药用植物资源的整合信息数据标准规范探讨

从药用植物资源可持续利用对科学数据的需求出发,分析了药用植物资源信息数据的现状,阐明了在科研信息化环境下建立具有参考型数据库性质的药用植物资源整合信息数据库的必要性,探索了药用植物资源数据的规范与框架,开发了面向药用植物资源可持续利用的信息需求和共享交换的数据元标准,为建设共享、集成的药用植物信息系统提供了统一的数据接口,以期促进药用植物资源共享集成信息平台的建设.     

福建省实验动物技术服务基地建设规划的思路

制订福建省2008～2010年实验动物技术服务基地建设规划,是促进实验动物科技资源的合理配置与共享和实验动物学科发展的需求。本文根据对全省实验动物科技现状的调查,在《福建省＂十一五＂科技发展规划纲要》的基础上,提出制订福建省2008～2010年实验动物技术服务基地建设规划的思路,包括指导思想、工作目标、工作重点和对策措施。通过整合、优化和提升实验动物现有资源,建设技术先进、管理规范、开放运行的实验动物技术服务平台,成为我省生命科学、生物科学、食品、化妆品、保健品等相关研究与技术开发提供公共服务的动物实验基地,实现全省范围的服务共享。     

生命与健康大数据中心资源

生命与健康多组学数据是生命科学研究和生物医学技术发展的重要基础。然而,我国缺乏生物数据管理和共享平台,不但无法满足国内日益增长的生物医学及相关学科领域的研究发展需求,而且严重制约我国生物大数据整合共享与转化利用。鉴于此,中国科学院北京基因组研究所于2016年初成立生命与健康大数据中心(BIG Data Center, BIGD),围绕国家人口健康和重要战略生物资源,建立生物大数据管理平台和多组学数据资源体系。本文重点介绍BIGD的生命与健康大数据资源系统,主要包括组学原始数据归档库、基因组数据库、基因组变异数据库、基因表达数据库、甲基化数据库、生物信息工具库和生命科学维基知识库,提供生物大数据汇交、整合与共享服务,为促进我国生命科学数据管理、推动国家生物信息中心建设奠定重要基础。     

国家微生物科学数据中心——国家微生物资源大数据体系建设

国家微生物科学数据中心成立于2019年，以中国科学院微生物研究所作为依托单位。中心数据资源总量超过6 PB，数据记录数超过52亿条，数据内容完整覆盖微生物资源、微生物及交叉技术方法、研究过程及工程、微生物组学、微生物技术以及微生物文献、专利、专家、成果等微生物研究的全生命周期。国家微生物科学数据中心通过建设一系列重点数据库构建系统全面的国家微生物大数据体系，涉及全球微生物菌种分类及研究领域、病原微生物研究领域、微生物组研究方面及真菌研究领域，为全球微生物学相关的工作者提供信息服务和交流平台。在新冠疫情期间，中心开发新型冠状病毒国家科技资源服务系统，第一时间建立了全球科学数据发布及共享平台。研发的新型冠状病毒变异评估和预警系统(New Coronavirus Variation Evaluation and Early Warning System, VarEPS)，是全球首个对SARS-CoV-2基因组已知变异及虚拟变异进行多维度风险评估和预警的系统。中心以世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms,WDCM)为平台，倡导全球微生物菌种...     

中国医学科学院医学实验动物研究所

正简介中国医学科学院医学实验动物研究所成立于1980年,是从事实验动物学和比较医学科研与教学的专业研究所,是国内唯一的集实验动物和疾病动物模型资源创制、保种和生产供应、比较医学技术研究及实验动物技术培训于一体的研究单位。研究所使命是为生物医药研究提供实验动物资源、人类疾病模型资源、比较医学分析和评价技术服务和人才培训,实现实验动物资源、技术、信息交流和人才的支撑。     

CNGBdb：国家基因库生命大数据平台

国家基因库生命大数据平台(China National GeneBank DataBase, CNGBdb)是一个致力于生命科学多组学数据归档和开放共享的数据库平台,是深圳国家基因库的核心功能"三库两平台"中生物信息数据库的对外服务平台,拥有深圳国家基因库丰富的样本资源、数据资源、合作项目资源和强大的数据计算和分析能力等优势。生命科学研究已经进入到了一个以高通量多组学数据为基础的大数据时代,迫切需要加强国际合作和信息共享。随着中国经济的发展和在生命科学研究领域的研究项目投入力度的加大,需要建立相关的生命大数据归档和共享的平台,来促进我国生命科学研究项目中生成的基因组学数据的系统管理、开放共享与合理利用。目前,CNGBdb主要提供生命科学研究相关的数据归档、知识搜索、数据管理、数据计算和数据服务等服务。其归档和共享的数据类型,主要包括项目、样本、实验、测序、组装、变异、序列等。截止2020年5月22号,CNGBdb已接受了全球生命科学科研工作者提交的研究项目达2176个,归档的基因组学数据量超过2221TB。未来,CNGBdb将继续推动生命科学研究多组学数据的开放共享和产业应用,完善基因组学数据的归档和共享功能,提升其服务生命科学数据开放共享的能力。CNGBdb的网址是:https://db.cngb.org/。     

中国替代方法研究评价中心共识平台的建立

在社会需要和科技进步的双重推动下,＂3R＂原则和动物试验替代方法正在从道德理念向实验技术转变。站在全球科技发展的高度,结合我国实验动物替代领域的现状和未来趋势,利用MSSQLServer2000构建中国替代方法研究评价中心共识平台,管理信息数据库,用WEB技术将数据库与internet WWW（WorldWideWeb）页面连接,构成动态的咨询平台和信息数据网络查询系统。该共识平台的建立为国内从事实验动物及替代方法研究应用的用户提供了便利,起到了国内外替代技术交流的桥梁作用。     

我国医疗卫生资源配置现状与政策建议

作为有限的公共资源之一的卫生资源,其配置状况直接影响卫生服务需求及利用,本文重点分析了影响医疗服务公平性和可及性相关的宏观背景、发展趋势和主要问题,提出战略建议如下：落实公立医疗机构改革,发挥示范作用;规范“互联网+医疗流程”模式,促进传统医疗资源共享,提高健康大数据利用效率;推进紧密型医疗集团发展,建立柔性的分级诊疗制度;构建全科医生生态区域和健康管理网络,实现资源下沉;试行第三方影像检验平台等新型服务模式,推进均质服务。     

关于举办“实验用非人灵长类动物专业技术交流会暨非人灵长类实验动物医师岗位培训班”的通知

正非人灵长类实验动物资源是推动生命科学发展、攻克人类重大疾病,保障生命健康的重要战略资源。在引领和支撑生命科学研究、生物技术创新和生物医药产业发展中发挥着不可或缺的重要作用,其战略地位受到了世界各国的普遍重视。为了进一步加强我国非人灵长类实验动物资源培育,开发特色实验动物模型,增强相关工作人员的职业技能。以满足重大科学研究和医药产业发展的需求,提高我国科学技术创新能力。     

东莞松山湖明珠实验动物科技有限公司

东莞松山湖明珠实验动物科技有限公司（南方医科大学实验动物科技园）致力于建设覆盖整个实验动物领域、凸显非人灵长类、比格犬和小型猪资源优势与特色的实验动物繁育和动物实验研究一站式服务体系,已具备实验动物资源标准化建设、人类重大疾病模型研制、药物筛选及安全性评价、医疗器械安全和效能检测等领域的综合研究服务能力。 公司拥有标准化实验动物生产和动物实验设施及配套功能实验室近3万平方米,持有广东省实验动物生产和使用许可证,是广东省科技人才基地以及南方医科大学生物学一级学科博士后流动工作站,目前承担多项国家和省级科研项目。愿与海内外研究机构紧密合作,为制药、医疗和生物科技行业提供多种形式的合作研发服务。     

招聘启事

<正>生化与细胞所动物实验技术平台招聘动物饲养管理技术人员中科院上海生物化学与细胞生物学研究所动物实验技术平台是研究所重要的公共服务和技术支撑平台之一。动物实验技术平台拥有大小鼠屏障设施4000平方,小鼠IVC笼位20000个及一批动物实验相关的仪器设备,能为科研工作提供良好的实验动物饲养管理服务及专业化的技术支持,包括大小鼠的饲养管理、生理指标检测、影像学诊断、行为学分析及胚胎操作等。详细信息请参考网站     

药用植物保育云服务平台设计与实现

药用植物资源是中医药事业和生物医药产业赖以生存和发展的重要资源,同时也是我国的中医药文化遗产的载体。而药用植物资源的保育工作是药植资源可持续性开发与应用的基础。随着生物信息学与信息化技术的快速发展,利用包括云计算在内的新兴信息化技术,在传统种质资源保护与管理等方面的应用越来越多,然而,在药用植物资源保育方面还有待开发与应用。利用云计算、数据库应用及生物信息学等相关技术,对我国药用植物资源的保育数据进行信息化及平台建设,构建药用植物保育云服务平台系统。该系统通过收集、整理和加工药用植物资源信息,开展药用植物数据信息化与应用开发,完成药用植物保育云服务平台,可提供药用植物保护及新物种培育等方面信息查询服务。该平台对于药用植物研究相关的数据标准化、保育学科研究,以及信息共享与服务,具有较为重要的应用价值与社会意义。     

实验动物生物学特性数据的分类编码

参照国家“实验动物资源共性描述规范”的数据分类原则,以实验动物所包含的基本信息、遗传数据、生理数据、生化数据、解剖数据等五大生物学特性数据种类进行划分,采用层级结构探索了一套灵活性、可扩展的实验动物生物学特性数据动态分类编码方法,该方法对实验动物数据资源的科学保存、有效共享和科学管理具有重要的支撑作用。     

国家农作物种质资源平台的建立和应用

农作物种质资源是生物多样性的重要组成部分, 是作物育种和农业生产的物质基础。长期以来, 我国农作物种质资源标准不统一、资源保存相对分散、信息网络设施薄弱, 制约了农作物种质资源的共享利用。本文提出了国家农作物种质资源平台的概念和架构, 它是一个虚拟式的农作物种质资源机构, 由国家长期种质库、国家复份种质库、国家中期种质库、国家种质圃和国家种质信息中心组成。阐述了农作物种质资源技术规范体系构建的原则和方法, 建立了由110种作物的描述规范、数据规范和数据质量控制规范组成的技术规范体系。提出了以信息共享带动实物共享的思路、方法和途径, 建成了拥有39万份种质信息的国家农作物种质资源数据库和中国作物种质资源信息网(http://www.cgris.net/)。创建了日常性服务、展示性服务、针对性服务、需求性服务和引导性服务等5种农作物种质资源服务模式, 有效解决了农作物种质资源共享利用的难题。     

2019新型冠状病毒信息库

2019年12月在中国武汉开始爆发的新型肺炎已造成全球25个国家/地区的31516人感染、638人死亡(截止2020年2月7日16时),引起该肺炎的病毒被世界卫生组织命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。为促进2019-nCoV数据共享应用并及时向全球公众提供病毒的相关信息,国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)建立了2019新型冠状病毒信息库(2019nCoVR,https://bigd.big.ac.cn/ncov)。该信息库整合了来自德国全球流感病毒数据库、美国国家生物技术信息中心、深圳(国家)基因库、国家微生物科学数据中心及CNCB/NGDC等机构公开发布的2019-nCoV核苷酸和蛋白质序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章等信息,开展了不同冠状病毒株的基因组序列变异分析并提供可视化展示。同时,2019nCoVR无缝对接CNCB/NGDC的相关数据库,提供新测序病毒株系的基因组原始测序数据、组装后序列的在线汇交、管理与共享、国际数据库同步发布等数据服务。本文对2019nCoVR数据汇交、管理、发布及使用等进行全面阐述,以方便用户了解该信息库各项功能及数据状况,为加速开展病毒的分类溯源、变异演化、快速检测、药物研发以及新型肺炎的精准预防与治疗等研究提供重要基础。     

弓形虫感染实验动物模型的特点及建模方案的选择

弓形虫感染对人类生活和畜牧业发展构成严重威胁。弓形虫感染实验动物模型是进行弓形虫学相关研究的基础条件之一。在实际研究工作中,根据不同的实验目的、选取不同的实验动物和以不同的实验方法所建立的实验动物模型,呈现出复杂和多变的特点。这一方面可以满足不同实验的需要,但同时也在实验结果的评价上导致一定程度的不足。根据弓形虫感染实验动物模型的不同特点,针对特定的实验目的,选择适合方法建立适合的实验动物模型,是进行相关弓形虫学研究的有效基础和前提。     

基于SSH的网络文件管理系统的设计

网上文件管理系统是网络资源的一种共享机制。它采用对用户分级管理的方式,为不同级别的用户提供不同的资源服务。一般来说,网上文件管理系统包含两大服务类,一类是用户管理,一类是资源共享。其中资源共享有分为对资源的上传、下载及删除。用户管理包含用户消息管理、管理员对用户的权限管理、用户的备忘录、查询的文件和用户的信息等功能。     

孤独症谱系障碍动物模型相关神经生物学研究进展

孤独症谱系障碍(austim spectrum disorder, ASD)是一种以社交和沟通障碍以及重复和限制性行为为特征的神经发育障碍。ASD的表型异质性使得确定核心症状涉及的确切病因和病理生理机制困难重重,且这些症状通常伴有注意缺陷多动障碍、癫痫发作和感觉运动异常等共患病。动物模型提供了阐明疾病的病因和发病机制的重要平台。越来越多的研究利用如环境暴露、母体免疫激活(maternal immune activation, MIA)等诱导的动物模型进行孤独症谱系障碍病因病机的探讨以及药物治疗靶点的筛选。该文综述常见动物模型的不同神经网络机制、脑组织及相关因子变化、症状表型等方面,为今后进行精准动物实验研究提供针对性的动物模型选择,也可为阐明疾病神经生物学、开发潜在的治疗药物提供参考。     

东莞松山湖明珠实验动物科技有限公司

东莞松山湖明珠实验动物科技有限公司（南方医科大学实验动物科技园）致力于建设覆盖整个实验动物领域、凸显非人灵长类、比格犬和小型猪资源优势与特色的实验动物繁育和动物实验研究一站式服务体系,已具备实验动物资源标准化建设、人类重大疾病模型研制、药物筛选及安全性评价、医疗器械安全和效能检测等领域的综合研究服务能力。     

医院动物实验与科研情况分析

目的:通过对沈阳军区总医院近5年的动物实验情况以及科研相关数据的分析,得出动物实验情况概况及发展规律,以期更好地为科研服务。方法:回顾性分析沈阳军区总医院整体的科研课题层次、数量、资助强度、动物实验人员的学历层次,以及实验动物种类和数量的相关资料,分析沈阳军区总医院实验动物概况。结果:沈阳军区总医院动物实验项目随科研课题数量的增加呈逐年递增态势,实验动物模型也向多样化发展。结论:沈阳军区总医院科研课题多数需要进行动物实验,动物实验已成为医院"医教研一体化"的重要组成部分,实验动物这门独立的学科成为医院科研必要的支撑条件。