MALDI-TOF MS在快速检测碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌及其同源性分析中的应用

利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)筛选碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKp)特异性峰, 并进行同源性分析。

收集30株CRKp临床分离株, 采用法国梅里埃VITEK 2 Compact分析仪进行细菌鉴定和药敏试验、利用改良碳青霉烯灭活试验(mCIM)检测碳青霉烯酶; 利用MALDI-TOF MS技术筛选CRKp菌株特异性峰, 采用MALDI-TOF MS进行同源性分析, 多位点序列分型(MLST)方法作为验证。

30株CRKp株mCIM均为阳性, 其中24株含有共同特异性峰, 特异性达到80%, 符合区分阈值。蛋白质质量峰聚类分析显示, 30株CRKp株分为三大簇, 同时MLST结果表明, ST11/A型为27株、ST15/B型为2株, 而ST2193/D型仅有1株。

MALDI-TOF MS在CRKp鉴定中具有精准、快速的优点。MALDI-TOF MS能够有效进行CRKp同源性分析, 并应用于院内感染流行暴发的监测。

     

糖尿病药物那格列奈促进嗜酸乳杆菌生长的作用

系统评价糖尿病药物对乳杆菌属微生物生长的影响,并进一步探讨糖尿病药物促进乳杆菌属微生物生长的作用机制。

利用体外纯培养法评估糖尿病药物对乳杆菌属微生物生长的影响,筛选出具有促进作用的“药菌组合”,并进一步采用非靶向代谢组学技术检测“药菌组合”培养液上清中的代谢物组;采用结晶紫染色法和RT-qPCR法分别检测特定乳杆菌生物膜形成和细菌素生物合成基因的表达。

10种常见糖尿病药物对乳杆菌的生长主要表现为抑制作用,仅那格列奈可在低浓度下刺激嗜酸乳杆菌的生长,促进率达48.30%。“那格列奈―嗜酸乳杆菌组合”培养液上清中共注释到584种已知代谢物,其中差异代谢物有42个,主要富集在氨基酸代谢和生物合成、氨酰t-RNA生物合成和次生代谢产物生物合成等代谢通路上;同时,那格列奈还促进了嗜酸乳杆菌生物膜的形成以及增加了生物膜的黏附性,并上调细菌素合成结构基因的表达（t = 2.373,P = 0.033）。

糖尿病药物对乳杆菌生长普遍具有抑制作用,但那格列奈可通过调节氨基酸代谢和生物合成、促进生物膜的分泌和细菌素的生物合成来刺激嗜酸乳杆菌的生长。

     

沈阳市某三甲医院呼吸重症监护室病原菌分布及其耐药性

分析沈阳市某三甲医院呼吸重症监护室（RICU）患者相关样本病原菌分布及其耐药性,为呼吸重症患者感染的治疗提供参考。

回顾性分析该院2021年6月至2022年6月收治的253例RICU患者的病例数据,通过API菌种鉴定系统及纸片扩散法药物敏感性试验检测送检的体液和组织标本中病原菌分布及其药敏情况。

RICU患者检出阳性标本共147例,阳性率58.10%;检出革兰阳性细菌39株（11.24%）、革兰阴性细菌206株（59.37%）、真菌102株（29.39%）。占比排名前5位的病原菌为鲍曼不动杆菌（21.90%）、白假丝酵母菌（12.10%）、肺炎克雷伯菌（10.37%）、热带假丝酵母菌（7.49%）、铜绿假单胞菌（5.19%）。病原菌耐药性分析显示,鲍曼不动杆菌对常见抗生素均耐药;白假丝酵母菌对常用的抗生素均表现为敏感,但热带假丝酵母菌对伏立康唑和氟康唑的耐药率超过50.00%;相比痰液,尿液中肺炎克雷伯菌的耐药率较高;铜绿假单胞菌对亚胺培南、替卡西林/克拉维酸的耐药率均超过50.00%。

该院RICU患者主要是以革兰阴性细菌和真菌感染为主,其中鲍曼不动杆菌和白假丝酵母菌所占比例较高,二者对常用的抗生素普遍耐药,临床可据此对病原菌耐药性的变化进行实时监测,为合理选用抗生素提供依据。

     

基于16S rDNA测序技术分析功能性便秘患者粪便菌群

运用16S rDNA测序技术分析功能性便秘（FC）患者粪便菌群特征,以期寻找FC特征菌,为FC诊治寻找新的治疗靶点。

收集福建中医药大学附属第二人民医院60例实验组（FC患者）和30例正常组的粪便,采用16S rDNA测序技术分析粪便菌群结构,并进行基因功能的预测。

两组在门水平上,主要由厚壁菌门和拟杆菌门组成;在属水平上,主要优势菌以粪杆菌属和拟杆菌属为主。实验组粪便菌群丰富度指数Chao1、Observed_OTUs较正常组升高（P＜0.05）,多样性指数Shannon指数和Simpson指数虽有上升趋势,但差异无统计学意义（P＞0.05）。布劳特菌属、罗氏菌属、Ruminococcus_gnavus_group、Ruminococcus_gauvreauii_group、Eubacterium_hallii_group、Anaerostipes、Lachnospiraceae_ND3007_group、Dorea、乳球菌属在实验组中丰度均显著降低（P＜0.01）。实验组特征菌为小杆菌属,正常组为布劳特菌属和埃希菌−志贺菌属。实验组蔗糖降解Ⅲ（PWY-621）、丙酮酸发酵成乙酸和乳酸（PWY-5100）和琥珀酸发酵成丁酸盐（PWY-5677）功能下降（P＜0.05）。

功能性便秘患者主要表现为肠道菌群丰度与多样性升高,FC的发病可能与菌群结构发生改变有关。

     

不同程度颅脑疾病患者肠道菌群分析

检测不同程度颅脑疾病患者肠道菌群分布情况, 探讨患者肠道菌群分布与疾病的关系, 为该类患者的治疗提供参考。

通过MiSeq PE2x300 bp高通量测序技术对21例重度颅脑损伤患者(G1组, GCS≤8分)和14例轻度颅脑损伤患者(G2组, GCS > 8分)粪便样本中细菌的16S rRNA基因V3-V4可变区进行定性分析, 并对两组患者肠道菌群进行生物学分类比较、多样性分析和组间物种差异分析。

两组患者肠道菌群多样性差异无统计学意义(均P > 0.05)。G1组患者肠道厌氧球菌属(Anaerococcus)、埃希菌-志贺菌属(Escherichia-Shigella)、链球菌属(Streptococcus)、肠球菌属(Enterococcus)、棒状杆菌属(Corynebacterium)数量高于G2组(均P < 0.05)。

颅脑疾病患者肠道菌群紊乱, 其肠道菌群丰度及多样性显著下降, 有害菌数量升高, 有益菌数量下降。

     

肠道菌群特征与食管癌患者术后肺部感染的关系

探究食管癌患者术前肠道菌群特征与术后肺部感染的关系,为该类患者的治疗提供参考。

纳入我院2019年6月至2021年12月期间收治的272例食管癌手术患者为研究对象,根据术后是否并发肺部感染将其分为感染组（64例）和非感染组（208例）,记录患者年龄、高血压、吸烟史等一般资料。采用选择性培养基培养患者肠道大肠埃希菌、肠球菌属、葡萄球菌属、双歧杆菌属、酵母菌属、乳杆菌属、消化球菌属细菌并按照平板计数法计数,同时进行16S rRNA基因测序,进行菌群多样性分析。采用Logistic回归进行食管癌患者术后肺部感染的影响因素分析。

感染组与非感染组患者肠道菌群Chaol指数、Shannon指数、Simpson指数比较差异均无统计学意义（均P＞0.05）。与非感染组比较,感染组患者年龄≥60岁、吸烟史≥20年、术前FEV1/FVC＜70%、手术时间≥4 h患者比例及肠道大肠埃希菌、肠球菌属、葡萄球菌属数量显著升高,而肠道双歧杆菌属、酵母菌属、乳杆菌属、消化球菌属数量显著降低（均P＜0.05）。大肠埃希菌、肠球菌属是影响食管癌患者术后发生肺部感染的独立危险因素,而双歧杆菌属是影响食管癌患者术后发生肺部感染的保护因素（均P＜0.05）。

食管癌术后肺部感染患者与未发生肺部感染的其术前肠道菌群差异显著,大肠埃希菌、肠球菌属、双歧杆菌属是食管癌患者术后发生肺部感染的影响因素。

     

首发抑郁症患者肠道菌群特征及其与健康人群肠道菌群结构的差异

比较首发抑郁症患者与健康人群肠道菌群的差异,探讨抑郁症患者肠道菌群和抑郁症状间的关系,为抑郁症的发病机制研究及治疗提供一定的理论依据。

选择2019年10月至2020年9月我院收治的首发抑郁症患者及健康人群为研究对象,分为抑郁组（n = 23）和健康组（n = 31）。对研究对象肠道菌群16S rRNA基因中V4−V5区域片段进行基因测序,使用汉密尔顿抑郁量表对两组对象抑郁症状进行评估。检测两组对象肠道菌群α多样性、β多样性和组间差异。

首发抑郁症患者与健康人群肠道菌群多样性差异无统计学意义（均P＞0.05）。两组对象肠道拟杆菌门和拟杆菌纲的相对丰度差异有统计学意义（均P＜0.05）。两组对象芽胞杆菌目等的相对丰度差异有统计学意义（P＜0.05）。在属水平和种水平上,两组对象分别有28个菌属和40个菌种的丰度差异有统计学意义（均P＜0.05）。LEfSe分析显示,拟杆菌科、艾克曼菌科等10种菌科是造成两组对象肠道菌群差异的主要细菌。

首发抑郁症患者与健康人群肠道菌群多样性未发现显著差异,但抑郁症患者肠道菌群结构与健康人群相比发生了改变,主要体现在拟杆菌属等细菌在抑郁症患者肠道中的相对丰度显著上升。

     

基于TLR4/NF-κB信号通路探究涤浊汤对高尿酸血症大鼠肠道菌群紊乱的调节作用

探究TLR4/NF-κB信号通路能否成为涤浊汤调节高尿酸血症大鼠肠道菌群紊乱的机制。

将70只SPF级雄性SD大鼠随机分为NC组、HUA组、DZTL组、DZTM组、DZTH组、阳性对照组和DZTH+LPS组,每组10只。检测大鼠血清中尿酸（SUA）、肌酐（Cr）、尿素氮（BUN）、黄嘌呤氧化酶（XOD）和内毒素（LPS）水平。 HE染色观察肾组织病理学变化;16S rDNA测序检测肠道菌群alpha多样性与肠道菌群群落结构;蛋白质印迹法检测肾组织中TLR4和p-NF-κB p65蛋白表达。

与NC组相比,HUA组大鼠血清中SUA、Cr、BUN、XOD及LPS水平均显著升高（均P＜0.05）;与HUA组相比,DZTL组、DZTM组、DZTH组和阳性对照组大鼠血清中SUA、Cr、BUN、XOD、LPS水平以及Shannon指数、Sobs指数、Chao1指数、Ace指数均显著降低,DZTH组和阳性对照组变化最显著（均P＜0.05）;与DZTH组相比,DZTH+LPS组大鼠血清中SUA、Cr、BUN、XOD、LPS水平以及Shannon指数、Sobs指数、Chao1指数、Ace指数均显著升高（均P＜0.05）。与NC组相比,HUA组厚壁菌门、放线菌门、梭状芽胞杆菌属、瘤胃菌属、乳杆菌属、颤螺菌属和双歧杆菌属相对丰度均显著降低,拟杆菌门、变形菌门、TM7菌门、拟杆菌属、产芽胞菌属和TM-3菌属相对丰度均显著升高（均P＜0.05）;与HUA组相比,DZTL组、DZTM组、DZTH组和阳性对照组厚壁菌门、放线菌门、梭状芽胞杆菌属、瘤胃菌属、乳杆菌属、颤螺菌属和双歧杆菌属相对丰度均显著升高,拟杆菌门、变形菌门、TM7菌门、拟杆菌属、产芽胞菌属和TM-3菌属相对丰度均显著降低（均P＜0.05）;与DZTH组相比,DZTH+LPS组厚壁菌门、放线菌门、梭状芽胞杆菌属、瘤胃菌属、乳杆菌属、颤螺菌属和双歧杆菌属相对丰度均显著降低,拟杆菌门、变形菌门、TM7菌门、拟杆菌属、产芽胞菌属和TM-3菌属相对丰度均显著升高（均P＜0.05）。与NC组相比,HUA组大鼠肾组织中TLR4、p-NF-κB p65蛋白表达均显著增加（均P＜0.01）;与HUA组相比,DZTL组、DZTM组、DZTH组和阳性对照组肾组织中TLR4、p-NF-κB p65蛋白表达均显著降低（均P＜0.01）;DZTH组大鼠肾组织中TLR4、p-NF-κB p65蛋白表达和阳性对照组相比差异无统计学意义（P=0.559）;与DZTH组相比,DZTH+LPS组大鼠肾组织中TLR4、p-NF-κB p65蛋白表达显著增加（P＜0.01）。

涤浊汤可改善高尿酸血症大鼠肠道菌群平衡状况,发挥抗高尿酸血症的作用,其作用机制与抑制TLR4/NF-κB信号通路活化有关。

     

广西三种真红树植物可培养细菌多样性及其生物活性初筛

为了挖掘真红树植物潜在细菌新物种和生物活性物质,丰富红树林微生物多样性,为新型活性产物开发提供菌株资源。该文从秋茄、木榄和红海榄三种广西来源的真红树植物及其生境中,按根、茎、叶、花、果实和泥土分成22份样品,选用8种不同培养基分离可培养细菌,通过16S rRNA基因序列鉴定,分析其多样性,采用纸片法筛选细菌发酵粗提物的抑菌活性,点植法测试其酶活性。结果表明：(1)共分离获得可培养细菌35株,隶属于23个科28个属,芽孢杆菌属占细菌总数的14.3%,为优势菌属,同时发现11株潜在的新细菌资源。(2)活性筛选获得4株细菌具有抑菌活性,16株细菌具有酶活性,芽孢杆菌属是酶活性优势菌属。综上所述,广西真红树植物可培养细菌多样性丰富,部分细菌具有抑菌活性和酶活性,在新型抗生素和酶应用方面具有一定的开发潜力。     

夏季老年慢性阻塞性肺疾病患者口咽菌群分析

分析夏季老年慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者与健康人群的口咽菌群构成,旨在确定老年COPD患者与健康人群上呼吸道菌群间的差异。

选择2018年6—8月沈阳市沈阳医学院附属第二医院COPD患者29例和健康体检者25例,采集口咽拭子进行细菌16S rRNA高通量测序。通过菌群多样性分析、物种组成和物种差异分析,比较老年COPD患者与健康人群口咽部微生物的异同。

老年COPD患者口咽中菌群丰富度显著高于健康人群,物种多样性低于健康人群。在门水平上,老年COPD患者口咽菌群中拟杆菌门相对丰度降低,放线菌门相对丰度显著增高;在属水平上,老年COPD患者口咽菌群中罗氏菌属、放线菌属和劳特罗普氏菌属丰度均显著高于健康人群,奈瑟菌属和普雷沃菌属相对丰度降低,差异均具有统计学意义（P＜0.05）。

老年COPD患者口咽部正常菌群组成发生变化,机会致病菌如罗氏菌属、劳特罗普氏菌属比例增加,提示夏季老年COPD患者口咽菌群失调。

     

圈养食叶猴的肠道菌群特征

充分认识圈养食叶猴的肠道菌群组成特征, 为饲养管理方法的改进提供参考依据。

通过MiSeq高通量测序平台对3个物种的19个个体[黑叶猴(n=5)、川金丝猴(n=9)和西非黑白疣猴(n=5)]的肠道菌群16S rRNA V4-V5区进行测序和分析。

食叶猴肠道菌群以厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌门, 瘤胃菌科、普氏菌科、理研菌科和毛螺菌科为优势菌科, 普氏菌属、密螺旋体属和瘤胃球菌属为优势菌属; 食叶猴物种间肠道菌群组成存在显著差异, 肠道菌群按照宿主物种聚类, 而不受环境因素的影响。

宿主物种是决定肠道微生物组成的重要因素, 食叶猴肠道菌群特征反映了宿主对其食性的适应。

     

高通量扩增子测序分析生防细菌对丹参根际和根表土壤真菌群落多样性的影响

利用高量测序方法探究生防细菌对丹参植株根际和根表土壤真菌群落多样性的影响。

向丹参植株根部施入生防细菌DS-R5,培养45 d后采集根际和根表土壤样品提取总DNA,扩增样品基因组DNA的V4―V5区后进行双端测序,利用生物信息学解析生防细菌对丹参植株根际和根表土壤真菌群落多样性的影响。

菌株DS-R5处理后增加了根际和根表土壤真菌群落的多样性和丰度;根际土壤共有物种种类大于根表土壤,说明菌株DS-R5处理后根际土壤处理与对照物种种类更接近,而对根表土壤中的微生物物种影响较大。真菌群落结构组成分析结果表明,不同土壤样品在门水平上共有优势真菌主要有子囊菌门、接合菌门、担子菌门和未分类;相比根表土壤对照样品,根表土壤处理样品中子囊菌门丰度下降了13.0%,接合菌门丰度升高了69.2%;根际土壤处理样品相比根际土壤对照样品,子囊菌门和接合菌门丰度分别升高了5.9%和8.9%,但二者差异无统计学意义。在属水平上,根表土壤样品经菌株DS-R5处理后提高了有益菌属的丰度,同时降低了有害菌属的丰度。

丹参植株施入生防细菌后,改变了根际土壤和根表土壤中微生物群落结构和多样性,本研究结果可以为利用生防细菌防控丹参根腐病提供理论参考。

     

Lynch综合征患者肠道菌群特征及其与糖脂代谢水平的相关性

探讨遗传性非息肉性结直肠癌（Lynch综合征）患者肠道菌群特点及其与糖脂代谢指标的相关性。

选取2011年9月至2021年9月我院收治的42例Lynch综合征患者作为Lynch组,并选取42例同期健康体检人群作为对照组。比较两组对象粪便菌群的丰度和多样性,应用Pearson相关性检验分析不同菌属拷贝数与糖脂代谢指标水平的相关性。

Lynch组患者肠道菌群Chao1指数、Ace指数、Shannon指数均高于对照组,Simpson指数低于对照组（均P＜0.05）。Lynch组患者HbA1c、TC、TG、LDL-C、FPG、apo-B水平均高于对照组,HDL-C和apo-A1水平低于对照组（均P＜0.05）。Lynch组患者粪便中以变形菌门、肠球菌属、埃希菌属、消化链球菌属、韦荣球菌属、不动杆菌属为主要优势菌。Lynch组患者TG水平与乳杆菌属拷贝数呈负相关,与埃希菌属和韦荣球菌属拷贝数呈正相关（均P＜0.05）;HDL-C水平与乳杆菌属和布劳特菌属拷贝数呈正相关,与埃希菌属、韦荣球菌属、消化链球菌属拷贝数呈负相关（均P＜0.05）;FPG水平与乳杆菌属和布劳特菌属拷贝数呈负相关,与肠球菌属、埃希菌属、韦荣球菌属拷贝数呈正相关（均P＜0.05）。

Lynch综合征患者肠道菌群丰度和多样性低于健康人,其中乳杆菌属、布劳特菌属、埃希菌属等菌群与糖脂代谢具有相关性。

     

朱鹮肠道微生物多样性与产酶活性

【背景】朱鹮是我国国家一级保护动物,属于世界上最濒危的鸟类之一。对朱鹮肠道微生物的多样性和产胞外酶活性进行分析,可为朱鹮种群数量恢复提供思路。【目的】了解朱鹮肠道微生物的多样性,测定其产胞外酶活性。【方法】采用纯培养的方法获得朱鹮肠道微生物,通过革兰氏染色和生理生化鉴定,结合16S rRNA基因扩增和序列分析对细菌进行鉴定。使用水解圈法筛选产淀粉酶、蛋白酶、纤维素酶、脂肪酶的菌株。【结果】从人工喂养的朱鹮新鲜粪便中共分离到296株细菌,共计2个门11个属。变形菌门(Proteobacteria) 236株,占分离总数的79.73%,分别为：埃希氏菌属(Escherichia) 137株,占分离总数的46.28%;哈夫尼亚菌属(Hafnia) 39株,占分离总数的13.18%;变形菌属(Proteus) 28株,占分离总数的9.46%;柠檬酸杆菌属(Citrobacter) 23株,占分离总数的7.77%;气单胞菌属(Aeromonas) 6株,占分离总数的2.03%;肠杆菌属(Enterobacter) 1株,占分离总数的0.34%;志贺菌属(Shigella) 1株,占分离总数的0.34%;克雷伯菌属(Klebsiella) 1株,占分离总数的0.34%。厚壁菌门(Firmicutes) 60株,占分离总数的20.27%,分别为：肠球菌属(Enterococcus) 33株,占分离总数的11.15%;库特氏菌属(Kurthia) 14株,占分离总数的4.73%;芽孢杆菌属(Bacillus) 13株,占分离总数的4.39%。优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)中的埃希氏菌属(Escherichia),占细菌总数的46.28%。经过生理生化鉴定,每个菌株生理生化鉴定出的种属与各自的16S rRNA基因鉴定出的种属相一致。产酶活力分析结果显示有238株产蛋白酶、25株产脂肪酶、24株产淀粉酶、15株产纤维素酶,分别占分离总数的80.41%、8.45%、8.11%和5.07%。【结论】朱鹮肠道微生物分离出的细菌可分为2门11属,优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)中的埃希氏菌属(Escherichia),占细菌总数的46.28%;产酶活性分析显示,80.41%的菌株具有产蛋白酶能力。     

沼泽红假单胞菌对健康小鼠肠道微生物的影响

探讨不同剂量沼泽红假单胞菌对健康小鼠生理功能及肠道微生物结构的影响。

将48只C57/BL6小鼠随机分为对照组(无菌生理盐水)以及沼泽红假单胞菌低剂量组(5×10⁸ CFU/mL)、中剂量组(5×10⁹ CFU/mL)、高剂量组(5×10¹⁰ CFU/mL), 每组12只; 不同剂量灌胃4周后, 测定小鼠胃泌素(Gas)、生长抑素(SS)含量, 观察肠道形态, 并应用Illumina-MiSeq测序平台进行16S rRNA基因V3-V4区测序, 分析其肠道微生物群落结构、多样性及组间差异。

与对照组相比, 低剂量组对促进小鼠Gas分泌差异具有统计学意义(t=6.426, P < 0.01), 高剂量组对抑制小鼠SS分泌差异具有统计学意义(t=3.711, P < 0.05);对照组小鼠回肠肠绒毛高度差异无统计学意义(P > 0.05), 且无肠道炎症刺激反应。沼泽红假单胞菌干预后细菌丰富度和多样性增加, 在门水平上, 与对照组相比, 实验组小鼠肠道菌群拟杆菌门丰度显著降低, 厚壁菌门丰度显著增加(均P < 0.05);在属水平上, 与对照组相比, 实验组小鼠肠道菌群Lachnospiraceae NK4A136 group、乳杆菌属、拟杆菌属、理研菌属和Prevotellaceae UCG-001相对丰度显著增加(均P < 0.05)。

沼泽红假单胞菌能够维持胃肠激素稳态和肠道形态结构, 且对健康小鼠肠道菌群的丰富度和组成产生一定的影响, 维持肠道平衡与稳定。

     

基于16S rRNA基因测序研究蜥蜴胃康方对胃癌肝转移裸鼠肠道菌群的影响

观察不同剂量蜥蜴胃康方对胃癌肝转移裸鼠肠道菌群的影响。

60只裸鼠随机分为正常对照组(10只)和造模组(50只), 造模组用HGC-27胃癌细胞通过脾脏注射制备胃癌肝转移模型, 造模4周时, 随机取正常对照组1只与造模组5只, 取裸鼠肝组织通过病理切片对比验证造模是否成功。随后剩余造模组45只裸鼠随机分为模型组、5-氟尿嘧啶(5-FU)组以及蜥蜴胃康方高(2.6 g/mL)、中(1.3 g/mL)、低(0.6 g/mL)剂量组, 每组9只。取最后一次灌胃2 h后各组裸鼠新鲜粪便进行16S rRNA基因测序。

16S rRNA测序结果显示, 与正常对照组相比模型组裸鼠肠道菌群在门水平表现为拟杆菌门、厚壁菌门丰度下降, 放线菌门、蓝藻菌门丰度富集。属水平表现为Muribaculaceae丰度显著降低(t=3.514 4, P=0.024 6), 拟普雷沃菌属丰度显著富集(t=-4.660 1, P=0.009 6), 副拟杆菌属丰度显著富集(t=-4.284 7, P=0.012 8), 瘤胃球菌属丰度显著降低(t=3.342 7, P=0.028 8)。经蜥蜴胃康方干预后, 胃癌肝转移裸鼠的肠道菌群结构得到了改善, 门水平表现为厚壁菌门丰度增加, 放线菌门丰度降低, 各组间差异有统计学意义(H=11.619 9, P=0.040 4);蓝藻菌门丰度降低, 组间差异有统计学意义(H=11.433 1, P=0.043 4)。属水平表现为Muribaculaceae丰度升高, 拟普雷沃菌属、副拟杆菌属丰度降低; 瘤胃球菌属(H=14.658 4, P=0.011 9)、乳杆菌属(H=11.386 0, P=0.044 2)丰度显著富集, 各组间差异有统计学意义(P < 0.05)。

蜥蜴胃康方能增加厚壁菌门丰度, 降低放线菌门、蓝藻菌门丰度, 提高益生菌乳杆菌属、瘤胃球菌属丰度, 降低致病菌肠杆菌属、梭状芽胞杆菌属丰度。其中以蜥蜴胃康方高剂量组对肠杆菌属、梭状芽胞杆菌属的抑制作用最显著, 并能有效提高乳杆菌属丰度, 从而调节胃癌肝转移裸鼠肠道菌群的平衡, 增强肠黏膜免疫屏障, 激活免疫细胞释放肿瘤坏死因子来发挥对胃癌的抑制作用。

     

成人化脓性脑膜炎患者脑脊液变化

分析成人化脓性脑膜炎患者脑脊液细胞、病原菌等的变化及其关系, 为该病的有效诊断、病情监测和针对性治疗提供参考。

对我院32例成人化脓性脑膜炎患者用药前后不同时期的脑脊液分别进行常规、生化与细胞学检测, 对检测结果进行统计分析。

与恢复期比较, 患者急性期时脑压、脑脊液白细胞总数与乳酸脱氢酶水平显著升高(均P < 0.05)。32例患者中, 15例脑脊液细菌培养呈阳性。典型菌与非典型菌感染者急性期脑脊液白细胞总数、小淋巴细胞、单核吞噬细胞和嗜中性粒细胞比例差异均有统计学意义(均P < 0.05)。

成人化脓性脑膜炎患者脑脊液变化显著, 脑脊液细胞学变化与感染类型相关, 可为个性化诊疗提供参考。

     

基于16S rDNA技术研究隔药饼灸对高脂血症兔肠道菌群属水平的影响

研究隔药饼灸对高脂血症兔属水平肠道菌群的作用,筛选相关菌属。

将24只兔按随机数表法分为正常组、模型组和隔药饼灸组,每组8只;干预12周后,观察TC、TG、LDL-C水平的变化,采用16S rDNA高通量测序技术分析属水平菌落差异。

与模型组比较,隔药饼灸组兔血清LDL-C、TG、TC水平均下降（均P＜0.05）。隔药饼灸组肠道菌群结构发生改善,un_f_Muribaculaceae、un_o_Gastranaerophilales、瘤胃球菌科UCG-014属、阿克曼菌属相对丰度均显著提高（均P＜0.05）,毛螺菌属NK4A136、瘤胃梭菌属6、拟杆菌属相对丰度均降低（均P＜0.05）。

隔药饼灸能改善异常血脂及调整菌群结构,可能与上调un_f_Muribaculaceae、un_o_Gastranaerophilales、瘤胃球菌科UCG-014属、阿克曼菌属相对丰度,降低毛螺菌属NK4A136、瘤胃梭菌属6、拟杆菌属相对丰度有关。

     

双相情感障碍患者健康状况与肠道菌群的相关性分析

探讨双相情感障碍（BD）患者健康状况与肠道菌群的相关性,为该类患者的治疗提供参考。

收集我院BD患者（BD组）和健康人群（健康对照组）的粪便样本,使用QIAamp^® DNA粪便抽提试剂盒进行粪便样本的总DNA提取,随后进行16S rRNA基因测序,使用主成分分析（PCoA）探究健康对照组和BD组患者肠道菌群多样性情况。采用BD患者自我报告健康问卷评估患者的健康状况。

BD患者肠道菌群Shannon指数（P = 0.020 5）、Chao指数（P = 0.025 1）和Simpson指数（P = 0.020 8）显著低于健康对照组（均P＜0.05）。加权的Unifrac PCoA分析表明,BD组患者肠道菌群相似性低于健康对照组。两组对象肠道菌群门水平上有差异的菌群为放线菌门和厚壁菌门;属、种水平上的差异菌群有普氏粪杆菌、梭状芽胞杆菌和瘤胃球菌属。两组对象在功能性身体健康（PCS）、心理健康（MCS）、睡眠质量（PSQI）、抑郁（PHQ-9）、焦虑（GAD-7）和狂躁（ASRM）的平均总成绩上差异均有统计学意义（均P＜0.05）。BD患者的功能性身体健康得分与肠道放线菌门、厚壁菌门、拟杆菌属、梭状芽胞杆菌呈负相关,与普氏粪杆菌以及瘤胃球菌属呈正相关。

健康对照组和BD组患者的肠道菌群结构大致相似,BD患者的肠道菌群多样性低于健康对照组,BD患者健康状况与肠道菌群存在一定的相关性。

     

孕晚期女性阴道菌群与妊娠结局的相关性

分析不同妊娠结局女性孕晚期阴道菌群,探索阴道菌群变化与妊娠结局的相关性。

收集厦门市第五医院收治的妊娠期女性阴道分泌物,筛选排除后,纳入不良妊娠组14例,正常妊娠组17例。采用高通量测序法对阴道菌群16S rDNA V3−V4区进行测序;采用QIIME2软件分析阴道菌群的组成和多样性指标;采用PCoA主坐标分析菌群β多样性差异;采用LEfSe比较不同妊娠结局女性阴道微生物差异,获得具有统计学意义的菌群标志物,并对差异菌群做相关性分析。

在菌群组成方面,厚壁菌门、乳杆菌属比例在正常妊娠组中显著增加,放线菌门、双歧杆菌属比例在不良妊娠组中显著升高（均P＜0.05）。在多样性方面,两组的α多样性差异无统计学意义（P＞0.05）,正常妊娠组β多样性较高,不良妊娠组的菌群相似度较高（均P＜0.05）。LEfSe分析结果显示,正常妊娠组阴道乳杆菌属丰度显著升高,不良妊娠组加德纳菌属、双歧杆菌属和梭菌目丰度显著增加。相关性分析表明,乳杆菌目与梭菌目比例呈负相关。

与正常妊娠组相比,不良妊娠组女性阴道菌群存在多样性下降、乳杆菌丰度下降的趋势,同时双歧杆菌、加德纳菌、梭菌等厌氧菌丰度增加。