ras基因产物p^21的分子进化和癌变机理探讨

作者收集了人、果蝇、酵母、粘菌和病毒的10种P21氨基酸全顺序,运用AADIS和UPGMA两程序并结合进一步的数据分析揭示:①就协同进化来说,ras基因每年每基因平均重复率为2.78×10~(-9),这或许系迄今报道的最低速率保持者;②ras基因每年每氨基酸替代率为2.23×10~(-10),这在进化上是相当保守的。数据分析进一步证实的实验结果还有:①v-Has和v-Kis分别来自c-H-ras1和c-K-ras2;②c-H-ras1、c-K-ras2和c-N-ras由一个共同的祖先基因演化而来。根据Fitch等的观点,我们在此特别提出了p21的不变子/共变子转化假说,从分子进化角度对P21在癌变中的作用作出可能的解释。     

HBsAg空间结构与分子进化分析

目的:获得乙型肝炎表面抗原HBsAg的生物信息学资料。方法:从Genbank中获得HBsAg的核酸序列,用ExPaSy、EBI和NCBI网站的在线软件推导其编码氨基酸序列、理化性质、空间结构,并在Blastn比对后选择不同地理株进行分子进化进行分析。结果:HBsAg由226个氨基酸组成,分子量25777．6Da,等电点8．74,为亲水性蛋白质;信号肽位于1-29aa处,二级结构由-螺旋(18．14%)、延伸(25．66%)、随机线圈(56．19%)组成。中国与日本、冈比亚、德国、西班牙、墨西哥、荷兰、瑞典、泰国的HBsAg相似率依次为99%、94%、94%、94%、91%、89%、98%、98%、98%．。用不同地理株HBsAg核酸序列构建出的分子进化树中,中国和日本的聚成一簇。结论:通过对HBsAg的生物信息学分析获得该抗原特征,为进一步研究乙型肝炎的感染与发病机制、研制基因工程疫苗以及研究HBsAg新的功能域等提供依据。     

GP37蛋白结构分析与昆虫病毒分子进化的关系

The gp37 gene from LsMNPV has been sequenced and the deduced amino acid sequence was compared with other GP37 amino acid sequences from 8 insect viruses. The maximum homology of amino acid sequences and the conserved structural regions were analyzed with PROSIS software. The relationship of evolution of 9 insect viruses was discussed and the evolutionary tree was drawned.     

分子进化研究：Ⅱ.5SrRNA序列的分形与分子进化的关系

本文根据分形理论的原理和方法,在对现行的计算核酸序列分维的方法进行修改的基础上,对各类生物的80余种5SrRNA序列的分维进行了计算,并结合耗散结构理论就其分维与分子进化的关系问题进行了研究和探讨。作者认为,5SrRNA序列的分维与其分子进化间的关系是一种复杂的非线性关系,在分子进化的过程中,序列的分维表现为随机涨落。     

从氨基酸残基的静态可及性探讨组蛋白的分子进化

本文以蛋白质氨基酸残基的静态可及性为指标。分别探讨了Ｈ２Ａ、Ｈ２Ｂ、Ｈ３、Ｈ４这４种组蛋白分子的进化关系,并获得了Ｈ２Ａ、Ｈ２Ｂ和Ｈ３各自相应的分子系统树。该研究从分子进化的角度表明,在构成核小体的这４种组蛋白分子中,组蛋白Ｈ４的保守性最大。作者推测,与其他几种蛋白相比,在维持染色体的结构、功能以及在染色体的起源上,组蛋白Ｈ４可能具有最为重要的意义和作用。     

从超氧化物歧化酶的分布和结构看其分子进化

超氧化物歧化酶(SOD)是一种催化超氧化物阴离子自由基发生歧化反应, 生成氧和过氧化氢的金属酶. 按其结合的金属离子, 区分为Fe-SOD, Mn-SOD和CuZn-SOD三种. Fe-SOD主要存在于原核细胞中;Mn-SOD在原核和真核细胞中都存在;CuZn-SOD主要存在于真核细胞中. Fe, Mn-SOD的一级结构, 空间结构及其性质很相似, 来自一个共同的祖先; CuZn-SOD的结构与前两者相差较大, 是在以后的发展中单独进化的.     

雀形目10种鸟类线粒体的DNA变异及分子进化

采用14种限制性内切酶（Apa I、BamHI、Bgl Ⅱ、EcoRI、EcoRV、HindⅢ、HpaI、KpnI、PstI、PuvⅡ、SalI、ScaI、XbaI和XhoI）对雀形目3科10种鸟类（蒙古百灵、喜鹊、小嘴乌雅、白腰朱顶雀、锡嘴雀、朱雀、红腹灰雀、灰腹灰雀、红交嘴雀和黄喉Wu）进行限制性片段长度多态分析（RFLP分析）。结果表明：雀形目鸟类基因组大小存在遗传多态性,不同类群在酶切类型上表现出各自的特点,雀形目鸟类与非雀形目鸟类在线粒体DNA的进化速率有着相同的特点,化石记录的地质年代与线粒体DNA分子时钟记录的年代有着惊人的吻合,这两个互为独立事件的统一,提示线粒体DNA作为分子进化的良好工具。     

GH79家族糖苷水解酶分子进化关系和蛋白结构研究

GH79家族的糖苷水解酶在碳水化合物改性、细胞免疫识别和信号传导等方面具有广泛的生理活性和重要的应用前景。然而,目前GH79家族的多样性催化机理仍不清楚,识别底物的结构基础和分子机制尚不清晰。本文总结了近几年GH79家族的研究进展,系统分析了GH79家族酶的来源与分布,通过对酶的序列特征、分子进化关系、蛋白结构解析等方面进行深入阐述,旨在为后续的GH79家族的蛋白质工程和功能催化机制的解析奠定基础。     

线粒体的分子进化与氧效应

线粒体通常被认为是消耗氧气产生ATP的细胞器.但自然界有多种生物具有厌氧型线粒体,其厌氧生物化学和遗传学研究表明,线粒体可能来源于兼性厌氧的α-蛋白细菌,在有氧环境中,起始共生体的厌氧功能丧失或被改变而进化成为经典的线粒体,但在厌氧环境中,有氧呼吸功能丧失了进化.厌氧型线粒体为了完成能量的转化,改变了呼吸链的组成,表现出产能模式的多样性.而经典线粒体在利用氧化反应获得能量的同时,也通过电子漏产生了自由基,对生命体本身构成了威胁.事实上,生命体呼吸链的进化是沿着不断加强对氧的利用效率和不断克服氧毒性的方向发展的.     

植物基因家族的分子进化

植物基因家族的分子进化曾庆平,郭勇（华南理工大学生物工程系,广州５１０６４１）关键词基因家族,同源性,分子进化,生物工程建立基因数据库与计算机检索程序使不同基因之间的碱基序列同源性的比较成为可能,同时也有助于进行基因的分子起源与进化以及蛋白质结构与功...     

具有转糖基活性的糖苷酶的分子进化

糖苷酶是糖类合成的重要催化剂,但其催化的反应为可逆反应,产物产量不高。近年来,通过糖苷酶催化位点氨基酸突变、其他位点氨基酸突变、随机突变、C端缺失突变和DNA混编（DNA shuffling）等方法对糖苷酶进行分子进化．使得糖苷酶合成糖类的产量大幅度提高,同时也优化了糖苷酶催化糖类合成时的其他性质,如区域选择性和温度耐受性等。     

miR-34基因家族的分子进化

根据miRNA基因在进化中高度保守的特点,利用生物信息学方法在目前已测序的动物物种中搜寻参与哺乳动物早期发育调控的mir-34基因的同源序列,在33个不同的动物物种中获得了miR-34基因的54条同源序列,其中18条为新发现的序列。表明miR-34是高度保守的,广泛存在于后生动物中。目前发现的mir-34基因80%位于基因间隔区,少数位于蛋白编码基因的内含子区和3′UTR上。不同动物中,mir-34基因成熟序列的同源性为68%,前体序列为38.89%。在无脊椎动物中只有一个mir-34,而在几乎所有的脊椎动物中都有mir-34a,mir-34b,mir-34c,形成miR-34基因家族。系统进化分析表明,脊椎动物中miR-34基因家族是通过基因的串联和局部重复形成的,这个过程中伴随着个别碱基的变异。     

脊髓灰质炎病毒的分子进化

本文根据脊髓灰质炎病毒3个型别参考毒株的基因组核苷酸序列和蛋白质氨基酸序列资料,首次试用Kimura的分子进化理论和计算方法,推算出脊髓灰质炎病毒型间的进化距离、分歧进化时间及病毒蛋白质氨基酸的替换率。结果表明:(1)型间毒株相互进化距离大致相等;(2)三个型病毒是由一个共同祖先病毒在距今约1—2千年以前几乎同时分歧进化而来;(3)型间毒株蛋白质氨基酸替换率也大致相等。     

登革病毒的分子进化和流行趋势

登革热是一种最流行的蚊媒传播传染病 ,近二十年来其流行呈上升趋势 ,本文从现代分子生物学和分子进化角度 ,对登革热的流行趋势进行综述。     

人原发性肝癌和肝癌细胞株的N-ras癌基因的产物p21

以原发肝癌及肝癌7402细胞株DNA转染NIH/3T3得到的转化细胞与材料,经~(35)S-甲硫氨酸参入,应用放射免疫吸附,聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,发现原发性肝癌的转化细胞株中N-ras基因的表达产物p21明显高于非转化的细胞。7402细胞株和7402转化的细胞株可能存在有二个ras基因,一个是ras~N;另一个是ras~H。本文结果为证明N-ras是人肝癌的一种转化基因提供了证据。     

木聚糖酶分子进化的研究进展

木聚糖的降解需要多种水解酶的协同作用,其中βD1,4内切木聚糖酶是最关键的水解酶之一。同一家族木聚糖酶氨基酸序列间有较高的同源性和较近的亲缘关系,这标准通常用于酶的家族归类。不同来源的同种木聚糖酶在相同位置上的氨基酸残基起源于共同祖先或者具有相似的生物学功能,而在进化过程中,对酶分子结构、催化起重要作用的氨基酸残基往往高度保守。综述了木聚糖酶分子进化的研究进展及其应用前景 。     

花色变异的分子基础与进化模式研究进展

近年来国际上风行的生态学与进化生物学的学科整合已成为生物学发展的一个趋势.寻找适合的生物学系统来进行从表型到基因型的综合研究是推动这一整合向纵深发展的一项必要的和带探索性的工作.被子植物花色的形成机理和有关代谢途径上的结构和调控基因在若干模式植物中已有相当了解,使花色成为适合生态与进化生物学研究的一个首选性状,为进一步了解野生种中花色的形成机制奠定了基础.本文着重介绍旋花科（Convolvulaceae）番薯属（Ipomoea）花青素代谢途径的分子遗传学、生物化学和生态学工作,试图从多学科的角度提供有关花色自然变异的知识背景,并指出未解决的生物学问题和预期今后可能出现的发展.     

花色变异的分子基础与进化模式研究进展

近年来国际上风行的生态学与进化生物学的学科整合已成为生物学发展的一个趋势。寻找适合的生物学系统来进行从表型到基因型的综合研究是推动这一整合向纵深发展的一项必要的和带探索性的工作。被子植物花色的形成机理和有关代谢途径上的结构和调控基因在若干模式植物中已有相当了解,使花色成为适合生态与进化生物学研究的一个首选性状, 为进一步了解野生种中花色的形成机制奠定了基础。本文着重介绍旋花科(Convolvulaceae)番薯属(Ipomoea)花青素代谢途径的分子遗传学、生物化学和生态学工作, 试图从多学科的角度提供有关花色自然变异的知识背景, 并指出未解决的生物学问题和预期今后可能出现的发展。     

关于节肢动物系统分类与进化的分子佐证

从分子系统学方面就了肢动物系统进化及高级阶元分类研究中争论的关键问题进行比较分析。综述了该领域所取得的新进展,着重从分子水平来探讨节肢动物的起源与进化。     

DNA分子进化的研究基础和策略

从研究方法和技术手段等方面讨论了分子进化研究上的一些重大问题．阐述了基因的基本结构及DNA分子的进化方式：净化选择、中性进化和分化选择。探讨了利用DNA分子进化数据构建系统树的原理,评价了NJ、UPGMAM、MP和ML4种算法在构建进化树时的合理性与不足,以及进化树可靠性检验的方法,并对未来分子进化生物学的发展加以展望。