婴幼儿呼吸道微生物群演替研究进展

婴幼儿从出生开始正常呼吸道微生物就无时不刻地进行着演替,最终呼吸系统微生物形成动态平衡。婴幼儿时期是呼吸道微生物群演替的重要时期,也是免疫发育的关键时期,容易受外界因素的影响,这些影响因素包括分娩方式、喂养方式、抗生素、季节、疫苗接种等。研究表明婴幼儿时期的呼吸道微生物的组成和发育会影响微生物群的稳定性,从而影响呼吸道感染和过敏性疾病的发生。现对婴幼儿呼吸道微生物群演替及其影响因素,如分娩方式、喂养方式、抗生素使用、季节、疫苗接种等进行综述。     

生态因子对新生儿呼吸道微生物建群的影响

研究新生儿呼吸道微生态学,探讨各种生态因子对新生儿咽部微生物定植的影响.确定健康新生儿呼吸道微生物菌群的组成以及新生儿咽部的优势菌种.选择37例足月生产、无任何家族遗传病及感染性疾病、发育正常的健康新生儿及其母亲,进行定位定性测定.结果:①人类呼吸系统微生态平衡的最初建立与生产方式有一定关系,剖腹产新生儿无菌,正常产30%左右的新生儿带有母亲产道的正常菌,但在出生后3～4d即完全被以链球菌属为主的咽部正常菌所替代,不会表现出任何病症;②喂养方式对有益微生物的定植不能起到决定性作用;③季节对呼吸系统微生态平衡的建立有很大影响,冬季的北方,农村以烧煤或燃柴为主要的取暖方式,室温不稳定,空气污染严重;城市集中供暖,室温稳定,但相对湿度不够,致病菌和条件致病菌在鼻咽部生存,免疫力稍有下降就会导致呼吸道疾病的发生,这也是冬春季北方新生儿生存率低于夏秋季的原因所在.④游泳对有益微生物的建群有帮助,但无决定性作用;⑤胎膜早破组新生儿咽部微生物检出率高于正常对照组,而且检出菌的种类多,条件致病菌比例高,这势必给新生儿的呼吸道感染提供了条件.新生儿呼吸系统微生态平衡的最初建立是诸多生态因子的综合作用,其中生产方式、喂养方式、游泳对微生物的建群影响不大,而季节和胎膜早破影响较大.     

吸烟对人体呼吸道厌氧菌的影响

目的探究吸烟对人体内的呼吸道微生态的影响。方法采用细菌鉴定及药敏分析系统鉴定健康吸烟者与非吸烟者,患下呼吸道感染吸烟与非吸烟者咽后壁分泌物的细菌密度、细菌数量及种类的改变。结果在健康吸烟者与患有下呼吸道感染患者的呼吸道中,厌氧菌明显升高,其中以韦荣菌和消化链球菌为主。结论吸烟可使人体的呼吸道微生态中细菌密度,细菌数量及种类的改变,易患呼吸系统疾病。     

阴道微生态及其微生态疗法的研究进展

健康妇女阴道内存在着多种的正常微生物群落。它们与宿主、环境之间构成了相互制约、相互协调、动态的阴道微生态平衡。由于多种原因引起阴道生境改变,机体内分泌紊乱以及免疫功能下降时,阴道的微生物种群发生生态演替,当这种演替超过了生理波动范围时,阴道的微生态平...     

吸烟对呼吸道感染患者的微生态影响

呼吸道感染是常见病多发病,而呼吸道感染可导致微生态失调。有报道,宿主的任何病理变化都可作为生态失调的微观环境因素。微观环境对正常微生物群的影响是直接的;而且是主要的。为此,我们对吸烟和被动吸烟者的微生态变化及呼吸道感染患者微生态的变化以及二者之间的关系进行了研究。以进一步探讨吸烟对呼吸道感染患者直接或间接的影响。研究结果表明,吸烟及被动吸烟者患反复呼吸道感染的年发生率明显高于不吸烟者。健康对照组与患者口咽部菌群数相比有显著差异,无论是吸烟还是不吸烟的患者菌群含量均高于健康对照组（Ｐ＜００５）。结果表明,吸烟不仅有害于自身健康,而且危害被动吸烟者,其对呼吸道微生态的影响都是一致的,即可导致微生态失调,从而导致呼吸道疾病     

支气管哮喘与呼吸道微生态关系的研究进展

人体是个巨大的生态系统,各个器官的表面附着大量的微生物,微生物群通过与宿主细胞之间的相互作用来保证机体的正常营养代谢和微生态稳定。长期以来由于呼吸道的生理功能和特性,其微生物菌群的调节作用没有引起足够重视。自“肠-肺轴”的提出,更多学者开始致力于研究呼吸道微生态,并发现一些呼吸道疾病如慢性阻塞性肺疾病、特发性肺纤维化以及支气管哮喘等的发生发展与呼吸道微生态存在一定的关系,这为进一步研究呼吸道疾病,并寻求更好的治疗方式提供新的方向和选择。本文就支气管哮喘与呼吸道微生态之间的作用关系作一综述。     

在医学教育中继续加强微生态学教学改革的思考

微生态学是研究正常微生物群与其宿主相互关系的生命科学分支,是细胞水平或分子水平的生态学。微生态学是一门理论与实践密切相结合的新兴学科。微生态学理论来源于实践,又回归于实践,并指导实践。在欧美国家、日本,微生态学技术及微生态制剂得到了广泛应用。在医学方面,近年来国内用于治疗预防、保健的微生态制剂也有了迅猛的发展。首先应用在肠道病的生态防治,并取得了良好的效果。在口腔,泌尿生殖道、皮肤及呼吸道已相继应用微生态学理论和微生态调节剂,对各种疾病进行诊断,治疗和预防。     

草原群落退化演替过程中微斑块土壤碳氮的空间异质动态

微斑块变化是草原退化过程中的活跃成分。分析了呼伦贝尔克氏针茅草原逆行演替过程中微斑块土壤全碳、全氮和碱解氮含量的空间异质性,提出了"养分聚集效应"的概念。研究结果表明:随着群落退化演替的加剧,土壤全碳、全氮和碱解氮的含量均表现为演替前期演替后期演替中期(P0.05)。从土壤全碳、全氮和碱解氮的变异系数和变异函数综合分析来看,10 cm×10 cm微尺度上,草原退化演替过程中土壤全碳、全氮和碱解氮的空间异质性具有明显的不一致性;全碳的空间异质性表现为演替中期演替前期演替后期,全氮表现为演替后期演替前期演替中期,碱解氮表现为演替中期演替后期演替前期。草原退化过程中土壤养分在微斑块上的富积和迁移表现出尺度依赖性和变异性。     

生态系统演替过程中土壤与微生物碳氮磷化学计量关系的变化

土壤碳(C)、氮(N)、磷(P)化学计量特征会显著影响微生物的生长、群落结构、生物量C:N:P化学计量及其代谢活动。然而生态系统演替过程中土壤-微生物C:N:P化学计量的时间格局及其协调关系还不明确。为此, 该研究收集了2016年5月以前发表的文献中19个生态系统演替序列(包括13个森林、6个草地生态系统)的土壤-微生物生物量C:N:P研究结果, 整合分析了其中土壤-微生物生态化学计量的时间动态, 结果表明: (1)生态系统演替过程中土壤C:N没有一致的时间格局, 而土壤C:P和N:P均随演替进程显著增加, 其中土壤C:N:P与演替时间之间线性关系的斜率与相应演替序列的初始土壤有机C含量呈负相关关系。(2)演替进程中土壤-微生物生物量C:N:P没有一致的时间格局。(3)微生物生物量C占土壤有机C百分比(qMBC)、微生物生物量N占土壤全N百分比、微生物生物量P占土壤全P百分比均随着演替进程而显著增加, 即单位资源所能支持的微生物生物量随着演替进程而增加, 这与宏观生态系统演替理论相符。(4) qMBC随着土壤C:N、C:P和N:P以及C:N、C:P和N:P化学计量不平衡性(即土壤C:N、C:P和N:P分别除以微生物生物量C:N、C:P和N:P)的增加而减小; 其中, C:N、C:P和N:P化学计量不平衡性解释了qMBC变异性的37%-57%, 是演替时间解释率的7-17倍, 表明土壤-微生物生态化学计量关系对qMBC演替动态有重要影响。该研究强调了生态化学计量学理论和生态系统演替理论在土壤微生物时间动态研究中的重要作用, 表明适当地融合生态学宏观理论于土壤微生物研究可以加深对土壤-微生物生态过程的认识。     

科尔沁沙地植物群落恢复演替系列种群生态位动态特征

以科尔沁沙地草地植被恢复过程不同阶段和不同演替时间的6个群落类型的取样为对象。研究了植被恢复过程群落演替序列主要种群的生态位动态特征。结果表明：演替过程每一群落类型优势种的作用明显,具有最大的生态位宽度。生态位宽度在演替序列的动态变化较好地对应着种群动态,生态位宽度是种群动态的一个间接测度。是种群在群落中的地位和作用的数量表达。能够较好地解释群落演替过程种群的环境适应性和资源利用能力。沙米、雾冰藜、狗尾草、差巴嘎蒿、猪毛菜、隐子草分别是演替时间为1a、3a、5a、12a、20a和30a群落的优势种群。在群落演替序列较高的生态位重叠是适宜生境斑块化和空间异质性的结果,同时也反映了演替序列群落的过渡性质以及群落结构的不稳定性。     

婴幼儿期使用抗生素所致菌群失衡 对疾病发生的影响研究进展

人体表面定植的各种细菌承载庞大的基因库,它们之间的互相作用对维持人体微生态的稳定必不可少。婴幼儿期是生长发育的重要时期,同样也是菌群演替的关键时期。此时期免疫系统发育尚未成熟,容易受病毒及细菌感染,而使用抗生素治疗细菌感染是难以避免的。然而抗生素的使用不仅改变正常菌群,进而改变人体的免疫反应和代谢模式,同时对人体产生长远的影响,导致疾病的发生,甚至引起人体定植的正常菌群产生耐药性,构成新的耐药菌株的来源。本文就近年来婴幼儿期使用抗生素所致菌群失衡对疾病发生的影响作一综述。     

口腔微生物与全身健康研究进展

口腔微生物是定植于人体口腔的微生物集合。众多研究证实,口腔微生物与多种口腔感染性疾病及系统性疾病紧密相关。随着“人类微生物组计划”及其他微生物宏基因组学相关项目的开展,人们对口腔微生物群落的认识不断深入。本文基于最新研究进展,就口腔微生物的组成、演替特点、与口腔和全身系统性疾病的关系及与肠道微生物的交互作用进行综述。     

Microbial Succession in the Gut: Directional Trends of Taxonomic and Functional Change in a Birth Cohort of Spanish Infants

In spite of its major impact on life-long health, the process of microbial succession in the gut of infants remains poorly understood. Here, we analyze the patterns of taxonomic and functional change in the gut microbiota during the first year of life for a birth cohort of 13 infants. We detect that individual instances of gut colonization vary in the temporal dynamics of microbiota richness, diversity, and composition at both functional and taxonomic levels. Nevertheless, trends discernible in a majority of infants indicate that gut colonization occurs in two distinct phases of succession, separated by the introduction of solid foods to the diet. This change in resource availability causes a sharp decrease in the taxonomic richness of the microbiota due to the loss of rare taxa (p = 2.06e-9), although the number of core genera shared by all infants increases substantially. Moreover, although the gut microbial succession is not strictly deterministic, we detect an overarching directionality of change through time towards the taxonomic and functional composition of the maternal microbiota. Succession is however not complete by the one year mark, as significant differences remain between one-year-olds and their mothers in terms of taxonomic (p = 0.009) and functional (p = 0.004) microbiota composition, and in taxonomic richness (p = 2.76e-37) and diversity (p = 0.016). Our results also indicate that the taxonomic composition of the microbiota shapes its functional capacities. Therefore, the observed inter-individual variability in taxonomic composition during succession is not fully compensated by functional equivalence among bacterial genera and may have important physiological consequences. Finally, network analyses suggest that positive interactions among core genera during community assembly contribute to ensure their permanence within the gut, and highlight an expansion of complexity in the interactions network as the core of taxa shared by all infants grows following the introduction of solid foods.     

青稞酒发酵过程中的风味功能微生物及其风味代谢特征解析

[背景]青稞酒是一个多菌种固态发酵的产物,解析发酵过程中重要的功能微生物及其代谢特征对调控青稞酒发酵具有重要作用。[目的]揭示青稞酒发酵过程中的风味功能微生物并解析其风味代谢特征。[方法]基于高通量测序技术揭示青稞酒发酵过程中的微生物群落多样性和组成;采用顶空固相微萃取结合气相色谱-质谱技术跟踪酒醅的风味信息;通过微生物属与风味物质的关联分析揭示青稞酒发酵过程中风味功能微生物菌群,并采用蒙特卡洛检验分析进一步揭示发酵过程理化因子对风味功能微生物菌群的影响;于实验室环境下重构6株微生物发酵体系,以揭示其风味代谢特征。[结果]青稞酒发酵过程中9个真菌属和8个细菌属(相对丰度>1%)占据优势,其中Aspergillus、Komagataella、Lactobacillus、Pichia、Saccharomyces和Weissella是青稞酒发酵过程主要风味功能微生物;发酵过程中还原糖(r2=0.946 9,P=0.013 2)和酸度(r2=0.847 6,P=0.048 6)是驱动风味功能微生物菌群演替的关键因子;6株菌的组合发酵实验揭示了体外系统与原位系统具有相同的微生物演替现象与相...     

The gut microbiota in the metagenomics era: sometimes a friend, sometimes a foe

The normal intestinal microflora (microbiota) represents a complex, dynamic, and diverse collection of microorganisms, which usually inhabit the gastrointestinal tract. Normally, between this flora and the human host a mutually beneficial long-term symbiotic relationship is established, where the host contributes essential nutrients necessary for the survival of the microbiota and the latter fulfils multiple roles in host nutrition and development. Several achievements have recently converged to renew interest in studying the normal gut microbiota: the development of molecular methods of studying the microbial communities, the improved understanding of host-microbe interactions in health and disease, and the potential for therapeutic manipulation of the microbiota. We present recent data concerning the molecular technologies of studying the microbiota and new findings regarding the composition of the normal flora. We underline the beneficial activities of the gut flora on the human host. We emphasize the recent findings in the alterations of the microbiota in various medical conditions (celiac disease, irritable bowel syndrome, obesity, colorectal cancer, allergic disorders, and especially inflammatory bowel diseases). The results of these new studies suggest that changes of the microbiota could be linked to the etiopathogenesis of these diseases. These outstanding findings could be used for further diagnostic tools and/or therapy.     

On the origin of species: Factors shaping the establishment of infant's gut microbiota

The human gut microbiota is a complex and dynamic ecosystem, which naturally lives in a symbiotic relationship with the host. Perturbations of the microbial composition (dysbiosis) and reduced diversity may promote disease susceptibility and recurrence. In contrast to the mature intestinal microbiota of healthy adults, which appears relatively stable over time, the infant's microbiome only establishes and matures during the first years of life. In this respect, early childhood seems to represent a crucial age‐window in disease prevention, since microbial diversification and maturation of the microbiome primarily occurs during this period of life. A better understanding of ecological processes and pioneer consortia in microbial development is crucial, in order to support the development of a beneficial microbiota. Various deterministic and stochastic aspects seem to shape the microbiome in early life, including maternal, environmental, and host factors. Here, we review the current understanding of the origin of pioneer bacteria and the evolutionary factors that influence the development of the gut microbiota in infants. In addition, future perspectives, including manipulating and promoting the succession of initial bacteria during infancy, will be highlighted. Birth Defects Research (Part C) 105:240–251, 2015. © 2015 Wiley Periodicals, Inc.     

肠道菌群在肿瘤发生发展及免疫治疗中作用的研究进展北大核心CSCD

肠道菌群是一个与人体共生的复杂微生物区系,近年来被越来越多的研究者所关注。研究发现,肠道菌群不仅在维持人体正常生理功能中起到重要作用,在肿瘤发生、发展、诊断及治疗中也有不可忽视的作用。本文在对肠道菌群与肿瘤关系进行概述的基础上,重点介绍了肠道菌群促进肿瘤发生、发展的主要机制,以及肠道菌群对抗肿瘤免疫治疗尤其是免疫检查点抑制疗法的影响。此外,文中还总结了目前可行的调节肠道菌群以提高肿瘤治疗疗效的方法,并提出了其中可能存在的困难和挑战。     

肠道微生物群在人类健康衰老中的作用机制研究进展北大核心

衰老的特征是组织器官的功能衰退以及衰老相关疾病风险的增加,这给维护和促进健康长寿带来一系列新的挑战。尽管进行了广泛的衰老相关研究,但进展有限。人们越来越意识到肠道微生物群的结构和功能积极参与了衰老过程。肠道微生物群紊乱表现为许多与年龄相关的肠外器官轴的衰老。肠道微生物群可以被调节,这暗示了通过肠道微生物群抗衰老是一个可以实现的重要目标。本综述总结了肠道微生物群在不同年龄段中的动态演替,这种动态的肠道微生物群从胎儿到出生和婴儿期开始迅速发展,从断奶期到幼儿期迅速变化,然后建立稳定的成年人菌群,直到随着年龄增长最后发生衰退;肠道微生物群与肠外器官轴(大脑、心脏、肝脏、胰腺、肌肉、皮肤和骨骼)衰老相关疾病,以及通过饮食、粪菌移植和微生态制剂调节肠道微生物群靶向抗衰老的研究进展,以期为调控肠道微生物群抗衰老研究提供参考。