广东高州普通野生稻(Oryza rufipogon Griff)的遗传多样性和居群遗传分化研究

利用30对SSR引物对广东高州普通野生稻3个群体进行了遗传多样性分析和居群遗传分化研究.结果表明,30对引物中只有20对表现出多态,多态位点比率P为66.7%;在20个多态位点中共检测出81个等位变异,平均等位变异数(Ap)为4.05 个;3个群体总的遗传多样性(Ht)为0.61,其中,居群内的遗传多样性为居群间的遗传多样性的3倍多,说明总的遗传多样性主要来自居群内;虽然居群间的遗传分化系数(G ST)较低,仅为0.2427,但当遗传相似系数临界值增加时,3个群体在聚类图上相对独立 ,说明3个群体既存在着高度的遗传相似性,又具有一定程度的遗传分化,可以作为3个居群进行原生境保护.     

海南野生稻资源调查收集与保护

为了加强海南野生稻资源的保护和研究利用,2002—2013年对海南省18市(县)野生稻资源进行野外调查、资源收集和原、异位保护。初步查明,目前在全省15个市(县)发现154个野生稻自然居群,其中普通野生稻136个、疣粒野生稻11个、药用野生稻7个。收集到野生稻居群87个,其中普通野生稻80个、疣粒野生稻4个、药用野生稻3个,总共2900余份野生稻种茎,经繁殖和编目后妥善保存于海南省农业科学院试验基地的热带野生稻异位保存圃中,并参照农业行业标准-农业野生植物原生境保护点建设技术规范,分别在文昌、琼海、儋州、万宁、陵水和保亭等县(市)建立了6个野生稻原生境保护点,其中普通野生稻4个,疣粒野生稻1个,药用野生稻1个。根据调查结果,对海南野生稻濒危状况及其根源进行了分析,提出了海南野生稻保护相关建议。     

广东高州7个普通野生稻居群遗传结构的SSR分析

利用32对SSR引物对来自全部7个自然居群的217份广东高州普通野生稻（简称＂高野＂）材料进行遗传结构、多样性和遗传聚类分析。结果表明,高野各居群因遗传结构存在差异而相对独立,但各居群之间由于存在基因渗透又具有一定的相似性。高野总体多样性指数（Ht）为0.65,居群内的多样性（HS=0.431）略大于居群间的多样性（DS=0.392）,二者差异并不显著。居群间的遗传分化系数（GST）为0.611,说明高野群体的遗传差异是由居群内和居群间的遗传分化共同作用的结果。其中A、B、E居群间,D、F、G居群间遗传相似性较高,C居群与其它居群之间存在较大差异。根据7个居群的遗传结构,结合其地理分布状况,认为遗传多样性最大的B和E居群以及遗传分化最小的C居群应作为重点对象进行保护。     

广东高州7个普通野生稻居群遗传结构的SSR分析

利用32对SSR引物对来自全部7个自然居群的217份广东高州普通野生稻(简称“高野”)材料进行遗传结构、多样性和遗传聚类分析。结果表明, 高野各居群因遗传结构存在差异而相对独立, 但各居群之间由于存在基因渗透又具有一定的相似性。高野总体多样性指数(Ht)为0.65, 居群内的多样性(HS=0.431)略大于居群间的多样性(DS=0.392), 二者差异并不显著。居群间的遗传分化系数(GST)为0.611, 说明高野群体的遗传差异是由居群内和居群间的遗传分化共同作用的结果。其中A、B、E居群间, D、F、G居群间遗传相似性较高, C居群与其它居群之间存在较大差异。根据7个居群的遗传结构, 结合其地理分布状况, 认为遗传多样性最大的B和E居群以及遗传分化最小的C居群应作为重点对象进行保护。     

我国北回归线区域普通野生稻遗传多样性和遗传结构研究

选择分布于水稻染色体组的26对SSR引物,对集中分布于广西来宾市北回归线附近的13个普通野生稻居群的342份材料进行遗传多样性和遗传结构研究。结果表明,该地区的野生稻无论在种内(A=9.154,Ae=4.446,I=1.547,He=0.671)还是居群水平上(P=95%,A=4.219,Ae=2.394,I=0.905,He=0.476)遗传多样性都十分丰富,高于同类研究水平。供试居群的遗传分化系数Gst为0.30,表明30%的遗传变异存在于居群间,大部分遗传变异存在于居群内。居群间的遗传一致度变化范围为0.332~0.903,且居群间地理距离越近,遗传一致度越高,说明北回归线附近的普通野生稻居群符合"隔离-距离"模型。综合上述研究结果和我国野生稻保护现状,建议对居群G13和G06实施优先保护。     

云南元江普通野生稻(Oryza urfipogon Griff)遗传多样性分析及保护策略研究

用SSR方法对云南元江普通野生稻3个自然居群进行30个位点的遗传多样性分析.结果表明,元江普通野生稻具有较高的遗传变异水平(Ap＝2.6,Hs=0.77),且群体遗传分化系数较大,GST为41.08%,即在遗传变异总量中41.08%存在于居群间.本文还通过对云南元江普通野生稻遗传多样性特点的分析,提出了保护策略.     

黑龙江省野生秋子梨群体遗传结构的荧光AFLP分析

以来自黑龙江省海林市、东宁县和孙吴县3个居群的90个野生秋子梨株系为试材,利用荧光AFLP标记技术对野生秋子梨群体遗传多样性及遗传结构进行了分析,旨在为野生秋子梨种质资源的保护和利用提供科学依据。结果表明:野生秋子梨3个居群种群水平多态性位点百分比(P)为82.95%,Nei’s基因多样度(H)为0.1467,Shannon信息指数(I)为0.2397,野生秋子梨遗传多样性水平较低;3个居群的多态性位点百分比、基因多样度及Shannon信息指数比较,东宁居群>海林居群>孙吴居群,居群水平上东宁居群的遗传多样性较丰富;基因分化系数(GST=0.1008)显示,野生秋子梨的遗传变异主要发生在居群内;野生秋子梨居群间存在较大的基因流动(Nm=4.4603),说明3个野生秋子梨居群间存在着较频繁的基因交流;UPGMA聚类分析结果表明,3个居群是相对独立的孟德尔群体,且海林居群和东宁居群的遗传关系较近。3个居群中东宁居群遗传多样性最丰富,是进行原生境保护优先考虑的居群。     

居群遗传结构研究中显性标记数据方法初探

为对比显性标记应用于居群遗传结构研究时不同统计参数的适用性,利用RAPD技术对中国5个居群的100个疣粒野生稻个体进行了遗传结构分析。在衡量居群遗传多样性水平时,多态位点比率（PPB）会低估遗传变异的量,其价值不如Shannon多样性指数和Nei基因多样性指数,而采用Nei指数时不必进行Lynch-Milligan矫正。对个体间遗传关系进行分析时,17种遗传相似性指数矩阵两两之间的Mantel检测都表现出极显著的相关性（r＞0.95,t＞t     

利用SSR标记分析海南普通野生稻的遗传多样性

选用平均分布于水稻基因组的28对SSR引物,对海南不同纬度5个普通野生稻居群的163份材料进行遗传多样性和遗传结构研究。结果表明:(1)海南普通野生稻具有较高的遗传多样性,28个位点共检测到227个等位变异,平均等位变异数A=8.1071,有效等位变异数Ae=4.4190,平均期望杂合度He=0.4004,实际观察杂合度Ho=0.7062,香农指数I=1.6048;(2)居群的遗传分化系数较大,总的遗传变异中有46.40%存在于居群间(Fst=0.4640);(3)居群内杂合体较高(F is=-0.7069),根据固定指数(F=0.0588)计算出的异交率t=0.8889,说明海南普通野生稻的繁育系统属于一种较高的异交混合交配类型。     

云南疣粒野生稻的居群遗传结构及其在原位保护中的意义

用 1 2种酶系统 1 7个等位酶位点对采自云南思茅地区疣粒野生稻Oryzameyeriana(Zoll.etMerr.exSteud .)Baill.7个居群的 1 6 4个个体进行了遗传多样性的研究 .相对于以前报道过的具有相同生活史特性和繁育系统的种子植物和稻属中的其他种类 ,疣粒野生稻的遗传多样性水平极低 (A =1 .1 ,P =8.0 % ,H_o=0 .0 0 4和H_e=0 .0 1 5 ) ,但居群间的遗传分化较大 .F_ST高达 0 .6 4 9,表明在遗传变异总量中的6 4 .9%存在于居群间 .对这样在较小的地理区域内居群间就呈现出剧烈遗传分化的物种来说 ,大多居群均有保护的价值 .因此 ,进行原位保护时原则上应建立较大的自然保护区 ,涉及较多数目的居群 .同时 ,提出了在云南进行原位保护时应优先考虑的地点 .     

植酸在水稻(Oryza sativa L.)细胞培养中的促进作用

植酸(C_6H_(18)O_(24)P_6)添加到固体和液体培养基中,能显著降低多酚氧化酶活性,稳定培养基中pH值和mV值,并能促进水稻细胞生长,增强细胞抗褐化和水渍化能力,从而改善细胞状态。在培养基中植酸的最佳添加量为0.1%,配合使用MES可以增强其稳定pH值的效果。     

从水稻花粉管分离精细胞(简报)

精细胞的分离是植物生殖工程的一个重要组成部分,是目前被子植物有性生殖研究的一个活跃领域[1,2]。随着精细胞分离技术的完善和分离出精细胞的植物类型的增加,目前对精细胞的分子生物学研究已有一些进展,主要是精细胞特异蛋白的分离[3,4]和cDNA文库的构建以及一些精细胞特异基因的分离[5,6]。     

Cytokinin represses phosphate-starvation response through increasing of intracellular phosphate level

The involvement of cytokinins (CTKs) in the repression of phosphate (Pi)-starvation signalling has been widely documented. However, the full physiological and molecular relevance of this role remains unclear. To gain further insights into the regulation system of CTK repression of Pi-starvation signalling, a global analysis of gene expression events in rice seedlings under Pi starvation, and the exogenous CTK treatment under Pi-sufficient (+P) and Pi-deficient (-P) conditions, was conducted using oligonucleotide array analysis. Physiological and biochemical adaptation was observed after 10 d Pi starvation in rice seedlings. A global reduction of the Pi-starvation signalling was detected after 3 d treatment of exogenous CTK. Expression profiling data indicate that, together with a significant increase of intracellular Pi content, many expression changes responsive to Pi starvation were reversed by exogenous CTK treatment while CTK-responsive genes behaved normally under -P condition. These results suggest that the interplay of CTK signal and Pi-starvation response can be partially explained by the rise of Pi concentration after exogenous CTK treatment. Microarray data also revealed that a small number of genes have different CTK response patterns under different Pi levels, suggesting a subtle interaction between CTK and Pi-starvation signalling pathway.     

粳稻和籼稻D1蛋白光抑制敏感性的差异与其编码基因序列结构特征的相关性分析(英文)

粳稻 (OryzasativaL .ssp .japonica)和籼稻 (O .sativassp .indica)对光抑制的敏感程度存在差异 ,它们的叶绿体光反应中心Ⅱ核心蛋白D1的稳定性不同。以菌落原位杂交法克隆了粳稻“95 16”和籼稻“籼优 6 3”叶绿体D1蛋白的编码基因psbA。核苷酸序列同源比较显示 :两者在启动子区和 5′_UTR完全相同 ;编码区存在着个别碱基的差异 ,但均位于三联体密码的第三位 ,不影响氨基酸编码特性 ,在蛋白质氨基酸序列上没有差异 ;在 3′_UTR内存在寡聚U长度的差异。因此 ,粳稻和籼稻D1蛋白对光抑制作用敏感性的差异与其蛋白质的氨基酸序列结构无关 ,可能与调控psbA基因表达的上游因子或光保护机制的差异有关。     

水稻原生质体再生成熟植株

水稻原生质体培养一直是人们注意的问题,近年来这方面工作开始有了可喜的进展。本文简要报道用水稻种子成熟胚诱发的愈伤组织所制备的原生质体,经离体培养得到再生成熟植株的结果。     

水稻马协不育与可育花药ATPase定位(简报)

马协不育系系朱英国等用农家品种“马尾粘”的不育株与“协青早选”测交和回交选育成功的。超微结构研究表明马协不育花药单核边位期绒毡层提前解体,液泡膜破裂;不育花粉外壁基粒棒少,且分布不均匀;线粒体有大的电子透明区,二核期不育花粉中央大液泡崩溃。不育花药绒毡层提前解体可能影响花粉外壁合成及花粉营养供应,大量研究表明绒毡层发育异常与花粉败育密切相关,而液泡膜的破坏会导致水解酶类的泄     

Correlation Analysis of Differences of Photoinhibitory Sensitivity of D1 Proteins in Oryza sativa ssp. japonica and indica and Structural Features of the Sequences of the Coding Genes

Oryza sativa L. ssp. japonica and indica exhibit different sensitivity to photoinhibition and they show different stability of their core proteins D1 in the chloroplast photosystem Ⅱ. Using in situ hybridization, psbA , the gene encoding D1 protein of O. sativa ssp. japonica cv. 9516, and that of O. sativa ssp. indica cv. Shanyou 63 was cloned. As revealed by homology comparison of their sequences, the sequences are identical in the regions of promoter and 5′-UTR; differences are found in individual bases in the coding region all of which, being in the third position of respective codons, however, do not affect the amino acids coded finally; a difference is noted in the length of the oligo-U sequence in the region of 3′-UTR. It is thus apparent that, rather than a result of any difference in the amino acid sequences, the differences in the sensitivity to photoinhibition of D1 proteins between japonica and indica rice may be related to the upstream factors that regulate expression of psbA or to differences of photoprotective mechanisms.     

简单高效的根癌农杆菌介导的水稻基因转化方法

本文在研究影响农杆菌介导的水稻转化的主要因素基础上,建立了一套简单、高效的水稻转基因系统。将水稻成熟胚来源的愈伤组织用农杆菌EHA101/pHQ9,EHA 101/pHQ 10,EHA 101/pHQ T3感染后,筛选抗性愈伤,经分化获得转化株。抗性愈伤的平均得率为约100个愈伤/g愈伤外植体,抗性愈伤的分化频率平均高达85%。转基因植株的GUS染色、Southern杂交结果表明,T-DNA上的外源基因已整合进转基因植物的基因组中。转基因植株T1代对潮霉素的抗性表明,多数转基因株系符合孟德尔分离比3∶1。该系统的建立将有助于应用T-DNA标签法和基因打靶法进行水稻功能基因组的研究。     

Genetic Identification of Quantitative Trait Loci for Contents of Mineral Nutrients in Rice Grain

In present study, Fe, Zn, Mn, Cu, Ca, Mg, P and K contents of 85 introgression lines （ILs） derived from a cross between an elite indica cultivar Teqing and the wild rice （Oryza rufipogon） were measured by inductively coupled argon plasma （ICAP） spectrometry. Substantial variation was observed for all traits and most of the mineral elements were significantly positive correlated or independent except for Fe with Cu. A total of 31 putative quantitative trait loci （QTLs） were detected for these eight mineral elements by single point analysis. Wild rice （O. rufipogon） contributed favorable alleles for most of the QTLs （26 QTLs）, and chromosomes 1,9 and 12 exhibited 14 QTLs （45%） for these traits. One major effect of QTL for zinc content accounted for the largest proportion of phenotypic variation （11%-19%） was detected near the simple sequence repeats marker RM152 on chromosome 8. The co-locations of QTLs for some mineral elements observed in this mapping population suggested the relationship was at a molecular level among these traits and could be helpful for simultaneous improvement of these traits in rice grain by marker assisted selection.