运用AFLP技术筛选分离野败型水稻mtDNA中与雄性不育性状相关的片段

对野败型水稻不育系（珍汕97A）、保持系（珍汕97B）和F1杂种（汕优63）线粒体DNA进行了AFLP比较,从M／PA引物对选择扩增产物中找到了不育系与保持系差异条带ZA1、ZA2和ZA3。Northern分析表明,片段ZA1黄化苗期无转录产物,可能是非编码序列;而ZA2、ZA3两片段在不育系、保持系和F1杂种中的转录则有差异,其中片段ZA2在黄化苗期保持系转录,不育系和F1杂种无转录产物;片段ZA3在黄化苗期保持系和F1杂种转录,表明ZA3转录受核恢复基因Rf影响．     

红莲型细胞质雄性不育水稻线粒体DNA的AP-PCR分析

为了研究红莲型细胞质雄性不育与线粒体基因组的关系。以水稻红莲型粤泰细胞质雄性不育系A和保持系B及杂种一代F1为材料。应用AP-PCR分析,用10个单引物对其线粒体DNA进行扩增。实验结果表明,不同的引物在3种材料间均有不同程度的差异。为红莲型细胞质雄性不育分子机理的研究提供了线索;此外,在引物6F1的扩增图谱中找到一条在YTA和F1中特异的带TAF6F2,Sounthern分析TAF6F2不育胞质的特异性,可能与红莲型水稻细胞质雄性 不育性状的形成有关。     

三例小麦细胞质雄性不育系线粒体DNA的扩增片段长度多态性分析

细胞质雄性不育是小麦杂种优势利用的重要途径,为了鉴定3例小麦雄性不育系的细胞质类型,对其线粒体DNA(mtDNA)进行扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP)分析。文中利用差速离心法和不连续蔗糖密度梯度超速离心法提取纯化小麦线粒体。结果表明:通过该提取方法获得的mtDNA,其质量和纯度能够满足PCR反应和遗传学分析。在64对选扩引物中,筛选到了4对特异性引物,其中引物E1/M7在ms(Kots)-90-110不育系扩增出3条特异条带;引物E4/M2在ms(Ven)-90-110不育系扩增出2条特异条带;引物E7/M6在ms(S)-90-110不育系中扩增出2条特异条带;引物E6/M4在ms(Kots)-90-110不育系中扩增出2条特异条带。这些特异引物可以用来作为鉴定具有粘果山羊草Aegilops kotschyi、偏凸山羊草Ae.ventricosa、斯卑尔脱小麦Triticum spelta 3类不育细胞质型小麦雄性不育系的细胞质分子标记,为研究小麦细胞质雄性不育机理奠定了分子基础。     

红莲型和野败型水稻细胞质雄性不育系线粒体DNA(mtDNA)的比较研究

以水稻红莲型和野败型细胞质雄性不育系为材料,用不连续蔗糖梯度离心法提纯线粒体,以饱和酚-氯仿-异戊醇法抽提mtDNA。用琼脂糖电泳和电镜观察比较不育系mtDNA差异,发现不育系中有小分子mtDNA(即m_2和m_3),不同细胞质间的小分子mtDNA存在差异。在不育系与保持系间名为m_1的大分子mtDNA无差异;本文还研究了mtDNAm_1的理化性质。     

水稻红莲型细胞质雄性不育系与保持系mtRNA差异显示和差别片段？…

将Ｔ４ＲＮＡ连接酶和ＡＦＬＰ技术特点相结合构建于适于ｍｔＲＮＡ的差异显示方法,并比较水稻（Ｏｒｙｚａ ｓａｔｉｖａ Ｌ．）红莲型细胞质雄性不育系,保持系和杂种一代ｍｔＲＮＡ差异。在４组引物对的选择扩增产物中共找到６个差异片段,其中差异条带ＤＴＡ为不育系仅有,条带ＤＡＢ为不育系和保持系特有,而条带ＤＢＦ１、ＤＢＦ２、ＤＢＦ３、ＤＢＦ４为保持系和Ｆ１杂种共有。这表明水稻红莲型不育系粤泰Ａ与杂种一代泰优     

红莲型细胞质雄性不育性与线粒体渗透性转换

以水稻红莲型细胞质雄性不育(HL-CMS)的不育系粤泰A(YTA)、保持系粤泰B(YTB)以及杂种F1代红莲2号(HL2)的黄化苗为材料,研究了在不同pH及离子强度下线粒体渗透性转换(MPT)的发生及其差异。结果表明,YTA、YTB和HL2间MPT的发生均存在差别,不育系YTA线粒体渗透性转换孔(PTP)的开启与关闭对pH及离子强度的变化较保持系YTB和HL2敏感。HL2与YTA虽然具有相同的细胞质来源,但两者之间PTP及MPT的特性明显不同,前者MPT的变化与具有正常生理功能的YTB线粒体的PTP和MPT的发生特点与特性相似。这些说明红莲型水稻细胞质雄性不育的发生可能与其MPT的发生有关。     

红莲型水稻细胞质雄性不育花药蛋白质组学初步分析

采用固相pH梯度－SDS PAGE 双向电泳对红莲型细胞质雄性不育水稻(YTA)的不育系和保持系(YTB)单核期花粉总蛋白质进行了分离,通过银染显色,获得了分辨率和重复性较好的双向电泳图谱。Image Master 2D V5.0 软件可识别约1800个蛋白质点,其中差异表达的蛋白质点数为85。将其中16个差异点采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（matrix assisted laser desorption/ionizaton time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS）进行了肽质指纹图分析,通过采用Mascot 软件对MSDB数据库查询,其中9个蛋白质点得到了鉴定。YTA相对于YTB有部分参与碳代谢和淀粉合成的酶缺失或表达量降低,这些蛋白质分别是ADP-葡萄糖磷酸转移酶（AGPase）,UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶,乙酰辅酶A合成酶和二氢硫辛酸脱氢酶等。其中AGPase是参与淀粉合成的蛋白,与花粉发育密切相关。乙酰辅酶A合成酶和二氢硫辛酸脱氢酶是细胞内合成乙酰辅酶A的重要酶,而乙酰辅酶A是进入TCA循环的重要底物,乙酰辅酶A的缺乏可以导致TCA循环不能顺利进行,从而不能提供小孢子发育所需要的大量能量。YTA相对于YTB部分参与碳水化合物代谢的重要酶缺失或表达量降低,有可能导致因线粒体提供的能量不足,淀粉合成受阻,因而花粉不能正常发育。      

BT型细胞质雄性不育水稻及其三系的线粒体DNA研究

用RAPD技术对BT型水稻胞质雄性不育系秀A及其保持系秀B、恢复系湘晴以及杂种F1代的线粒体DNA进行了比较分析。结果表明不育系与其保持系间存在显著差异;不育系与其F1之间mtDNA也存在差异。在引物OPJ－08的扩增产物中,秀A扩增出一条分子量为800bp的多态性片段,在引物OPK－10的扩增产物中,杂种F1扩增出一条分子量为900bp的片段。把这两片段回收、克隆并制备探针,OPJ－08800的Southern杂交结果显示不育系与其F1杂交图谱存在多态性;OPK－10900的Suthern杂交结果显示不育系与其保持系同存在差异。推测这两片段与育性可能有一定的联系。     

水稻线粒体DNA雄性不育有关特异片段的克隆及序列分析

应用任意单引物聚合酶链反应技术,从水稻ＷＡ 型雄性不育系的线粒体ＤＮＡ 中得到一个特异的扩增片段Ｒ２－６３０ ＷＡ。以该片段为探针进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ 杂交分析检测到在雄性不育胞质与正常可育胞质间存在的线粒体ＤＮＡ 多态性。不育系珍汕９７Ａ 和其Ｆ１ 杂种的杂交图谱相同。而保持系珍汕９７Ｂ和恢复系明恢６３ 的杂交图谱一样。序列测定该片段全长６２９ ｂｐ,其碱基组成Ａ＋ Ｔ＝ ５４．１％ ,同源性比较结果显示, 该片段与１２３６ 个已报道的植物基因（包括１６ 个水稻线粒体基因）序列的同源性均小于５０％ 。序列内含有一个长度为１０ ｂｐ 的反向重复序列５－ＡＣＣＡＴＡＴＧＧＴ－３,位于２６２—２７２ 区段。另外,其３７９—４３９ 区段可编码一个含２０个氨基酸残基的短肽。上述结果表明,Ｒ２－６３０ ＷＡ 片段确与水稻野败型雄性不育密切相关。推测反向重复序列５－ＡＣＣＡＴＡＴＧＧＴ－３在细胞质雄性不育性状形成中,可能起着重要作用     

中国和韩国黑线姬鼠两亚种的线粒体DNA限制性片段分析

本文利用印迹杂交技术对中国华北地区黑线姬鼠Ａｐｏｄｅｍｕｓａｇｒａｒｉｕｓｐａｌｉｄｉｏｒ和韩国黑线姬鼠Ａ．ａｇｒａｒｉｕｓｃｏｒｅａｅ共１０７号标本的线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ,ｍｔＤ－ＮＡ）,通过８种限制性内切酶的消化,进行了限制性片段的分析。共检出３５种限制性片段和１２种单倍体类型。１２种单倍型在平均离散度为１．０１％时聚合为两个亚群：一个亚群为黑线姬鼠华北亚种,由采自中国４个不同地区的５１号标本的４种单倍型所组成;另一个亚群为黑线姬鼠朝鲜亚种,由采自韩国４个不同地区的５６号标本的８种单倍型所组成。黑线姬鼠华北亚种和朝鲜亚种在ｍｔＤＮＡ表型上表现出一定差异,这在分子水平上确立了两亚种的分类地位。为了进一步澄清黑线姬鼠种下分类的混乱,很有必要对中国其他地区的标本进行该项研究     

IDENTIFICATION AND CLONING OF AMPLIFIED FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM MARKERS LINKED TO THE MATING TYPE LOCUS OF CHLAMYDOMONAS REINHARDTII (CHLOROPHYTA)

Amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers have been widely used to generate molecular maps of plant species, including crops and cereals. We report on a useful protocol to identify AFLPs from Chlamydomonas reinhardtii Dangeard with digoxigenin labeled primers. Although Chlamydomonas has a small genome with a high GC content, we could detect polymorphic bands that led to the identification of several AFLP markers linked to the mating type locus of Chlamydomonas. Three of these markers were isolated from the gel, reamplified, and cloned. The clones were sequenced, and the insertion of the correct fragment was verified in AFLP gels and in Southern blots. One marker showed sequence identity to parts of the fus1 gene, known to be unique in the plus mating type. We also converted some of the AFLP markers into sequence tagged site markers, which allows a fast and convenient screening of progeny of crosses. This procedure will be a useful and fast alternative to the conventional generation of maps for the positional cloning of genes from Chlamydomonas.     

水稻(Oryza sativa L.)重复DNA顺序的克隆及序列分析——重复顺序存在意义的探讨

以大肠杆菌启动子选择质粒pKK175-6、pKK232-8为载体,将通过复性动力学方法获得的水稻重复DNA顺序片段进行克隆。阳性克隆菌株表现出对四环素或氯霉素不同程度的抗性。DNA序列分析表明．克隆到的某些水稻重复DNA顺序具有丰富的基因表达调节元件的同源序列。     

水稻(Oryza sativa L.)重复DNA顺序的克隆及序列分析——重复顺序存在意义的探讨

以大肠杆菌启动子选择质粒pKK175-6、pKK232-8为载体,将通过复性动力学方法获得的水稻重复DNA顺序片段进行克隆。阳性克隆菌株表现出对四环素或氯霉素不同程度的抗性。DNA序列分析表明,克隆到的某些水稻重复DNA顺序具有丰富的基因表达调节元件的同源序列。     

pms3 is the locus causing the original photoperiod-sensitive male sterility mutation of‘Nongken 58S'

Photoperiod-sensitive genic male sterile (PSGMS) rice is a very useful germplasm for hybrid rice development. It was first found as a spontaneous mutant in a japonica cultivar 'Nongken 58'. pms3 on chromosome 12 was determined to be the locus where the original PSGMS mutation occurred, changing the normal cultivar Nongken 58 to PSGMS Nongken 58S. Large amounts of RAPD and AFLP analyses were also conducted for the fine mapping of the pms3 genomic region, which resulted in 4 molecular markers linked to pms3. Although these markers somewhat increased the marker density of this region, the pms3 locus is still located in a marker-sparse region.     

中国大陆若干群体的黑果蝇的线粒体DNA多态性研究

本文研究了果蝇Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ种群Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ,ｍｔＤＮＡ）的多态性。用９种限制性内切酶ＸｂａⅠ,ＥｃｏＲⅠ,ＰｓｔⅠ,ＨｉｎｄⅢ,ＢｇｌⅡ,ＳａｃⅠ,ＳｃａⅠ,ＥｃｏＲＶ和ＰｕｖⅡ,对青岛、南京、上海、宁波与泉州５个Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ群体的ｍｔＤＮＡ进行了限制性片段长度多态性（ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎｆｒａｇｍｅｎｔｓｌｅｎｇｔｈｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ,ＲＦＬＰ）的研究。在５群体中,发现５种不同的酶切图谱,它们彼此之间的遗传差异π为０．４６％－１．７６％,群体内遗传差异πｉｊ为０．００％－０．３３％,群体间的差异ｄｘｙ,为０．００％－０．８２％。分布于中国大陆的Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ的群体间遗传差异在总遗传差异中所占比例γｓｔ值为２４．６２％。我们发现,Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ的栖息环境对ｍｔＤＮＡ的遗传变异有十分明显的影响,而不同地理纬度的群体之间其遗传距离并无倾群（ｃｌｉｎｅ）表现。