鸟枪法测序获得果蝇基因组测序成功

美国科学家宣布他们已完成了果蝇Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａｍｅｌａｎｏｇａｓｔｅｒ基因组的破译工作。他们破译了占编码区 97%的 12 0 0 0 00 0 0个碱基。该基因组附加区的 6 0 0 0 0 0 0 0个碱基则因尚未具备测定技术而未破译 ,他们说其中几乎不含有基因。他们所用的是一种有争议的测序法 ,即鸟枪测序法 ,该法遭到许多科学家的批评 ,但现在正是这个技术获得了成功 ,其结果甚至超越了最乐观的预见。鸟枪法测序就好象做拼板游戏。研究者将果蝇的基因组随机地切成小片 ,然后测定每一个ＤＮＡ小片段的核苷酸序列 ,他们称这些小片段是“测序工厂”…     

问：怎样理解DNA分子空间构象的相对稳定性？

问：怎样理解ＤＮＡ分子空间构象的相对稳定性？答;ＤＮＡ分子结构稳定性主要是指其空间构象（即双螺旋结构）的相对稳定性。ＤＮＡ空间构象的稳定性原因有三：第一个原因是ＤＮＡ分子中存在大量的氢键。根据对碱基构象的研究,发现在腺源吟Ａ和胸腺闻咤Ｔ之间可以形成２...     

《科学》：新型单分子DNA测序仪研制成功

科学网消息：美国Helicos BioSciences公司研究人员近日称,他们开发出了一种新型的测序设备——单分子DNA测序仪（single-molecule DNA sequencers）。该仪器能够“阅读”单分子DNA的单个碱基。相关研究文章发表在4月4日的《科学》（Science）上。     

Phen-Cu-Vc-H_2O_2体系中DNA化学发光的碱基特异性

在Ｐｈｅｎ－Ｃｕ－Ｖｃ－Ｈ２Ｏ２体系中研究了ＤＮＡ损伤过程中化学发光的碱基特异性。结果表明,ＤＮＡ的发光强度随ＤＮＡ浓度增大而线性增大,五种常见碱基中只有鸟嘌呤可产生发光。鸟嘌呤环上不同位点的取代对发光有不同影响,Ｎ７,Ｏ６位甲基取代使发光减弱,Ｎ９位核糖磷酸取代使发光增强,并随所含磷酸基团数目的增多而增大。脱氧核糖鸟苷或鸟苷酸发光强度大于核糖鸟苷或鸟苷酸     

对TMV不同抗性番茄品种叶绿体DNA的RAPD分析

本实验对ＴＭＶ抗性和敏感的两个番茄品种ｃｔ－ＤＮＡ进行ＲＡＰＤ分析,结果发现在２０个引物中有４个引物的扩增产物存在明显差异,共显示出１４条差异带。这可能是由于ｃｔ－ＤＮＡ碱基顺序变异或小片段ＤＮＡ插入或缺失造成的,深入研究将对探讨番茄抗ＴＭＶ的分子机理,进而用遗传工程方法培育抗病品种具有重要意义。     

利用嵌合RNA：DNA寡聚核苷酸进行核酸序列突变

动物中内源基因的单核苷酸突变可以引起多种单基因疾病。传统的基因疗法大多利用外源基因的导入 ,由于转基因的效率和外源基因表达上存在问题 ,这种基因疗法有一定的局限性。本文介绍的利用嵌合ＲＮＡ :ＤＮＡ寡聚核苷酸 (ＲＤＯ)在ＤＮＡ水平上对突变基因进行修复是一种新的基因疗法。这种基因疗法同样适用于植物 ,并且在植物功能基因组的理论研究中有重要作用。1　嵌合ＲＮＡ :ＤＮＡ寡聚核苷酸 (ＲＤＯ)的分子结构ＲＤＯ有一段五碱基长的ＤＮＡ序列 ,除了突变的位点以外 ,与靶基因互补。五碱基的ＤＮＡ序列两旁各有 1 0个 2’ -Ｏ -甲基…     

“三链DNA结构模型和能力学的理论生物学研究”获云南省科学技术一等奖

中国科学院昆明动物研究所刘次全研究员等 ,在中国科学院化学研究所ＳＴＭ实验室首次观察到变性条件下λ噬菌体ＤＮＡ三链辫状结构的直观形貌 ;在此基础上 ,参照ＴＡＴ三碱基体的有关结构参数 ,分别在Ｍ - 2 40 0计算机和ＳＧＩ系统的4Ｄ/ 80ｓ、 4Ｄ/ 2 0Ｇ和ＳＧＩＩｎｄｉｇｏＲ40 0 0上成功的构建了国内外第一个三链辫状结构模型 ;进而就三碱基体模型和能力学 ,ＤＮＡ三链结构模型和能力学 ,以及三链ＤＮＡ碱基配对相互作用三链和三链辫状ＤＮＡ构象比较方面 ,进行了系统的定量和半定量的理论生物学研究。在取得较大进展的基础上 ,又对…     

核糖核酸可含胸腺嘧啶吗

一般国内教材告诉读者：脱氧核糖核酸（ＤＮＡ）含ＡＴＣＧ４种碱基,而核糖核酸（ＲＮＡ）则含ＡＵＣＧ４种碱基。从碱基组成看,两者之间仅有一个碱基的差别,ＤＮＡ中的Ｔ在ＲＮＡ中被Ｕ取代,而Ｕ和Ｔ两者在化学结构上仅相差一个甲基。可是转移核糖核酸（ｔＲＮＡ）的ＲＮＡ,在其二级结构中有一个ＴΨＣ环的结构,其Ｔ指的是胸腺嘧啶核苷酸,那核糖核酸（ＲＮＡ）也可含胸腺嘧啶Ｔ,这与通常的观点有所不同;而事实上是怎么回事呢？一般国内参考书在讲述ｔＲＮＡ转录及转录后加工时,均提到碱基的多种加工修饰方式：如还原反应、脱氨基…     

核酸杂交技术在环境微生物检测中的应用

核酸杂交技术在环境微生物检测中的应用胡稳奇,张志光（湖南师范大学生物系,长沙４１０００６）核酸分子杂交技术是７０年代发展起来的一种崭新的分子生物学技术,即根据ＤＮＡ分子碱基互补配对的原理,以一特异性的ｃＤＮＡ探针与待测样品的ＤＮＡ或ＲＮＡ形成杂交分子...     

DNA烷基化损伤修复新机制

广泛存在于自然环境和饮食当中的烷基化试剂 (如亚硝基胺类和亚硝基胍类 )是造成ＤＮＡ损伤的原因之一 .烷基化试剂能将ＤＮＡ中碱基 ,特别是嘌呤碱基烷基化 .除Ｎ7和Ｎ3烷基化外 ,还能在Ｏ 6及磷酸骨架上出现烷基化 .目前 ,对于ＤＮＡ烷基化损伤修复机制主要有两种 :一 ,Ｎ位置上的烷基由ＤＮＡ糖基酶去除 .细胞内糖基酶有多种 ,针对不同的碱基和烷基化位点分为尿嘧啶糖基酶、3 甲基腺嘌呤糖基酶、甲酰亚氨嘧啶糖基酶、嘧啶二聚体糖基酶等 .修复反应包括烷基化碱基的切除及与互补链相应碱基的重新配对 .二 ,Ｏ位置上的烷基由烷基转移酶去除…     

番茄OVATE基因调控果实梨形发育

ＰｒｏｃＮａｔｌＡｃａｄＳｃｉＵＳＡ ,2 0 0 2 ,99:1 330 2～ 1 330 6早期研究表明番茄果实的梨形性状由位于第二染色体的一个隐性基因ｏｖａｔｅ所控制 ,ｏｖａｔｅ基因位于分子标记ＴＧ645附近 ,以此标记为探针筛选番茄ＢＡＣ文库将该基因定位于一个长为 1 0 5ｋｂ的ＤＮＡ片段内 ,进一步的分子标记定位表明该基因在含有 8个ＯＲＦ的 55ｋｂＤＮＡ内。通过ＰＣＲ扩增了圆形番茄这一区域ＤＮＡ并进行测序 ,结果表明突变体的ＯＲＦ6中有三处发生了突变。ＯＲＦ6由两个外显子和 1个内含子组成 ,有一个点突变和一个 2ｂｐ的插入或缺失突变…     

抗癌药物ADM与DNA相互作用的紫外共振拉曼光谱的研究

用紫外共振拉曼光谱研究了ＡＤＭ与小牛胸腺ＤＮＡ相互作用,分析表明：ＡＤＭ插入ＤＮＡ的ＧＣ－ＣＧ位置,ＡＤＭ与ＤＮＡ之间的主要相互作用是蒽环π电子与碱基Ｇ和Ｃ的π电子形成的π－π电子相互作用,并通过碱基Ｇ,Ｃ的ＮＨ２的氮的孤对Ｐ电子与ＡＤＭ的π－Ｐ电子相互作用以及ＡＤＭ和ＤＮＡ碱基Ｇ,Ｃ和ＰＯ２之间形成的氢键使相互作用加强;ＡＤＭ插入ＤＮＡ使其构象产生一定变化,但未破坏ＤＮＡ碱基对间的氢键。     

肽核酸（PNA）的特性及其在分子生物学研究中的应用

ＰＮＡ是一类新的信息分子,具有不带电荷的类似于肽链的骨架结构并携带有碱基,能与互补的ＤＮＡ和ＲＮＡ分子杂交,故其在生物化学和分子生物学研究领域中具有广阔的应用前景。本文就其特性及其应用前景进行了简要叙述。     

抗癌药物ADM与DNA相互作用的紫外共振拉曼光谱的研究

用紫外共振拉曼光谱研究了ＡＤＭ与小牛胸腺ＤＮＡ相互作用,分析表明：ＡＤＭ插入ＤＮＡ的ＧＣ－ＣＧ位置;ＡＤＭ与ＤＮＡ之间的主要相互作用是蒽环π电子与碱基Ｇ和Ｃ的π电子形成的π－π电子相互作用,并通过碱基Ｇ、Ｃ的ＮＨ＿２的氨的孤对Ｐ电子与ＡＤＭ的π电子形成的π－Ｐ电子相互作用以及ＡＤＭ和ＤＮＡ碱基Ｇ、Ｃ和ＰＯ＿２之间形成的氢键使相互作用加强;ＡＤＭ插入ＤＮＡ使其构象产生一定变化,但未破坏ＤＮＡ碱基对间的氢键。     

分子遗传学简介

DNA双螺旋结构中碱基之间的配对不是随意的, 总是腺嗦吟(A）与胸腺咯咤(T）相配对, 鸟嗓吟 {G）与胞嚓咤(C）相配对。在DNA分子中,一条链 上有一个G,另一条链上必定有一个C与它配对。同 样一条链上,有一个A,另一条链上必定有一个T与它 配对。因此,这两条链上的碱基配对是互补的。这样, 当一条核普酸链上的碱基顺序固定下来时,按照碱基 互补原则即可决定另一条链上的碱基排列顺序。碱基 互补现象具有十分重要的生物学意义,因为它不仅与 核酸结构有关,而且DNA的复制、转录及遗传信息的 传递都与它有着密切的关系。根据碱基之间连接研究 的结果,确定了腺p吟是与胸腺q, p}相结合的,其间形 成两个氢键;鸟漂吟是与胞嚓咤相结合的,其间形成三 个氢键。所以鸟0吟与胞嚓吮的结合比腺G吟与胸腺 璐咤的结合要稳定得多。其结构式如下：     

Maxam-Gilbert DNA序列分析实验方法(续)

碱基专一性的化学切断反应碱基专一性的部分切断反应包括以下三步:1.用具有碱基专一性的化学试剂对DNA分子中的某一种碱基进行部分修饰,控制修饰反应的条件,使DNA分子中每一个那样的碱基分别只在一部分DNA分子中被修饰;2.利用另一种化学试剂将被修饰的碱基从脱氧核糖     

tDNA^Trp识别位碱基的研究

识别位碱基Ｇ７３,为ｔＲＮＡ＾Ｔｒｐ的主要个性元件之一,ｔＤＮＡ＾Ｔｒｐ－ＮＣＣｒＡ的氨酰化活力测定及圆二色谱均表明在相同的ｐＨ条件下,识别位碱基的改变将影响到ｔＲＮＡ３′端的构象,而具有同一识别位碱基的ｔＤＮＡ＾Ｔｒｐ在不同ｐＨ条件下,亦显示出不同的构象及氨酰化活力,ｔＤＮＡ＾Ｔｒｐ的研究表明,是ｔＲＮＡ的构象而不是碱基本身决定了ｔＲＮＡ与其相应合成酶之间的精确识别。     

DNA和RNA双链中可视的瞬时沃森·克里克样错配

<正>碱基的互变异构是指碱基中的酮基或氨基发生酮式-烯醇式或者氨基-亚氨基的结构互变,在作为模板时可引起互补碱基的改变。而阴离子碱基即带有一个负电荷的碱基,在碱基互补配对过程中也可导致错配。杜克大学医学中心生物化学系的Isaac J.Kimsey等围绕碱基的互变异构以及阴离子碱基对DNA和RNA结构的影响进行了详细的研究。互变异构和阴离子碱基有重要的生物作用,但是由于他们存在时间短,丰度低,并且涉及到了质子的细微移动,因此他们的发生率及功能尚不清楚。研究人员使用核磁共振技术对DNA和RNA进行松弛分散,发现了dG·dT和rG·rU的摆动错     

拟南芥DNA全序列测定与分析完成

在 2 0 0 0年 1 2月 1 4日英国出版的ＮＡＴＵＲＥ杂志上 (Ｖｏｌ.4 0 8:796～ 81 5) ,发表了植物分子遗传研究的模式开花植物拟南芥 1 1 5.4Ｍｂ的全序列图谱 ,原文的中文译名为“开花植物拟南芥的基因组序列分析”。拟南芥ＤＮＡ全长 1 2 5Ｍｂ ,只剩下 1 0Ｍｂ的中心着丝区ＤＮＡ ,因为多重复序列所含基因很少 ,还未全测出。拟南芥全基因组ＤＮＡ包含 2 5498个功能基因组及其所对应的 1 1 0 0 0个蛋白质家族。这是人类首次全部破译出一种高等植物的全基因序列 ,是在分子水平上向植物生命奥秘探索的又一里程碑式的工作。拟南芥植物基因组…     

RAPD分子标记及其在作物遗传育种中的应用

ＲＡＰＤ分子标记是一种新型的分了遗传标记,其原理是采用１０个碱基的随机引物,以基因组ＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ随机扩增。其优越性在于其方法简单;分析中的花费少,用时短;分析所需的ＤＮＡ用量也不多等。本文着重介绍以电泳技术和ＰＣＲ扩增技术为核心的分子标记以及在农作物遗传育种中的应用。