赛默飞世尔科技研发专家获首个国际人类蛋白质组科学技术奖

赛默飞世尔科技生命科学质谱研发总监Alexander Makarov博士近日获得国际人类蛋白质组研究组织(HUPO)颁发的首个HUPO科学技术奖。该奖项表彰了Makaro博士对OrbitrapTM质量分析器的发展所作出的贡献。Makarov博士于2000     

英国的蛋白质工程研究

根据中国科学院与英国皇家学会1988年度科技交流协议,中国科学院生物科学与技术局组织了蛋白质工程考察组对英国进行了为期半个月的技术考察,先后访问了帝国理工学院、牛津大学、剑桥大学、Celltech公司等著名大学。     

研发动态

<正>美国发现DNA暗藏第二套编码美国华盛顿大学近日发现了DNA暗藏的第二套编码,所包含的信息将改变科学家对DNA指令的解读以及对健康和疾病有重要意义的突变的解释,相关论文发表在最新的《科学》杂志上。遗传编码包含64种密码子,John Stamatoyannopoulos博士领导的研究团队发现,部分密码子——他们称之为duons——含有双层意义,一层与蛋白质序列有关,一层与基因控制有关。它们演化的方式彼此互相影响。其中基因控制指令能帮助保持某些蛋白质     

猪生长瘦肉和沉积脂肪的分子与生化基础

我国畜牧业中一直存在着有碍生产、不利遗传、又难以解释的问题。亦即中国地方猪瘦肉少脂肪多 ,如湖北通城猪和江苏太湖猪 ;而外来大型猪则相反 ,瘦肉多脂肪少。对于这种复杂问题 ,华中农业大学生命科学技术学院杨在清等教授和博士们作了研究 ,发现通城猪和太湖猪血液中激素敏感脂酶活性很高 ,还有一种分子量为 4 47KDa的细胞质蛋白质和分子量为 94KDa的脂细胞膜蛋白质。这些都是外来猪斯格猪和长白猪所极少有的 ,特殊的和带有遗传性的体内物质。这些物质经蛋白质SDS PAGE分析发现 ,敏感脂酶活性比外来猪高 3倍 ,4 47KDa蛋白质和 94KD…     

基于质谱的蛋白质生物标志物发现中的特征选择与机器学习方法研究进展

随着质谱技术的进步以及生物信息学与统计学算法的发展,以疾病研究为主要目的之一的人类蛋白质组计划正快速推进。蛋白质生物标志物在疾病早期诊断和临床治疗等方面有着非常重要的意义,其发现策略和方法的研究已成为一个重要的热点领域。特征选择与机器学习对于解决蛋白质组数据"高维度"及"稀疏性"问题有较好的效果,因而逐渐被广泛地应用于发现蛋白质生物标志物的研究中。文中主要阐述蛋白质生物标志物的发现策略以及其中特征选择与机器学习方法的原理、应用实例和适用范围,并讨论深度学习方法在本领域的应用前景及局限性,以期为相关研究提供参考。     

糖生物学研究进展

糖生物学是以生物大分子的组成部分糖链为对象 ,研究它作为生物信息分子在多细胞生物高层次生命活动中的功能。糖生物学 (glycobiology)这一名词是 1 988年由牛津大学生化系副主任德弗克 (Raymond ADwek)教授在《生化年评》上首次提出的 [1 ] ,这标志着糖生物学这一新的分支学科的诞生。同年 ,牛津大学研制成功了 N-糖链的结构分析仪 ,并商品化。1　糖生物学的发展历程糖与蛋白质、核酸和脂类作为生物分子中的 4大物质 ,早在 1个世纪前就已被人们认识 ,但科学家对它的研究却远远滞后于核酸与蛋白质。 60年代 ,科学家发现细胞表面密布糖链 …     

Food Funct:优质蛋白对人类的生长、发育和健康是必不可少的

正最近的报道称某些肉类蛋白质对你来说并不好,德州农工大学生态农业研究学院的科学家发现,食用充足的优质蛋白质对人类的生长、发育和健康是至关重要的。GuoyaoWu博士的研究发表在FoodFunction上。他的文章阐述了膳食蛋白质摄入量和人类健康的关系,他说动物性和植物性食物的适当     

蛋白质构象病提示的疾病防治新思路

蛋白质构象病是由于组织中特定的蛋白质承受了构象变化,进而聚集并产生沉积所引起的一种疾病。构象病概念的提出提示人们可以通过抑制或者逆转组织蛋白的变构来防治疾病,本文就蛋白质构象病的概念以及近年关注较多的β折叠形成阻断肽和分子伴侣两种防治思路予以综述。     

二次实验法教学的探索与实践

二次实验法教学是针对学生在初次实验中发现的问题所进行的重新设计和探究实验的教学,对于培养学生敢于质疑、积极创新的精神和继承性的批判思维是极其有利的。本文提出了二次实验法教学操作模式的教学程序,并以“检测生物组织中的糖类、脂肪和蛋白质”实验为例探讨了二次实验法在生物实验教学中的应用。     

“多元化”研究性教学在蛋白质工程教学中的改革与探索

本文通过更新教学理念、精选教学内容、合理利用现代化多媒体教学手段、组织课程辩论赛、优化实验教学体系、革新过程考核体系等探索了"多元化"研究性教学在蛋白质工程教学中的作用。研究发现"多元化"研究性教学模式,提供了主动、开放的学习环境,从而有效激发了学生对蛋白质工程的学习兴趣,教学效果良好。     

美洲黑杨次生维管组织发育的内在节律性与细胞内含物的动态变化

美洲黑杨（Populus deltoids）是一种重要的商业用材树种,在我国多用作胶合板和纸浆原料,其速生性的特点也很早为人们所认识。众所周知,树木次生维管组织的发育具有内在的节律性,与此同时维管组织的细胞内含物也会发生动态变化。利用电镜技术及细胞化学方法,研究了美洲黑杨次生维管组织的发育以及细胞内含物分布的变化,发现次生维管组织的发育具有内在节律性,在年周期中表现为分化期和休眠期交替出现,次生韧皮部与次生木质部交替分化形成。在维管组织发育过程中,早期蛋白质和脂类物质首先减少,然后淀粉粒解体消失,发育期内维管组织的蛋白质、脂类和淀粉的积累最少,休眠期内维管组织细胞内最早出现淀粉的积累,然后蛋白质和脂类物质积累大大增加。杨树维管组织发育过程的内在节律性与细胞内含物的动态变化密切相关。     

美洲黑杨次生维管组织发育的内在节律性与细胞内含物的动态变化

美洲黑杨(Populus deltoids)是一种重要的商业用材树种, 在我国多用作胶合板和纸浆原料, 其速生性的特点也很早为人们所认识。众所周知, 树木次生维管组织的发育具有内在的节律性, 与此同时维管组织的细胞内含物也会发生动态变化。利用电镜技术及细胞化学方法, 研究了美洲黑杨次生维管组织的发育以及细胞内含物分布的变化, 发现次生维管组织的发育具有内在节律性, 在年周期中表现为分化期和休眠期交替出现; 次生韧皮部与次生木质部交替分化形成。在维管组织发育过程中, 早期蛋白质和脂类物质首先减少, 然后淀粉粒解体消失, 发育期内维管组织的蛋白质、脂类和淀粉的积累最少, 休眠期内维管组织细胞内最早出现淀粉的积累, 然后蛋白质和脂类物质积累大大增加。杨树维管组织发育过程的内在节律性与细胞内含物的动态变化密切相关。     

“蛋白质鉴定实验”后的再探究

善学者,也必善问。在学习"蛋白质鉴定实验"时,有很多学生对于实验所涉及的相关内容及现象产生疑问。对此在学生现有的操作能力下,利用所掌握的知识对实验过程中所提出的疑问和实验现象进行再探究,从而培养学生善于发现问题、敢于提出问题、并能够创造性地解决问题的能力。     

双水相纯化人肺腺癌和癌旁正常肺组织质膜蛋白质组差异分析

肿瘤标志物对于肺腺癌病人的临床诊断和预后具有重要意义.本研究根据临床诊断选取人肺腺癌组织和癌旁正常肺组织为研究对象,采用差速离心联合双水相法纯化组织细胞质膜,运用同位素标记相对和绝对定量技术结合高效液相色谱-串联质谱技术,鉴定出肺腺癌组织和癌旁正常肺组织的差异蛋白质41种.同癌旁正常肺组织相比,18个蛋白质在肺腺癌组织中表达上调,23个蛋白质在肺腺癌组织中表达下调.生物信息学分析发现,差异质膜蛋白质FLOT1、CAV1和ITGB1均处于蛋白质相互作用网络的重要位置,可能参与了肺腺癌相关信号转导.利用蛋白质印迹和免疫组织化学染色验证,差异蛋白质FLOT1、CAV1和ITGB1在肺腺癌织和癌旁正常肺组织的表达情况,其验证结果与蛋白质组学研究结果一致.研究结果对肺腺癌诊断标志物和肺腺癌癌变分子机理研究具有重要意义.     

双水相纯化的人肺腺癌和癌旁正常肺组织质膜蛋白质组差异分析

肿瘤标志物对于肺腺癌病人的临床诊断和预后具有重要意义. 本研究根据临床诊断选取人肺腺癌组织和癌旁正常肺组织为研究对象,采用差速离心联合双水相法纯化组织细胞质膜,运用同位素标记相对和绝对定量技术结合高效液相色谱 串联质谱技术,鉴定出肺腺癌组织和癌旁正常肺组织的差异蛋白质41种. 同癌旁正常肺组织相比,18个蛋白质在肺腺癌组织中表达上调,23个蛋白质在肺腺癌组织中表达下调. 生物信息学分析发现,差异质膜蛋白质FLOT1、CAV1和ITGB1均处于蛋白质相互作用网络的重要位置,可能参与了肺腺癌相关信号转导.利用蛋白质印迹和免疫组织化学染色验证,差异蛋白质FLOT1、CAV1和ITGB1在肺腺癌织和癌旁正常肺组织的表达情况,其验证结果与蛋白质组学研究结果一致. 研究结果对肺腺癌诊断标志物和肺腺癌癌变分子机理研究具有重要意义.     

一滴海水一碗汤

正咕噜博士不做实验改做饭,最新推出一道"生猛海鲜汤"。其中富含蛋白质及多种维生素,能为你和家人提供完美均衡的营养,只售9.9元,现已列入"博士牌"豪华午餐!还等什么,快打电话订购吧!和大伙儿开个玩笑,咕噜博士的厨艺其实可以忽略不计,他的"海鲜汤"里有什么也只有借助显微镜才能看清。现在咱们就取一滴拿到显微镜下观察一番,看这"汤"里都有哪些"猛料"吧!     

蛋白质聚集的三种途径和控制策略

蛋白质聚集在生物医药生产中是一个关键问题。在蛋白质的生产、运输和储存的过程中,多种因素都能导致蛋白质发生聚集。随着对蛋白质聚集这一现象的深入研究,发现蛋白质聚集的产生存在不同途径和各种影响因素,如理化因素、翻译修饰和蛋白质结构等。由于蛋白质的聚集对于蛋白质的活性和均一性具有重大影响,因此了解蛋白质聚集的途径以及研究如何控制聚集对获得均质蛋白是十分有意义的。本文主要阐述了3D结构域交换、盐桥的形成、氧化应激3种蛋白质的聚集途径,以及在蛋白质生产、运输、储存过程中控制蛋白质聚集的方法,这有助于减少由于蛋白质聚集体形成而造成的损失,并提高实验研究和商业生产中的蛋白质纯度和均质性。     

小鼠P型ATP酶ATP8A2基因的克隆及其剪切亚型的分析

真核生物细胞各种膜结构两侧的磷脂分布是不对称的,这种不对称需要磷脂翻转酶的动态调节.目前认为这些酶可以分为三种,即爬行酶类、外翻酶类和内翻酶类,对于它们的研究才刚刚起步.P型ATP酶第四类亚型被认为有潜在的磷脂内翻酶活性,酵母全部5个该家族的蛋白质如DRS2p都陆续被确定了具有磷脂内翻酶的活性.对于酵母内翻酶的研究还发现该类蛋白质对于细胞极性建立和膜泡运输有重要作用.哺乳动物中由基因组比对发现有14个P型ATP酶第四类亚型成员,但对于它们的研究仅局限于病理方面.为了能够了解哺乳动物磷脂内翻酶在细胞内活动的分子机制,克隆了酵母DRS2p在哺乳动物中的同源物ATP8A2的编码基因,并发现了它的两种剪切亚型.通过对它们的组织分布分析,发现该蛋白质主要分布在睾丸中,提示它可能对于精子的发生有一定功能.     

蛋白质二级结构指定

蛋白质二级结构是指蛋白质骨架结构中有规律重复的构象。由蛋白质原子坐标正确地指定蛋白质二级结构是分析蛋白质结构与功能的基础,二级结构的指定对于蛋白质分类、蛋白质功能模体的发现以及理解蛋白质折叠机制有着重要的作用。并且蛋白质二级结构信息广泛应用到蛋白质分子可视化、蛋白质比对以及蛋白质结构预测中。目前有超过20种蛋白质二级结构指定方法,这些方法大体可以分为两大类:基于氢键和基于几何,不同方法指定结果之间的差异较大。由于尚没有蛋白质二级结构指定方法的综述文献,因此,本文主要介绍和总结已有蛋白质二级结构指定方法。     

本刊编委FraserA．W．Wilson博士简介

Fraser A.W.Wilson博士1983年毕业于牛津大学实验心理学系,后到耶鲁大学医学院,从师于著名的神经科学学家Goldman-Rakic研究员,长期从事非人灵长类前额叶功能的研究。1996年到美国Arizona大学心理学系就职。其间,发表了很多实验论文。其中,1993年以第一作者在Science发表有关前额叶功能的论文,该文至今仍是前额叶研究的经典文献。1997年,与其他研究人员合作,再次在Science上发表另一篇有关前额叶的研究论文。他的主要发现是:背侧前额叶主要涉及到“以头为中心”的空间坐标系。在猕猴前额叶研究中作出了突出贡献。2005年1月,Wilson博士从…