３６０００）１引言真核生物的转录启始是由顺式作用的ＤＮＡ基序（ｅｔｓ－ａｃｔｉｎｇＤＮＡｍｏｔｉｆ）与反式作用的蛋白质因子（ｔｒａｎｓ－ａｃｔｉｎｚｎｒｏｔｅｉｎｆａｃｔｏｒ）...     

限制性核酸内切酶与DNA相互作用研究进展

蛋白质对ＤＮＡ识别的模体中,除了锌指结构、螺旋—转角—螺旋、亮氨酸拉链和β带外,近年来发现,Ⅱ型限制性内切酶与ＤＮＡ作用的模体有许多特别之处。通过对ＥｃｏＲＩ、ＢａｍＨＩ、ＥｃｏＲＶ等与ＤＮＡ复合物的空间构象、一级结构分析,发现酶分子存在催化性裂缝,并且氨基端形成臂结构包绕ＤＮＡ;同时ＤＮＡ发生构象变化、螺旋扭结。这些有趣的结构有利于酶对底物的特异性结合和催化作用。     

应用cDNA微阵列研究肿瘤基因表达谱

随着研究水平的深入 ,对基因在发育过程中、生理反应中和疾病发展中表达上的时空差别 ,基因蛋白质产物的亚细胞定位和细胞分子间的相互作用等研究领域的开拓 ,所涉及到的基因的广泛性用传统方法研究已很难达到要求 ,因此一些新的研究方法应运而生 ,基因表达谱的研究即为其中之一。基因表达谱 ( ｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐｒｏｆｉｌｅ)是指细胞中所有基因表达的格局 ,具体说来就是指细胞中产生所有ｍＲＮＡ的总和。对于所有的ｍＲＮＡ来说 ,通常采用的研究方法是将其逆转录成ｃＤＮＡ ,通过构建ｃＤＮＡ文库 ,再进行分析研究。原先采用…     

原核生物DNA的程序性复制

原核生物ＤＮＡ的程序性复制薛建华明镇寰（杭州大学生命科学学院,杭州３１００１２）关键词聚合酶Ⅲ全酶复制叉程序性ＤＮＡ的复制是一个复杂的过程,需要各种蛋白质、酶之间及蛋白质与ＤＮＡ之间的相互作用,才能顺利完成。原核生物（如Ｅ．ｃｏｌｉ）是以ＤＮＡ聚合酶...     

HMG蛋白质与人ε—珠蛋白基因5‘旁侧调控元件DNA相 …

ＨＭＧ蛋白质是一类在染色质内含量极为丰富的非组蛋白质,它们在染色质的结构与功能中起着重要的作用。本文运用凝胶电泳阻抑法和ＤＮａｓｅＩ足迹法分析了ＨＭＧ蛋白质与人ε－珠蛋白基因５＇旁侧调控元件ＤＮＡ之间相互作用的情况。结果表明ＨＭＧ蛋白质（１／２）既能与两个正调控元件（－５３５￣－４５３ｂｐ和－４４６￣－４１９ｂｐ）ＤＮＡ相结合,也能与启动子（－１７７￣＋１ｂｐ）ＤＮＡ相结合;而ＨＭＧ蛋白质（１４／     

木质素过氧化物酶基因5'端上游调控序列的分析

黄孢原毛平革菌（Ｐｈａｎｅｒｏｃｈａｅｔｅｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ）能产生降解木质素的胞外木质素过氧化物酶（ＬＩＰ） 和锰过氧化物酶（ ＭｎＰ）同工酶。为研究ＬＩＰ基因的转录调控机理, 对ＬＩＰ基因（ ＧＬＧ３ 和ＧＬＧ６） 的５′端上游序列进行亚克隆, 获得６ 个亚克隆ＤＮＡ 片段, 然后应用凝胶迁移率变动分析技术筛选能与菌体蛋白质专一性结合的ＤＮＡ片段。结果表明： ＬＩＰ基因ＧＬＧ６ 的５′端上游有一个约６７０ ｂｐ 的ＤＮＡ 片段能与总蛋白质组分专一性结合, 其核苷酸序列分析表明该片段可能含有蛋白质结合的序列特征。研究结果初步显示, 黄孢原毛平革菌可能存在有与ＬＩＰ基因上游某些顺式调控元件相互作用的蛋白质, 调控着ＬＩＰ基因的转录表达。     

泛蛋白连接酶Ubc9参与氧还蛋白Ref—1的降解

氧还蛋白Ｒｅｆ－１是一种双功能蛋白质,在细胞氧还调控和ＤＮＡ无嘌呤／无嘧啶损伤修复中起重要作用。发寻找与它相互作用的蛋白Ｒｉｐｓ（Ｒｅｒ－１ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｎｇ ｐｒｏｔｅｒｎｓ）,用Ｒｅｆ－１氧还功能域进行了酵母双杂交库的筛选,得到了５种阳性克隆。其中Ｒｉｐ３经测序证实为泛蛋白连接酶Ｕｂｃ９。Ｈｅｌａ细胞中共过表达Ｕｂｃ９可以明显抑制Ｒｅｆ－１对ＡＰ－１报告系统的增强作用。Ｗｅｓｔｅｒｎ印迹     

核酶的抗病毒作用

反义核酸技术（ａｎｔｉｓｅｎｓｅｎｕｃｌｅｉｃａｃｉｄｓｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）是根据核酸杂交原理设计的以选择性地抑制特定基因表达为目的的一类核酸研究新技术,它包括反义ＲＮＡ（ａｎｔｉｓｅｎｓｅＲＮＡ,ａｓＲＮＡ）、反义ＤＮＡ（ａｎｔｉｓｅｎｓｅＤＮＡ,ａｓＤＮＡ）及核酸（ｒｉｂｏｚｙｍｅ,Ｒｚ）三大技术领域,反义核酸技术同基因治疗一样已经成为一项引人瞩目研究领域。本文对核酸作用的原理和在抗病毒方面的研究进展作一综述     

蛋白质间相互作用技术的研究近况

蛋白质间相互作用技术的研究近况黄翠芬叶棋浓（军事医学科学院生物工程研究所,北京１００８５０关键词：蛋白质,相互作用,技术ＲｅｃｅｎｔＡｄｖａｎｃｅｓｉｎｔｈｅＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓｏｆＰｒｏｔｅｉｎ┐ＰｒｏｔｅｉｎＩｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓＨｕａｎｇＣｕ...     

杆状病毒DNA解旋酶

ＤＮＡ解旋酶 (ｈｅｌｉｃａｓｅ)是ＤＮＡ复制过程中一类重要的酶 ,负责打开ＤＮＡ双链 ,并参与新生链的合成 ,在ＤＮＡ修复和重组过程中都发挥着必不可少的作用。杆状病毒ＤＮＡ解旋酶除了参与ＤＮＡ复制外 ,对于晚期基因的转录、关闭宿主蛋白质合成及决定杆状病毒宿主域方面都有重要的作用。1.杆状病毒解旋酶的结构目前已有 5种杆状病毒的ＤＮＡ解旋酶基因得到克隆并测序 ,分别是苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒(ＡｃＭＮＰＶ) ,黄杉毒蛾核多角体病毒 (ＯｐＭＮＰＶ) ,家蚕核多角体病毒 (ＢｍＮＰＶ) ,甜菜夜蛾核多角体病毒(ＳｅＭＮＰＶ)及粉…     

线粒体与细胞凋亡机制

细胞凋亡是生理性的细胞死亡过程,受到多种基因的精确调节,一类被统称为ｃａｓｐａｓｅ的半胱氨酸蛋白酶是细胞凋亡程序的执行者,综们被激活后作用于细胞内的一些蛋白质,经起细胞凋亡。线粒体中含有许多凋亡相关因子,在凋亡信号转导中起着重要作用。细胞受到凋亡刺激后,细胞色素ｃ、ＡＩＦ、ｃａｓｐａｓｅ－９等凋亡相关因子从线粒体中释放出来。细胞色素ｃ通过和Ａｐａｆ－１、ｃａｓｐａｓｅ－９相互作用,激活ｃａｓｐａｓ     

几种濒危植物及其近缘类群总DNA的提取与鉴定

用低ｐＨ 介质,高盐沉淀蛋白质方法成功地从银杉（Ｃａｔｈａｙａ ａｒｇｙｒｏｐｈｙｌｌａ Ｃｈｕｎ ｅｔＫｕａｎｇ）、矮牡丹（Ｐａｅｏｎｉａ ｓｕｆｆｒｕｔｉｃｏｓａ ｖａｒ． ｓｐｏｎｔａｎｅａ）、南川升麻（Ｃｉｍ ｉｃｉｆｕｇａ ｎａｎｃｈｕａｎｅｎｓｉｓＨｓｉａｏ）、裂叶沙参（Ａｄｅｎｏｐｈｏｒａ ｌｏｂｏｐｈｙｌｌａ）的同属种泡沙参（Ａ． ｐｏｔａｎｉｎｉｉ）等植物中提取和部分纯化了细胞总ＤＮＡ,并对其产率、质量和纯度作了鉴定。此方法的关键是用了一个低ｐＨ提取介质,它能有效防止组织破碎及沉淀大量材料时的电离化作用及酚化合物的进一步氧化。所得ＤＮＡ 不需经氯化铯梯度离心或柱层析,直接可用于限制性片断长度多态性（ＲＦＬＰ）及随机扩增的ＤＮＡ多态性（ＲＡＰＤ）等分子水平的遗传标记。为检测濒危植物的遗传多样性提供了一套迅速、简便和可靠的技术方案     

水稻D1snoRNA及其基因的鉴定和功能分析

测定和比较了籼稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．ｓｐ．ｉｎｄｉｃａ）、粳稻（Ｏ．ｓａｔｉｖａＬ．ｓｐ．ｊａｐｏｎｉｃａ）和多年生野生稻（Ｏ．ｒｕｆｉｐｏｇｏｎＷ．Ｇｒｉｆｉｔｈ）ｈｓｐ７０基因第一个内含子中Ｄ１ＤＮＡ以及部分上游序列,并通过Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交及ｃＤＮＡ序列分析对Ｄ１ＤＮＡ编码的Ｄ１ｓｎｏＲＮＡ进行了实验鉴定。Ｄ１ｓｎｏＲＮＡ属于反义ｓｎｏＲＮＡ家族,它与水稻２５ＳｒＲＮＡ互补序列为１４个核苷酸长。根据理论计算,Ｄ１ｓｎｏＲＮＡ具有指导水稻２５ＳｒＲＮＡ中第８０７位的核糖甲基化功能。Ｄ１ＤＮＡ与Ｃ１ＤＮＡ相隔仅１０５个核苷酸,在内含子中如此短的距离内连续编码两种ｓｎｏＲＮＡ是罕见的,这一结构为研究串联结构的ｓｎｏＲＮＡ转录后加工机制提供了一个良好的研究体系。     

HMG蛋白质与人ε-珠蛋白基因5′旁侧调控元件DNA相互作用

ＨＭＧ蛋白质是一类在染色质内含量极为丰富的非组蛋白质,它们在染色质的结构与功能中起着重要的作用。本文运用凝胶电泳阻抑法和ＤＮａｓｅＩ足迹法分析了ＨＭＧ蛋白质与人ε－珠蛋白基因５′旁侧调控元件ＤＮＡ之间相互作用的情况。结果表明ＨＭＧ蛋白质（１／２）既能与两个正调控元件（－５３５～－４５３ｂｐ和－４４６～－４１９ｂｐ）ＤＮＡ相结合,也能与启动子（－１７７～＋１ｂｐ）ＤＮＡ相结合;而ＨＭＧ蛋白质（１４／１７）都不能与它们相结合。相反,ＨＭＧ蛋白质（１４／１７）能与一个负调控元件（－３９２～－１７７ｂｐ）ＤＮＡ相结合,而ＨＭＧ蛋白质（１／２）却不能与它相结合。上述的结果提示了ＨＭＧ蛋白质在人ε－珠蛋白基因时空表达过程中起着积极的调控作用。     

E.coli Rho因子的结构与功能

Ｅ．ｃｏｌｉＲｈｏ因子的结构与功能赖兵张海（北京大学生命科学学院生物化学与分子生物学系,北京１００８７１）关键词Ｒｈｏ因子ＡＴＰａｓｅ转录过程中起决定作用的序列,蛋白质因子及它们之间的相互作用,一直是生物化学家和分子生物学家关注的焦点之一。由于真核生...